반응성 염료폐수 처리를 위한 화학응집, 펜톤산화, 세라믹 분리막 복합공정의 최적화

양정목(Jeong Mok Yang),박철환(Chul Hwan Park),이병환(Byung Hwan Lee),김탁현(Tak Hyun Kim),이진원(Jin Won Lee),김상용(Sang Yong Kim) 大韓環境工學會 2006 대한환경공학회지 Vol.28 No.3

Inactivation of the DevS Histidine Kinase of Mycobacterium smegmatis by the Formation of the Intersubunit Disulfide Bond

Jin-Mok Lee(이진목),Kwang-Jin Park(박광진),Min-Ju Kim(김민주),In-Jeong Ko(고인정),Jeong-Il Oh(오정일) 한국생명과학회 2010 생명과학회지 Vol.20 No.6

DevSR two-component system은 Mycobacterium smegmatis의 redox sensing에 관련된 주요한 regulatory system이다. DevSR system은 DevS histidine kinase와 DevR response regulator로 구성되어 있다. 저산소 조건에서 DevS histidine kinase는 활성화되어 DevR response regulator를 인산화 시키고, 인산화된 DevR response regulator는 DevR regulon의 transcriptional activator로 작용한다. DevS의 kinase activity는 DevS의 N-terminal에 위치한 GAF domain에 존재하는 heme의 ligand-binding state에 의해 결정된다. 본 연구에서는 C-terminal kinase domain의 redox-responsive cysteine (C547)이 DevS kinase activity의 redox-dependent control과 연관이 있음을 밝혔다. 산소가 존재할 때, C547 residue 사이의 disulfide bond의 형성은 DevS kinase activity를 불활성화 시킨다. β-mercaptoethanol과 dithiothreitol과 같은 환원제를 이용하여 산화된 DevS를 환원시켰을 때, DevS kinase activity가 복원된 것이 관찰되었다. 또한, C547을 alanine으로 치환했을 때, M. smegmatis의 DevS의 sensory 기능을 부분적으로 손상되는 것이 complementation 실험을 통해 in vivo 상에서 증명되었다. The DevSR two-component system is a major regulatory system involved in redox sensing in Mycobacterium smegmatis. The DevSR system consists of the DevS histidine kinase and its cognate DevR response regulator. When exposed to hypoxic conditions, the DevS histidine kinase is activated to phosphorylate the DevR response regulator, leading to the transcriptional activation of the DevR regulation. The ligand-binding state of the heme embedded in the N-terminal GAF domain of DevS determines the kinase activity of DevS. In this study, we demonstrated that the redox-responsive cysteine (C547) in the C-terminal kinase domain is involved in the redox-dependent control of DevS kinase activity. The formation of an intersubunit disulfide bond between the C547 residues in the presence of O₂ led to inactivation of DevS kinase activity. The reduction of the oxidized DevS with reductants such as β-mercaptoethanol and dithiothreitol resulted in the restoration of DevS kinase activity. It was demonstrated in vivo by complementation test that the substitution of C547 to alanine partially impaired the sensory function of DevS in M. smegmatis.

주성분회귀분석을 이용한 한국프로야구 순위

배재영,이진목,이제영,Bae, Jae-Young,Lee, Jin-Mok,Lee, Jea-Young 한국통계학회 2012 Communications for statistical applications and me Vol.19 No.3

야구경기에서 순위를 예측하는 것은 야구팬들에게 관심의 대상이 된다. 이러한 순위를 예측하기 위해서 2011년 한국프로야구 기록 자료를 바탕으로 산술평균방법, 가중평균방법, 주성분분석방법, 주성분회귀분석 방법을 제시한다. 표준화를 통한 산술평균, 상관계수를 이용한 가중평균과 주성분 분석을 이용해서 순위를 예측하고, 최종모형으로 주성분회귀분석 모형이 선택되었다. 주성분 분석으로 축약된 변수를 이용해서 회귀분석을 실시하여, 투수부분, 타자부분, 투수와 타자부분의 순위예측 모형을 제안한다. 예측된 회귀모형을 통해서 2012년도 순위 예측이 가능하다. In baseball rankings, prediction has been a subject of interest for baseball fans. To predict these rankings, (based on 2011 data from Korea Professional Baseball records) the arithmetic mean method, the weighted average method, principal component analysis, and principal component regression analysis is presented. By standardizing the arithmetic average, the correlation coefficient using the weighted average method, using principal components analysis to predict rankings, the final model was selected as a principal component regression model. By practicing regression analysis with a reduced variable by principal component analysis, we propose a rank predictability model of a pitcher part, a batter part and a pitcher batter part. We can estimate a 2011 rank of pro-baseball by a predicted regression model. By principal component regression analysis, the pitcher part, the other part, the pitcher and the batter part of the ranking prediction model is proposed. The regression model predicts the rankings for 2012.

