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CRISPR/Cas9 시스템을 이용한 세포 사멸 불활성화(immortalization) 배추
이예린(Ye-Rin Lee),이혜은(Hye-Eun Lee),한고은(Koeun Han),이은수(Eun Su Lee),고기성(Ki Seong Ko),이균오(Kyun Oh Lee),김도선(Do-Sun Kim) 한국원예학회 2021 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2021 No.10
배추(Brassica rapa)는 국내뿐만 아니라 중국 및 다른 동아시아에서 중요한 채소이다. 배추의 경우 애기장대가 속하는 배추과 식물로서 애기장대 발현 시스템을 직접 이용할 수 있고, 유전체 및 전사체 서열이 밝혀져 있어 유전체 편집 기술을 활용하여 식물 특이적 당 잔기를 제거할 수 있다. 현재까지 많은 식물 이용 바이오의약품 생산 연구가 진행되어왔지만 식물 세포의 낮은 단백질 생산성을 극복하고 생산 수율 증진시키는 데 한계가 있다. 이러한 생산기술의 한계를 극복하고 안전하고 저렴한 식물 기반의 차세대 biosimilar 생산 플랫폼을 개발하는 노력이 필요하다. 따라서 본 연구에서는 애기장대에서 소포체 스트레스에 의해 유발되는 미절첩 단백질 반응(unfolded protein response, UPR)의 핵심 신호전달 유전자를 유전체 수준에서 교정한 배추 변이체 후보군을 확보하고자 하였다. CRISPR/Cas9시스템과 Agrobacterium 형질전환을 통한 유전자 교정으로 배추 형질전환체를 획득하였다. PCR 분석을 통해 형질전환 여부를 확인한 후 deep-sequencing 분석을 수행하여 유전자 변이 개체를 선발하였으며, 자가수정을 통한 homozygous 계통을 확보하였다. 확보된 E1 종자를 파종하여 파종 7일 후 N-glycosylation inhibitor인 tunicamycin (TM)을 농도별로 처리하여 기존 식물(wild type)의 식물체와 유전자 교정이 된 식물체간의 스트레스 내성을 비교하였다. 세포사멸 조절인자가 제거된 불멸화(immortalization) 식물체 세포의 경우 wild type 세포에 비해 스트레스 저항성과 증식율(proliferation)이 증가할 것으로 기대되며 또한 식물 세포배양 시스템으로 전환 시 단백질 생산 수율도 증가될 것으로 기대된다.
중만생종 양파(Allium cepa L.) 품종판별을 위한 SNP 마커세트 개발
이예린(Ye-Rin Lee),한지원(JiWon Han),한고은(Koeun Han),이은수(Eun Su Lee),김도선(Do-Sun Kim),이혜은(Hye-Eun Lee) 한국원예학회 2021 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2021 No.10
양파(Allium cepa L.)는 조미채소로서 전 세계적으로 건강식품, 의약품 등으로 이용되고 있는 중요한 채소 중 하나이다. 국내 주요 재배 양파 품종은 대부분 중만생종이며, 본 실험에서는 중만생종 양파 품종 판별을 위한 SNP 마커세트를 개발하고자 하였다. 30개의 양파 핵심계통의 전사체 시퀀싱 정보를 활용하여 draft reference genome에 정렬한 후 총 1,515,410개의 SNP를 탐색하였다. 이중에서 대립유전자가 2개인 bi-alleic 형태의 SNP를 선발하였으며, missing data를 제거한 후 여러 단계의 필터링을 거쳐 PIC value값이 0.3 이상인 SNP 26,160개를 선발하였다. 선발된 SNP는 SNP 위치에서 up/down stream 방향으로 각가 500bp에 해당하는 인접 서열(flanking sequence)를 확보하여 최종적으로 134개의 SNP 프라이머를 제작하였다. 선발된 SNP의 다형성을 확인하기 위해 국립원예특작과학원 및 종묘회사에서 개발한 22개의 양파 F1 품종 및 1개의 배가반수체(doubled haploid, DH)에 대하여 HRM 분석을 실시하였다. 그 결과 다형성을 보이는 19개의 SNP를 최종적으로 선발하였으며, 선발된 19개의 SNP를 활용하여 중만생종 양파 품종의 유연관계 분석 및 품종 판별을 실시하였다. 개발된 SNP 마커세트를 활용하여 중․ 만생종 양파 품종을 신속하게 판별할 수 있을 것으로 생각되며, 더 나아가 양파 품종의 진위성 검정과 품종보호 출원 시 대조 품종의 선정 등 다양한 방면에서 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
