Determination of Protein Sequence by Tandem Mass Spectrometry

유은순 호남대학교 산업기술연구소 1997 산업기술연구논문집 Vol.5 No.-

FAB 탄뎀질량분석 및 그와 관련된 분석법은 단백질의 일차 구조를 결정하는 중요한 방법이다. 질량분석법을 통하여 단백질의 sequence를 결정시, 이 분석법의 장점은 정확도 및 구조가 수정된 아미노산잔기도 결정할 수 있으며 일반적으로 Edman sequencing방법을 이용할 때 필요한 수많은 purification단계를 생략할 수 있다는 점이다. The FAB MS/MS(Fast Atom Bombardment Mass Spectromerty/Mass Spectrometry) and related techniques are powerful tools availble to the protein cemist for primary structure determination. The advantages of mass spectrometric protein sequencing are the sensitivity, the ability to detect modified amino acid residues, and te fact that sequence information can be obtained from mass-selected peptides without the laborious purification generally needed for Edman sequencing.

2-D NMR Study of Synthetic Oligosaccharides

유은순 호남대학교산업기술연구소 1997 산업기술연구논문집 Vol.4 No.-

합성된 올리고당이 일차적 구조는 고자장 수소핵자기공명분광기를 사용하여 밝힐 수 있다. 당잔기의 구성요소 및 구조에 관한 정보와 올리고당의 배열순서 및 연결부위에 관한 연구도 일차와 이차원적 NMR방법을 다양하게 사용하여 행하여 질 수 있다. 이러한 NMR 분석법은 올리고당의 용액내의 구조를 연구하는데도 유용하다. 본 연구는 이차원적 핵자기공명분석법을 이용하여 합성올리고당인 gal(β1-4)glc(β1-3)glc와 gal(β1-4)glc(β1-6)glc의 여러 구조 요소중 연결부위의 분석에 초점을 맞추었다. The primary structure of synthetic oligosaccharide can be elucidated by employing high-field proton NMR (Nuclear Magnetic Resonance) spectroscopy. Information with respect to the composition and configuration of saccharide residues and the sequence and linkage positions of the oligosaccharide can be obtained by employing a variety of one- and two-dimensional NMR techniques. These techniques are also useful in establishing the solution conformation (secondary structure) of the oligosaccharide moiety. This study is focused on the elucidation of linkage positions of synthetic trisaccharides, gal(β1-4)glc(β1-3)glc and gal(β1-4)glc(β1-6)glc, suing 2-D NMR spectroscopy.

