Gath-Geva 알고리즘을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석

박한샘(Han-Saem Park),유시호(Si-Ho Yoo),조성배(Sung-Bae Cho) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B

다량의 유전자 발현 정보를 담고 있는 DNA 마이크로어레이 기술의 발달로 인해 대량의 생물정보를 한번의 실험을 통해 분석할 수 있게 되었다. 유전자 발현 데이터를 분석하는 방법 중 하나인 클러스터링은 비슷한 기능을 가진 유전자들을 그룹별로 묶어서 그룹 내의 유전자들의 기능을 밝히거나, 미지의 유전자를 분석하는데 이용되고 있다. 본 논문에서는 유전자 발현 데이터를 클러스터링하여 그로부터 유전 정보를 찾아내기 위한 방법으로 GG (Gath-Geva) 알고리즘을 제시한다. 퍼지 클러스터링 알고리즘중 하나인 GG 알고리즘은 대표적인 퍼지 클러스터링 방법인 퍼지 c-means 와 GK (Gustafson-Kessel) 알고리즘을 개선한 것으로, 차원이 크고 분포가 애매하여 클러스터링이 어려운 유전자 발현 데이터의 클러스터링에 적합한 알고리즘이다. 혈청(Serum) 유전자 데이터와 효모(Yeast) 세포주기 데이터를 GG 알고리즘 이용해 클러스터링 해 보고, 그 결과를 퍼지 c-means 알고리즘, GK알고리즘과 비교해 본 결과, GG 알고리즘이 유전자 발현 데이터의 클러스터링에 더 적합함을 확인하였다.

소셜 네트워크 서비스에서 집단 공통 관심사의 추천 방법

박한샘(Park Hansaem),권경락(Kwon Kyunglag),최윤준(Choi Yoonjun),강대현(Kang Daehyun),이정민(Lee Jeungmin),정인정(Chung In-Jeong) 한국통신학회 2015 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2015 No.1

다기준 의사 결정 방법을 이용한 모바일 환경에서의 정보추천

박한샘(Han-Saem Park),박문희(Moon-Hee Park) 한국정보과학회 2008 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지 Vol.14 No.3

정보추천 서비스를 위한 선호도는 상황에 따라 달라질 수 있으므로, 정보추천 서비스를 제공하기 위해서는 먼저 사용자의 컨텍스트 정보를 알아야 한다. 본 논문은 모바일 환경에서 다수 사용자의 선호도를 고려한 추천 시스템을 제안하며, 음식점 추천에 이를 적용하고자 한다. 모바일 환경에서 개별 사용자의 선호도를 모델링하기 위해 베이지안 네트워크를 사용하였으며, 음식점 추천은 많은 경우 개별 사용자가 아닌 다수 사용자의 선호도를 고려해야 하므로, 본 논문에서는 개별 사용자의 선호도를 바탕으로 다수의 선호도를 획득하기 위해 다기준 의사결정방법인 AHP를 이용하였다. 실험을 위해서 10가지 서로 다른 상황에서 추천을 수행하였으며, 마지막으로 SUS 사용성 평가를 통해 제안하는 시스템의 사용성이 높게 평가되었음을 확인하였다. Since the preference for information recommendation service can change according to the context, we should know the user context before providing information recommendation. This paper proposes recommender system that considers multi-user preference inmobile environment and attempted to apply it to restaurant recommendation. To model the preference of individual users in mobile environment, we have used Bayesian network, and restaurant recommendation mostly should consider not an individual user but several users, so this paper has used AHP of multi-criteria decision making process to obtain the preference of several users based on one of individual users. For experiments, we conducted recommendation in 10 different situations, and finally, we confirmed that the proposed system was evaluated as a good one using a usability test of SUS.

소셜 네트워크 구성을 위한 모바일 컨텍스트 설계 및 수집

박한샘(Han-Saem Park),정태민(Tae-Min Jung),조성배(Sung-Bae Cho) 한국정보과학회 2009 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.36 No.2B