Regulation of Photosynthesis Genes (puf, puc, puhA, bchC, bchE, bchF, and bchI) in Rhodobacter sphaeroides

고인정,김용진,이진목,신선주,오정일,Ko, In-Jeong,Kim, Yong-Jin,Lee, Jin-Mok,Shin, Sun-Joo,Oh, Jeong-Il Korean Society of Life Science 2006 생명과학회지 Vol.16 No.4

본 연구에서는 lacZ transcriptional fusion plasmid를 이용하여 광합성 세균인 Rhodobacter sphaeroides에서의 7가지 광합성유전자 (puf, puc, puhA, bchC, bchE, bchF, bchI) 발현의 경향과 조절을 조사하였다. R. sphaeroides에서 puhA와 bchI를 제외한 모든 광합성유전자들이 호기적 조건과 비교했을 때 혐기적 조건에서 더욱 강하게 발현되었다. puhA 유전자는 bchFNBHLM-RSP0290과 operon을 형성하며, bchI 유전자는 crtA와 operon을 이루는 것으로 나타났다. 광합성 조건에서 자란 R. sphaeroides의 puf, puc, bchCXYZ operon의 발현은 빛의 세기에 비례하는 반면, bchFNBHLM(RSP0290 puhA) operon의 발현은 빛의 세기에 반비례 하였다. bchEJG의 발현은 $10\;W/m^2$의 빛이 조사된 광합성 조건에서 제일 낮았으며, $100\;W/m^2$의 빛의 광합성 조건에서 가장 높았다. R. sphaeroides의 산소인지와 빛 인지에 관련된 세 가지 주요 조절기작에 의한 광합성유전자 조절은 다음과 같다. puf와 bchC는 PpsR repressor와 PrrBA two-component system에 의해 조절된다. 그리고 puc operon은 PpsR, FnrL, PrrBA system에 의해 조절된다. bchE의 발현은 FnrL과 PrrBA system에 의해 조절되는 반면, bchF는 오로지 PpsR에 의해서만 조절된다. PpsR repressor는 강한 세기의 빛 조건에서 bchf 발현억제의 원인이 되며, FnrL은 그 자체가 산소를 인지하는 기능 이외에도 세포질의 산화/환원 상태의 인지에 관련될 것으로 보인다. Here we examined the expression patterns and regulation of seven photosynthesis (PS) genes (puf, puc, puhA, bchC, bchE, bchF, and bchI) in the anoxygenic photosynthetic bacterium, Rhodobacter sphaeroides, based on lacZ reporter gene assay. Expression of the tested PS genes, except puhA and bchI, were strongly induced in R. sphaeroides grown under anaerobic conditions relative to that under aerobic conditions. The puhA and bchI genes appear to form the operons together with bchFNBHLM-RSP0290 and crtA, respectively. Expression of the puf, puc, and bchCXYZ operons in R. sphaeroides grown photosynthetically was proportional to the incident light intensity, whereas that of bchFNBHLM(RSP0290-puhA) was inversely related to light intensity. Expression of bchEJG was lowest under medium-light photosynthetic conditions $(10\;W/m^2)$ and highest under high light conditions $(100\;W/m^2)$. The regulation of PS genes by the three major regulatory systems involved in oxygen- and light-sensing in R. sphaeroides is as following: puf and bchC are regulated by both the PpsR repressor and the PrrBA two-component system. The puc operon is under control of PpsR, FnrL, and PrrBA system. Expression of bchE is controlled by FnrL and PrrBA two-component system, whereas bchF is regulated exclusively by PpsR. It was demonstrated that the PpsR repressor is responsible for high-light repression of bchF and that FnrL might be involved in perceiving the cellular redox state in addition to sensing $O_2$ itself.

방사형그래프를 활용한 한우의 품질관련 주요 유전자 상호작용 효과 규명

이제영,배재영,이진목,오동엽,이성원,Lee, Jea-Young,Bae, Jae-Young,Lee, Jin-Mok,Oh, Dong-Yep,Lee, Seong-Won 한국데이터정보과학회 2013 한국데이터정보과학회지 Vol.24 No.1

