Microsatellite marker를 활용한 칡소의 유전적 다양성 및 유연관계 분석

최연호(Yun Ho Choy),서주희(Joo Hee Seo),박병호(Byungho Park),이승수(Seung Soo Lee),최태정,조광현,최재원(Jae Won Choi),정경섭(Kyoung-sub Jung),공홍식(Hong Sik Kong) 한국생명과학회 2015 생명과학회지 Vol.25 No.6

본 연구는 microsatellite marker를 이용하여 국내에서 사육되고 있는 칡소 9지역 간의 유전적 거리 분석 및 계통 지도 작성 등의 계통유전학적 분석을 실시하였다. 11종의 MS 마커를 이용하여 대립유전자의 수(No. of allele)를 확인한 결과 8에서 24개로 확인되었으며, 기대이형접합율(expected heterozygosity, Hexp)은 0.672에서 0.834 범위 안에 나타났으며, 관측이형접합율(observed heterozygosity, Hobs)은 0.687에서 0.886, 다형성정보지수(Polymorphism information content, PIC)은 0.638에서 0.876로 확인되었다. 무작위 교배집단(Random)으로 가정하였을 경우 동일개체 출현빈도는 11개의 marker를 사용하였을 때, 5.24×10<SUP>-19</SUP> 빈도로 출현하는 것을 확인 할 수 있었으며, 반형매 교배집단(Half-sib)과 전형매 교배집단(sib)으로 가정했을 경우에는 2.63×10<SUP>-06</SUP>, 2.63×10<SUP>-06</SUP>으로 각각 확인되었다. 이러한 결과는 칡소의 개체식별 및 친지확인 marker로 11종의 MS marker가 충분히 활용 가능할 것으로 사료된다. Phylogenetic tree (Neighbor-Joining tree), Principle Component Analysis (PCA) 그리고 Factorial Component Analysis (FCA) 분석을 통해 9 지역의 칡소 집단 간의 유연관계를 확인하였다. 이러한 결과는 칡소 품종을 중요한 가축유전자원으로써 인식하고 국내 타 품종과의 유전적 차별화와 순수성 보존과 능력을 개량하는데 있어 기초 자료로 활용 가능할 것으로 사료된다. This study examined the genetic distance among Chikso (Korea native brindle cattle) in nine regional areas using allele frequencies and a genetic diversity analysis with microsatellite markers. The analysis of the genetic diversity and genetic relationships of 2068 Chikso (383 KW, 180 GG, 52 KN, 129 KB, 332 UL, 24 JN, 198 JB, 148 CN, 622 CB) was carried out using 11 microsatellite markers. The number of alleles, observed heterozygostiy (Hobs), expected heterozygosity (Hexp), and polymorphism information content (PIC) of the 11 microsatellite markers were 8?24, 0.672?0.834, 0.687?0.886, and 0.638?0.876, respectively. The expected probability of identity values in random individuals (PI), random half-sib (PIhalf-sibs), and random sibs (PIsibs) were estimated to be 5.24×10<SUP>-19</SUP>, 2.63×10<SUP>-06</SUP>, and 2.63× 10<SUP>-06</SUP>, respectively, indicating that these markers can be used for traceability systems in Chikso cattle. The results of a phylogenetic tree (neighbor-joining tree), principle component analysis (PCA), and factorial component analysis (FCA) revealed genetic distance among nine Chikso populations. In conclusion, this study provides useful basic data that can be utilized in Chikso breeding and development. In addition, we will have to manage and conserve as a valuable genetic resource, without losing diversity of Chikso.

