Genetic Polymorphism of the Serum Proteins of Horses in Cheju : 제주마의 혈청단백질의 유전적 다형현상

신진아 Graduate School, Cheju National University 2001 국내박사

제주도내 사육되고 있는 말의 혈액 유전형을 조사하기 위해, 천연기념물인 제주재래마군 45두, 제주경마장의 제주경주마군 60두, 육성마 목장의 더러브렛군 60두를 선정하여, 혈청단백질인 albumin (Alb), vitamin-D binding protein (GC), esterase (ES), AIB glycoprotein (AlB), transferrin (TF) 좌위를 Polyacrylamide gel electrophoresis를 이용하여, 표현형, 빈도수와 유전적 평형상태를 구하였다. 더러브렛군에서의 TF 좌위를 제외하고, 모든 좌위에서 다형현상을 보였다. 제주재래마군에서 ES^(S)와 TF^(Fl) 대립유전자는 관찰되지 않았다. 더러브렛군에서는 Alb^(B), ES^(I), TF^(D)와 TF^(Fl)의 빈도수는 높게 나타났다. 관찰치와 기대치의 검증결과, 제주경주마군의 ES 좌위를 제외하고 세 군 모두 유전적 평형상태를 나타내었다. Alb, ES 와 TF 좌위에서 이형접합도는 높게 나타난 반면 GS와 AlB 좌위에서는 낮게 나타났다. 평균 이형접합도는 제주재래마군, 제주경주마군, 더러브렛군 에서 각각 0.3535, 0.3555, 0.2726을 나타내었다. The study was carried out to investigate the genetic polymorphism of the serum proteins of horses in Cheju, they were assigned to three groups; 45 Cheju native horses (CNH), 60 Cheju racing horses (CRH) and 60 Thoroughbreds (TB). We analyzed the phenotypes and gene frequencies of serum proteins at albumin (Alb), vitamin-D binding protein (GC), esterase (ES), A1B glycoprotein (AlB) and transferrin (TF) loci in three groups by using horizontal polyacrylamide gel electrophoresis (HPAGE). All of the loci, except A1B in TB, showed polymorphisms and different allelic and phenotypic frequencies in all three groups. ES^(S) and TF^(Fl) were not observed in CNH. Allelic frequencies of Alb^(B), ES^(I), TF^(D) and TF^(Fl) were high in TB. All of the loci, except ES locus in CRH, appeared to be in a state of Hardy-Weinberg equilibrium from goodness-of-fit test in all three groups. Heterozygosity estimates at Alb, ES and TF loci were high, but GC and AlB loci were low in all three groups. Average heterorygosities in CNH, CRH and TB were 0.3535, 0.3555 and 0.2726, respectively. Results showed differences in the frequencies of alleles and phenotypes of several serum protein loci between CNH and CRH, suggested that CRH might be the horses crossed with other breeds in some degree.

