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최아영,백기운,정유진,김지환,최강국,Choi, Ahyoung,Baek, Kiwoon,Chung, Eu Jin,Kim, Jee-Hwan,Choi, Gang-Guk The Microbiological Society of Korea 2017 미생물학회지 Vol.53 No.4
그람 음성이며 긴 막대 모양의 betaproteobacteria에 속하는 GR16-43을 한강 발원지 검룡소에서 분리하였다. GR16-43 균주에 대한 유전체분석을 실시하였으며, G + C 비율이 67.12%인 4,806,848 bp 크기의 염기서열을 얻었다. 유전체 특징은 황산화와 관련된 다량의 유전자를 보유하고 있어 균주의 잠재적 중요성을 보여준다. 이러한 결과는 GR16-43 균주가 빈영양 담수 환경에서의 적응 연구를 위한 유전체 정보를 제공한다. A betaproteobacterium strain GR16-43 was isolated from a surface layer of the Geomnyong Pond in Republic of Korea by a dilution-to-extinction culturing method. We report the whole genome sequence of the strain GR16-43, which contains 4,806,848 bp with a G + C content 67.12%, and to include 4,424 protein-coding genes and 47 transfer RNA genes. The genome was determined to contain the genes encoding carbon monoxide dehydrogenase, nitrate reductase, nitrite reductase, nitric oxide reductase, and the sulfur oxidation (sox) gene cluster, highlighting the potential importance of the bacterial group represented by the strain in the cycling of inorganic elements. These results indicate that strain GR16-43 genome showed several traits indicating adaptation of the bacteria to living in freshwater environments.
최아영,정유진,남영호,최강국,Choi, Ahyoung,Chung, Eu Jin,Nam, Young Ho,Choi, Gang-Guk The Microbiological Society of Korea 2017 미생물학회지 Vol.53 No.4
그람 음성이며 막대모양의 Sphingobacteriaceae bacterium SH-48은 삼척 소한천에서 분리하였다. SH-48에 대한 유전체 분석을 실시하였으며, G + C 비율이 38.4%인 5,650,162 bp 크기의 염기서열을 얻었다. 유전체 특징은 카로티노이드 생합성 유전자인 crt 유전자 클러스터를 보유하고 있어 균주의 잠재적 중요성을 보여준다. 이러한 유전체 정보는 카로티노이드 생합성 경로에 대한 새로운 정보를 제공한다. We sequenced the genome of the Sphingobacteriaceae bacterium SH-48 isolated from the Sohan stream in Republic of Korea by using a dilution-to-extinction culturing method. The sequences were assembled into a draft genome containing 5,650,162 bp with a G + C content of 35.4% and 4,856 protein-coding genes in 2 contigs. This strain contains the carotenoid biosynthesis genes crtY, crtZ, crtD, crtI, crtB, and crtH as gene clusters. This genomic information provides new insights into the carotenoid biosynthesis pathway.
최아영(Ahyoung Choi) 한국컴퓨터그래픽스학회 2016 컴퓨터그래픽스학회논문지 Vol.22 No.5
최근 인간과 에이전트 간의 감성적인 상호작용을 지원하기 위해 에이전트의 기쁨, 슬픔 등의 얼굴 표정에 대한 사용자의 반응을 분석하는 연구들이 진행되었다. 그러나 기존의 연구에서는 사용자가 긍정적 혹은 부정적으로 평가하는 지를 검증하기 위해 주로 설문지를 통해 사용자 피드백을 획득하는 방법을 사용하였다. 본 연구에서는 인간과 에이전트 상호작용에서 에이전트의 얼굴 표정에 대한 사용자의 생체신호를 측정하여 감성적인 영향이 있는지 살펴보았다. 일관성 있는 생체 신호 해석 결과를 도출하기 위해 실시간으로 심박수와 피부전도도 등의 생체 신호를 획득하고, 명시적 혹은 비명시적인 피드백 분석방법을 통합하여, 해석을 안정적으로 하도록 하였다. 실험결과 에이전트의 긍정(혹은 부정)적인 얼굴 표정이 사용자의 긍정(혹은 부정)적인 반응을 이끌어 냄을 확인할 수 있었다. 또한, 인간과 에이전트와의 상호작용에서도 인간과 인간의 상호작용과 유사하게 에이전트의 긍정적인 얼굴 표정이 사용자의 부정적인 감정을 감소시킴을 확인할 수 있었다. 본 연구는 인간과 에이전트의 감성적인 상호작용을 위해 에이전트의 얼굴 표정을 디자인하기 위한 근거로 활용할 수 있다. This study evaluate user feedback such as physiological response and facial expression when subjects play a social decision making game with interactive virtual agent partners. In the social decision making game, subjects will invest some of money or credit in one of projects. Their partners (virtual agents) will also invest in one of the projects. They will interact with different kinds of virtual agents which behave reciprocated or unreciprocated behavior while expressing socially affective facial expression. The total money or credit which the subject earns is contingent on partner’s choice. From this study, I observed that subject’s appraisal of interaction with cooperative/uncooperative (or friendly/unfriendly) virtual agents in an investment game result in increased autonomic and somatic response, and that these responses were observed by physiological signal and facial expression in real time. For assessing user feedback, Photoplethysmography (PPG) sensor, Galvanic skin response (GSR) sensor while capturing front facial image of the subject from web camera were used. After all trials, subjects asked to answer to questions associated with evaluation how much these interaction with virtual agents affect to their appraisals.