유전 및 육종 : 한우 검정우의 일당증체량에 관한 연구

박병호 ( Byoung Ho Park ),최태정 ( Tae Jeong Choi ),최재관 ( Jae Gwan Choi ),최연호 ( Yun Ho Choy ),조광현 ( Kwang Hyun Cho ),이승수 ( Seung Soo Lee ),김시동 ( Si Dong Kim ),권오섭 ( Oh Sub Kwon ),나승환 ( Seung Hwan Na ),최유림 ( 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2012 한국축산학회지 Vol.54 No.5

본 연구는 당대검정 한우 4,681두와 후대검정 한우 4,442두의 자료를 이용하여 한우 일당증체량을 통한 성장 특성과 유전력을 추정하고, 도체형질과의 유전상관을 알아보고자 수행하였다. Park et al. ; Average Daily Gain of Hanwoo -3 2 1- 당대검정우에서 구한 6~9개월령, 9~12개월령, 6~12개월령 일당 증체량의 평균과 표준편차는 각각 1.04 ± 0.16 kg, 1.11 ± 0.17 kg, 1.07 ± 0.11 kg이었으며, 6~9개월령과 9~12개월령, 6~9개월령과 6~12개월령, 9~12개월령과 6~12개월령 일당증체량의 표현형 상관 이 각각 -0.03, 0.66, 0.65였다. 후대검정우에서 구한 6~12개월령 일당증체량과 도체중, 등심단 면적, 등지방두께 및 근내지방도의 표현형 상관은 각각 0.446, 0.199, 0.0266 및 0.045였다. 6~12개월령 일당증체량, 도체중, 등심단면적, 등지방두께 및 근 내지방도의 유전력은 각각 0.251, 0.298, 0.424, 0.503 및 0.626 이었으며, 6~12개월령 일당증체량과 도체중, 등심단면적, 등지방두 께 및 근내지방도의 유전상관은 각각 0.606, 0.292, -0.095 및 -0.007이었다. 본 연구로부터 일당증체량에 대한 개량으로 도체 중, 등심단면적 및 등지방두께에 대한 개량이 가능할 것으로 사료 된다. This study was conducted to identify the characteristics and estimate the genetic parameters of average daily gain (ADG) and carcass traits of Hanwoo. The data used in this study were 4,681 heads which were performance-tested and 4,442 heads which were progeny-tested in test station of National Agricultural Cooperative Federation. The means and standard deviations of ADG between 6~9 months (ADG:6-9), ADG between 9~12 (ADG:9-12) and ADG between 6~12 (ADG:6-12) from the performance test were 1.04 ± 0.16, 1.11 ± 0.17 and 1.07 ± 0.11, respectively. The phenotypic correlations of ADG:6-9 and ADG:9-12, ADG:6-9 and ADG:6-12, ADG:9-12 and ADG:6-12 were -0.03, 0.66 and 0.65, respectively. The phenotypic correlations of ADG:6-12 with carcass weight (CW), eye muscle area (EMA), backfat thickness (BF), and marbling score (MS) from progeny test were 0.446, 0.199, 0.0266 and 0.045, respectively. Estimated heritabilities from the pooled data were 0.251 (ADG:6-12), 0.298 (CW), 0.424 (EMA), 0.503 (BF) and 0.626 (MS), respectively. Estimated genetic correlations of ADG:6-12 with CW, EMA, BF, MS were 0.606, 0.292, -0.095 and -0.007, respectively. From these results, it could be suggested that selection for ADG significantly affects CW, EMA and BF by correlated response to selection.

유전 및 육종 : 홀스타인의 국제유전평가를 위한 모형개발에 관한 연구

조광현 ( Kwang Hyun Cho ),박병호 ( Byoung Ho Park ),최재관 ( Jac Kwan Choi ),최대과 ( Dae Kwa Choi ),최태정 ( Tae Jeong Choi ),최연호 ( Yun Ho Choy ),이승수 ( Seung Su Lee ),조총일 ( Chung Il Cho ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2013 한국축산학회지 Vol.55 No.1