Polymorphisms of the exons 13, 15 and 16 of transferrin gene in Cheju horses

김남영 Graduate School Cheju National University 2001 국내박사

본 연구는 제주마집단(Group I. 제주도 축산진흥원 사육, 137두; Group Ⅱ, 농가사육, 30두)과 더러브렛 품종집단(한국마사회 육성마목장, 43두)을 이용하여 SSCP를 통한 Transferrin exon 13, 15, 16의 다형현상 확인과 각 SSCP 유전자형의 염기서열을 분석하기 위하여 수행하였다. 공시재료에서 SSCP에서 관찰된 band에 의한 분석결과 대립인자는 exon 13, 15 및 16에서 각각 2개(A, B), 3개(A, B, C ) 및 3개(A, B, C )가 존재하는 것으로 확인되었다. Transferrin exon 13의 A와 B의 대립인자는 Group Ⅰ과 더러브렛 품종에서는 빈도가 0.993과 0.007 및 0.977과 0.023으로 각각 나타나 제주마와 더러브렛 집단 모두 A인자가 매우 높게 분포하고 있음을 확인되었다. exon 15에서는 관찰된 인자형은 A, B 및 C 의 종류로 Group Ⅰ에서는 그 인자형의 빈도는 각가 0.398, 0.463 및 0.139로 조사되었고, Group Ⅱ에서는 0.600, 0.283, 0.117로, 더러브렛 품종에서는 각각 0.884, 0.023, 0.093이었다. exon 15에서 높게 출현되고 있는 유전자형은 Group Ⅰ에서 AB형(0.445)형, Group Ⅱ에서 AA(0.367)형, 더러브렛 품종에서는 AA(0.767) 유전자형이 가장 높은 빈도로 출현되어 제주마 집단간 또는 품종간에 빈도의 차이를 관찬할 수 있었다. exon 16의 SSCP 분석결과 검출된 인자형은 A, B, C의 3종이 관찰되었다. 대립인자형의 빈도는 Group Ⅰ에서는 A, B, C 각각 0.536, 0.409, 0.055로 나타났으나, Group Ⅱ에서는 A 및 B 2종류의 인자형만 0.683 및 0.317로 조사되었고 더러브렛 품종에서는 A(1.000)인자형만 검출되었다. 출현빈도가 높은 유전자형은 Group Ⅰ에서는 AA(0.533)형, Group Ⅱ에서는 AA(0.467)형이었고 더러브렛 품종은 AA형(1.000)만 검출되어 제주마와 더러브렛 품종간 유전인자의 빈도차이가 관찰되었다. exon 15와 exon 16의 SSCP 대립인자형은 친감자별에 이용할 때 parentage exclution 확률(친자부정 판정가능확률)은 각각 0.46과 0.374로 추정되었다. exon 13, 15 및 16의 조합으로 형성된 개체의 유전자형은 전체 13종류가 출현되었고 집단 또는 품종간에 빈도의 차이가 있었다. 이들 전체 유전자형에서 제주마 Group Ⅰ(축산진흥원)에서는 AA-AB-AB 유전자형, 제주마 Group Ⅱ(농가)와 더러브렛 품종에서는 AA-AA-AA유전자형이 높은 출현빈도를 보이고 있었다. SSCP 유전자형에 따른 각 인자들에 대한 염기서열을 분석한 결과 exon 16에서 1개의 새로운 SNP가 발견되었는데 cDNA 2075번에서 Cytosine이 Thymine이로 치환되어 아미노산 Threonine에서 Methionine으로 치환되고 있음이 확인되었다. 본 연구결과 제주마 transferrin exon 13, 15, 16 은 더러브렛 품종에서와 같이 높은 대립인자의 다형성을 보였으며, Group Ⅱ의 일부 제주마는 더러브렛과 교잡된 것으로 검토되었다. 제주마의 유전적 특성을 보호하기 위해서는 등록과 번식에 대한 체계적인 관리가 선행되어야 한다고 사료된다. This study was conducted to determine the polymorphism of transferrin exons 13, 15 and 16 by Single-Strand Conformation Polymorphism(SSCP) analysis and to compare their genotypes of Cheju horse group Ⅰ(Cheju Institute), Cheju horse group Ⅱ(farms) and Thoroughbred(KRA). SSCP of transferrin exons 13, 15, and 16 showed tow(A, B) three(A, B, C) and three(A, B, C) codominant alleles, respectively. The frequencies of alleles A and B in the transferrin exon 13 were 0.993, 0.007 in group Ⅰ, 0.977 and 0.023 in Thoroughbred group, but only allele A in group Ⅱ. In transferrin exon 15, the frequencies of alleles A, B and C were 0.398, 0.463, and 0.139 in group Ⅰ and 0.600, 0.283, and 0.117 in group Ⅱ, and 0.884, 0.023, and 0.093 in Thoroughbred, respectively. The allele frequencies of exon 16 were 0.536, 0.409 and 0.055 for the alleles A, B and C in Group Ⅰ, 0.683, 0.317 for the alleles A and B in Group Ⅱ and 1.000 for the allele A in Thoroughbred. The multiple allele frequencies in exons 15 and 16 suggested that the genotyping of this locus could be used to identify an individual and to test the parentage of offspring. The probability for parentage exclusion were 0.46 and 0.374 for exons 15 and 16 for Cheju horse group Ⅰ. Among the 13 combined genotypes of exons 13, 15 and 16, the genotype AA-AB-AB(0.372) is the most common in Cheju horse group Ⅰ, but genotype AA-AA-AA is common in the Cheju horse group Ⅱ(0.366) and Thoroughbred(0.767), indicating possible crossbreeding between group Ⅱ and Thoroughbred. The present study showed one more SNP(not reported before), which was at the cDNA position 2075(C/T) in C allele of the exon 16 resulting in amino acid change(Threonine→Methionine). Result of the present study suggests that polymorphism of exons 13, 15 and 16 in Cheju horses is as high as in Thoroughbred and that some Cheju horses in group Ⅱ may have crossbred with Thoroughbred. Record keeping about the pedigree information and breeding control system are required for the preservation of genetic characteristics of Cheju horses.

Synthesis, structures, and properties of mono- and bi-nuclear metals (Cu2+, Ni2+, Mn2+, and Ln3+) Complexes with 22-membered phenol-bases N4O2 compartmental macrocyclic ligand

Han chung hun Graduate School Cheju National University 2005 국내박사

Changes of Flavonoid Contents in Cheju Citrus during Maturation : 제주산 감귤의 시기별, 품종별 Flavonoids의 함량 변화

