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배양세포에서 Semi-quantitative RT-PCR에 의한 조류인플루엔자 H9N2의 전사활성 분석 최적 시기 결정 및 전사체 분석
나기윤,이영민,변승준,전익수,박종현,조인수,주이석,이윤정,권준헌,구용범,Na, Gi-Youn,Lee, Young-Min,Byun, Sung-June,Jeon, Ik-Soo,Park, Jong-Hyeon,Cho, In-Soo,Joo, Yi-Seok,Lee, Yun-Jung,Kwon, Jun-Hun,Koo, Yong-Bum 한국미생물학회 2009 미생물학회지 Vol.45 No.3
The transcription of mRNA of avian influenza virus is regulated temporally during infection. Therefore, the measurement of transcript level in host cells should be performed before viral release from host cells because errors can occur in the analysis of the transcript levels if the viruses released from the infected cells re-infect cells. In this study, the timing of viral release was determined by measuring the level of viral RNA from viruses released from H9N2-infected chicken fibroblast cell line UMNSAH/DF-1 by semi-quantitative RT-PCR. The viral genomic RNA was isolated together with mouse total RNA which was added to the collected medium as carrier to monitor the viral RNA recovery and to use its GAPDH as an internal control for normalizing reverse transcription reaction as well as PCR reaction. It was found that viral release of H9N2 in the chicken fibroblast cell line UMNSAH/DF-1 took between 16 and 20 h after infection. We measured all 8 viral mRNA levels. Of the 8 transcripts, 7 species of viral mRNAs (each encoding HA, NA, PB1, PB2, NP, M, NS, respectively) except PA mRNA showed robust amplification, indicating these mRNA can be used as targets for amplification to measure transcript levels. These results altogether suggest that the method in this study can be used for screening antiviral materials against viral RNA polymerase as a therapeutic target. 조류인플루엔자 바이러스 mRNA의 전사는 감염 동안에 시간적으로 조절되어진다. 감염 후 세포 내에서 증식된 바이러스가 방출되어 세포를 다시 감염하게 되면 전사 수준 분석에 오차가 발생할 수 있으므로 바이러스가 방출 되기 이전에 전사 수준의 측정이 이루어져야 한다. 본 연구에서는 조류인플루엔자 H9N2를 감염시킨 닭의 섬유아세포주 UMNSAH/DF-1에서 바이러스 감염 후 증식된 바이러스의 방출까지의 시간을 측정하기 위하여 배양액 중에 방출되는 바이러스 RNA 게놈 수준을 semi-quantitative RT-PCR에 의해 측정하였다. 배양액 중의 바이러스 RNA 게놈의 분리 과정에서 발생할 수 있는 RNA 회수율의 오차를 보정하기 위해 mouse의 전체 RNA를 배양액 시료에 넣어서 바이러스 RNA 분리에 carrier로 사용하고 그 속에 포함된 mouse의 GAPDH를 RNA를 역전사 반응 및 PCR의 내부 대조 RNA로 사용하였다. 그 결과 감염 후 방출까지 16~20시간이 소요됨을 알 수 있었다. 따라서 감염 후 12시간 후에 세포 내에서 합성된 8종의 전사체의 수준을 측정하였다. 8종의 mRNA 중 PA를 제외한 7종의 mRNA (HA, NA, PB1, PB2, NP, M, NS를 암호화하는 mRNA)는 뚜렷한 증폭 band를 보였으며, 이것은 이들이 전사활성 측정에 사용될 수 있는 것으로 나타났다. 이상과 같은 전사수준의 측정 방법은 조류인플루엔자 바이러스의 RNA polymerase를 표적으로 한 항바이러스제의 검색에 사용할 수 있을 것으로 보인다.
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독서를 활용한 수학 수업이 중학생의 정의적 태도에 미치는 영향
나기윤,손홍찬 한국학교수학회 2016 韓國學校數學會論文集 Vol.19 No.1
본 연구에서는 수학과 독서를 활용한 수학 수업이 학생들에게 정의적으로 어떠한 영향을 미치는지 탐구하였다. 중학교 2학년 100명의 남학생을 대상으로 정의적 특성요소로 흥미, 자신감, 가치인식, 자기조절력, 수학 불안 5개 요인을 조사해보고, 상ㆍ중ㆍ하 수준별 학생들에게 수학과 독서수업이 미치는 영향을 탐구하였다. 또 사전․사후 검사 결과와 학생의 인터뷰를 통해 바람직한 독서를 활용 수업 방안을 모색하였다. In this study we explored the effect of reading in mathematics classroom on five mathematical affective characteristics of middle school students. 100 2nd male middle schoolers' were participated in this study and five affective characteristics - interests, self-confidence, recognition of mathematics value, self-regulation, and mathematics anxiety - were investigated. According to the results, reading in mathematics class had an overall positive effect. Especially the characteristics interests and self-confidence of students’ were improved. And for the low level students all characteristics were improved. And based on the result of pre and post test and interview with 6 students, we suggest that desirable reading in mathematics classroom.
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