본 연구는 국내 국가단위 평가결과의 문제점을 해결하면서 유전능력평가시스템을 고도화하고 우리나라가 국제유전평가에 참여하기 위하여 국제평가기구에서 요구하는 검증작업을 통과하기 위하여 수행하였다. 본 연구에 이용된 자료는 농협중앙회 젖소개량부에서 수집한 분만일이 2001년부터 2009년까지의 검정성적으로 총 1,416,589개이며 산차는 5산으로 제한하였으며, 누적착유일은 75~305일로 제한하였고, 전체 혈통자료는 2,279,741개이며 부모를 갖는 개체는 535,409개이고 아비소는 2,467두로 구성되어 있는 기록들을 이용하였다. 유량, 유지방, 유단백에 대한 육종가는 신규로 개발한 다형질모형(Multiple traits model)을 이용하여 육종가를 구하였으며 기초작업은 SAS version 9.2와 R프로그램을 이용하였으며 유전모수를 추정하기 위하여 VCE 6.0을 이용하였다. 전반적으로 유전적 추세는 꾸준히 지속되어 오고 있으며 산차별 차이가 두드러지게 나타나지는 않았다. 유지방을 제외하고 유량과 유단백 형질의 추세가 잘 추정되었음을 알 수 있다. 유전평가분석결과 상위 1000두의 랭킹안에 최근의 생년을 갖는 딸소가 기존에 사용한 모수로 분석한 결과보다 딸소가 증가했음을 알 수 있다. 국제유전평가모형을 통해 새로 평가한 결과 씨수소상위 100두를 기존 평가모형에 의한 평가결과와 비교했을 때, 2006년생은 23두에서 28두로 2007년생은 12두에서 20두로 2008년생은 2두에서 8두로 증가하였다. 이는 최근의 딸소나 씨수소의 유전능력이 우수함에도 불구하고 상위에 랭크되지 못했던 결과가 새 모형의 적용으로 보완하여 새로운 평가분석에 적용할 수 있을 것으로 판단된다. 따라서 기존의 단형질 모형 대신 다형질 모형을 이용한 분석방법으로 평가를 실시하고 국제유전평가에도 다형질 모형을 이용한 육종가를 제시함으로써 다형질 선발의 정확도가 향상될 수 있을 것이다. This study was aimed to solve the problems of current national genetic evaluation systems in Korea and its development to pass the verification processes as required by International Bull Evaluation Service(Interbull). This will enable Korea to participate in international genetic evaluation program. A total of 1,416,589 test-day milk records with calving dates used in this study were collected by National Agricultural Cooperative Federation from 2001 to 2009. Parity was limited up to fifth calving and milk production records were adjusted to cumulative 305 day lactation. The pedigree consisted of 2,279,741 animals where 2,467 bulls had 535,409 parents. A newly developed multiple trait model was used in calculation of breeding values for milk yield, milk fat, and protein yield. Data were edited with SAS(version 9.2) and R programs, and genetic parameters were estimated using VCE 6.0. Results showed a continuous increase in genetic potentials, in general, and no remarkable differences were found between performances by parity. Except fat yield, potentials in milk yield and protein yield were well calculated. We found an increased number of daughters per each top ranked 1,000 bulls in recent years of calf births compared to the cases of previous evaluations. Of the bulls ranked top 100 by our new models(multiple-trait models) we found that increased numbers of bulls were included. Of twenty eight bulls born in 2006, twenty bulls born in 2007 and eight bulls born in 2008 that were listed by new models, only 23, 12, and 2 bulls born in respective years were represented on top 100 by old single-trait models. Re-ranking of the daughters or sires by multiple-trait models suggest that this new multiple trait approach should be used for dairy cattle genetic evaluation and seed-stock selection in the future to increase the accuracy of multiple trait selection. Breeding values for these traits should also be calculated by new method for international genetic evaluation.

유전 및 육종 : 한우 거세우의 초음파 생체진단형질과 도체형질에 대한 지역과 출생년도 및 계절 효과 분석

정재경 ( Jae Kyoung Cheong ),오윤택 ( Yun Taek Oh ),최호남 ( Ho Nam Choi ),이철학 ( Cheol Hak Lee ),김강희 ( Kang Hee Kim ),김기양 ( Ki Yang Kim ),최연호 ( Yun Ho Choy ),김형철 ( Hyeong Cheol Kim ),황정미 ( Jeong Mi Hwang ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2012 한국축산학회지 Vol.54 No.4

