강원도 양식 연어과 어류에서 분리된 에로모나스 종의 유전학적 동정

임종원,구본형,김광일,정현도,홍수희,Lim, Jongwon,Koo, Bonhyeong,Kim, Kwang Il,Jeong, Hyun Do,Hong, Suhee 한국어병학회 2017 한국어병학회지 Vol.30 No.2

현재 양식장에서는 Aeromonad를 비롯한 다양한 병원균에 의한 전염병으로 인해 많은 경제적 손실을 겪고 있다. 연어과 어류뿐만 아니라 담수 및 해수어류에도 치명적인 감염을 야기하는 Aeromonas 종은 적어도 26종 이상이 보고되어왔으며, 전염병을 유발하는 유비쿼터스 세균이다. Aeromonas 종을 확인하기 위해 16S rDNA 및 하우스 키핑 유전자의 핵산 서열을 기반으로 한 분자생물학적 기술이 사용될 수 있다. 본 연구에서 Aeromonas 종은 강원도 16개 양식장의 연어과 어류로부터 분리되었으며 Aeromonad의 16S rDNA와 하우스 키핑 유전자의 서열, 즉 RNA polymerase sigma factor ${\sigma}^{70}$ (rpoD) 또는 DNA gyrase subunit B (gyrB)를 기반으로 계통 발생 학적으로 동정했다. 그 결과 대서양 연어 (Salmo salar), 은연어 (Oncorhynchus keta), 산천어 (Oncorhynchus masou masou), 무지개송어 (Oncorhynchus mykiss)에서 96 개의 균주가 수집되었으며, 36개의 균주가 16S rDNA 분석에 의해 Aeromonas 속으로 확인되었다. 확인된 Aeromonas 속 균주는 rpoD 또는 gyrB 유전자 서열을 기반으로 추가 분석되어 Aeromonas salmonicida (24 균주), A. sobria (10 균주), A. media (1 균주) 및 A. popoffii (1 균주)로 검출되었으며, 이 것은 Aeromonas salmonicida가 강원도의 연어과 어류에서 주요 감염균임을 나타낸다. 또 하우스 키핑 유전자의 서열에 기초한 Aeromonas 종의 계통발생학적 동정은 16S rDNA 서열보다 더 정확하다는 것이 또한 증명되었다. At the present, fish farms are suffering a lot of economic losses due to infectious diseases caused by various pathogens including aeromonad. Aeromonad is ubiquitous bacteria that causes infectious diseases. At least 26 species in the genus Aeromonas have been reported to cause fatal infections not only in salmonid fishes, but also in other freshwater and seawater fishes. Molecular techniques based on nucleic acid sequences of 16S rDNA and housekeeping genes can be used to identify the Aeromonas species. In this study, The genus Aeromonas was isolated from salmonid fishes of sixteen fish farms in Gangwon-Do, Korea and phylogenetically identified based on the sequences of 16S rDNA and housekeeping genes for Aeromonad, i.e. RNA polymerase sigma factor ${\sigma}^{70}$ (rpoD) or DNA gyrase subunit B (gyrB). Consequently, 96 strains were collected from Atlantic salmon (Salmo salar), coho salmon (Oncorhynchus kisutch), masou salmon (Oncorhynchus masou) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), and 36 isolates were identified as the genus Aeromonas by 16S rDNA analysis. Thirty six Aeromonad isolates were further analysed based on rpoD or gyrB gene sequences and found Aeromonas salmonicida (24 isolates), A. sobria (10 isolates), A. media (1 isolates) and A. popoffii (1 isolates), indicating that A. salmonicida is a main infectious bacteria in Salmonid fishes in Gangwon-Do. It was also proved that the phylogenetic identification of Aeromonas species based on the sequences of housekeeping gene is more precise than the 16S rDNA sequence.

외화 시청 중 외국어 수준과 자막 참조 특성의 비교

임종원(Jongwon Lim),윤정식(Jeongshick Yoon),김성준(Sungjoon Kim),임현교(Hyeonkyo Lim) 한국디지털콘텐츠학회 2020 한국디지털콘텐츠학회논문지 Vol.21 No.7

강원도의 연어과 어류에서 분리된 IHNV 분리주의 계통분류 및 병원성 분석

임종원 ( Jongwon Lim ),고은호 ( Eunho Go ),홍수희 ( Suhee Hong ) 한국어병학회 2021 한국어병학회지 Vol.34 No.2

