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Waxy와 atpB-rbcL 염기서열 분석에 의한 Coryloideae의 계통 유연관계
유기억,Jun Wen 한국식물분류학회 2008 식물 분류학회지 Vol.38 No.4
Phylogenetic studies were conducted for 35 populations of the subfamily Coryloideae (Betulaceae) based on waxy gene of nuclear DNA and atpB-rbcL intergenic spacer region of chloroplast DNA. Waxy data analysis suggest that Coryloideae is monophyletic; Corylus is monophyletic and basally branching within the subfamily Coryloideae; Ostryopsis is sister to the Carpinus and Ostrya clade, and the Ostrya is monophyletic (BS=86, PP=99). AtpB-rbcL intergenic spacer region analysis shows that Ostryopsis appeared as the most basal clade within the Coryloideae; Corylus is monophyletic(BS=98, PP=100) and placed between Carpinus-Ostrya and Ostryopsis clade; Carpinus and Ostrya formed a clade with a high support value(BS=100, PP=100). Carpinus sect. Carpinus is monophyletic, whereas sect. Distegocarpus is paraphyletic in the waxy tree. Corylus formed two subclades, but discordance at the infrageneric classification based on morphological characters. In the atpB-rbcL tree, Carpinus and Corylus taxa form a polytomy within the each clade. Results from the two data sets differ mainly in the relative position of Ostryopsis, the monophyly of Ostrya, and the relationships within the Carpinus-Ostrya clade. Further studies are needed for clarify the taxonomic position and the generic limitation. Coryloideae 35집단에 대한 계통 유연관계를 알아보기 위하여 핵 DNA의 waxy 유전자와 엽록체 DNA의 atpB-rbcL intergenic spacer 지역에 대한 염기서열을 분석하였다. Waxy 유전자 분석에서 Coryloideae의 4개 속은 단계통군을 형성하였으며, 개암나무속은 단계통군을 형성하면서 군내군의 가장 기부에 분계조(clade)를 형성하였다. Ostryopsis속은 서어나무속과 새우나무속을 위한 자매군을 형성하였으며, 새우나무속 역시 단계통군을 형성하였다(BS=86, PP=99). AtpB-rbcL 분석에서는 Ostryopsis속이 아과 내에서 가장 기부에 분계조를 형성하였다. 개암나무속은 서어나무속-새우나무속과 Ostryopsis속의 중간에 위치하였고(BS=98, PP=100), 서어나무속은 새우나무속 분류군들과 함께 높은 지지도(BS=100, PP=100)를 가지고 하나의 clade를 형성하였다. Waxy 유전자 분석에서 서어나무속의 Carpinus절은 단계통을 형성하였지만 Distegocarpus절은 병계원군(paraphyletic group)으로 나타났다. 개암나무속의 경우는 2개의 subclade를 형성하였지만 속내 절 또는 아절 등의 분류계급과는 일치하지 않았다. AtpB-rbcL 분석에서는 대부분의 분류군들이 각각의 clade내에서 polytomy를 형성하여 차이를 보였다. 이상의 결과에서 두 유전자의 계통분석 결과가 뚜렷하게 불일치하였고, 특히 Ostryopsis속의 위치와 새우나무속의 단계통 여부, 그리고 서어나무속과 새우나무속의 유연관계가 가장 큰 차이를 보였다. 따라서 이들에 대한 추가적인 연구가 필요한 것으로 판단된다.