본 연구는 한우 거세우의 초음파 진단형질과 도체형질을 이용하여 지역별과 출생년도-계절별 변이 요인의 효과를 규명하고자 실시하였다. 전국의 거세 한우 26,129두의 기록을 이용하여 초음파 진단형질로 등지방두께, 등심단면적 및 근내지방도를 진단하였고, 도체형질로 도체중, 등지방두께, 등심단면적 및 근내지방도를 조사하였다. 거세 한우의 지역별, 출생년도-계절 및 상관관계에 대한 비교분석의 결과는 다음과 같다. 지역별 및 출생년도-계절에서 초음파 진단형질과 도체형질 모두 고도의 유의성이 인정되었다(p<0.01). 지역별로 보면 경기지역이 도체형질 실측치 중 하나인 등지방두께를 제외한 초음파 진단형질 관측치와 도체형질 실측치에서 가장 높게 나타났다. 초음파 진단형질과 도체형질 간의 차이를 보면 대전의 등지방두께를 제외한 모든 지역에서 도체형질의 실측치가 초음파 진단형질의 관측치보다 약 2~3mm가 두껍게 나타났다. 등심단면적은 경기, 경남 및 제주를 제외한 모든 지역에서 약 2~7cm2의 차이가 났으며 그 중 가장 많은 차이가 나타나는 지역은 전남으로 나타났다. 근내지방도는 초음파 진단형질의 관측치와 도체형질의 실측치 차이의 범위가 0.9점에서 2.26점으로 나타났다. 초음파 진단형질과 도체형질에 대한 출생년도-계절 효과에 대해 2009년 봄의 초음파 진단형질인 등지방두께와 등심단면적이 다른 출생년도-계절에 비해 얇고 좁았지만 도체형질에서는 반대로 등지방두께와 등심단면적이 두껍고 넓게 나타났다. 초음파 진단형질과 도체형질 간의 표현형 상관관계를 보면 등지방두께는 0.62, 등심단면적은 0.31 그리고 근내지방도는 0.56으로 다른 문헌과 비교했을 때 상관계수가 낮은 것으로 나타났다. 이것은 초음파 진단시점과 출하시점간의 기간 차이가 다른 문헌에 비해 길었고, 공시우들의 지역별 그리고 농장별로 사육 방식과 환경요인들에 대한 변이가 컸기 때문인 것으로 생각된다. 본 연구의 결과는 거세우의 도체 특성의 예측 정확도를 높이고 고급육 생산 효율을 높일 수 있는 초음파 응용기술 개발에 기초자료로 활용 될 것으로 판단된다. Ultrasound measures of back fat thickness(UBF), eye muscle area(UEMA) and marbling score(UMS) and carcass measures of carcass weight(CW), backfat thickness(BF), eye muscle area(EMA) and marbling score(MS) were available on 26,129 Hanwoo steers. Statistically significant differences by regions of the farms location and birth years-seasons for the steers taken ultrasound measures and their carcass measures(p<0.01) were found. Steers in Gyeonggi province showed the highest values in ultrasound measures and carcass traits except in BF compared to steers in the other provinces. Comparing between ultrasound and carcass measures, UBF was thicker in general than BF in all regions except in Daejeon city. UEMA was higher than EMA in all regions except in Gyeonggior in Jeju provinces. Especially, the difference in Jeonnam province between UEMA and EMA was 7㎠ while the differences between UMS and MS ranged from 0.9 to 2.26 depending on the regions of steers located. Steers born in spring showed greater ultrasound or carcass values than those born in autumn. However, carcass measures of steers born in autumn were greater than those born in spring, 2009 except MS. The pearson and residual correlations were 0.63 and 0.65 between UBF and BF, 0.31 and 0.32 between UEMA and EMA and 0.56 and 0.56 between UMS and MS, respectively.