커넥티드 UAVs의 수평 거리 분포에 따른 캡처 효과 성능 분석
이예린(Yelin Lee),임수현(Suhyeon Lim),이승민(Seungmin Lee),이준승(Junseoung Lee),이호원(Howon Lee) 한국통신학회 2022 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2022 No.2
최근 무선통신 분야에서 UAV(unmanned aerial vehicle) 관련 연구가 매우 활발히 진행되고 있다. 이에 따라 3차원 공간에서 네트워크 성능 향상을 위한 무선 자원의 효율적인 사용은 매우 중요하다. 따라서 본 논문에서는 무선 통신 환경에서의 캡처효과(capture effect)를 이용하여 채널 사용률을 향상시키기 위하여, 커넥티드-UAVs의 수평 거리 분포에 따른 랜덤 접속 프로토콜 별 캡처효과 성능을 비교 분석한다.
멀티셀 A2G 통신 시뮬레이터 기반 접속 지연 제한에 따른 랜덤 접속 프로토콜 성능 분석
이준승(Lee Jun Seoung),이예린(Lee Ye Lin),이승민(Seungmin Lee),이호원(Howon Lee) 한국통신학회 2021 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2021 No.6
최근 다중 UAV(unmanned aerial vehicle) 네트워크에서 효율적인 데이터 송수신을 위한 랜덤 접속 프로토콜에 대한 연구 개발이 활발히 진행되고 있다. UAV들이 각자의 서비스에 따라 임무를 수행하는 경우, 각각의 UAV들은 지상제어국과 효율적으로 패킷을 송수신할 수 있어야 한다. 따라서, 본 논문에서는 멀티셀 A2G(air-to-ground) 통신 시뮬레이터를 기반으로 다중 UAV 무선 네트워크에서 효율적인 패킷 송수신을 위한 다양한 랜덤 접속 프로토콜들을 소개하고, 매트랩 시뮬레이션을 통해 접속 지연 제한에 따른 랜덤접속 프로토콜들의 성능을 비교 분석해본다.
생물검정을 이용한 딸기(Fragaria×ananassa Duch.) 유전자원의 역병균(Phytophthora cactorum)에 의한 crown rot 저항성 평가
이예린(Ye Rin Lee),장원석(Won Suk Jang),남명현(Myeong Hyeon Nam),이준대(Jundae Lee) 한국육종학회 2018 한국육종학회지 Vol.50 No.3
Crown rot caused by Phytophthora cactorum is one of several serious, widespread diseases that cause problems in strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) cultivation. In this study, we aimed to identify a strawberry resistant to P. cactorum through bioassay. A total of 104 wild and cultivated strawberry accessions, including ‘Sulhyang’ and ‘Akihime’, were inoculated with an isolate of P. cactorum, ‘PC151111’. A zoospore suspension was used with a density of approximately 10⁶ zoosporesㆍmL⁻¹. Three strawberry seedlings were tested three times independently. The disease index was scored on a scale from 0-4 through symptom observation while the inoculated plants were incubated at 25±3°C under 16 h/8 h (light/dark) conditions for three weeks. The results showed that the mean disease index varied from 0.78-3.78, and the ‘Pechika’ and ‘Kaorino’ cultivars were highly resistant to P. cactorum, with mean disease indexes of 0.78 and 0.89, respectively. These cultivars will be useful resources in breeding strawberries resistant to crown rot.