최근 인간의 질병과 관련된 유전자 연구가 많이 진행 되고 있다. 인간의 질병에 관련된 유전자는 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 중요하다고 한다. 무수히 많은 유전자들 중에서 상호작용을 찾기 위해서 선형모형 등의 통계적 방법을 이용할 시에는 계산의 복잡성 및 비용등 여러 단점이 생긴다. 따라서 이런 수많은 유전자들 중 주요 유전자 상호작용을 찾는 방법으로 SNPHarvester가 개발되었다. 본 연구에서는 최근에 밝혀진 한우의 지방산과 경제형질에 관련된 32개의 우수 단일 염기 다형성(SNP)를 이용하여 주요 유전자 조합을 SNPHarvester방법에 적용하여 분석한 결과를 시각적으로 쉽게 확인하기위해 방사형 그래프로 나타냄으로써 한우의 맛과 육질을 높일 수 있는 단일 염기 다형성 조합을 시각적으로 찾아내고, 각 형질별 단일효과와 상호작용 효과의 차이를 비교하여 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 더 큰 차이를 시각적 효과로 규명하였다. It is well known that disease of human and economic traits of livestock are affected a lot by gene combination effect rather than a single gene effect. But existing methods have disadvantages such as heavy computing, many expenses and long time. In order to overcome those drawbacks, SNPHarvester was developed to find the main gene combinations among the many genes. In this paper, we used the superior gene combination which are related to the quality of the Korean beef cattle among sets of SNPs by SNPHarvester, and identified the superior genotypes using radial graph which can enhance various qualities of Korean beef among selected SNP combinations.

산업용 임베디드 시스템에서 RTOS를 이용한 효과적인 시컨스 제어

최영섭(Young-Seob Choi),이진목(Jin-Mok Lee),추정훈(Jung-Hun Chu) 대한전기학회 2010 대한전기학회 학술대회 논문집 Vol.2010 No.7

기술의 발전에 따라 현재 산업용 시스템에서 사용하는 CPU, MCU는 그 성능이 매우 빠르게 발전하고 있다. 속도는 물론, 이더넷, USB, SPI, CAN, SCI등 수없이 많은 주변장치를 지원함으로써 기존의 명령들만 처리하던 단순한 제어의 역할에서 점차 많은 어플리 케이션을 지원하는 멀티 프로세서로의 역할로 변경되고 있다. 이로 인해 강력한 성능과 작은 크기의 CPU, MCU를 이용하여 공간의 제약 없는 제품의 개발이 가능해 졌다. 그러나 다양하고 복잡한 기능이 필요할수록 개발자가 많은 기능을 제어하기 위해 복잡한 시컨스를 설계해야 하고, 우선순위에 입각하여 모든 여러 가지 예외처리 및 에러처리를 구상하고 프로그램 해야만 하는 어려움이 있다. 또한 이렇게 설계한 프로그램의 유지보수는 프로그램 작성자 이외의 다른 사람이 이해하고 수정하기에는 매우 어렵다. 본 논문에서는 이러한 문제를 해결하기 위해서 RTOS (Real Time Operating System)를 적용하여 효과적으로 시컨스를 설계하고 제어하는 방법을 제시한다.

Design of a Compact Access-Point Metamaterial Antenna with Circular Polarization

Joong-ki Park(박중기),In-Kyu Yang(양인규),Sungtak Kahng(강승택),Jin-il Lee(이진일),Seongryong Yoo(유성룡),Se-gyoon Mok(목세균) 대한전기학회 2012 대한전기학회 학술대회 논문집 Vol.2012 No.5

신경망을 이용한 전력품질 측정에 관한 연구

최재호,김홍균,이진목 충북대학교 컴퓨터정보통신 연구소 2006 컴퓨터정보통신연구 Vol.14 No.1

본 논문에서는 RBF 신경망을 이용한 실시간 전력품질 측정 방법에 대하여 연구하였다. 전력품질 문제는 다양하여 실시간으로 자동으로 인식하기 위해서는 신경망을 이용하는 것이 매우 유용하다. 그러나 매우 짧은 시간에 일어나는 과도상태의 경우에는 변화를 감지하기가 매우 힘들다. 웨이블릿 변환은 이러한 빠른 변화에 민감하므로 과도장태 해석에 적합하다. 그러나 웨이블릿 변환만을 이용하는 특징 추출방법은 순간전압강하나 순간전압상승과 같은 문제에 대한 인식률이 낮다. 본 논문에서는 이러한 문제를 보완하기 위하여 부가적인 특징을 추출하여 거의 모든 전력품질 문제에 대한 인식률을 향상시켰다. This paper presents a power quality monitoring system using RBF neural network. Neural network is a very powerful way to detect and classify power quality problems. But the transient like as very fast problems is difficult event to recognize. Wavelet transform is appropriate method for detecting signal irregularities. The way to use only the input feature of wavelet transform has the low efficiency so we put additional features to increase efficiency to classify sag and swell. Finally we got high efficiency for detecting and classifying almost all Power quality problems.