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PubMed 문헌 분석을 통한 한약재 네트워크 다차원 분석 시스템 개발
서동민(Dongmin Seo),유석종(Seok Jong Yu),이민호(Min-Ho Lee),예상준(Sang-Jun Yea),김철(Chul Kim) 한국콘텐츠학회 2016 한국콘텐츠학회논문지 Vol.16 No.6
최근 유전체학의 발전, 웨어러블 디바이스의 확산, IT/NT의 발전 등에 따라 방대한 양의 바이오-메디컬 데이터가 생산되고, 이에 따라 빅데이터를 활용한 헬스케어 산업이 급속히 발달하고 있으며, 이와 관련된 빅데이터 기술은 국민의 건강 증대와 건강한 고령 삶을 제공하는 핵심 기술로 급부상하고 있다. 또한, 한의학에 대한 과학적 접근이 진행되면서 한약재 성분의 효능을 검증하고자 하는 다양한 분자 생물학 분야의 연구가 진행되고 있다. 하지만 관련 한약재의 주요 성분과 관련된 생화학적 기작을 손쉽게 검색할 수 있는 시스템이 갖추어져 있지 못한 실정이다. 그래서 본 논문에서는 PubMed로부터 한약재와 관련된 논문들을 수집후, 수집된 논문들에 대한 문헌 분석을 통해 추출된 한약재 관련 화합물, 유전자 그리고 생물학적 상호작용 정보를 저장 및 관리하는 한약재 정보 데이터베이스를 구축했다. 또한, 연구자들에게 구축한 한약재정보 데이터베이스에 대한 직관적 분석을 제공하기 위해 화합물, 유전자 그리고 생물학적 상호작용 정보간 계층구조를 기반으로 네트워크를 구성 후, 해당 네트워크에 대한 다차원 분석을 제공하는 시스템을 개발했다. 마지막으로, 본 시스템은 향후 다양한 한약재 성분의 효능 및 생물학적 기작을 파악하는데 중요한 도구로 활용될 것으로 기대한다. With the development of genomics, wearable device and IT/NT, a vast amount of bio-medical data are generated recently. Also, healthcare industries based on big-data are booming and big-data technology based on bio-medical data is rising rapidly as a core technology for improving the national health and aged society. Also, oriental medicine research is focused with modern research technology and validate it’s various biochemical effect by combining with molecular biology technology. However there are few searching system for finding biochemical mechanism which is related to major compounds in oriental medicine. Therefore, in this paper, we collected papers related with medical herbs from PubMed and constructed a medical herbs database to store and manage chemical, gene/protein and biological interaction information extracted by a literature analysis on the papers. Also, to supporting a multidimensional analysis on the database, we developed a network analysis system based on a hierarchy structure of chemical, gene/protein and biological interaction information. Finally, we expect this system will be used the major tool to discover various biochemical effect by combining with molecular biology technology.
한의학 분야 문헌 분석을 통한 생물학적 네트워크 분석시스템 개발
유석종(Seok Jong Yu),조용성(Yongseong Cho),이준학(Junehawk Lee),서동민(Dongmin Seo),예상준(Sang-Jun Yea),김철(Chul Kim) 한국콘텐츠학회 2015 한국콘텐츠학회논문지 Vol.15 No.10
최근 한의학에 대한 과학적 접근이 진행되면서 한약재 성분의 효능을 검증하고자 하는 다양한 분자 생물학 분야의 연구가 진행되고 있다. 하지만 관련 한약재의 주요 성분과 관련된 생화학적 기작을 손쉽게 검색할 수 있는 시스템이 갖추어져 있지 못한 실정이다. 본 연구는 국내 한약재에 대한 약효 성분과 생물학적 기작에 대한 정보를 수집 및 텍스트마이닝을 수행하여 한약재 정보 데이터베이스를 구축하고자 하였다. 연구자가 손쉽게 분석된 한약재의 화합물, 유전자 그리고 생물학적 상호작용 정보를 검색할 수 있는 웹사이트 원형을 개발하였다. 문헌 분석결과 한의학분야 주요 화합물 및 유전자/단백질 정보를 추출할 수 있었고 현대 한의학 연구 현황의 특징을 보여주었다. 분석된 결과는 웹을 통해 한약재별 PubMed 문헌 정보와 관련된 한약재의 약재 정보 및 생물학적 상호작용 정보를 가시화하여 볼 수 있도록 개발하였다. Currently, oriental medicine research is focused with modern research technology and validate it’s various biochemical effect by combining with molecular biology technology. But there are few searching system for finding biochemical mechanism which is related to major compounds in oriental medicine. In this research, we aimed developing korean herb database based on text-mining system by analyzing PubMed data. We have developed prototype system for searching chemical, gene and biological relation in oriental medicine. It is characterized by modern oriental medicine research trend with major chemical, gene and protein information. Analysis results can be searched on the prototype system with visualization of the biological interactions.
Ti-Nb 합금강에서 합금성분의 변화에 따른 석출물거동이 고온연성에 미치는 영향
한원배 ( Won Bae Han ),이종호 ( Jong Ho Lee ),김희수 ( Hee Soo Kim ),안현환 ( Hyeun Hwan An ),이승재 ( Seung Jae Lee ),김성우 ( Seong Woo Kim ),서석종 ( Seok Jong Seo ),윤종승 ( Chong Seung Yoon ) 대한금속재료학회 ( 구 대한금속학회 ) 2012 대한금속·재료학회지 Vol.50 No.4
Hot ductility behavior of precipitation-hardened low-carbon iron alloys containing 0.02 wt% Ti and 0.05 wt% Nb was characterized by a hot tensile stress test. Carbon (0.05, 0.1, 0.25 wt%) and boron (0.002 wt%) contents were varied to study the effect of precipitates on the high-temperature embrittlement of the alloys in the temperature range of 600~800℃. Ductility loss was observed at 700℃ for the tested alloys. The cause of the ductility loss was mainly attributed to the carbides and ferrite films formed at the grain boundaries during deformation. Although the carbon content tended to raise the total fraction of Nb (C, N), the precipitates were formed mostly in the grain interior as the precipitation temperature was raised above the deformation temperature by the high carbon content. Hence, carbon in excess suppressed the hot ductility loss. Meanwhile, boron addition improved the hot ductility of the alloys. The improvement is likely due to the boron atoms capturing carbon atoms and thus retarding the carbide formation.