김영천 Graduate School, Cheju National University 2000 국내박사

제주에서는 재배되고있는 온주밀감, 만감류 그리고 재래감귤의 flavonoids의 함량 및 구성비와 성숙 중 함량변화를 알아보기 위해 25종 감귤품종에 대한 12종의 flavonoids함량과 시기별 변화를 측정하였다. 시기별, 품종별 과피율은 유자가 성숙 중 다소 증가되는 경향을 보였고, 나머지 품종들은 변화가 거의 없거나 10% 수준으로 감소되었다. 유자의 과피율의 변화는 거의 없었으며, 지작의 과피율이 54.41%로 가장 높았고, 진귤이 14.08%로 성숙초기 가장 낮은 과피율을 나타내었다. 감귤과피 중의 flavonoids로는 rutin, narigin, hesperidin, neohesperidin, quercetin, naringenin, hesperetin, kaemferol, nobiletin, tangeretin 및 3,5,6,7,8,3′, 4′ methoxylated flavone이 검출되었다. rutin은 모두 24종의 감귤품종과피에서 검출되었으며, 9월 초순경 삼보감에서 5.13mg/g으로 가장 많이 검출되었다. narigin은 18종의 과피에서 검출되었으며, 좌등이 9월 초순경 34.02mg/g으로 많이 검출되었다. Hesperidin은 25종의 감귤과피에서 검출되었으며, 8월 하순경 한라에 28.702mg/g이 함유되어 있었다. Neohesperidin은 9월 초순경 좌등에 13.68mg/g으로 가장 많이 함유되어 있었고 13종의 과피에서 검출되었다. Diosmin은 감자와 당유자에서 9월 하순과 10월 초순 경까지 0.71∼0.01mg/g 정도로 적게 검출되었지만 함량은 8월 초순경에도 0.18∼0.02mg/g 정도로 적었다. Naringenin은 12종의 감귤과피에서 검출되었으며. 8월 하순경 최고 0.66mg/g 다전금의 과피에 함유되어 있었다. Hesperetin은 8월 하순 및 9월 초순에 11종의 과피에서 검출되었고, 편귤의 과피에서 0.96mg/g이 함유되어 있었다. Kaemferol은 7종의 과피에서 검출되었고 0.34mg/g으로 9월 하순경 편귤의 과피에 가장 많이 함유되어 있었다. Nobiletin은 홍귤의 과피에 4.46mg/g으로 많이 함유되어 있었고 22종에서 검출되었다. 3,5,6,7,8,3′, 4′-methoxylated flavone은 17종 과피에 0.22∼0.01mg/g 정도로 함유되어 있었다. Tangeretindms 20종의 과피에서 검출되었고, 8월 하순경 진귤의 과피에 3.28 mg/g로 많이 함유되어 있었다. 재래감귤, 온주감귤, 만감류로 분류해 살펴보았을 때, 재래감귤의 과피인 경우 hesperidin이 거의 없는 지각, 편귤, 당유자는 공통적으로 많은 양의 nagingin과 neohesperidin을 함유하고 있었다. 반대로 naringin과 neohesperidin이 거의 없는 유자, 진귤, 홍귤, 감자, 동정귤, 병귤, 빈귤, 사두감의 과피에는 많은 양의 heperidin이 함유되어 있었다. 온주밀감의 과피에는 주로 heperidin이 많이 함유되어 있었고, 만감류의 과피에는 nagingin을 많이 함유한 품종이 비교적 많았으며, 이런 품종들의 성숙 중 nagingin이 감소되는 폭도 좁게 나타났다. 재래귤과 마찬가지로 naringin과 neohesperidin이 많을 경우 hesperidin이 거의 검출되지 않았고, hesperidin이 많을 때에는 naringin과 neohesperidin함량이 상대적으로 적게 나타났다. This study was intended to examinate twelve flavonoid contents and Changes in twenty-five citrus species to identify the flavonoid contents and Changes during maturation in Citrus unshiu, late group and Cheju traditional citrus. The peel ratio according to citrus species, decreased by approximately 10% during maturation or stable except for Yooja that showed a peel ratio of sligthly increasing tendency. Jikak had the highest peel ratio by 58.41% and Jinkyool had the lowest peel ratio by 14.08% in the last harvest. Rutin, naringin, hesperidin, diosmin, neohesperidin, quercetin, naringenin, hesperetin, kaemferol, nobiletin, 3,5,6,7,8,3′,4′-methoxylated flavone and tangeretin were detected in citrus peel. Rutin was present in the peel of twenty-four citrus species and contained highest amounts in the peel of Sambogam by 5.13mg/g in early September. Naringin was found in peel of fifteen citrus species and contained highest amounts in the peel of Jawdung by 34.02mg/g in early September. Hesperidin was present in the peel of twenty-two citrus species and contained highest amounts in the peel of Halla by 28.70mg/g in late August. Neohesperidin was present in the peel of thirteen citrus species and contained highest amounts in the peel of Jawdung by 13.68mg/g in early September. Diosmin was detected only in Gamja and Dangyooja by 0.71∼0.01mg/g until late September and October. Quercetin was present in the peel of twenty-three citrus species and contained highest amounts in the peel of Hungjin and Halla by 0.18mg/g in late August. Naringein was present in the peel of twelve citrus species and contained highest amounts in the peel of Dajunkum by 0.66mg/g in early September. Hesperetin was present in the peel of eleven citrus species and contained highest amounts in the peel of Punkyool by 0.96mg/g in late August. Kaemferol was present in the peel of seven citrus species and contained highest amounts in the peel of Punkyool by 0.34mg/g in late August. Nobiletin contained highest amounts in the peel of Hongkyool by 4.46mg/g and detected in the peel of twenty-two citrus species. 3,5,6,7,8,3′,4′- methoxylated flavone was contained in the peel of seventeen citrus species and ranged from 0.01mg/g to 0.22mg/g. Tangeretin was contained in the highest quantity in the peel of Jinkyool by 3.28mg/g in late August and detected in the peel of twenty citrus species. In the case of Cheju traditional citrus, the peel of Jikak,Punkyool and Dangyooja, not containing hesperidin, contained a high content of naringin and neohesperidin, conversely, those of Yooja, Jinkyool, Hongkyool, Gamja, Dongjungkyool, Bungkyool, Binkyool and Sadoogam, containing only a little naringin and neohesperidin, contained a high content of hesperidin. The peel of Citrus unshiu mainly contained hesperidin. Much of the peel in the late group contained naringin and showed stable naringin content change during maturation, the peel of the late group that had high naringin and neohesperidin content contained almost no hesperidin, conversely, the peel of the late group that had hesperidin containcxl low naringin and neohesperidin content just as the Citrus unshiu.