유전 및 육종 : 한우의 유전체 육종가의 정확도 추정

이승수 ( Seung Soo Lee ),이승환 ( Seung Hwan Lee ),최태정 ( Tae Jeong Choi ),최연호 ( Yun Ho Choy ),조광현 ( Kwang Hyun Cho ),최유림 ( You Lin Choi ),조용민 ( Yong Min Cho ),김내수 ( Nae Soo Kim ),이중재 ( Jung Jae Lee ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2013 한국축산학회지 Vol.55 No.1

본 연구는 농협 한우개량사업소 후대검정우 552두의 도체중, 배최장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도를 측정한 후 고밀도 SNP 패널(777K)을 사용하여 유전체 혈연 행렬(Genetic Relationship Matrix, GRM)을 추정하고 GBLUP(Genomic Best Linear Unbiased Prediction) 방법으로 GEBV(Genomic Estimated Breeding Value)를 구하여 교차 검증(Cross-validation) 방법으로 그 정확도를 추정함으로써 유전체 선발 기법을 한우 유전평가 체계에 적용하기 위한 기초자료로 이용하고자 수행하였다. 교차 검증 방법으로 각 형질별로 추정된 유전체 육종가의 정확도는 0.915~ 0.957로 상당히 높게 추정되었다. 대립유전자의 빈도로 계산된 유전체 혈연 행렬을 이용하여 GBLUP 방법으로 추정된 육종가 정확도의 최대 차이는 후대검정우 534두에 대하여 도체중, 배최장근 단면적, 등지방 두께 및 근내지방도 순으로 각각 9.56%, 5.78%, 5.78% 및 4.18% 정도의 수준으로 상승했고, 혈통 기록상의 모든 개체 3,674두에 대해서는 형질 별로 최대 13.54%, 6.50%, 6.50% 및 4.31% 정도의 수준으로 증가한 결과가 추정되었다. 이는 한우 보증씨수소의 선발 시스템에서 아직 표현형 자료를 생산할 수 없는 당대검정 후보축 대한 집단을 조성할 때 유전체 정보를 이용한 사전 선발을 활용하면 기존의 상대적으로 낮았던 육종가의 정확도의 상승 효과와 세대 간격의 단축으로 인하여 유전적 개량량을 증대시킬 수 있을 것으로 기대된다. 본 연구에서 genomic breeding value 추정을 위하여 조성된 집단의 경우는 후대 검정우 집단으로서 개체들 간의 혈연관계가 높으며, 이미 전통적인 BLUP 방법으로도 상당히 높은 정확도를 가진 집단을 이용하였다. 그러나, 현재 한우 집단에 대한 유전체 자료 구축 시 이용할 수 있는 정확한 자료는 후대검정우 집단 외에는 참조 집단을 조성할 수 있는 대안이 없으므로, 지속적인 유전체 검정을 위해서는 다양한 유전적 조성이 구축된 참조 집단을 구축해야 할 것으로 사료된다. 또한 유전체 검정을 통한 정확도 상승효과를 기대하기 위해서 지속적으로 참조 집단의 크기를 늘릴 필요성이 있다. This study was conducted to estimate the Genomic Estimated Breeding Value(GEBV) using Genomic Best Linear Unbiased Prediction(GBLUP) method in Hanwoo(Korean native cattle) population. The result is expected to adapt genomic selection onto the national Hanwoo evaluation system. Carcass weight(CW), eye muscle area(EMA), backfat thickness(BT), and marbling score (MS) were investigated in 552 Hanwoo progeny-tested steers at Livestock Improvement Main Center. Animals were genotyped with Illumina BovineHD BeadChip(777K SNPs). For statistical analysis, Genetic Relationship Matrix(GRM) was formulated on the basis of genotypes and the accuracy of GEBV was estimated with 10-fold Cross-validation method. The accuracies estimated with cross-validation method were between 0.915~0.957. In 534 progeny-tested steers, the maximum difference of GEBV accuracy compared to conventional EBV for CW, EMA, BT, and MS traits were 9.56%, 5.78%, 5.78%, and 4.18% respectively. In 3,674 pedigree traced bulls, maximum increased difference of GEBV for CW, EMA, BT, and MS traits were increased as 13.54%, 6.50%, 6.50%, and 4.31% respectively. This showed that the implementation of genomic pre-selection for candidate calves to test on meat production traits could improve the genetic gain by increasing accuracy and reducing generation interval in Hanwoo genetic evaluation system to select proven bulls.