개인화된 신호 해석을 위한 맥락 기반 생체 신호의 모델링 기법
최아영(Ahyoung Choi),우운택(Woontack Woo) 한국HCI학회 2009 한국HCI학회 학술대회 Vol.2009 No.2
일상생활에서 활용 가능한 다양한 종류의 생체 신호 획득 및 분석 방법이 연구되고 있다. 기존의 생체 신호 분석 방법은 표준화된 임계치를 사용하여 해석한 결과를 제공하며 신호 측정 당시의 상황이 고려되지 않아 잡음 혹은 외부 환경의 영향을 받기 쉬운 단점이 있다. 본 논문에서는 생체 신호뿐만 아니라 기타 정황정보를 기반으로 하여 개인화된 신호를 분석하기 위한 모델(Personalized Decision Making method, PDM)을 제안한다. 개인화된 신호해석 모델은 사용자의 맥락 정보, 사용자의 맥락 정보, 사용자의 나이, 성별, 현재의 몸 및 정신 상태, 음식 및 카페인의 섭취 여부, 측정 시간 및 측정 요일 등을 기반으로 각 맥락 간의 연관 관계를 나타내고, 이상적인 사용자의 생체 신호 예측치를 베이즈 정리를 기반으로 획득한다. 개인화된 해석 모델(ACM)을 통해 표준 임계치를 적용한 해석에 비해 인식의 정확도를 높일 수 있으며, 다양한 측정시의 조건을 알면 현재 사용자의 건강상태를 개인화된 분석과 유사한 정확도로 예측이 가능하다. 제안한 방법은 현재 관측된 관측치의 분포를 모르더라도, 현재 사용자의 상태를 맥락정보를 기반으로 하여 예측할 수 있으므로, 일반적인 데이터 모델을 기반으로 개개인에 맞는 얼굴 표정을 인식하는 연구 등에 활용이 가능하다. With the advent of light-weight daily physiological signal monitoring sensors, intelligent inference and analysis method for physiological signal monitoring application, commercialized products and services are released. However, practical constraints still remain for daily physiological signal monitoring. Most devices provide rough health check function and analyze with randomly sampled measurements. In this work, we propose the probabilistic modeling of physiological signal analysis. This model represent the relationship between previous user measurement (history), other group's type, model and current observation. From the experiment, we found that the personalized analysis with long term regular data shows reliable result and reduces the analyzing errors. In addition, participants agree that the personalized analysis shows reliable and adaptive information than other standard analysis method.
최아영(Ahyoung Choi),우운택(Woontack Woo) 한국정보과학회 2005 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.32 No.1
본 논문에서는 한의학의 관점에서 몸과 마음의 상호작용에 대한 이론에 기반하여 사용자의 주의를 파악하기 위해 필요한 생체 신호의 센싱방법을 제안한다. 생체 신호는 음양오행의 각 부분의 반응을 살필 수 있는 체표의 자극 반응점인 경혈점에서 GSR을 이용하여 측정한다. 제안된 방법은 기존의 서양의학에 기반한 생체 신호 특징 분석을 다른 관점에서 해석할 수 있는 틀을 마련한다. 추출된 생체신호는 감정, 의도 분석에 활용될 수 있으며 추후 유비퀴터스 컴퓨팅 환경에서 인간과 컴퓨터간의 원활한 상호작용을 위한 개인화된 인터페이스 제공에 사용될 수 있다.