The Effect of Sodium Carboxymethylcellulose on Prevention of Postoperative Pleural and Pericardial Adhesions in Dogs : 개에서 Sodium Carboxymethylcellulose의 흉막 및 심낭에 대한 유착방지효과

정동규 Graduate School, Cheju National University 2000 국내박사

개와 사람의 흉강수술 또는 개심수술 시에 발생하는 흉막과 심낭의 유착은 합병증을 유착시킨다. 이러한 흉강유착의 방지를 위해 1% sodium carboxymethycellulose(SCMC)를 개의 흉막 및 심낭에 적용하였다. 10두의 개를 SCMC 투여 군과 생리식염수 투여 군으로 각각 5두씩 나누었다. 실험 개의 흉강 내로 접근 후 4번째에서 6번째 늑간에 건조된 거즈를 사용하여 찰과상을 유도하였고 심낭을 절개하고 절개면의 양측에 2cm×2cm 크기로 심외막과 심낭 사이에 찰과상을 유도하였다. 인위적인 찰과상의 유도 후, 생리식염수 투여 군에서는 멸균 생리식염수를 체중 kg당 3.5㎖의 용량으로 흉강 및 심낭 내로 도포하였고 SCMC 투여 군은 1% SCMC를 같은 용량으로 흉강 내와 심낭 내에 도포하였다. 수술 전과 후에 CBC와 혈장 plasminogen지를 측정하였다. 유착의 정도는 수술 30일 후에 0∼4로 점수화 하여 판정하였다. SCMC 투여 군에서의 심낭의 평균 유착치는 2.4±0.8, 생리식염수 투여 군에서의 심낭과 심장과의 평균 유착치는 3.7±0.9로 나타나 SCMC 투여 군에서 유의성 있게 낮았다(p<0.01). 폐엽과 흉막간의 평균 유착치는 SCMC 투여 군에서는 1.7±0.2로 나타나서 saline 투여 군의 평균 유착치 3.5±0.8 보다 현저히 낮았다(<0.01). saline 투여 군의 혈중 plasmmlogen 농도는 술 후 1일에 28.2±5.6% 감소하였고, 술 후 7일에 47±41.4% 증가하였다(p<0.05). SCMC 투여군에서는 실험적 수술 1일 후 27.1±10.3%로 감소하다가 7일 후에는30.8±21.6% 증가하였다(p<0.01). 흉강 및 개심 수술 중 1% SCMC를 투여하여 흉강 내의 유착을 방지함으로써 재수술이 필요한 경우에 수술의 어려움과 조직손상의 위험을 감소시킬 수 있다. Pleural and pericardial adhesions are very common post-operative complications in intra-thoracic operations in dogs. The purposes of this study are to evaluate the efficacy of 1% sodium carboxymethylcellulose (SCMC) to prevent postoperative pleural and pericardial adhesions, to determine the effective dose of 1% SCMC in intra-thoracic surgery, and to find common adhesive structures after infra-thoracic operation in the dog. The experimental design was a randomized complete block design with five treatments in two blocks (saline-treated & SCMC-treated group). Adhesions were induced by abrasion in the pleura and pericardium. 1% SCMC and saline were then instilled into the pleural cavity respectively (3.5ml/kg). On the 30th day after the operation, the extents of adhesions were measured according to the severity from 0 to 4 points. The plasminogen concentration and complete blood counts (CBC) were evaluated in the pre- and post-operative period. Adhesion scores from the viscera to parietal pericardium were 3.7 in animals treated with normal saline and 2.4 in animals treated with 1% SCMC (p<0.01). Mean scores from the lung lobes were 3.5 in saline treated group and 1.7 in SCMC-treated group (p<0.01). In addition, adhesions between the pericardium and sternum were more frequently formed than in the other pleural surface in saline-treated group (3.6) and SCMC-treated group (2.8). These results suggest that the application of 1% SCMC during infra-thoracic operation could be beneficial to prevent pleural and pericardial adhesions, and it would reduce the technical difficulty and the risk in repeated cardiac surgical procedures.