유전 및 육종 : 국내 두록종 농장간 유전적 연결성 추정

조충일 ( Chung Il Cho ),최재관 ( Jae Kwan Choi ),박병호 ( Byoung Ho Park ),김시동 ( Si Dong Kim ),권오섭 ( Oh Sub Kwon ),최유림 ( You Lim Choi ),최연호 ( Yun Ho Choy ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2012 한국축산학회지 Vol.54 No.5

돼지에서 농장간 유전적 연결성은 다른 농장간 추정 육종가의 비 교를 위해 매우 중요한 지표이다. 본 연구에서는 유전적 연결고리 가 존재하는 6개의 두록 농장에서 수집된 24,971두의 90 kg 도달 일령에 대한 검정자료 및 456,697두의 혈통정보를 이용하였으며, 농장간 연결성은 연결율 수식에 의해 계산하였다. 분석 결과, 두록 농장간 교류를 위하여 총 8두에서 생산된 정액이 사용된 것으로 나타났다. A 농장은 8두의 종돈을 통하여 나머지 5개 농장과 모두 종돈 교류가 이루어졌으며, B-E 농장의 경우 F 농장을 제외한 나머 지 4개 농장과의 종돈 교류가 있었으며, F 농장은 오직 A농장과 혈연적인 연결이 존재하는 것으로 나타났다. 그러나 F 농장은 A농 장과의 연결을 통하여 나머지 다른 농장과 연결성을 갖게 되어 두 록 6개 농장간 연결성이 존재하는 것으로 나타났다. 또한 농장간 연결율이 가장 높은 값은 A농장과 C 농장간의 91.7%로 6개의 두 록 농장 중 농장간 연결율이 가장 높았으며, 반대로 D농장과 F 농 장에서 65.1%로 가장 낮은 연결율을 나타냈다. 국내 6개 두록 종 돈장간 연결율은 65% 이상으로 고도의 유전적 연결성이 존재하는 것으로 나타나 단일 집단의 개념에서 유전평가가 가능하며, 이를 이용하여 농장내외 개체간 상대적 비교를 통해 우수 종축을 선발할 수 있을 것으로 사료된다. The genetic connectedness between herds is an essential requirement to make robust across-herd estimation of the breeding values of the animals. In this study, genetic connectedness between herds was evaluated by a connectedness rating method. A total of 24,971 records of days to 90 kg (D90KG) of the pigs on performance testing programs collected from six herds (labeled from ``A`` to ``F``) of Duroc breed along with pedigree information comprising 456,697 families were used. Results showed that a total of eight boars were used for semen exchange programs among participant farms. Herds ``A`` through ``E`` were found strongly connected among them. But ``F`` herd was genetically connected strongly only with ``A`` herd. The highest average connectedness rating was 91.7% between ``A`` herd and ``C`` herd. The lowest average connectedness rating was 65.1% between ``D`` and ``F``. The concept of a single genetic group comprising six Duroc herds studied is meaningful due to high connectedness rates among them. Therefore, with this high genetic ties between participant Duroc farms, the more accurate genetic evaluation would be possible.

유전 및 육종 : 홀스타인의 유생산형질에 대한 유전모수 추정

조충일 ( Chung Il Cho ),조관현 ( Kwang Hyeon Cho ),최연호 ( Yun Ho Choy ),최재관 ( Jae Kwan Choi ),최태정 ( Tae Jeong Choi ),박병호 ( Byoung Ho Park ),이승수 ( Seung Su Lee ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2013 한국축산학회지 Vol.55 No.1

