http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
미토콘드리아 DNA에 의한 붕넙치과(科) 어류 4종간(種間)의 염기치환수(鹽基置換數)
박중연 ( Jung Youn Park ),김윤 ( Yoon Kim ) 한국수산학회 1995 한국수산과학회지 Vol.28 No.5
붕넙치科 어류의 종간에 있어서의 유전적 분화정도를 DNA level에서 관찰하기 위하여 참가자미, 문치가자미, 돌가자미, 강가자미의 미토콘드라아 DNA를 분리하고, 6鹽基認識의 14제한효소로써 절단한 절단단편의 鹽基置換數를 계산하였다. 1) mtDNA 총염기대수는 4종 모두 17.6kbp 부근으로 나타나 동일한 염기대수를 가지는것으로 추정되었다. 2) 14종류의 제한효소로써 절단한 절단단편의 pattern으로 4종의 종내 및 종간의 haplotype수를 조사한 결과, 참가자미에서는 10개, 문치가자미에서는 4개, 강가자미에서는 2개, 돌가자미에서는 1개의 haplotype이 관찰되었으며, 종간에 있어서는 공통적인 haplotype가 전혀 관찰되지 않았다. 3) mtDNA의 유전적 변이성을 나타내는 haplotype 다양도(h)는 참가자미에서 0.588, 문치가자미에서 0.371로 나타나 참가자미에서 높은 변이성을 나타내었다. 4) 4종의 유전적 분화의 정도를 mtDNA haplotype간의 제한 부위당 염기치환수(d)로써 살펴 본 결과, 종내의 平均은 0.0045, 종간의 平均은 0.0344, 속간의 평균은 0.0457로 되어 종간, 속간의 값이 종내에 비해 현저하게 높은 수치를 나타내었다. 5) 4種間의 mtDNA haplotype는 1개 또는 2개의 염기치환에 의한 差異가 아니고 遺傳的 불연속을 나타내었다. In order to estimate the level of genetic differences among the pleuronectid species, mitochondrial DNAs were isolated from four species: brown sole, Limanda herensteini; marbled sole, Limanda yokohamae; stone flounder, Kareius bicoloratus; starry flounder, Platichthys stellatus, and the number of nucleotide substitutions was calculated by the restriction fragment length polymorphisms (RELPs) generated by 14 six base recognition restriction endonucleases. Total lengths of the mitochondrial DNA were measured as about 17.6kbp in all species. Ten different composite genotypes were observed in brown sole, four different genotypes in marbled sole, and two different genotypes in starry flounder. However, only one genotype was observed in stone flounder. The calculated haplotypic diversity value of brown sole was higher than that of marbled sole. The average number of nucleotide substitutions per sites in four species was estimated to be 0.0045 in the intraspecies, 0.0344 in the interspecies, and 0.0457 in the genera, respectively. From these results, we could estimate that the genetic differences among interspecies were not influenced by nucleotide substitutions but genetical discontinuous.
2007-2009년 매물도에서 새우조망에 의한 어류 종조서의 연변동
박중연 ( Jung Youn Park ),강현숙 ( Hyun Sook Kang ),강정하 ( Jung Ha Kang ),김진구 ( Jin Koo Kim ),유정화 ( Jung Hwa Ryu ),김동선 ( Dong Sun Kim ) 한국수산과학회 2013 한국수산과학회지 Vol.46 No.5
We investigated yearly fluctuation of the fish species composition of beam trawls off Maemuldo in the east southern sea of Korea, from March 2007 to November 2009. A total of 75 fish species were collected during the period. The number of fish species accumulated amounted to 54, 64 and 75 species in 2007, 2008 and 2009, respectively. The number of newly occurring species increased with time. The number of expected resident species in Maemuldo was estimated as 9 species including Conger myrister, Okamejei kenojei and Pholis nebulosa,each of which appeared more than 14 out of a total 27 times. Cluster analysis showed that the years 2007 and 2008 were closely clustered,while the year 2009 was distantly clustered with 2007 and 2008. This may be due to the high catch ratio of Clidoderma asperrimum in 2009alone, when a low water temperature phenomenon was observed unlike the situation in 2007 and 2008.