On the class of generalized paranormal operators : 일반화된 PARANORMAL 작용소들의 집합에 관한 연구

김대원 Graduate School Cheju National University 2004 국내박사

본 논문에서는 힐버트 공간(Hilbeert space) 위에서 비정규(nonnormal) 유계선형작용소로서 paranormal 작용소를 일반화하는 M-paranormal 작용소와 paranormal 작용소의 k제곱근 작용소의 여러 가지 특성을 조사하였는데, 그 특성 중 주요 결과들은 다음과 같다. (1) M-paranormal 작용소와 유니터리동치(unitary equivalent)가 되는 작용소도 역시 M-paranormal 작용소이다. (2) 일반적으로 가환인 두 M-paranormal 작용소 S, T의 곱 ST는 M-paranormal 작용소가 되지 않지만, 다음 성질 중 하나가 성립하면 그 곱 ST는 M-paranormal 작용소이다. 임의의 x∈H에 대하여 ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) (3) 이중가환(doubly commuting)인 두 M-paranormal 작용소 S, T의 곱 ST는 M-paranormal 작용소가 되지 않지만, M>(1/2)이고 ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) 이면, 그 곱 ST는 M-paranormal 작용소가 된다. (4) M-paranormal 작용소와 등거리변환(isometry)이 가환이면, 그 두 곱 역시 M-paranormal 작용소이다. (5) λ, μ가 M-paranormal 작용소 T의 서로 다른 고유치이고 0<M≤1일 때, ker(T-λ)⊥ker(T-μ) 이 성립한다. (6) paranormal 작용소의 k제곱근 작용소와 paranormal 작용소, 새롭게 정의한 대수적 paranormal(algebraically paranormal) 작용소 사이의 포함관계는 다음과 같다. paranormal 작용소⊆paranormal 작용소의 k제곱근 작용소 ⊆대수적 paranormal 작용소. (7) paranormal 작용소의 k제곱근 작용소들의 집합은 B(H)의 노름위상(norm topology)에 대하여 폐집합이고 또한 B(H)의 진부분집합이다. (8) paranormal 작용소의 k제곱근 작용소와 등거리변환이 가환이면, 그 두 곱도 paranormal 작용소의 k제곱근 작용소이다. (9) 영이 아닌 가중값{a_(n)} (n=1, 2, …)를 갖는 가중인 밀림 작용소(weighted shift) T가 paranormal 작용소의 k제곱근 작용소가 되기 위한 필요충분조건은 n=1, 2,3, …에 대하여 ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) 이다. (10) 0∈π_(00)(T^(n))을 만족하는 paranormal 작용소의 k제곱근 작용소는 Weyl 작용소이다. In this paper, we shall study the various characteristics of the M-paranormal operators which generalizes a paranormal operators, and those of kth roots of a paranormal on a Hilbert space H. The main results of the characteristics are as follows: (1) If S is unitarily equivalent to any M-paranormal operator T, then S is M-paranormal. (2) In general, the product TS of commuting M-paranormal operators T, S is not M-paranormal. But the following holds; Let T and S be commuting M-paranormal operators. But the product TS is M-paranormal if one of the following holds; ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) (3) Let T and S be double commuting M-paranormal operators and let M>(1/2). Then the product TS is M-paranormal if ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) for any x∈H. (4) If an M-paranormal T commutes with an isometric S, then TS is M-paranormal. (5) Let λ and μ be distinct eigenvalues of an M-paranormal T and 0<M≤1. Then ker(T-λ)⊥ker(T-μ). (6) We have the following implications among paranormal operators, kth roots of paranormal operator and algebraically paranormal operators: paranormal⊆the kth roots of paranormal operators ⊆algebraically paranormal (7) The kth roots of a paranormal operator T is closed in the norm topology and a proper subclass of B(H). (8) Let T be a kth root of an M-paranormal operator. If T commutes with an isometric operator S, then TS is also a kth root of M-paranormal. (9) Let T be a weighted shift with nonzero weights {a_(n)} (n=1, 2, …). Then T is a kth root of M-paranormal operator if and only if ◁수식 삽입▷(원문을 참조하세요) for n=1, 2, 3, …. (10) If T is a kth root of a paranormal operator with 0∈π_(00)(T^(n)), then T is a Weyl operator.

Convergence of fuzzy random variables : 퍼지 확률 변수의 수렴에 관한 연구

이지순 Graduate School, Cheju National University 1997 국내박사

퍼지 이론은 현재 여러 분야에서 많은 연구자들에 의해 연구되고 발전되어 지고 있다. 본 논문에서는 퍼지 변수와 그들의 소속도 함수의 관계에 대한 성질들을 연구하였다. 볼록 퍼지 변수를 정의하고 볼록 퍼지 변수의 성질들도 조사했다. 또한, 퍼지 확률 변수, 그들의 소속도 함수와 볼록 퍼지 변수들의 기대치의 관계도 연구했다. 그리고 퍼지 변수, 퍼지 확률 변수 그리고 그들의 소속도 함수에 대한 성질들도 살펴보았다. 퍼지 변수와 퍼지 확률 변수의 수렴을 정의하고, 이 정의를 사용하여 퍼지 확률 변수와 그것의 소속도 함수의 수렴성에 대해 증명하였다. Today, fuzzy theory is studied and developed on the various parts. In this paper, we review certain properties of fuzzy variables and relationship for their membership functions. We define the convex fuzzy variable and observe properties of the convex fuzzy variables, fuzzy random variables, and its membership functions. Furthermore, we study the relationship between expectation of fuzzy random variable, its membership function, and convex fuzzy variable. We define the convergence of sequences of fuzzy variables and fuzzy random variables, and then prove the convergence of sequence of fuzzy random variables and its membership function.

