XML 기반의 화학 정보 검색을 위한 분자 구조 표현에 관한 연구 = (A) Study on Molecules Structure Representation of A Chemistry Information Retrieval based on XML

국문 초록 (Abstract)

화학 정보는 다른 과학 분야에 비해 다양하고 복잡한 용어 및 정보표현체계를 가지고 있으므로 전문화된 검색체계와 관리/활용체계가 요구된다. 따라서, 화학 정보의 검색 체계를 정립하고, 검색에서 화학 정보 표현체계의 표준화를 도모하여 소모성을 줄이고 이종 DB간 호환성을 높여야 한다.
화학분야에서 중요한 것은 화학 구조식으로서, 구조적으로 동일한 물질을 검색해 내는 것 또한 중요하다고 하겠다. 그러나, 화학구조의 구현방식이 각 소프트웨어마다 다르고, 분자와 화학 정보를 저장하기 위해서는 문서를 재사용하지 못하는 문제점이 있다.
이러한 문제점을 극복하고 다양한 서비스 환경을 고려한 파일 포맷이 개발됨에 따라 표준으로 추진되고 있는 XML 기반의 화학용 마크업 언어인 CML(Chemical Markup Language)이 등장하게 되었다. CML은 화학식을 웹상에서 표준화된 방법으로 표현하기 위한 연구의 일환으로서 인터넷 환경과 맞물리는 현재 흐름에서 중요한 연구 과제가 될 수 있다. 또한 화학 정보 검색 서비스에서 CML을 이용하면 데이터의 공용성과 프로그램의 유연성을 향상시키는데 필요한 막대한 비용과 노력을 절감할 수 있다.
본 논문에서는 이러한 화학 정보 검색 서비스 환경에서 XML기반의 CML을 사용하여 문서 작성자가 작업중에 중요한 데이터의 손실 없이도 분자 정보를 사용하거나 재사용할 수 있도록 하였고, 화학 정보 검색 서비스에서의 화학 구조식을 웹 상에서 표준화된 방법으로 표현하는 방법을 연구하는데 그 목적이 있다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

Compare chemical information to other science field and Chemical Information is various and has a complicated term and an information expression system.
A professionalized search system and management and a conjugation are necessary.
Therefore, Chemical Informationattempts standardization of a expression system is in a triangular position, a search with a search system of chemical information and reduces waste anger and must raise compatibility between different kind DB.
It is important to have searched the same matter with a structure enemy as a chemical constitution formula too and will do important thing in a chemical field.
However, an implementation method of chemical structure is different in every each software, and the problem that cannot reuse a document in order to store a numerator and chemical information is.
It was appeared in the CML(Chemical Markup Language) which was a markup language for development XML-based chemistry proceeded with for a standard according to becoming the file format that it overcame these problems, and considered various service environments.
As for the CML, Internet environment and connectedcan currently become an important project in stream as a part of study to express a chemical formula with a way standardized on Web.
chemical information retrieval service improves flexibility of a public result program of data if ituses CML in too chemical information retrieval service, but can reduce necessary huge cost and effort.
This paper did document so that drow up used XML-based CML in this chemical information retrieval service environments, and loss of important data let you be and used numerator information, or JakEopJung can reuse a documentation ruler in this paper.
chemical information retrieval service studies a wayto express a way standardized a chemical constitution formula in a Web quotient in chemical information retrieval service, but he has a purpose.

목차 (Table of Contents)

• 목차 = ii
• 제1장 서론 = 1
• 1.1 연구 배경 및 목적 = 1
• 1.2 논문의 구성 = 2
• 제2장 관련 연구 = 3
• 2.1 XML(eXtensible Markup Language) = 3
• 2.1.1 XML의 정의 = 3
• 2.1.2 HTML의 한계 = 4
• 2.1.3 SGML의 한계 = 5
• 2.1.4 XML 문서의 구성 = 6
• 2.1.5 XML 응용분야 = 9
• 2.2 CML(Chemical Markup Language) = 12
• 2.2.1 CML의 개요 = 12
• 2.2.2 XML 커뮤니티와의 관계 = 12
• 2.2.3 CML 디자인의 중요 요소 = 13
• 2.2.4 CML의 확장성 = 13
• 2.2.5 CML의 적용 = 14
• 2.2.6 CML과 관련된 언어들에 대한 이해 = 15
• 2.2.7 Implementability와 CML 소프트웨어 = 15
• 2.3 화학정보 검색의 특징 및 기준 = 16
• 2.3.1 화학 정보의 특징 = 16
• 2.3.2 화학 정보 검색의 특징 = 16
• 2.3.3 화학 정보 검색의 기준 = 17
• 2.4 화학 정보 검색 방법 분석 = 17
• 2.4.1 산업기술정보원(KINITI) 데이터베이스 = 17
• 2.4.2 DIALOG = 19
• 2.4.3 STN = 22
• 2.4.4 SCIFinder = 25
• 2.4.5 NIST Chemisty Web book = 26
• 2.4.6 ChemFinder = 28
• 제3장 CML 표현을 위한 브라우저 = 30
• 3.1 JUMBO 브라우저를 통한 CML 보기 = 30
• 3.2 SVG Viewer를 통한 CML 보기 = 31
• 제4장 CML을 이용한 화학 분자 구조 표현 = 32
• 4.1 CML 선언부 = 32
• 4.2 CML을 이용한 원소에 대한 정보 표시 = 32
• 4.3 Bond(연결고리)의 표현 = 33
• 4.4 Ehtanol(CH3CH2OH)의 실제 구현 = 36
• 제5장 결론 및 향후 연구 = 38
• 참고 문헌 = 39
• 요약 = 41
• Abstract = 42