경상북도 후포와 강원도 장호에서 정치망으로 채집된 어류 종조성 비교
강정하 ( Jung Ha Kang ),김이경 ( Yi Gyeong Kim ),박중연 ( Jung Youn Park ),김진구 ( Jin Koo Kim ),유정화 ( Jung Hwa Ryu ),강충배 ( Chung Bae Kang ),박정호 ( Jeong Ho Park ) 한국수산과학회 2014 한국수산과학회지 Vol.47 No.4
Two major temperature fronts, the Subpolar (Gosung, Gang-won-do; 38°-41° N) and Thermal (Jukbyun, Gyeong-sang-buk-do; 36°-37° N) fronts, are found in the East Sea along the east coast of Korea. These are located roughly where the Tsushima Warm Current and North Korea Cold Current intersect. To clarify the effect of the Thermal Front, we investigated seasonal variation in fish species composition using set nets in two areas located north (Jangho, Gang-won-do) and south (Hupo, Gyeong-sang-buk-do) of Jukbyun, Gyeong-sang-buk-do, and compared the sea water temperature and salinity. We collected a total of 38 fish species in Hupo and 25 in Jangho. Trachurus japonicus was the most common species at both sites, but the subdominant species differed. At Hupo, the subdominant species were Konosirus punctatus and Diodon holocanthus, whereas Clupea pallasii and Scomber japonicus were subdominant at Jangho. Based on Froese and Pauly (2014), subtropical fishes accounted for 55% of fish in Hupo but only for 33% in Jangho. The difference in fish species composition was most obvious in May and August. According to the Korea Hydrographic and Oceanographic Administration, sea surface temperature and salinity were slightly higher at Hupo than at Jangho. Our findings suggest that the oceanographic boundary resulting from the Thermal Front near Jukbyun, Gyeong-sang-buk- do may have a major effect on the distribution of migratory fish species.
다중 PCR 분석법을 이용한 전갱이속 어종의 신속한 종판별 분석법 개발
박연정(Yeon Jung Park),이미난(Mi Nan Lee),김은미(Eun Mi Kim),노은수(Eun Soo Noh),노재구(Jae Koo Noh),박중연(Jung Youn Park),강정하(Jung-Ha Kang) 한국생명과학회 2018 생명과학회지 Vol.28 No.9
국제 무역 및 전세계 수산물 소비의 증가로 인해 다양한 수산물이 국내로 수입되어 유통되고 있다. 최근 수입수산물의 종명 및 원산지 표시사항을 허위로 기재하는 경우가 급증하여 식품안전성에 심각한 문제가 야기되고 있다. 불법적으로 유통되는 수산물의 안전관리를 위해 DNA 기반 기술을 이용한 종 판별법 마련이 시급하다. 본 연구에서는 전세계적으로 중요한 대형선망어업 어종 중 하나인 전갱이속 어류의 종을 판별하기 위해 duplex-PCR을 사용한 검출 방법을 개발하였다. 국내에 유통되는 T. japonicus과 T. novaezelandiae의 시료를 확보하여 COI 영역의 염기서열 분석을 통하여 종간 특이성을 나타내는 단일염기다형성 유전자를 탐색하였으며, PCR 증폭 산물의 크기를 고려하여 2개의 종 특이적인 정방향 primer를 설계하였다. Duplex-PCR 분석 결과, T. japonicus (103 bp), T. novaezelandiae (214 bp)와 같은 단일 밴드를 전기영동상에서 확인 할 수 있었으며 상호간의 비 특이적 밴드는 형성되지 않았다. 또한 duplex-PCR 방법을 통한 T. japonicus과 T. novaezelandiae에서 최저 0.01 ng/μl까지 검출됨을 확인 할 수 있었다. 