Characterization of action mechanism of glycinecin A, a bacteriocin derived from Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra on phytopathogenic Xanthomonas campestris pv. vesicatoria

Pham, Huy Thang Graduate School Cheju National University 2004 국내박사

The ability of glycinecin A, a bacteriocin derived from Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra, to kill closely related bacteria has been demonstrated previously by Heu(Heu et al. 2001). In the present study, we aimed at determining the glycinecin A induced cause of death of sensitive cells. Treatment with glycinecin A caused slow dissipation of membrane potential in comparison to valinomycin, a cell membrane potential disruptor. In contrast glycinecin A induced the depletion of the pH gradient(ΔpH) of Xanthomonas cells as rapidly as did nigericin, a H^(+)/K^(+) exchanger, that rapidly reversed the pH of the cells to that of the medium. Meanwhile glycinecin A did not induce the depletion of ΔpH of E. coli cells, which indicate that glycinecin A may need a specific receptor for its binding and action. Glycinecin A treatment also induced leakage of potassium ions, from X. campestris pv. vesicatoria YK93-4 cells, but not induced leakage of other ions such as Mg^(2+) and PO_(4)^(3-). The induction of potassium leakage due to glycinecin A is faster and higher than the induction caused by valinomycin. The bacteriocin killed sensitive bacterial cells in a dose-dependent manner, sensitive cells were killed within two hours of incubation, most strictly due to the potassium ion efflux caused by glycinecin A. These results suggest that the bactericidal mechanism of action of glycinecin A is correlated with the permeability of membranes to hydroxyl and potassium ions, leading to the lethal activity of the bacteriocin on the target bacteri

Hyperthermia aggravates Neuronal Apoptosis following Global Ischemia in Gerbils : 저빌에서 전신성 뇌허혈시 고체온증이 신경세포의 Apoptosis를 악화시킴

박신미 Graduate School Cheju National University 2001 국내박사

Brain hyperthermia has been known to be implicate in the exacerbated damage of neuronal cells during ischemic insult or recirculation. In this study, we examined whether and how hyperthermia (39℃) affects the neuronal apoptosis according to the difference of brain regions such as hippocampus, thalamus, neocortex, piriform cortex at an early reperfusion stage. Bilateral common carotid arteries occlusion (CCAo) was induced in gerbils for 5 min during which brain temperature was maintained at either 37℃ (normothermia) or 39℃ (hyperthermia) followed reperfusion for 48h. Apoptotic cell death was evaluated by terminal deoxyribonucleotidyl transferase-mediated dUTP-biotin nick end-labeling (TUNEL) and Bax, pro-apoptosis member. In addition, we evaluated the state of astrocyte or microglial cells including inducible nitric oxide synthase(nNOS), endothelial nitric oxide synthase (eNOS) and neuronal nitric oxide sqfnthase (nNOS) within the same brain areas. The numbers of TUNEL-positive neurons were increased within neocortex and hippocampus in hyperthermic(HT) animals. but not in normothermic (NT) and sham-operated animals at 48 h after reperfusion. The numbers of Bax-positive neurons were increased within the hippocampus, thalamus, neocortex and piriform cortex in HT animals, but not within neocortex and piriform cortex in NT animals. The glial fibrillary acidic protein (GFAP) immunoreactivity of HT animals was increased in the hippocampal region compared with that of NT animals. In contrast with NT animals, the intensive activation of microglial cells by isolectin B4 histochemistry could be seen in the hippocampus. thalamus and neocortex region in HT animals. The nNOS-positive cells between the HT and NT animals were not changed in these regions. However, the iNOS-and eNOS-positive cells (abundantly in neuron) were highly increased within the hippocampal CAI region in HT animals. Therefore, our results suggest that hyperthermia may be one of the crucial factors in acceleration of the neuronal apoptosis by the elevation of iNOS expression through the activation of microglia and astrocyte after ischemic injury. Brain hyperthermia has been known to be implicate in the exacerbated damage of neuronal cells during ischemic insult or recirculation. In this study, we examined whether and how hyperthermia (39℃) affects the neuronal apoptosis according to the difference of brain regions such as hippocampus, thalamus, neocortex, piriform cortex at an early reperfusion stage. Bilateral common carotid arteries occlusion (CCAo) was induced in gerbils for 5 min during which brain temperature was maintained at either 37℃ (normothermia) or 39℃ (hyperthermia) followed reperfusion for 48h. Apoptotic cell death was evaluated by terminal deoxyribonucleotidyl transferase-mediated dUTP-biotin nick end-labeling (TUNEL) and Bax, pro-apoptosis member. In addition, we evaluated the state of astrocyte or microglial cells including inducible nitric oxide synthase(nNOS), endothelial nitric oxide synthase (eNOS) and neuronal nitric oxide sqfnthase (nNOS) within the same brain areas. The numbers of TUNEL-positive neurons were increased within neocortex and hippocampus in hyperthermic(HT) animals. but not in normothermic (NT) and sham-operated animals at 48 h after reperfusion. The numbers of Bax-positive neurons were increased within the hippocampus, thalamus, neocortex and piriform cortex in HT animals, but not within neocortex and piriform cortex in NT animals. The glial fibrillary acidic protein (GFAP) immunoreactivity of HT animals was increased in the hippocampal region compared with that of NT animals. In contrast with NT animals, the intensive activation of microglial cells by isolectin B4 histochemistry could be seen in the hippocampus. thalamus and neocortex region in HT animals. The nNOS-positive cells between the HT and NT animals were not changed in these regions. However, the iNOS-and eNOS-positive cells (abundantly in neuron) were highly increased within the hippocampal CAI region in HT animals. Therefore, our results suggest that hyperthermia may be one of the crucial factors in acceleration of the neuronal apoptosis by the elevation of iNOS expression through the activation of microglia and astrocyte after ischemic injury.