디지털 시대의 프랑스 문학 교육을 위한 소고

유은순,류선정 한국프랑스어문교육학회 2024 프랑스어문교육 Vol.84 No.-

본 논문은 디지털 시대에 프랑스 문학 교육의 새로운 방향성을 탐색하기 위해 디지털 문학관에 대한 사용자의 경험을 분석하고 디지털 문학관이 보완해야 할 점을 점검한 다음, 그것이 프랑스 문학 강의에 사용될 경우 가져올 기대 효과를 환기하는 데 목적이 있다. 이를 위해 우선 국내외 디지털 인문학의 강의 연구 사례들을 검토하면서, 디지털 기반 프랑스 문학 교육의 현황과 나아가야 할 방향에 대해 고찰하였다. 그리고 카뮈 디지털 문학관의 사용 경험에 대한 설문조사를 바탕으로 디지털 문학관의 기능적, 내용적 측면에서 수정 및 보완되어야 할 사항들을 점검하면서, 그것이 교육적 도구로서 갖는 장점 및 단점도 살펴보았다. 설문조사 결과 학생들은 첫째, 디지털 문학관의 교육적 활용을 긍정적으로 평가하였을 뿐만 아니라 문학 강의에서 디지털 도구 사용의 유용성과 필요성에 공감하였다. 둘째, 카뮈 디지털 문학관의 장점으로 작품에 대한 정량적 분석과 시각화를 통해 방대한 내용을 집약적으로 전달하고 직관적으로 파악하게 하는 점을 꼽았다. 특히 캐릭터, 공간, 키워드, 작품, 작가와 당대 지식인들 간의 교류 등을 네트워크로 시각화한 것은 작가의 작품 세계를 이해하게 하는 데 매우 유용하다고 평가하였다. 셋째, 정보의 가독성을 위해 폰트 크기, 바탕 색깔 등 미학적인 부분과 사용자 인터페이스 같은 기술적 문제를 보완해야 한다고 지적하였다. 이러한 설문 결과를 바탕으로 카뮈 디지털 문학관을 보완하고 향후 그것을 활용한 프랑스 문학 강의를 다음과 같이 설계해 보는 것을 제언하였다. 저학년 강의에서는 카뮈 디지털 문학관을 통해 학생들이 카뮈의 작품에 대해 흥미를 느낄 수 있도록 작품 세계를 거시적인 차원에서 이해하는 데 중점을 둔 수업을 설계할 필요가 있다. 이때 교수자는 프랑코 모레티(Franco Moretti)의 ‘멀리서 읽기(distant reading)’ 개념에 근거해 학생들에게 작품에 대한 정량적 접근과 정성적 접근이 서로 어떻게 보완될 수 있는지 이해시키면서, 자연스럽게 카뮈 작품을 정독하도록 유도하는 것이 중요할 것이다. 고학년 강의에서는 디지털 문학관의 다양한 네트워크 시각화가 제공하는 정량적 결과를 활용하여 작품을 분석하게 하는 데 중점을 둔 수업을 설계할 필요가 있다. 이때 교수자는 학생들이 정량적 접근과 정성적 접근을 병합한 분석을 실제로 진행할 수 있도록 유도하는 것이 중요할 것이다. Actuellement, l'enseignement de la littérature française évolue avec l'avènement du numérique. Cet article analyse l'expérience des utilisateurs d'une maison littéraire numérique dédiée à Albert Camus, en examinant les effets attendus de son utilisation dans les cours de littérature. L'objectif de notre recherche est d'explorer de nouvelles perspectives pour l'enseignement de la littérature française à l'ère numérique. Pour cela, nous avons d'abord examiné des cas d'enseignement en « humanités numériques », réfléchi sur l'état actuel de l'enseignement de la littérature française numérique, et envisagé ses orientations futures. Ensuite nous avons mené un sondage auprès de 40 étudiants afin d’évaluer la maison littéraire numérique d'Albert Camus en tant qu'outil pédagogique. Puis, nous avons examiné les avantages et les inconvénients de ses fonctionnalités. Les résultats du sondage ont révélé plusieurs points importants. Premièrement, les étudiants ont positivement évalué l’application éducative, soulignant l'utilité des outils d'analyse numérique en littérature. Deuxièmement, la maison littéraire numérique a été saluée pour sa capacité à faciliter la compréhension intuitive et l'étude intensive des œuvres de Camus grâce à des analyses quantitatives et des visualisations. Les visualisations les plus appréciées comprennent les réseaux de mots-clés, de personnages, d'œuvres, ainsi que les lieux réels et symboliques liés à la vie et aux œuvres de l'auteur. Troisièmement, les étudiants ont souligné la nécessité d’améliorer la lisibilité de l’information en résolvant certains problèmes techniques tels que l'interface utilisateur, la taille et la couleur de la police. À la lumière de ces résultats, nous proposons de concevoir l'enseignement de la littérature française en utilisant la maison littéraire numérique d'Albert Camus. Pour les cours des première et deuxième années, les enseignants devraient mettre l'accent sur des cours permettant aux étudiants de comprendre l'univers littéraire de Camus à un niveau macro, suscitant ainsi leur intérêt pour ses œuvres. Dans cette optique, les professeurs peuvent expliquer aux étudiants, à travers la notion de « distant reading » de Franco Moretti, comment les approches quantitative et qualitative des œuvres peuvent se compléter mutuellement, encourageant ainsi une lecture naturelle des œuvres de Camus. Pour les cours des troisième et quatrième années, les professeurs peuvent envisager des cours permettant aux étudiants d'analyser les œuvres de Camus en utilisant des données quantitatives et visuelles. Dans ce contexte, il est essentiel que les professeurs motivent les étudiants à analyser ses œuvres en combinant les approches qualitative et quantitative.