The purpose of this study was to estimate (co)variance components of three milk production traits for genetic evaluation using a multiple lactation model. Each of the first five lactations was treated as different traits. For the parameter estimation study, a data set was set up including lactations from cows calved from 2001 to 2009. The total number of raw lactation records in first to fifth parities reached 1,416,589. At least 10 cows were required for each contemporary group, herd-year-season effect. Sires with fewer than 10 daughters were discarded. Lactations with 305d milk yield exceeding 15,000 kg were removed. In total, 1,456 sires of cows were remained after all the selection steps. A complete pedigree consisting of 292,382 records was used for the study. A sire model containing herd-year-season, caving age, and sire additive genetic effects was applied to the selected lactation data and pedigree for estimating (co)variance components via VCE. Heritabilities and genetic or residual correlations were then derived from the (co)variance estimates using R package. Genetic correlations between lactations ranged from 0.76 to 0.98 for milk yield, 0.79~1.00 for fat yield, 0.75~1.00 for protein yield. On individual lactation basis, relatively low heritability values were obtained 0.14~0.23, 0.13~0.20 and 0.14~0.19 for milk, fat, and protein yields, respectively. For the combined lactation heritability values were 0.29, 0.28, and 0.26 for milk, fat, and protein yields. The estimated parameters will be used in national genetic evaluations for production traits. 본 연구의 목적은 여러 산차를 이용한 모델을 사용하여 유전평가분석을 하기위하여 3개의 유량생산 형질에 대한 (공)분산 성분을 추정하고자 하였다. 모수추정을 위한 자료는 2001년부터 2009년까지의 검정자료를 이용하였고 원시자료수는 1,416,589개이며 5개의 산차형질에 대해 각각 다른 형질로 가정하여 추정하였다. 동기그룹 내 10두 이하 및 씨수소의 딸소가 10두 미만인 개체는 삭제를 하였으며 305일 유량생산이 15,000kg을 초과하는 비유개체에 대하여 사전 데이터 가공을 실시하였다. 혈통파일은 총292,382개의 혈통자료와 1,456두의 씨수소로 구성되어진 혈통자료가 연구에 사용되었다. Sire 모형은 herd-year-season의 동기그룹과 분만월령 그리고 혈통과 5산까지 상가적 유전효과들이 적용되었으며 VCE를 이용하여 유전 (공)분산이 추정되었다. 유전율과 유전상과 그리고 잔차상관은 R 패키지를 이용하여 계산하였다. 유량에 대한 산차간 유전 상관은 0.76에서 0.98였고, 유지방량은 0.79~0.10, 유단백질량은 0.75~1.00로 나타났다. 각 산차별 유량, 유지방량, 유단백질량은 상대적으로 낮은 유전력인 0.14~0.23, 0.13~0.20이 추정되었으며 산차에 가중치로 결합된 유전력은 각 형질에서 0.29, 0.28, 0.26로 나타났다. 본 연구에서 추정된 모수들은 국가단위 유전평가분석에 사용될 수 있을 것으로 판단된다.

한우 거세우의 도체형질에 대한 유전모수 추정

황정미 ( Jeong Mi Hwang ),김시동 ( Si Dong Kim ),최연호 ( Yun Ho Choy ),윤호백 ( Ho Baek Yoon ),박철진 ( Cheol Jin Park ) 한국동물자원과학회 2008 한국축산학회지 Vol.50 No.5

유전 및 육종 : 한우 후대검정우 체척, 도체형질 및 부분육간 상관분석

이재구 ( Jae Gu Lee ),이승수 ( Seung Soo Lee ),조광현 ( Kwang Hyun Cho ),조충일 ( Chung Il Cho ),최연호 ( Yun Ho Choy ),최재관 ( Jae Gwan Choi ),박병호 ( Byoung Ho Park ),나종심 ( Chong Sam Na ),최태정 ( Tae Jeong Choi ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2013 한국축산학회지 Vol.55 No.5