Transcription and chromosomal location of the active retroelements HERV-K an d L1Hs in human cells : 인간 세포에서 retroelements HERV-K와 L1Hs의 전사와 염색체상의 위치

한상현 Graduate School Cheju National University 2003 국내박사

전위인자(transposable element)는 유전체 기능에 중요한 역할을 담당하며 전위와 재조합을 통해서 염색체의 다른 위치로 전위할 수 있다. 그 결과로 생성된 반복서열들은 많은 유전적 재조합의 기회를 제공하게 된다. 뿐만 아니라, 염색체상에서 전위인자의 위치 변화는 유전체 불안정성, 세포의 형질전환과 분화를 초래하기도 한다. 인간 유전체에서 몇 종류의 역전위인자(retro-transposable elements)들이 알려져 있다. 대표적 역전위인자인 인간내생성레트로바이러스(HERVs)와 긴 산재형 고반복 인자(LINEs)들은 기능적인 전위활성 보유하고 있다. HERV는 인간 유전체의 0.5%-3% 정도로 추정된다; 전형적인 레트로바이러스 단백질인 gag, pol, env를 암호화하고 있으며, 양 끝에 유사 프로모터로 작용하는 장만달반복배열(LTR)들이 위치한다. 인간 유전체에서 발견된 HERV LTR과 독자적인 LTR들은 세포생물학적으로 중요한 역할을 수행하고 있다. LTR들은 HERV 유전자 및 인접한 숙주 유전자의 발현을 조절하는 다양한 요소들을 보유하고 있다. 인간 LINE-1(L1Hs)은 두 개의 열린 해독틀(ORF)이 내재하고 있다: 그 중 하나는 역전사를 담당하는 역전사효소를 암호화하고, 다른 하나는 RNA-단백질 복합체 형성을 담당한다. 본 연구는 다양한 인간 세포주들(2종의 정상 림프구와 2종의 정상 섬유아세포, 16종의 암세포주)을 대상으로 HERV-K와 L1Hs의 전사 및 전사체의 염색체 위치를 조사하였다. 또한, 이들 역전위인자들의 유전자 발현에서 몇 가지 화학적 발암물질의 효과를 시험하였다. 역전위인자들의 RNA 전사체는 사용된 모든 세포주에서 발견되었으나, 확인된 전사체의 상대적인 양은 세포 유형에 따라 서로 다르게 나타났다. 예를 들어, 섬유아세포들과 백혈구 세포들에서 전사 수준이 세포의 발생단계에 따라 상이하게 나타났다. 또한, HERV-K 유전자들(HERV-K10 LTR, HERV-K(T47D) LTR, HERV-K(C4) env, and HERV-K10 env)과 L1Hs p40 유전자, 조절 단백질 유전자들(BAX, c-MYC, IL-6, and p53)의 발현 양상은 처리된 발암물질에 따라 변화하였다. 다양한 세포에서 HERV-K 유전자의 활성이 세포유형 특이적으로 보고 되었기에, HERV-K 유전자들이 세포의 증식, 사멸, 분화, 암 발생 및 외생성레트로바이러스의 유입에 대항하는 항바이러스 방어 전략 등에 관여함을 암시한다. L1Hs의 전사는 세포유형적 특이성을 보이지는 않았으나, 스트레스나 암 발생 인자에 대한 반응에서는 다양하게 나타났다. 비록, 역전위인자 RNA 전사체가 연구에 사용한 모든 세포주에서 발견되었지만, 역전위인자의 발현과 인간 암 사이에서 직접적인 관련성에 대한 증거를 찾기에는 불충분하였다. 이상의 결과는 발암물질에 대한 반응에서 HERV-K와 L1Hs p40 유전자 발현의 변화를 근거하여, 역전위인자의 활성 수준의 변화가 세포의 형질전환에 기여함을 암시하고 있다. 몇몇 발암물질은 전위활성을 유도하였다. 트랜스포존 특이적 ITR과 인위적인 무작위 ITR을 증폭 시발체로 사용하여 유전체 수준의 증폭을 수행한 결과, 증폭산물은 변화된 양상을 보였다. 평균 5세대 배양 후, 증폭산물 중에서 구별되는 절편들이 관찰되었다. 염기서열 분석에 수반된 BLAST 검색, 계통유전학적 분석을 통해 역전위인자의 전사체들이 거의 모든 염색체의 다양한 좌위로부터 전사됨을 보여주었다. HERV-K10 LTR 인자의 전사체들은 21번 염색체와 Y 염색체에서는 나타나지 않았으며, 전사좌위는 염색체의 동원체 부근부터 말단소립에 이르기까지 전 영역에서 걸쳐 나타났다. HERV-K10 LTR은 포유류 종분화 이전과 이후에 수차례에 걸쳐 인간 유전체로 유입된 것으로 보인다. L1Hs 전사체들은 21번 염색체를 제외한 모든 염색체에서 확인되었다. 유사도 검색과 DNA 서열에 대한 가상적인 단백질 서열 해독은 인간 반수체 유전체 내에 적어도 140개의 전사활성 좌위가 확인되었다. 또한 절대성 원칙, 단순통합분지도(majority rule, strict consensus tree)에서 활성 L1Hs 인자들이 두 집단(cluster)을 형성하였다. 염색체상의 위치를 살펴보면, 역전위인자 전사체들이 다수의 염색체취약부위(fragile site)로부터 전사되며, 이와 같은 사실은 역전위인자의 염색체상 위치와 염색체 불안정성(chromosomal instability)과 암관련 절단부위(cancer-related breakpoint), 유전병관련 좌위 사이의 관련을 암시하고 있다. 역전위인자들이 인간유전체로 유입된 이후, 유전체의 인트론을 확장시키고, 많은 유사 유전자(pseudogene)들을 생성하였다. 결론적으로, 본 연구는 많은 역전위인자들이 숙주 유전체 내에서 전사, 전위되고 있을 뿐만 아니라, 세포내외 환경으로부터 다양한 자극에 대해서도 반응할 수 있음을 제안하고 있다. 또한, 활성형 HERV-K와 L1Hs 역전위인자들은 인간 유전체에서 자신의 전위 활성이 잠재성을 유지한 채 광범위하게 분포하고 있다. Transposable elements play an important role in genome function. They can transpose their chromosome locations using transposition and recombination. The resulting repetitive sequences provide numerous opportunities for genetic recombination. Moreover, the changes in the chromosomal locations of transposable elements induce genomic instability, transformation, and differentiation of cells. The human genome contains several retro-transposable elements. The representative retroelements, human endogenous retroviruses(HERVs) and long interspersed nuclear elements(LINEs), are functionally active. HERVs are estimated to constitute at least 0.5-3% of the human genome; they encode characteristic retroviral proteins, such as gag, pol, and env, and have flanking promoter-like long terminal repeats(LTRs). HERV LTRs and solitary LTRs found in the human genome play an important role in cell