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유전체 염기서열 분석이 완료된 필수 세포 내 기생 또는 공생 미생물들의 데이터 양이 축적되면서 비교유전체분석을 통한 X-bacteria 의 유전체를 연구할 필요성이 대두 되었다. 이 아메바 공생세균에 대한 유전체 비교분석을 위해 λ-ZapII/EcoRI 을 이용하여 만든 genomic DNA library 를 염기서열 분석을 통해 tagging 하였다. 명확한 plaque 에 대한 임의 선별에 의해 1,212kbp 의 삽입 DNA 를 갖는 380 개의 중복되지 않은 plaque 가 선별되었고, T3 와 T7 primers 를 이용하여 양끝의 서열분석을 하였다. 요약하면, 우리는 823개의 유전자를 인지하였으며, 650Kbp 의 염기서열을 읽었다. 염기서열 분석을 통해 얻어진 X-bacterial genome 의 평균G+C contents 값은 39.4%였다. 일반적인 중복되지 않은 단백질 자료들에 대한 비교분석 결과 265 tag-sequence 가 기능이 알려진 genes 과의 유사성을 보여주었고, 166 tags 는 기능이 알려지지 않은 genes 과 유사하였으며, 나머지 392 tags는 E-value 값이 E-05 이하인 낮은 유사성을 보여주었다. 각각의 tag sequence 는 BLASTx program 을 이용하여 예측된 기능별로 분류하였다. 또한 각각의 tags 는 레지오넬라 종과 비교 분석을 하였으며 이 결과 NCBI 데이터베이스에서 유사도를 보였던431tags 중 284tags 가 레지오넬라 데이터베이스에서 발견되었다. 지금까지 subcloning 과 추가적인 염기서열 분석을 통하여 이전의 16 ORFs 를 포함하여 35 ORFs 를 밝혀내었으며, 비교분석을 통하여 X-bacteria 의 세포 내 생활과 관련된 13 개의 유전자를 예측하였다. 그 유전자들은 icmK, icmTS, dotA, virB3, lvrB, lvrC, ceaA, oprN, MutT/nudix family 단백질, proP, sbpA, rpfB, Na/Ca antiporter (nceA)이다. 아메바 공생세균에 대한 유전체 비교분석의 발전은 아메바 내 공생세균에 대한 이해를 향상시켜 줄 것이다. X-bacteria are in symbiosis with Amoeba proteus and could not be cultured in vitro. As completely sequenced genomes of obligate endocellular bacteria pathogens are accumulated, we approached the characteristics of X-bacteria genome by comparative analysis. Genomic DNA library of X-bacteria constructed in Lambda-ZapII/EcoR1 was tagged by nucleotide sequencing. By random selections, we obtained 380 non-redundant plagues of 1,212 kbps and sequenced from both ends using T3 and T7 primers. In summary, we tagged 823 genes and sequenced 650 kbp. The average G+C content of the sequenced X-bacterial genome was 39.4%. By similarity search against public non-redundant protein database, we identified 265 tags of known gene functions and 166 tags of unknown functions. The rest 392 tags had low homology with cut-off E-05. Tagged sequences were categorized according to their putative functions and species predicted by BLASTx. To date, we completed sequencing 35 ORFs. 288tags of 431tags of known protein were found in Legionella pneumophila genome. By comparative analysis, we predicted 13 genes related with infection and endocellular lifestyle of X-bacteria. They are icmK, icmTS, dotA, virB3, lvrB, lvrC, ceaA, oprN, MutT/nudix family protein, proP, sbpA, rpfB and Na/Ca antiporter (nceA). Characterization of these genes would promote our understanding for the mechanism of bacterial symbiosis in xD strain of A. proteus.