The Use of ESR in Studying the Mechanism of Xanthine Oxidase

유은순 호남대학교 산업기술연구소 1999 산업기술연구논문집 Vol.7 No.-

전자스핀 공명법(ESR)은 다양한 유형의 단백질의 형태 및 그들의 효소적 기전을 연구하는 데 중요한 방법이다. 효소복합체내 전자스핀-핵스핀의 짝지움을 통하여 금속이온과 연결된 리간드기 뿐아니라 핵주변에 가깝게 위치한(6Å이내) 리간드기도 알 수 있다. 이 특성으로 화학반응 중 Xanthine 산화효소의 형태상의 아주 작은 변화도 알아낼 수 있다. ESR(Electron Spin Resonsnce) is a powerful tool for studying many types of protein conformations and their enzymatic mechanisms. The electron spin-nuclear spin coupling in enzymatic complexes has the potential not only of revealing ligand groups to the metal ion but also of surrounding nuclei in close proximity(i.e.≤6Å). This allows one to detect extremely small changes in the conformation of xanthine oxidate during the chemical reaction.

저에너지 Collision Tandem Mass Spectrometry를 이용한 올리고당의 연결위치 연구 : Effect of the Acetylation Derivatization 아세틸화 반응이 미치는 영향

유은순 호남대학교 산업기술연구소 1996 산업기술연구논문집 Vol.3 No.-

올리고당의 연결위치(linkage position)는 FAB CAD MS/MS (Fast Atom Bombardment Collision Activated Dissociation Mass Spectrometry/Mass Spectrometry)를 이용하여 알 수 있다. 연결위치-이성질체 올리고당을 아세틸화시키면 자유올리고당보다 연결위치의 구별이 쉽고 독특한 분절이온 패턴을 얻을 수 있다. 그 이유는 연결위치에 따라 각 올리고당이 충돌에너지(collision energy)를 흡수하여 glycosidic결합 주위를 회전하는 회전운동의 자유도가 달라지기때문이다. Linkage positions in oligosaccharides may be obtained by FAB CAD MS/MS (Fast Atom Bombardment Collision Activated Dissociation Mass Spectrometry/Mass Spectrometry). Acetylated derivatives of the linkage-isometric trisaccharides exhibited better linkage dependent product ion patterns than the free trisaccharides and provided specifec fragmentation patterns according to linkage position. The reason for the better linkage dependent spectra patterns of acetylated forms is related to the ability of each linkage position in the oligosaccharides to absorb collision energy and rotational freedom of the individual glycosidic linkage.

음이온 충돌 탄뎀 질량분석법을 이용한 올리고당의 연결부위 연구

유은순 湖南大學校 1996 호남대학교 학술논문집 Vol.17 No.2

Negative ion FAB(Fast Atom Bombardment) mass spectra were found to allow the determination of the linkage position in a series of underivatized linkage-isomeric oligosaccharides. Previous work??? reported that ion patterns of linkage-isomeric trisaccharides could be distinguished by positive ion FAB CAD MS/MS. Negative ion FAB MS/MS spectra of linkage-isomeric trisaccharides exhibited better sensitivity than positive ion mode and provided specific fragmentation patterns according to linkage positions. Especially, the fragmentation, mz/163 in F6 and m/z 221 in G6, not occuring in 1-3 nor 1-4 linkage, was an indication of 1-6 linkage, by changing collision energies from +10 eV to +60 eV. The m/z 378 peak in F3 and F4 FAB CAD MS/MS spectra could not be found in the spectrum of F6. The survival ratios of molecular ions in each collision energy set, gave support to previous result????? in which the order of bond stability was 1-6>1-4>1-3 linkage.