IHNV는 국내 연어 양식업에서 경제적 손실을 발생시켜왔으며, 연어과 어류에 높은 폐사율을 초래한다. 본 연구에서는 강원도의 연어과 어류로부터 분리된 IHNV 분리주의 계통발생적 분류와 병원성을 조사하였다. 계통발생학적 분석은 IHNV의 303bp를 해당하는 mid-G 영역을 염기 분석하여 수행되었다. 바이러스주 모두 J 유전자형으로 RTDH 1709, RTJS1709, MSOK1711, RTYK1711, RTCC 1801 그리고 RTHC1802는 J-Nagano형이며, RTYK1801는 J-Shizuoka형에 속하는 것으로 확인되었다. 이러한 결과는 이전 연구와 일치하게 강원도에서는 두 가지 유전형이 분포한다는 것을 시사한다. 또한, 6개 분리주를 무지개송어 치어의 복강에 주사하여 병원성을 시험한 결과, J-Nagano형인 RTCC 1801와 RTJS1709 바이러스주로 주사된 그룹은 100%의 폐사율을 나타냈다. 그 뒤로, J-Nagano형인 RTHC1802, RTDH1709 그리고 MSOK1711 분리주가 주사된 그룹들은 50%, 30% 그리고 20%의 폐사율을 나타났다. 그러나 J-Shizuoka형인 RTYK 1711 분리주와 대조군에서는 폐사가 발생하지 않았다. 이러한 결과는 J-Shizuoka형이 J-Nagano형 바이러스 분리주보다 높다고 보고한 기존의 연구결과와 상반되며 J 유전자형 내에서 유전자형과 병원성간의 상관관계가 없는 것을 시사한다. 하지만 본 연구에서는 1개의 J-Shizuoka형 분리주만이 분석되었기 때문에 J 유전자형 내에서 유전자형과 병원성간의 상관관계를 확실하게 알기 위해서는 J 유전자형의 병원성에 대한 추가 조사가 필요할 것으로 보인다. This study investigated the phylogenetic classification and pathogenicity of 6 infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) strains isolated from salmonid fish in Gangwon-do, Korea. Based on the nucleotide sequence of mid-G region, all six strains belong to J genotype, of which 5 are J-Nagano type and 1 J-Shizuoka type. In a challenge test, 5 isolates of J-Nagano type IHNV showed a various mortalities as 2 isolates induced a high mortality of 100% and the other 3 isolates induced mortalities of 50, 30, and 20% after intraperitoneal injection in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Meanwhile no mortality was occurred by 1 isolate of J-Shizuoka type virus. Thus, it seems that there might be no relation between genotype and pathogenicity within IHNV J genotypes. This is contrary to previous studies where reported a higher pathogenicity of J-Shizuoka type virus than J-Nagano type virus in rainbow trout. Further examination will be required to clarify this since only one J-Shizuoka type virus was analyzed in this study.

해수에 순치된 첨연어(Oncorhynchus keta)에서 분리된 정형 에로모나스 살모니시다(Aeromonas salmonicida)에 대한 특성 분석

임종원 ( Jongwon Lim ),고성재 ( Sungjae Ko ),박영준 ( Youngjun Park ),안도일 ( Do-il Ahn ),홍수희 ( Suhee Hong ) 한국어병학회 2023 한국어병학회지 Vol.36 No.2

첨연어(Oncorhynchus keta)는 한국에서 회귀하는 연어로 종 보존을 위해 경상북도 울진군에 위치한 수산자원공단에서 해수 순치하며 종묘 생산하였다. 그러나, 사육 중이던 첨연어 치어에서 세균성 질병에 감염된 증상을 보이며 폐사하였다. 따라서, 본 연구에서는 2021년 10월경에 사육환경에 따라 구분된 첨연어로부터 원인체를 규명하고자 세균을 분리하였다. 분리된 세균은 16S rDNA, rpoD (RNA polymerase sigma factor σ70) 및 vapA (A-layer)의 염기서열을 기반으로 유전학적으로 동정하고, 추가로 염분에 따른 성장, 생화학적 특성 분석, 항생제 감수성 및 병원성 인자를 분석하여 균주를 특성화하였다. 그 결과, 분리된 4개의 균주는 모두 Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida 아종으로 동정하였다. 또한, 분리된 균주는 염분의 농도가 증가할수록 배지에서 성장이 감소하였다. 생화학적 특성 분석에서 분리된 4개 균주는 용혈성이 확인되지 않았고, 모두 같은 생화학적인 성상을 나타냈다. 항생제 감수성 분석에서는 oxolinic acid, flumequine 그리고 florfenicol에 대한 항생제에서 40~44 mm 억제대를 형성하였다. 병원성 인자의 발현 분석은 mRNA 수준에서 RT-PCR로 확인되었으며, 4개 균주는 모두 A. salmonicida의 병원성에 크게 기여한다고 잘 알려진 outer membrane ring of T3SS (ascV), inner membrane ring of T3SS (ascC), vapA, enterotoxin (act) 및 lipase (lip) 유전자가 발현되었다. 이 연구에서 분리된 A. salmonicida subsp. salmonicida의 특성 분석은 해수에 순치된 첨연어에서 발병하는 절창병을 예방하기 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것이다. Chum salmon (Oncorhynchus keta) is a species which returns to Korea for spawning and was produced as seed production at the Fisheries Resources Agency located in Uljin-gun, Gyeongsangbuk-do to preserve the species. However, farmed chum salmon showed symptoms of bacterial infection. Therefore, in this study, bacteria were isolated to identify the causative agent from chum salmon in October 2021. The isolated bacteria were identified based on the sequences of 16S rDNA, rpoD (RNA polymerase sigma factor σ70), and vapA (A-layer) genes. Also, salinity-growth curve, biochemical characterization, antibiotic susceptibility test, and pathogenicity analysis were performed in four strains. As a result, four isolated strains were identified as Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida. Additionally, the bacterial strains showed a decrease in growth as the salt concentration increased in the medium. All of the isolated strains exhibited γ-hemolysis, and the same biochemical properties. In the antimicrobial susceptibility test, all strains showed an inhibition zone of 40 to 44 mm for oxolinic acid, flumequine, and florfenicol. Pathogenic factors were assessed by RT-PCR at the mRNA level, and found that the four strains expresses the outer membrane ring of T3SS (ascV), inner membrane ring of T3SS (ascC), vapA, enterotoxin (act), and lipase (lip) genes which are well known to significantly contribute to the pathogenicity of A. salmonicida. The results of this study can be used as basic data to prevent A. salmonicida subsp. salmonicida occurring in sea-chum salmon in the future.