유기억,이우철,오영주 한국자원식물학회 1999 한국자원식물학회지 Vol.12 No.4
External morphology, principal component analysis, cluster analysis, and vegetation were investigated to understand the taxonomic relationships and native environmental characters of Megaleranthis saniculifolia populations in four different habitats. Morphological characters such as calyx length and width, calyx index, presence or absence of serrate in calyx lobe, length of peduncle, branch of peduncle and fruit characters were useful for the identification of four different habitats. But, characters of plant height, bract and seed in four habitats were similar. The results obtained based on the principal component(PC) analysis of treated 96 OTU were divided into two groups by PC 1, 2, 3, and the sums of contributions for the total variance were 66.79%(PC1 31.3%, PC2 20.7%, PC3 15.8%, respectively), and only Mt. Taeki population was distinctly different from populations of other three habitats. In cluster analysis based on average linkage cluster analysis and Ward's method, there were similarities in the composition of clustered taxa, and each populations were not identified. Importance value by relative coverage and frequency appeared in M. saniculifolia(50.81%), Aruncus dioicus(12.64%), Corydalus turtschanovii(11.62%), Veratrum oxysepalum(11.45%), Anemone koraiensis(8.96%), Meehania urticifolia(8.76%), Filipendula palmata(7.06%), Aconitum pseudo-laeve(5.66%), Pseudostellaria palibiniana(5.45%) and Smilacina japonica(5.25%), respectively. These species were considered to be highly similar with M. saniculifolia. The highest importance value in all investigated sites was M. saniculifolia, but specific composition of high level different from each habitat. Average diversity of species was 1.40, and the highest in Mt. Kwangdeok(1.31), lowest in Mt. Jumbong(1.17). Average soil pH was 5.25 and similar in each habitat. Although the lowest content of K ion, but the highest the EC, water capacity, organic compound, Ca content were found in soil of Mt. Sobaek. Soils in Mt. Kwangdeok had the lowest content of EC, organic compound, Ca. Soils of Mt. Jumbong showed the highest of Mg content, but the lowest of water capacity, $P_2O_5$, and K contents.
ITS 염기서열에 의한 한국산 제비꽃속(Viola)의 계통 유연관계
유기억,장수길,이우철 한국식물분류학회 2005 식물 분류학회지 Vol.35 No.1
Molecular phylogenetic studies were conducted to evaluate interspecific relationships in 40 populations of Viola including 35 Korean taxa, four Japanese populations and one outgroup using nuclear ribosomal ITS sequences. The phylogenetic analyses were conducted using parsimony and neighbor-joining methods. Subsection Trigonocarpae of section Nomimium appeared as the most basal clade within the Korean Viola. Section Dischidium and Chamaemelanium was monophyletic(bootstrap 100%) and placed between subsect. Trigonocarpae and three other subsections of sect. Nomimium. Sect. Nomimium was paraphyletic. Although each subsectional grouping was in accordance with previous infrageneric classification based on morphological characters, yet discordance remained at the series level. Two evolutionary trends observed in the ITS tree were as follows. First, subsect. Trigonocarpae(x=10) was derived from the outgroup(x=6); Second, subsects. Bilobatae and Vaginatae(x=10 or 12), and subsect. Patellares(x=12) of sect. Nomimium were originated from sects. Dischidium and Chamaemelanium(x=6). Viola albida complex including three very closely related taxa was recognized as independent group within subsect. Patellares in parsimony tree. This result suggested that they should be treated as a taxa in series Pinnatae. Phylogenetic position of a putative hybrid species, Viola woosanensis was not supported with previous morphological hypothesis. 한국산 제비꽃속 35분류군과 일본산 4집단, 군외군 1분류군 등 총 40집단에 대한 계통 유연관계를 알아보기 위하여 핵 rDNA의 internal transcribed spacer(ITS)지역에 대한 염기서열을 분석하였다. 정렬된 염기서열들은 bootstrap을 포함한 parsimony 방법과 neighbor-joining 방법을 통하여 계통수를 평가하였다. 그 결과 진정제비꽃절의 낚시제비꽃아절은 군내군의 가장 기부에 분계조를 형성하였으며, 장백제비꽃절은 노랑제비꽃절과 자매군을 형성하면서 진정제비꽃절의 낚시제비꽃아절과 콩제비꽃아절, 고깔제비꽃아절, 제비꽃아절 사이에서 단계통군을 형성하였다. 진정제비꽃절은 병계원적인 분계조를 형성하였고 4개 아절은 독립적인 분계조를 형성하였지만 계열 수준에서는 구별이 불가능하였다. 세포학적 연구에 기초한 제비꽃속의 분화에서 기본염색체 수 x=10을 갖는 낚시제비꽃아절은 x=6인 군외군에서 독립적으로 분화한 것으로 나타났으며 나머지 분류군들은 x=6인 노랑제비꽃과 장백제비꽃아절로부터 x=10 또는 12인 콩제비꽃과 고깔제비꽃아절을 거쳐 x=12인 제비꽃아절로 분화한 특징을 보였다. 형태적인 변이가 매우 심한 분류군으로 알려진 태백제비꽃(V. albida complex)은 Patellares아절 내에서 하나의 군으로 유집되어 Pinnatae계열로 처리하는 것이 타당할 것으로 생각되며, 뫼제비꽃과 남산제비꽃의 잡종인 우산제비꽃은 형태적 특징에 의한 분류와는 일치하지 않는 것으로 나타났다.
