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꾸지뽕나무의 ITS 영역 염기서열 분석에 의한 유연관계 분석
오찬진 ( Chan Jin Oh ),이솔 ( Sol Lee ),권용석 ( Yong Seok Kwon ),유한춘 ( Han Choon You ),유석봉 ( Suk Bong Ryu ),위안진 ( Anjin Wi ) 전북대학교 농업과학기술연구소 2012 농업생명과학연구 Vol.43 No.2
꾸지뽕나무를 8개 집단에서 암·수나무를 구별하여 ITS1, 5.8S 그리고 ITS2 영역의 염기서열을 비교분석하여 유연관계를 조사한 결과 전체 719 bp의 염기가 밝혀졌으며 ITS1 영역은 231 bp, 5.8S 영역은 158 bp 그리고 ITS2 영역은 239 bp로 나타났다. 분자학적 유연관계는 나주지역의 암·수나무 개체와 진주의 수나무 개체, 홍성의 수나무 개체, 보령의 수나무 개체 및 고흥의 암나무 개체의 염기서열이 100%의 유의성을 보였으며 이들과 군산의 암나무 개체와 순창지역의 수나무 개체와는 99.8%의 유의성을 보였으며 순창지역의 암나무 개체와는 99.4%의 유의성을 보였다. 임실지역의 암·수나무 개체간에는 99.8%의 유의성을 보였다. 뽕나무(FJ599759)의 염기서열과 비교분석결과는 64.7%의 유연관계를 나타내 뽕나무와 꾸지뽕나무 간에는 분자학적 유연관계가 아주 낮은 것으로 나타났다. 그러나 꾸지뽕나무 개체 간에는 염기서열의 변이가 적어 유전적으로 유의성이 매우 높은 것으로 나타났다. The comparison of the internal transcribed spacer (ITS) sequences of nuclear rDNA of 8 distingushed male and female of Cudrania tricuspidata (Call.) Bureau were made for the genetic analysis. The length of total nuclear DNA was showed 717 nt and including 231 nt of ITS1 gene, 158 nt of 5.8S gene and 239 nt of ITS2 gene. Based on the sequence analysis of amplified ITS gene region, the homologies were showed 100% from male and female of Naju, male of Jinu, Hongseong, Boryeong and female of Goheung plant. However, these palnts showed 99.8% and 99.4% homologies with those of female of Gunsan, male of Sunchang and female of Sunchang plants, at nucleotide level, respectively. The female and male of Imsil plants showed 99.8% homologies. The homologies between Cudrania tricuspidata and Molrus alba (Genebank accession number FJ599759) palnts showed 66.7%. The results suggested that Cudrania tricuspidata were distinct from Molrus alba and showed very close relationship between Cudrania tricuspidata plants at the nucleotide level of ITS region.
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