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재래흑염소 개체식별과 친자확인을 위한 Microsatellite Marker Set 개발
이상훈(Sang-Hoon Lee),강호찬(Ho-Chan Kang),이성수(Sung-Soo Lee),이진욱(Jinwook Lee),김은호(Eun-Ho Kim),명철현(Hyun-Cheol Myung),김관우(Kwan-Woo Kim),임현태(Hyun-Tae Lim) 한국생명과학회 2020 생명과학회지 Vol.30 No.10
본 연구는 재래흑염소와 교잡종 염소 총 304두를 대상으로 Microsatellite (MS) marker의 대립유전자형 분석을 통해 염소의 개체식별과 친자확인을 목적으로 실시하였다. 각 MS marker 별 대립유전자형의 다형성을 토대로 11종의 MS marker를 선발하였다. 선발된 MS marker를 사용할 경우 동일한 유전자형을 가진 개체가 출현할 확률이 무작위, 반형매 교배집단에서 각각 5.58×10<SUP>-10</SUP>, 1.15×10<SUP>-7</SUP>으로 분석되었다. 또한 친자감정 확률은 부모의 정보가 있을 경우 0.999996, 부모의 정보가 없을 경우 0.999833으로 분석되어 국내에서 사육하고 있는 염소들의 개체식별 및 친자확인이 가능할 것으로 사료된다. 또한 국내 재래흑염소 4 계통과 교잡종 염소들 간의 혈연관계 분석을 통해 국내 재래흑염소의 유전적 특성을 확인하였다. 본 연구의 결과는 염소의 개량 기반 구축에 필요한 개체관리와 친자감별 및 향후 염소고기의 생산 이력 구축에 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 판단된다. The Korean native black goat (Capra hircus coreanae) is the goat species to be officially registered in Korea under the Food and Agriculture Organization. The object of this study is to establish a set of microsatellite (MS) markers for the individual identification and parentage verification of goats. In this study, we analyzed alleles of MS markers in crosses between Korean native black goats and crossbred goats (n=304 animals), and, based on the diversity of alleles for each marker, we selected 11 MS markers for individual identification and parentage verification. Using these 11 MS markers, the probabilities of different individuals with the same genotype being found within random and half-sib mating populations were 5.58×10<SUP>-10</SUP> and 1.15×10<SUP>-7</SUP>, respectively. The parentage verification accuracy was 0.999996 when information about the parents was available and 0.999833 with no information. Thus, even given the total rearing population of 576,150 animals in South Korea, we concluded that these markers could be used for the individual identification and parentage verification of goats. Moreover, by analyzing the genetic relationships between the four lines of Korean native black goats and the crossbred goats, we verified the genetic characteristics of Korean native black goats, confirming their conservation value as a unique genetic resource.
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