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개미 군집 알고리즘을 적용한 DNA 칩 분석 데이터 클러스터링 시스템 구축
김윤미(Yun-mi Kim),김연정(Yearn Jeong Kim),윤경오(KyongOh Yoon),조혜진(HyeJin Cho),김대현(DaeHyun Kim),이근일(Keunil Lee),최혜연(Hyeyeon Choi),이민수(Minsoo Lee) 한국멀티미디어학회 2006 한국멀티미디어학회 학술발표논문집 Vol.2006 No.2
다양한 생물 정보에 대한 편리하면서도 빠르고 정확한 분석 기술이 중요해짐에 따라 실험 정보를 담은 바이오 칩에 대한 통합 분석의 필요성이 크게 대두되고 있다. DNA 칩 분석은 실험, 품질 관리와 정규화, 분류화, 클러스터링 그리고 생물 정보 데이터웨어하우스 구축의 분석 과정을 거치는데 본 논문에서는 이 클러스터링 과정에 초점을 맞추어 연구를 진행한다. 바이오 데이터의 복잡하고, 사이즈가 크며, 계속적으로 변화하는 성질을 잘 반영하기 위해 시스템에는 생태계 모방 알고리즘을 이용한 클러스터링 기법을 사용한다. 이러한 생태계 모방 알고리즘으로는 개미 군집, 유전자, 신경망 알고리즘 등이 있으며 여기에서는 이 중 개미 군집 기반의 클러스터링 시스템을 구축하였다. 개미 군집 알고리즘은 먹이를 찾아 이동하는 개미의 행동을 모방한 에이전트를 이용하여 가장 최적인 경로를 탐색하는 경로 최적화 방법으로 이를 기반으로 하여 구축된 시스템은 데이터 입력, 토픽 맵 형성, 클러스터 할당, 결과 표출 과정을 통해 클러스터링을 수행한다.