RAPD, ISSR과 PCR-RFLP를 이용한 한국산 제비꽃속(Viola)의 종간 유연관계
유기억,이우철,권오근 한국식물분류학회 2004 식물 분류학회지 Vol.34 No.1
Molecular taxonomic studies were conducted to evaluate interspecific relationships in Korean Viola 34 taxa included two Japanese populations using RAPD(randomly amplified polymorphic DNA), ISSR(inter simple sequence repeat) and PCR-RFLP(restriction fragment length polymorphism) analysis. Only six and four primers out of 40 arbitrary and 12 ISSR primers screened for 34 taxa, and revealed 70(98.6%) and 28(96.6%) polymorphic bands, respectively. Fifteen restriction endonucleases produced 80 restriction site and size variation from the large single copy region of cpDNA, 16(20%) of which are polymorphic. The separate analysis of RAPD, ISSR and PCR-RFLP data was incongruent in the relationships among 34 taxa, but combined data was in accordance with previous infrageneric classification system based on morphological characters, especially the subsection and series level. Section Chamaemelanium placed between subsect. Patellares and Vaginatae of section Nomimium was not formed as a distinct group. Viola albida complex includes three very closely related taxa was recognized independent group within subsect. Patellares in combined data tree. This result strongly suggested that they should be treated to series Pinnatae. RAPD analysis was very useful to clarify the interspecific relationships among the species of Korean Viola than ISSR and PCR-RFLP analysis. 한국산 제비꽃속 32분류군과 일본산 2집단 등 총 34분류군에 대한 유연관계를 알아보기 위하여 RAPD(randomly amplified polymorphic DNA), ISSR(inter simple sequence repeat), PCR-RFLP(restriction fragment length polymorphism) 분석을 실시하였다. RAPD에서는 40개의 primer 중 6개가 분류군 전체에서 반응을 보였고 이로부터 총 70개(98.6%)의 다형화 밴드를 얻었으며, ISSR 분석에서는 4개의 primer로 부터 28개(96.6%)의 다형화밴드를 얻었다. 엽록체 DNA의 non-coding부분을 이용한 PCR-RFLP 분석에서는 반응이 일어난 4지역에서 증폭된 약 6.78 kb의 DNA 각각에 대하여 15가지 제한효소를 처리한 결과 총 80개의 restriction site를 얻었으며 그중 16 site는 polymorphic하게 나타나 20%의 다형화를 보였다. 본 연구에서 다룬 3가지 형질에 의한 유집분석 결과 각각의 형질에 의해서는 서로 일치하지 않는 유집형태를 보였지만 3가지 형질을 통합한 결과는 진정제비꽃절(sect. Nomimium)내 아절과 계열간 구분이 명확하게 나타났으며 무경종과 유경종도 구별이 가능하여 외부형태형질에 의한 기존의 분류체계와 일치하였다. 그러나 노랑제비꽃절(sect. Chamaemelanium)은 진정제비꽃절과 독립적인 군을 형성하지 않고 진정제비꽃절 내 무경종그룹인 Patellares아절과 Vaginatae아절 사이에 위치하여 나타났다. 형태적인 변이가 매우 심한 분류군인 태백제비꽃군(V. albida complex)은 Patellares아절 내에서 하나의 군으로 유집되어 Pinnatae계열로 처리하는 것이 타당할 것으로 생각된다. 본 연구에서 사용한 3가지 형질 중 RAPD 분석방법은 ISSR과 PCR-RFLP 분석보다 제비꽃속의 종간 유연관계를 밝히는데 더 유용한 것으로 판단된다.