미생물담체를 이용한 타이어공장폐수의 유기물 제거에 관한 연구

유은순 호남대학교 2003 호남대학교 학술논문집 Vol.24 No.2

한방치료의 세계화를 위한 기초연구

유은순 호남대학교 산업기술연구소 2013 녹색산업연구 Vol.19 No.2

본 연구는 한방치료의 세계화를 위한 기초연구의 필요성을 제시하기 위해 수행되었다. 한방치료의 세계화를 달성하려면 한방치료의 안전성과 효용성에 대한 객관적 증명이 필수적이다. 또한 양방치료와 비교하여 한방치료의 강점의 부각 및 진단과 치료, 처방의 표준화 작업도 뒤따라야 한다. 한방치료를 과학화하기 위하여 기(氣)의 양 및 세기를 정량화할 수 있는 기(氣)측정기구의 개발이 시급하게 요구된다. This investigation was conducted to promote basic research to achieve the safety and efficacy of traditional medicine to ensure the patients receive care with the most favorable risk-to-benefit ratio. It is necessary to enhance standardization and strengthen the advantages of Korean traditional medicine. Globalization of traditional medicine is achieved through accumulation of scientific results of diagnosis, prognosis and presciption. It is urgently needed to develop the measuring instrument of amount and /or strength of Ki (viral energy) for scientification of traditional medicine.

폐타이어공장 폐수의 화학적 처리

유은순 호남대학교 산업기술연구소 2000 산업기술연구논문집 Vol.8 No.-

본 연구에서는 타이어 재활용공장의 폐수처리를 위하여 다양한 배합의 응집제 조건들의 응집특성에 대하여 실험을 실시하였다. 폐수에 대한 시험응집제 조건들의 Jar-test결과, 타이어 재활용공장 폐수의 BOD와 COD수치를 감소시키기 위해서는 다른 조건들보다 AlNa-1와 PASi-1의 두가지 조건이 효율적이었음을 알 수 있었다. AlNa-1와 PASi-1조건의 반응기작에 대한 이론적인 연구도 병행되었다. This study was performed to test the coagulation characteristics of various combinations of coagulants for effective wasterwater treatment of tire recycling industry. From the results of Jar-test, it was found that two kinds of coagulation conditions such as AlNa-1 and PASi-1 were effective to decrease BOD and COD values from the polluted wastewater than the other conditions. The reaction mechanisms of AlNa-1 and PASi-1 were also theoretically studied.

The Repair of O^6-methylguanine in E. coli via the ada^+ encoded Proteins : ada^+ encoded 단백질을 통한 E. coli내 O^6- 메틸구아닌의 Repair

유은순 호남대학교 산업기술연구소 2001 산업기술연구논문집 Vol.9 No.-

E.coli내에서 알킬화 물질에 대한 적응반응에 관여하는 효소들은 여러 가지 독특한 특성을 지닌다. ada+유전자를 바탕으로 생성된 유도단백질은 O6-메틸구아닌과 methylphosphotriester의 한쪽 이성질체를 수선한다. ada+ 유전자 생성물은 독특한 proteolytic절단을 행하여 O6-methylguanine DNA methyl전달효소 I을 생성해 내는데 이는 methylphosphotriesters에 대해서는 활성을 지니지 않는다. 두 효소 모두 자살반응식 형태를 지닌다. In E. coli, the adaptive response to alkylating agents involves enzymes with several unique characteristics. An inducible protein, the ada+ gene product, repairs O6 -methylguanine and one isomer of methylphosphotriesters. The ada+ gene product also undergoes specific proteolytic cleavage to yield O6-methylguanine DNA methyltransferase I, which has no activity toward methylphosphotriesters. Both enzymes exhibit suicidal reaction kinetics.