따라서 본 연구에서 개발된 duplex-PCR 분석법을 이용한 전갱이속 어류의 종 판별법은 정확도와 민감도가 우수하여 수산물의 수출입 및 시중에 불법적으로 유통 가능성이 있는 제품을 신속하고 과학적으로 판별할 수 있어 수산물안전관리에 활용도가 매우 클 것으로 기대된다. Reliable labeling of fish products can reassure consumers regarding the identity and quality of seafoods. Therefore, techniques that can identify adulteration or mislabeling are valuable. To rapidly identify two Trachurus species, Trachurus japonicus and Trachurus novaezelandiae, a highly efficient, rapid, duplex polymerase chain reaction (PCR) having two species-specific primers simultaneously was identified. This species-specific primer focused on a single nucleotide mismatch in the 3’-terminal base of a primer designed in the mitochondrial cytochrome c oxidase (COI) subunit I DNA. To optimize the duplex PCR condition, gradient PCR reactions were conducted to determine the primer annealing temperature and the primer concentration. The PCR’s product was observed on the gel, suggesting that DNA molecules may be useful in differentiating the two species. The length of the amplification fragments were 103 bp for Trachurus japonicus and 214 bp for Trachurus novaezelandiae, which, along with the species-specific primer visualized by agarose gel electrophoresis, enabled accurate distinction of the species of the Trachurus genus. These results indicate that the duplex PCR, which has a species- specific primer based on single nucleotide polymorphism (SNP), can be useful for rapidly differentiating the two species of Trachurus. This duplex PCR analysis is simple, rapid, and reliable, and could be beneficial to protecting consumers’ rights.
Mi-Jung Kim(김미정),Kyung Kil Kim(김경길),Jung-Youn Park(박중연) 한국생명과학회 2010 생명과학회지 Vol.20 No.4
우리나라의 주요 양식 대상 종이며, 년간 총 생산량 1위를 점하고 있는 넙치를 모델로 하여 양식 집단의 유전적 다양성의 변화를 확인하였다. 이를 위해, 한국에서 서식하고 있는 자연산 및 양식산 넙치 각 29개체를 사용하여, hypervariation 영역으로 알려진 tRNA (tRNA<SUP>Thr</SUP>, tRNA<SUP>Pro</SUP>) 영역과 control region의 앞부분까지의 522 bp에 대한 염기서열의 특성을 분석하였다. 23개의 haplotype에서 522 bp의 염기 중 49곳(9.4%)에서 변이가 나타났다. 대부분의 haplotype은 자연집단에서 유일하게 나타났으며, 오직 4개의 haplotype만이 양식집단에서 나타났다. 또한, 두 집단 사이에서는 유전적으로 유의한 집단분화가 발생하였다는 사실도 확인할 수 있었다. 따라서 미토콘드리아 DNA 염기서열 분석 기법은 집단의 유전적 다양성을 평가뿐만 아니라 양식집단의 유전적 모니터링에 사용가능 할 것으로 판단된다. We sequenced a 522 bp fragment including the tRNA<SUP>Thr</SUP>, tRNA<SUP>Pro</SUP> gene and the first half of the control region from 29 wild and cultured olive flounder specimens from Korea. Out of 522 nucleotide sites, 49 (9.4%) were variable, 23 haplotypes being found. Most haplotypes are unique in the wild population and only four were shared by cultured specimins. The nucleotide diversity and differences between wild and cultured populations were 0.025±0.013 and 0.015±0.008, and 12.94±6.00 and 7.83±3.75, respectively. Haplotype diversity was 0.98±0.02 and 0.49±0.09 in the wild and cultured populations, respectively. These results show that marked reductions of genetic variability in the hatchery strains were observed in the number of mitochondrial DNA haplotypes and haplotype diversity when compared to the wild populations. Furthermore, we detected significant population differentiation between both populations. The mtDNA sequencing technique used to evaluate the genetic variability of hatchery strains compared to that of the wild population is potential for genetic monitoring of olive flounder hatchery stocks.