최근 스마트폰이나 PDA와 같은 모바일 디바이스가 널리 보급되었으며, 또한 개인화 장비기술이 발달하면서 모바일 디바이스가 카메라, MP3 플레이어 등 다양한 기능을 포함하게 되었다. 이와 함께 대부분의 사용자가 보유하고 있는 모바일 디바이스는 사용자가 항상 휴대하고 다니며, 여러가지 센서를 포함하고 있어 사용자의 다양한 컨텍스트 정보를 수집하기에 매우 유용한 도구가 되었다. 본 논문에서는 이러한 모바일 디바이스를 이용하여 사용자의 다양한 컨텍스트를 수집하기 위한 방법을 제시한다. 수집된 모바일 컨텍스트는 다양한 연구를 위해 활용될 수 있는데, 본 논문에서는 모바일 소셜 네트워크 구성을 주요 목적으로 하였으며 설계 또한 이러한 목적을 고려하여 이루어졌다. 마지막으로 제시된 방법을 통해 실제로 수집된 컨텍스트를 소개하고, 향후 어떤 연구를 위해 활용될 수 있는지를 기술한다.

생분해성 PLA-PBAT 블렌드 필름을 이용한 친환경 포트의 특성 연구

박한샘 ( Han Saem Park ),강재련 ( Jae Ryeon Kang ),송강엽 ( Kang Yeop Song ),서원준 ( Wonjun Seo ),이선주 ( Seonju Lee ),이원기 ( Won Ki Lee ) 한국환경과학회 2015 한국환경과학회지 Vol.24 No.8

Since single-use disposable plastic usage has steadily been increasing, recent trends in polymeric research point to increasing demand for eco-friend materials which reduce plastic waste. A huge amount of non-degradable polypropylene (PP)-based pots for seedling culture are discarded for transplantation. The purpose of this study is to investigate an eco-friendly biodegradable material as a possible substitute for PP pot. The blend of poly(lactic acid) (PLA) with poly(butylene adipate-co-terephthalate) (PBAT) was used because of its good mechanical and flexible properties as well as biodegradation. After landfill, various properties of the blend pot were investigated by UTM, SEM, NMR and TGA. The results showed the tensile strength of the blend film rapidly decreased after 5 weeks of landfill due to degradation. From NMR data after landfill, the composition of PLA in the blend was decreased. These results indicate that the biodegradation of the blend preferentially occurs in PLA component. To investigate the effect of holes in pot bottom and side on root growth, a plant in the pot was grown. Some roots came out through holes as landfill period increases. These results indicate that the eco-friendly pot can be directly planted without the removal of pot.

진화연산과 적응적 α-cut 기반 평가를 이용한 유전자 발현 데이타의 퍼지 클러스터 분석

박한샘(Han-Saem Park),조성배(Sung-Bae Cho) 한국정보과학회 2006 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 Vol.33 No.8

유전자 데이타의 클러스터링은 방대한 유전자 정보를 발현 정도에 따라 비슷한 그룹으로 나누어 분석하는 방법으로 유전자의 기능을 분석하는데 사용되어 왔다. 클러스터링의 한 종류인 퍼지 클러스터링은 하나의 샘플이 소속정도에 따라 여러 그룹에 동시에 소속되도록 나누는 방법으로, 하나의 유전자 데이타는 여러가지 유전 정보를 가질 수 있기 때문에 유전자 발현 데이타의 분석에 보다 적절한 방법이다. 그러나 보통 클러스터링 방법은 초기 값에 민감하고, 지역해에 빠질 수 있는 단점을 갖는다. 이런 단점을 해결하기 위해 본 논문에서는 진화 연산을 이용한 퍼지 클러스터링 방법을 제안한다. 이때, 적합도 평가를 위해서 모든 데이타에 대해 동일한 기준을 적용하는 베이지안 검증방법의 단점을 개선하여, 데이타의 특성을 고려하여 결정된 적응적 α-cut 기반 평가방법을 사용한다. SRBCT 데이타와 효모 세포주기 데이타를 이용해 실험을 하고 결과를 분석하여 제안하는 방법의 유용성을 확인하였다. Clustering is one of widely used methods for grouping thousands of genes by their similarities of expression levels, so that it helps to analyze gene expression profiles. This method has been used for identifying the functions of genes. Fuzzy clustering method, which is one category of clustering, assigns one sample to multiple groups according to their degrees of membership. This method is more appropriate for analyzing gene expression profiles because single gene might involve multiple genetic functions. Clustering methods, however, have the problems that they are sensitive to initialization and can be trapped into local optima. To solve these problems, this paper proposes an evolutionary fuzzy clustering method, where adaptive ?-cut based evaluation is used for the fitness evaluation to apply different criteria considering the characteristics of datasets to overcome the limitation of Bayesian validation method that applies the same criterion to all datasets. We have conducted experiments with SRBCT and yeast cell-cycle datasets and analyzed the results to confirm the usefulness of the proposed method.

