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HMM을 이용한 단백질 β - barrel 막횡단 부위 예측
안창신(Chang Shin Ahn),유성준(Seong Joon Yoo),박현석(Hyun Seok Park) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.2Ⅱ
2000년대 초 인간 지농 프로젝트의 완성으로 새로운 포스트-지농 시대를 맞이하여, 유전자에 대한 해독보다는 인간의 모든 대사와 질병에 직접관여 하고 있는 단백질의 구조와 기능에 대해 많은 관심과 연구가 이루어지고 있다. 특히, 특정 단백질들은 암과 같은 불치병에 직접관여 하고 있으므로 이러한 단백질들의 기능과 구조에 대한 예측 성능의 향상은 새로운 신약 개발에 큰 도움이 될 것이다. 본 논문은 기계학습(Machine Learning)의 한 분야인 HMM(Hidden Markov Model)을 이용하여 β-barrel 형태로 막횡단하는 단백질의 특성과 기능으로부터 막횡단하는 부위가 존재하는지 여부를 예측하는 프로그램을 구현했다.
박승범 ( Seung Bum Park ),이경득 ( Kyung Deuk Lee ),김대웅 ( Dae Woong Kim ),유중현 ( Jung Hyeon Yoo ),김경훈 ( Kyung Hun Kim ),안창신 ( Chang Shin An ),이태용 ( Tae Yong Lee ) 한국운동역학회 2010 한국운동역학회지 Vol.20 No.2
The purpose of this study was to analyze biomechanical factors of trail running shoes applied to korean shoe-lasts. 10 healthy male subjects with an average age of 37.2 years(SD=8.28), weight of 69.6 kg(SD=10.56) and a height of 171 cm(SD=4.93) were recruited for this study. Ten males walked on a treadmill wearing four different shoes. Foot pressure data was collected using a Pedar-X mobile system(Novel Gmbh., Germany) operating at the 1000 Hz. Surface EMG signals for tibialis anterior, gastrocnemius, vastus lateralis and biceps femoris were acquired at 1000 Hz using Noraxon TeleMyo DTS system(Noraxon Inc., USA). Foot pressure and leg muscle fatigue were measured and calculated during walking. The results are as follows: After walking 60 minutes, Type A showed a lower MPF. MPF values were significantly different from each muscle(p<.05). Therefore, Type A shoe might decrease muscle fatigue in the legs while walking. In addition, Type It showed that Type A shoe has the highest contact area and the lowest maximum pressure. As a result of the analysis, Trail running shoes will use a new design to reduce muscle fatigue and are expected to increase comfort and fitting.