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Screening for Antifungal Activity of the Pine Extracts Against Fusarium circinatum
Myoungju Kim(김명주),Gyu-Yul Shim(심규열) 한국잡초학회·한국잔디학회 2010 Weed & Turfgrass Science Vol.24 No.2
Fusarium circinatum은 소나무류에 푸사리움 가지마름병을 유발하는 병원균으로 알려져 있다. 본 연구에서는 골프장의 리기다소나무로부터 병원균을 분리하였으며, 이들의 형태적인 특성을 관찰하고 분자생물학적인 방법을 이용하여 동정한 결과 F. circinatum 임을 확인하였다. 특히 histone H3 유전자와 IGS rDNA의 염기서열을 분석한 결과 분리된 균들의 염기서열은 동일하였으며, 유성생식(mating)에 관여하는 유전자를 분석한 결과 모두 MAT1-1 유형임을 확인하였다. 또한 푸사리움 가지마름병에 대한 감수성 수종인 리기다소나무를 비롯하여 저항성 수종인 잣나무와 소나무의 메탄올 추출물을 만들어 이들의 병원균에 대한 항균력을 검정하였다. 그 결과 저항성 수종인 잣나무와 소나무의 추출물에서 리기다소나무 보다 높은 항균력을 확인 하였다. Fusarium circinatum is the causal agent of the pine disease commonly referred to as pitch canker. In this study, F. circinatum was isolated from the diseased Pinus rigida in the golf courses, Korea. The morphological characteristics and the molecular features of the isolates were investigated to identify the pathogen. Histone H3 gene and IGS rDNA region was analyzed and consequently the isolates identified as F. circinatum. All of them have the same sequences and the mating type was determined as MAT1-1. The inhibitory effect of the methanol extracts from the disease resistant pine species, Pinus koraiensis and Pinus densiflora and a susceptible species, P. rigida were evaluated against the isolate, F. circinatum. As a result, the extracts of P. koraiensis and P. densiflora showed higher antifungal activity than that of the susceptible, P. rigida.
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Cenangium ferruginosum에 의한 소나무류 피목가지마름병
김명주(Myoungju Kim),김경희(Kyung-Hee Kim) 한국잡초학회·한국잔디학회 2009 Weed & Turfgrass Science Vol.23 No.2
Cenangium ferruginosum 은 소나무류의 피목가지마름병의 원인균으로 알려져 있다. 한국에서 이 병은 1989년 처음 보고가 된 이래 2007년 봄 서울, 경기, 강원과 충북지역에서 대발생하였다. 병원균인 C. ferruginosum은 병원성이 약한 내생균으로 알려져 있으나 나무가 상처나 가뭄, 극심한 추위나 온난한 겨울기후 등으로 인한 스트레스를 받게 되면 병발생을 유발하게 된다. 본 연구에서는 기후변화에 따른 병 발생 동향을 이해하고자 국·내외 피목가지마름병 발생 현황 및 병원균의 특성을 설명하였다. 또한 경기, 충청, 경상지역의 발병한 잣나무 및 소나무의 병든 가지를 수집하여 병원균의 발달과정을 관찰하였으며, 병원균을 분리하여 이들의 형태학적인 특성과 분자수준에서의 특성을 분석한 결과 C. ferruginosum 임을 확인할 수 있었다. Cenangium ferruginosum was known as the causal agent of dieback of pines including Pinus koraiensis and Pinus densiflora. Since the first report of the disease in Korea in 1989, a group dying occurred in Seoul, Gyeonggi, Kangwon and Chungbuk in 2007 spring. Although C. ferreginosum was known as a weak pathogen or a parasite, this disease caused in stressed pine by drought, wounding, extremely cold weather or unusual warm winter. In this study, we explained the features of cenangium dieback with the characteristics of pathogen to understand the trend of disease associated with the climatic change of the world. We collected pycnidia and apothecia from the diseased branches and stems of P. koraiensis and P. densiflora in Gyeonggi, Chungcheong and Gyeongsang province to characterization of pathogen. The fungal development on the diseased branches were observed and the isolates from pycnidia and apothecia were identified as Cenangium ferruginosum by their morphological characteristics and the molecular techniques.
