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이소연,권기상,고영화,권오유,Lee, Soyeon,Kwon, Kiang,Ko, Younghwa,Kwon, O-Yu Korean Society of Life Science 2021 생명과학회지 Vol.31 No.6
본 연구는 전장 유전체 연관성 분석(genome-wide association study, GWAS)을 통해 ERp29의 mRNA 발현과 관련된 유전좌위(expression quantitative trait loci, eQTL)을 식별하는 것을 목표로 하였다. 대상 유전자는 ERp29이다. ERp29는 소포체(ER)의 lumen에 단백질의 folding & assembly 기능을 가진 분자 chaperone 단백질로서 소포체 스트레스에 의해 발현량이 증가하며, 분비 단백질의 생합성에 관여한다. 최근 연구 결과 발암과 연관성이 알려지면서 주목을 받고 있다. 총 373명의 유럽인의 genome을 대상으로 GWAS 분석 결과, ERp29 유전자 발현은 정소와 뇌에서 강하게 발현하는 long noncoding RNA (LncRNA) LOC105372577과 관계가 있었다. 즉, 3개의 eQTL: rs6138266 (p<4.172e10-9), rs62193420 (p<1.173e10-8), rs6138267 (p<2.041e10-8)와 연관성이 깊은 것으로 밝혀졌다. ERp29의 발현과 연관이 있는 것으로 확인된 3개의 eQTL을 사용한 transcriptome-wide association study (TWAS) 결과 osteosarcoma amplified 9 (OS9) 발현과 유의한 연관성을 보이며 OS9 유전자의 up-stream에 upstream of transcription factor 1 (USF1)이 결합할 수 있는 것을 알았다. This study identified genomic factors associated with endoplasmic reticulum protein (ERp)29 gene expression in a genome-wide association study (GWAS) of genetic variants, including single-nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 373 European genes from the 1000 Genomes Project were analyzed. SNPs with an allelic frequency of less than or more than 5% were removed, resulting in 5,913,563 SNPs including in the analysis. The following expression quantitative trait loci (eQTL) from the long noncoding RNA LOC105372577 were strongly associated with ERp29 expression: rs6138266 (p<4.172e10), rs62193420 (p<1.173e10), and rs6138267 (p<2.041e10). These were strongly expressed in the testis and in the brain. The three eQTL were identified through a transcriptome-wide association study (TWAS) and showed a significant association with ERp29 and osteosarcoma amplified 9 (OS9) expression. Upstream sequences of rs6138266 were recognized by ChIP-seq data, while HaploReg was used to demonstrate how its regulatory DNA binds upstream of transcription factor 1 (USF1). There were no changes in the expression of OS9 or USF1 following ER stress.
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MHEG - 6 응용을 위한 Java 가상 기계와 MHEG - 5 런타임 엔진간의 인터페이스 시스템 설계 및 구현
이융(Yung Yi),정승훈(Seunghoon Jeong),오승택(Seungtaek Oh),고영화(Younghwa Ko),최양희(Yanghee Choi) 한국정보과학회 1997 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.24 No.2Ⅲ
MHEG-5는 하나의 사용자 상호작용 멀티미디어 응용이 기종이나 운영체제 등이 서로 다른 환경에서도 동작할 수 있도록 응용의 공통된 표현 방법을 정의한 표준이다. MHEG-6는 MHEG-5가 제공해 주었던 기초적인 기능을 보완하여 좀 더 향상된 서비스를 제공하게 하였다. 이 서비스는 Java 가상 기계를 MHEG-6에 포함시킴으로써 가능하게 되었다. 본 논문에서는 MHEG-6 응용을 해석하여 실행 시키는 MHEG-6 런타임 엔진 설계의 요구 사항 중 하나인 MHEG-6 런타임 엔진과 Java VM 간의 인터페이스의 설계를 보인다. 인터페이스의 설계에서는 Java VM을 어떻게 엔진과 동작하게 할 것인가. Java VM과 런타임 엔진과 통신할 때 사용하는 메커니즘 및 메시지 구조, MHEG-5 API의 구현은 어떻게 이루어졌는가를 포함한다.
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김수연(Sooyeon Kim),정승훈(Seunghoon Jeong),오승택(Seungtaek Oh),고영화(Younghwa Ko),최양희(Yanghee Choi) 한국정보과학회 1997 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.24 No.1A
MHEG-5는 하나의 사용자 상호작용 멀티미디어 응용이 기종이나 운영체제 등이 서로 다른 환경에서도 동작하루 수 있도록 으용의 공통된 표현 방법을 정의한 표준이다. 본 논문에서는 MHEG-5 응용을 해석하여 사용자에게 보이고 사용자로부터의 입력을 응용의 내용에 따라 처리할 수 있는 기능을 가지는 MHEG-5 수행 시간 환경을 설명하고, 수행 환경에 의존적인 모듈인 프리젠테이션 시스템을 MS Windows 상에서 효과적으로 구현하기 위해 고려해야 할 사항들을 정리하고, 이를 만족하는 프리젠테이션 시스템의 설계 내용을 보인다.
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