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유전자 상호작용 데이타베이스 SOAP 서버 객체 모델의 설계 및 구현
이호일(HO IL LEE),유성준(Seongjoon Yoo),김민경(Minkyung Kim) 한국정보과학회 2005 정보과학회논문지 : 데이타베이스 Vol.32 No.2
최근 주요 생물정보학 데이타베이스 중 DDBJ, ENSEMBL, KEGG, 등의 데이타베이스는 연구자들의 편의를 위해 데이타와 분석용 도구들을 웹 서비스를 이용하여 제공한다. 이와 같이 웹 서비스를 이용하여 서비스를 제공하기 위해서는 SOAP 서버 객체와 메소드 정의가 매우 중요하다. 이 연구에서는 BIND, MINT, DIP과 같은 유전자 상호작용 데이타베이스를 위해서 필요한 SOAP 서버 객체에 대한 요구사항을 도출한다. 이어서 이 요구사항을 만족하는 SOAP 서버 객체와 메소드를 정의하였다. 이를 기반으로 프로토타입을 설계하고 구현한 것에 대하여 기술한다. Recently main Bioinformatics databases(DDBJ, ENSEMBL, KEGG, etc.) provide analysis tools and data using web services for the convenience of bioinformaticians. Thus, defining SOAP server objects and their methods are very important to provide services for web services. We define SOAP server objects for interaction databases such as BIND, MINT and DIP.
Pathway Database 통합 활용을 위한 웹 서비스 환경 구축
이호일(HOIL LEE),유성준(Seongjoon Yoo),김민경(Minkyung Kim),박현석(Hyun Seok Park) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B
최근 pathway 정보의 중요성이 점점 커지고 있다. 하지만 이런 정보를 이용하기에 많은 문제점이 발생하고 있다. 이런 문제점의 해결 방법으로 웹 서비스가 도입되고 있다. 이 논문에서는 주요 pathway 데이터베이스 중 하나인 BIND와 체계적인 개념으로 유전자 용어를 정리한 Gene Ontology(GO)에 대한 웹 서비스를 개발하였다. 개발자들은 이 웹 서비스를 이용하여 BIND와 GO 데이터를 보다 쉽게 이용할 수 있을 것이다.
최요한(Yohan Choi),유성준(Seongjoon Yoo),김민경(Minkyung Kim),박현석(Hyun Seok Park) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B
최근 웹 서비스 기술을 이용하여 바이오 데이터 및 데이터 메소드를 제공하는 것과 관련된 연구 들이 진행되고 있다. 웹 서비스 기반 바이오 데이터 서비스에 대한 연구 자료는 시스템 구조 및 API 등을 중심으로 보고되고 있으나 이를 기반으로 한 통합 응용 도구 개발 관련 연구는 미미한 실정이다. 이에 따라 이 논문에서는 웹 서비스 API 등을 이용하여 바이오인포매틱스 연구자들이 이용할 수 있는 데이터 통합, 검색, 브라우징 기능을 제공하는 분석 도구를 개발하였다. 사용자는 이 도구를 이용하여 바이오 데이터 간의 상호연관성을 보다 쉽게 발견할 수 있으며 보다 다양한 검색 결과를 여러 가지 형태로 볼 수 있게 될 것이다.