PET 음료용기의 재활용 활성화를 위한 디자인 측면에서의 고찰

임종원(Jongwon Lim),김성준(Sungjoon Kim) 한국디자인학회 2021 한국디자인학회 학술발표대회 논문집 Vol.2021 No.11

지하철 승강장의 공기 질 관리를 위한 제품 디자인 연구

임종원(Jongwon Lim),조민기(Mingi Jo),김성준(Sungjoon Kim) 한국디자인학회 2019 한국디자인학회 학술발표대회 논문집 Vol.2019 No.11

Metroair

Sungjoon Kim(김성준),Jongwon Lim(임종원),Mingi Jo(조민기) 한국디자인학회 2019 한국디자인학회 국제초대전도록 Vol.2019 No.11

수소연료전지 버스의 비선형 모델 예측 제어를 활용한 실시간 동력 분배 제어 알고리즘

이승연(Seungyeon Lee),이주인(Jooin Lee),임종원(Jongwon Lim),이형철(Hyeongcheol Lee) 한국자동차공학회 2023 한국자동차공학회 학술대회 및 전시회 Vol.2023 No.11

In this paper, power distribution control algorithm for fuel cell electric bus was developed. Power distribution control algorithm is developed by using Gradient based Model Predictive Control(GRAMPC). Algorithm considered vehicle’s system characteristics like fuel cell, battery, motor and vehicle dynamics. Cost function is developed with considering battery’s State-of-charge and consumption ratio of fuel cell. GRAMPC can execute nonlinear model predictive control algorithm with real-time environment. Driving scenario is developed including real world traffic condition by using SUMO and Autonomie. Algorithms is validated in real-time simulation environment with dSPACE RCP-HIL simulator.

노선 및 시간대를 고려한 ECMS 기반의 연료전지 하이브리드 버스의 최적 동력 분배에 관한 연구

김재영(Jaeyoung Kim),이주인(Jooin Lee),임종원(Jongwon Lim),정욱용(Ukyong Jeong),이형철(Hyeongcheol Lee) 한국자동차공학회 2023 한국자동차공학회 학술대회 및 전시회 Vol.2023 No.11

본 연구에서는 연료전지 하이브리드 버스의 노선 및 시간대를 고려한 동력 분배에 대한 연구를 수행하였다. 기존 ECMS(Equivalent Consumption Minimization Strategy) 기반의 최적 제어 전략의 경우, 차량의 주행 특성이 달라지면 최적 등가인자가 달라지는 문제가 있다. 하지만 버스의 경우 노선 및 시간대에 따라 일정한 주행 특성을 가지기 때문에 이를 고려한 최적 등가인자 맵을 적용하여 다양한 주행 특성에서 최적 동력 분배가 가능하도록 연구를 수행하였다. 이를 위해 연료전지 하이브리드 버스를 모델링하고 실제 버스의 주행 정보 데이터를 활용하여 노선 및 시간대별 최적 등가인자를 도출하였으며, 시뮬레이션을 통해 ECMS 기반의 최적제어 전략을 적용한 연료전지 하이브리드 버스가 기존의 규칙 기반 제어 전략과 비교하여 연료 소비량을 감소시키는 것을 확인하였다. 본 연구는 연료전지 하이브리드 버스의 운영 비용을 절감하고 미래 도시 교통 시스템의 지속 가능성을 높이는 데 기여할 수 있는 중요한 연구 결과를 제시한다.

지역난방용 열수송관의 보온재 열화에 따른 전단강도 특성 분석

김주용(Jooyong Kim),김연수(Yeon Soo Kim),임종원(Jongwon Lim) 대한기계학회 2020 대한기계학회 춘추학술대회 Vol.2020 No.12