순차적 냉동 사이클의 성능에 대한 실험적 연구

박한샘(Hansaem Park),장세동(Se-Dong Chang),정백영(Baikyoung Chung),김민수(Min Soo Kim) 대한설비공학회 2016 대한설비공학회 학술발표대회논문집 Vol.2016 No.11

Sequential Carnot cycles have been suggested as the new reference thermodynamic cycle since the temperature change of heat sources and their limited heat capacity can be applied in the cycle. From several researches about this cycle, it is introduced that the efficiency of the system increases along the number of individual cycles in the sequential system. Therefore, in this study, the performance of sequential refrigeration systems is investigated by experiments. The experimental setup for both a single refrigeration system and a sequential refrigeration system is installed as a water to water heat pump and the efficiency of two systems at the same capacity condition is compared. From the result of experiments, it is found that the sequential refrigeration system has an advantage of efficiency over the single refrigeration system about 0 to 16 percent and this advantage becomes more significant if the heat source of the cycle experiences bigger temperature change. Moreover, the reason of it is analyzed from a thermodynamic point of view.

당뇨병의 예측을 위한 분류기 앙상블의 BKS 결합

박한샘(Han-Saem Park),조성배(Sung-Bae Cho) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.2Ⅱ

경제 여건의 향상 및 생활양식의 변화로 최근 우리나라에서도 당뇨병 환자가 늘어남에 따라 당뇨병의 예측 및 치료가 중요한 관심사가 되고 있다. 본 논문은 1993년과 1995년 두 차례에 걸쳐 경기도 연천 지역 주민들의 여러 가지 신체 지수 등을 조사한 데이터를 대상으로, 1차 년도의 데이터로부터 동일한 환자가 2차년도에 정상상태를 유지하는지 혹은 당뇨병으로 진행이 되는지를 예측하는 문제를 다룬다. 혈당량, 허리둘레 등의 수치가 당뇨병의 발병에 영향을 끼치는 것은 알려진 사실이므로, 현재의 데이터로부터 앞으로의 발병 가능성을 예측하는 것이 가능하며, 이는 환자에게 보다 정확한 정보를 알려줄 수 있으므로 의미가 있는 일이다. 예측을 위해 본 논문에서는 분류기를 사용하며, 예측율을 높이기 위해 여러 분류기를 BKS로 결합하였다. BKS(behavior knowledge space) 결합 방법은 분류기간의 독립 가정이 필요 없으며, 데이터 크기가 크고 전형적인 경우에 좋은 결과를 낼 수 있는 방법이다. BKS 결합 방법을 통해 실험을 해 본 결과 단일 분류기로 실험을 한 결과보다 향상된 성능을 얻을 수 있었으며, 투표 결합 방법과 비교하여 더 좋은 성능을 보였다.

캐스케이드 열펌프 냉온수기의 준-동적 해석

박한샘(Hansaem Park),김동호(Dong Ho Kim),김민수(Min Soo Kim) 대한설비공학회 2012 대한설비공학회 학술발표대회논문집 Vol.2012 No.11

The cascade heat pump water heater, which has been developed for compensating the weaknesses of conventional heat pump water heaters, is expected to fill the residential hot water demand in a more efficient and eco-friendly way. In this study, a semi-transient model of a cascade system with R134a and R410A is designed to investigate the performance and transient behavior of the system. For the simulation of a heat pump, the experimental result obtained in a steady state condition is utilized. In addition, the one-dimensional turbulent mixing model is used to study thermal behavior of water with a storage tank.

천연가스를 이용한 S-CO₂ 사이클 구동 히트펌프에 대한 개념 설계 및 열역학적 해석

박한샘(Hansaem Park),김민수(Min Soo Kim) 대한설비공학회 2013 대한설비공학회 학술발표대회논문집 Vol.2013 No.11

To handle recent electric power shortage, the use of natural gas equipment for air-conditioning and heating has been encouraged in Korea. However, its performance and supply status have not been satisfactory until now. Therefore, in this study, the new type of natural gas equipment for air-conditioning and heating is designed and proposed with the concept of a supercritical carbon dioxide Brayton cycle(S-CO₂ cycle) introduced. Also, considering fundamental thermodynamic law and properties of operating fluids, the efficiency and performance characteristics of this system are analyzed.