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김명주(Myoungju Kim),임인철(Inchul Im),이재승(Jaeseung Lee),강수만(Suman Kang) 한국방사선학회 2013 한국방사선학회 논문지 Vol.7 No.2
This study was to analyze quantitatively movement of planning target volume (PTV) and change of PTV volume through movement of diaphragm according to breathing phase. The purpose of present study was to investigate optimized respiration phase for radiation therapy of lung cancer. Simulated breathing training was performed in order to minimize systematic errors which is caused non-specific or irregular breathing. We performed 4-dimensional computed tomography (4DCTi) in accordance with each respiratory phase in the normalized respiratory gated radiation therapy procedures, then not only defined PTVi in 0 ~ 90%, 30 ~ 70% and 40 ~ 60% in the reconstructed 4DCTi images but analyzed quantitatively movement and changes of volume in PTVi. As a results, average respiratory cycle was 3.4±0.5 seconds by simulated breathing training. R2-value which is expressed as concordance between clinically induced expected value and actual measured value, was almost 1. There was a statistically significant. And also movement of PTVi according to each respiration phase 0 ~ 90%, 30 ~ 70% and 40 ~ 60% were 13.4±6.4mm, 6.1±2.9mm and 4.0±2.1mm respectively. Change of volume in PTVi of respiration phase 30 ~ 70% was decreased by 32.6±8.7% and 40 ~ 60% was decreased by 41.6±6.2%. In conclusion, PTVi movement and volume change was reduced, when we apply a short breathing phase (40 ~ 60%: 30% duty cycle) range. Furthermore, PTVi margin considered respiration was not only within 4mm but able to get uniformity of dose. 본 연구는 각 호흡 위상에 따른 계획용표적체적(planning target volume. PTV)의 움직임 및 체적(PTV volume)의 변화를 횡격막(diaphragm)의 움직임을 이용하여 정량적으로 분석함으로써 폐암의 호흡 동기 방사선치료를 위한 최적화된 호흡 위상을 알아보고자 하였다. 비특이적 호흡이나 불규칙적인 호흡에 의한 체계적 오류(system error)를 최소화하기 위하여 모의 호흡 훈련을 시행하였다. 정규화된 호흡 동기 방사선치료 절차에 따라 각 호흡 위상 i에 따른 4차원 전산화치료계획(4-dimensional computed tomography. 4DCTi)을 시행하였으며 0~90%, 30~70%, 40~60% 호흡 위상으로 재구성된 4DCTi 영상에서 PTV를 정의하고 PTVi의 움직임 및 체적의 변화를 정략적으로 분석하였다. 모의 호흡 훈련에 의한 평균 호흡 주기는 3.4±0.5초로 나타났으며 임상적으로 유도되는 예상 값과 실제 측정값의 일치 정도를 나타내는 R-제곱 값은 1에 근접하여 유의하였다. 또한 각 호흡 위상 i에 따른 PTVi의 움직임은 0~90% 호흡 위상의 경우 13.4±6.4mm, 30~70% 호흡 위상의 경우 6.1±2.9mm, 40~60% 호흡 위상의 경우 4.0±2.1mm 이었으며 PTVi의 체적 변화는 30~70% 호흡 위상의 경우 32.6±8.7%, 40~60% 호흡 위상의 경우 41.6±6.2% 감소되었다. 결론적으로 짧은 호흡 위상(40~60%: 30% duty cycle) 폭을 적용하였을 때 PTV의 움직임 및 체적의 변화가 감소되어 호흡을 고려한 PTV 마진이 4mm 이내이면서 PTV 내 선량의 균일성을 얻을 수 있었다.
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