biology. LTRs have various elements for regulating the expression of HERVs and neighboring host genes. LINE-1 elements of human(L1Hs) have two open reading frames: one encodes an enzyme for reverse transcription and the other one for RNA-protein complex formation. This study investigated the transcriptions and chromosomal locations of the transcripts of HERV-K and L1Hs in various human cells(two normal lymphocytes, two normal fibroblast, and sixteen cancer cell lines). In addition, this study examined the effects of selected chemical carcinogens on gene expression. RNA transcripts of the retroelements were detected in all cell lines tested, but the relative amounts differed according to cell type. For example, the levels of transcription varied at different developmental stages in fibroblasts as well as in leukemia cells. In addition, the expression patterns of HERV-K genes(HERV-K10 LTR, HERV-K(T47D) LTR, HERV-K(C4) env, and HERV-K10 env), L1Hs p40, and regulatory protein genes(BAX, c-MYC, IL-6, and p53) were changed after treated with carcinogens. Since cell type-specific activation of HERV-K genes has been reported in various cells, it is thought that HERV-K genes may have functions in proliferation, apoptosis, differentiation, cancer development, and anti-viral protection strategies against exogenous retroviruses. L1Hs transcription was not distinguishable in the cell lines tested as a cell-type independent, but varied in response to carcinogenic and stress factors. Although RNA transcripts of retroelements were detected in the cell lines tested, evidences for a direct association between retroelement expression and human cancers could not find. The results suggest that the altered activity levels of the retroelements contribute to cell transformation, based on changes in the expression of the HERV-K genes and L1Hs p40 in responses to carcinogens. Some carcinogens induced the transposition activity. Genome-scale amplification has shown the altered amplification patterns using transposon-specific ITR and arbitrary random ITR as a amplification primer. After average 5 passages, the distinguishable fragments have seen in an amplification profile. Sequence analysis following a BLAST search and phylogenetic analysis showed that RNA transcripts of the retroelements were transcribed from various locations on most chromosomes. RNA transcripts of HERV-K10 LTR elements were located from the centromere to the telomere in all chromosomes, except chromosomes 21 and Y. HERV-K10 LTRs might be introduced into the human genome several times before and after mammalian speciation. L1Hs element transcripts were found on all but chromosome 21. Active L1Hs elements in at least 140 positions of the haploid human genome were identified by similarity search and putative protein translation of DNA sequences. In addition, the putative active L1Hs elements formed two clusters in the strict consensus tree. Based on chromosomal locations, retroelement transcripts were transcribed from many fragile sites, suggesting their association with chromosome instability, cancer-related breakpoints, and genetic disorder-related loci. After retroelement transcripts were introduced into human genome, they may expand introns of the genomes and produce many pseudogenes. Consequently, this study suggests that many retroelements are transcribed and transposed in the host genome, and they can respond to various stimuli in the extra- and intracellular environments. In addition, HERV-K and L1Hs retroelements are widely dispersed throughout the human genome, maintaining their retrotransposition potential.