유기억 한국국제정치학회 2010 한국국제정치학회 학술대회 발표논문집 Vol.2010 No.8
비무장지대 인근지역과 민통선 지역 등 인접지역에 대한 문헌 검토 결과 식물자원은 118과 506속으로 총 1,220종류가 분포하는 것으로 확인되었다. 지역별로는 강원도 지역이 935분류군이었으며 경기도 일대에서는 700분류군이 조사되었다. 이중 특산식물은 54종류가 포함되어 있었으며, 멸종위기 야생동ㆍ식물 Ⅱ등급에 해당하는 식물은 개느삼, 조름나물, 매화마름, 자주솜때, 기생꽃 등 5종류로 나타났다. 최근 조사된 철원 역곡천과 김화 남대천 일대의 비무장지대 조사에서는 334종류의 식물이 분포하여 파주, 연천 등 서부지역보다는 종다양성이 높은 것으로 나타났다. 344종류 중에는 9종의 희귀식물과 8종의 특산식물이 포함되어 있다. 이 지역은 귀화식물들의 종류가 늘어나는 추세이고 분포 면적도 확산되고 있는 실정이므로 이에 대한 대책이 강구되어야 할 것으로 판단된다.
유기억,천경식,장수길 한국환경생태학회 2009 한국환경생태학회지 Vol.23 No.5
This is a study intended to investigate the environmental factors including vegetation and soil in order to better understand the environmental and ecological characteristics of four different habitats of Pulsatilla tongkangensis (Mt. Baekun, Maha-ri, Kyulam-ri and Mt. Deokhang). These habitats, according to investigations, are mostly located on the slopes of mountains facing northwest at an altitude of 220m to 772m above sea level with angles of inclination ranging from 41 degree to 85 degree. A total of 27 vascular plant taxa are identified in ten quadrates of the four habitats. The importance value of these plants is as follows: Pulsatilla tongkangensis is 9.65%; Carex humilis var. nana 28.93%; Potentilla dickinsii 16.55%; Mukdenia rossii 7.09%; Peucedanum terebinthaceum and Eragrostis ferruginea 4.55%; and Vicia venosa var. albiflora 3.90%. The importance value of these six species is high, so they are at affinity with P. tongkangensis in their habitats. The degree of their average species diversity is 0.75, and that of dominance and evenness 0.24 and 0.85, respectively. Their average field capacity of soil is 19.05%, organic matter 10.51%, and soil pH is 7.43, which are similar among their habitats. 동강할미꽃 자생지(백운산, 마하리, 귤암리와 덕항산)의 환경특성을 파악하기 위하여 환경요인, 식생 및 토양분석을 실시하였다. 동강할미꽃 자생지는 해발 220-772 m에 위치하고, 경사는 41-85°로 다양하였으며, 주로 북서사면에 분포하였다. 식생분석결과 10개 방형구내에서 조사된 분류군은 총 27종류였다. 중요치는 동강할미꽃이 9.65%였으며, 산거울(28.93%), 돌양지꽃(16.55%), 돌단풍(7.09%), 기름나물과 그령(4.55%), 큰네잎갈퀴(3.90%) 등 6종류는 중요치가 높게 나타나 이 분류군들은 동강할미꽃과 친화도가 높은 것으로 생각된다. 종다양도는 평균 0.75이었고 우점도와 균등도는 각각 0.24와 0.85로 나타났다. 토양의 포장용수량은 평균 19.05%이었으며, 유기물 함량은 10.51%로 나타났고, pH는 7.43으로 자생지간에 비슷하게 나타났다.
유기억,이우철 강원대학교 부속 환경연구소 2004 Journal of the Environment Vol.1 No.-
Vascular plants of Hwangcheolbong were composed of 84 families, 250 genera, 325 species, 2 subspecies, 54 varieties and 12 forma, totaling 393 taxa. Among the 393 taxa. Thirteen species such as Deutzia uniflora, Filipendula palmata var. glabra, Lespedeza intermedza var. retusa, Lespedeza thunbergii for. angustifolia, Vicia venosissima, Viola diamantiaca, Vaccinium koreanum, Patrinia saniculaefolia, Hanabusaya asiatica, Aster ciliosus, Cirsium setidens, Saussurea diamantiaca, and Carex okamotoi were Korean endemic. The specific plants based on the distribution pattern appointen by Ministry of Environment were 69 taxa, and estimated 328 points. The naturalized plants were 7families, 11 genera, 12 species, 1 variety, totaling 13 taxa.