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서열 및 상호작용 정보를 활용한 이종간 유사 기능 단백질 추출
설영주(Young-Joo Seol),김민경(Min Kyung Kim),유성준(Seong-Joon Yoo),박선희(Seon Hee Park) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.2Ⅱ
단백질 간 상호작용은 생물체 내에서 발생하는 모든 생명 현상을 이루는 기본 단위로써, 이를 종 수준에서 밝히고자 하는 시도가 yeast와 초파리, worm등에서 보고되었다. 대량으로 존재하는 상호작용 데이터들은 종래에 서열로 시도되던 유연관계 비교 및 기능 유추 등에 기본 정보로 활용되고 있다. 본 연구에서는 다른 중에 속하는 동일 기능 단백질 즉 ortholog를 찾음에 있어 기존의 서열 접근 방식 이외에 상호작용 정보를 추가로 사용하는 시스템을 고안하여 서열방식만을 활용하던 이전의 방식이 지니는 문제점을 극복하고자 하였다.