This study was conducted to estimate the correlation structure between body size traits, carcass traits, and primal cuts in Hanwoo steers. Hanwoo progeny test data(body weight and body measurements) were collected from 2008 to 2010 from a total of 882 steers at the Hanwoo Improvement Main Center(NACF). Carcass traits considered were cold carcass weight, eye muscle area, backfat thickness, and marbling scores evaluated at the time of carcass grading. Correlation analyses were performed with observed scales of the traits and with residuals considering fixed environmental effects in generalized linear models. The correlation coefficient estimated between loin weight and chest girth was high at 0.74. The shank negatively correlated with pelvic width(-0.23) and hipbone width(-0.27). In addition, rib weight and chest girth was highly correlated(0.80). The correlation between carcass weight and chest girth was 0.86 in observed scale. Residual correlation between these traits was estimated at 0.65. Correlation between carcass weight and loin was 0.87 in the observed scale. Residual correlation was estimated at 0.83. The correlation coefficient estimated between shank weight and brisket and flank weight was negative at -0.69. Chest girth had a high correlation between primal cuts weight and body measurements. Thus, we believe that these results will provide a greater understanding on the relationship of primal cuts and other phenotypes, thus enabling valid production models for Hanwoo steers.

유전 및 육종 : 국내산 더러브렛 경주마의 씨수말 평가 기준으로 이용되는 연간수득상금 분석

이도형 ( Do Hyeong Lee ),공홍식 ( Hong Sik Kong ),이학교 ( Hak Kyo Lee ),박경도 ( Kyung Do Park ),조병욱 ( Byung Wook Cho ),최연호 ( Yun Ho Choy ),전병순 ( Byeong Soon Jeon ),조광현 ( Kwang Hyun Cho ),신영수 ( Young Soo Sin ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2011 한국축산학회지 Vol.53 No.4

본 연구는 연간수득상금형질을 이용한 국내 씨수말 평가시스템을 분석하여 주파기록과의 관계를 구명하고자 수행되었다. 씨수말 당 평균 자마수와 출주수는 각각 34두와 221회였다. 반면에 평균 2세 자마수와 출주수는 각각 9두와 25회였으며, 2세 자마들이 벌어들인 상금은 연간 수득상금의 8.3%였다. 연간수득상금에 대한 자마수와 출주수간의 단순상관계수는 각각 0.922와 0.934, 그리고 자마수와 출주수간의 단순상관계수는 0.985로 매우 높게 나타났다. 씨수말의 검정경력 첫해의 평균 자마수는 6두, 출주수는 17회로 매우 낮았으며, 검정경력에 따른 자마수와 연간수득상금은 매우 밀접한 관계를 나타내었다. 검정경력 4년차에서 40두 이상의 자마수를 확보하는 것으로 나타났으며, 자마수가 증가할수록 평균수득상금지수는 일괄적으로 증가하였다. 자마수가 30두 이하의 씨수말들의 평균수득상금지수는 1.00 보다 낮았으며, 자마수가 10두 이하인 경우에는 0.06에서 0.13의 범위를 나타내어 자마수는 씨수말의 순위 결정에 매우 큰 영향을 미치고 있었다. 주파기록에 대한 육종가와 출주당 수득상금의 상관계수는 다른 형질들에 비하여 가장 높은 -0.524에서 -0.633의 범위를 나타내었다. This study was conducted to analyze demerits of the sire evaluation system using annual earnings and to examine relationship between annual earnings and finish time in home-produced thoroughbred racehorses. The average number of progenies and number of starts per sire were 34 heads and 221 times, respectively. On the other hand, the number of progenies with the average age of 2 years and the number of starts were 9 heads and 25 times, respectively. The earnings of the horses with the age of 2 years accounted for 8.3% of annual earnings. The simple correlation coefficient between the number of progenies and the number of starts in annual earnings were 0.922 and 0.934, respectively. The correlation coefficient between the number of progenies and the number of starts was very high (0.985). The number of progenies and starts of sires for the first year of test career were very low (6 heads and 17 times), and there was very close relationship between number of progenies and annual earnings by the year of test career. The number of progenies was over 40 heads during the first 4 years of test career, and as the number of progenies increased the average earning index increased. The average earning index of sires with less than 30 progenies was lower than 1.00. When the number of progenies was less than 10, the average earning index was in the range of 0.06~0.13, indicating that the number of progenies affects much for determining the ranking of sires. The correlation coefficient between breeding value for finish time and annual earnings per start was very high(-0.524~-0.633) compared with other traits.