Development of Multiplex PCR for Detection of Vancomycin Resistant Enterococci and Epidemiological Application in Korea = Vancomycin Resistant Enterococci (VRE) 진단을 위한 Multiplex PCR 법 확립 및 국내 역학조사

국문 초록 (Abstract)

Vancomycin에 저항성을 나타내는 장구균(VRE)은 중요한 병원내 감염 병원균으로 등장하고 있으며 1989년 미국 CDC의 보고에 따르면 VRE에 의한 세균혈증과 심내막염의 감염율이 매우 빠른 속도로 증가하고 있다고 알려져 있다.
이러한 VRE의 축산동물 내에서의 등장은 avoparcin의 사용에 관련이 있을 것이라고 주장되어지고 있다. 본 연구에서는 4가지 형태의 VRE를 유도하는 유전자를 진단하고 구별할 수 있는 multiplex PCR법을 확립하였으며 이를 이용하여 avoparcin을 사용하였던 농장 및 사용하지 않은 농장으로부터의 VRE의 분리율 및 유전자형을 조사하였다. 70개소의 돼지 및 32개소의 닭 농장으로부터 1,091개의 분변 샘플을 수거하여 425주의 장구균을 분리하였으며 그 중 11주가 높은 농도의 vancomycin 저항성(64-256㎍/㎖)을 나타내었으며 PCR 조사결과 vanA, vanB 유전자를 확인할 수 있었다. 57주의 낮은 농도의 vancomycin에 저항성 3-8㎍/㎖)을 나타내는 VRE는 PCR 조사결과 vanC-1 또는 vanC-2의 유전자를 확인할 수 있었다. 국내의 높은 농도의 vancomycin에 저항성을 나타내는 VRE의 분리율(11/425, 2.58%)은 avoparcin을 사용하였던 다른 나라의 분리율(22/55 in England, 7% in Belgium)에 비해 현저히 낮은 것으로 조사되었다.
또한 분리주에 대한 유전적 연관성을 분석하기 위하여 rep-PCR법을 확립하였으며 이를 이용하여 8주의 동물유래 VRE와 31주의 사람유래 VRE의 rep-PCR 양상을 분석한 결과 사람유래 VRE의 경우 6개, 동물유래 VRE의 경우 한 개의 역학적으로 연관성이 있는 그룹이 관찰되었으며 사람유래 VRE의 동물유래 VRE간의 연관성을 관찰할 수 있었다. 결론적으로, 돼지 및 양계농장으로부터 11주의 high-level VRE가 분리되었으며, 이를 사람으로부터 분리된 VRE와 genotype 등을 비교 분석한 결과, 역학적으로 상관관계가 없는 것으로 확인되어 국내에서 동물사료첨가제로 쓰이는 avoparcin에 의한 vancomycin 항생제 유도는 인정되지 않았다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

Vancomycin resistant enterococci (VRE) have emerged as an important nosocomial pathogen. Since 1989 the Center for Disease Control, United States, has reported a rapid increase in the incidence of enterococcal bacteremia and endocarditis infection by VRE. It was suggested that the use of avoparcin in animal husbandry was associated with the appearance of VRE. In this study a multiplex PCR method was established to detect and differentiate genotypes of enterococci which specifically amplify the four van genes encoding vancomycin resistance elements. The incidence rates and types of VRE from farms using or not using avoparcin was investigated using this method. From 1,091 animal fecal samples collected from 70 pig and 32 poultry farms, a total of 425 of enterococci were isolated. Of the isolates, 11 of the them showed a pattern of high-level vancomycin resistance (MIC: 64-256 ㎍/㎖) which was associated with the vanA or vanB gene.
Fifty-seven isolates showed a pattern of low-level vancomycin resistance (MIC: 3-8 ㎍/㎖) associated with the vanC-1 or vanC-2 gene. The high-level VRE isolation rate in Korea (2.58%) was much lower than that of other countries (50% in England. 7% in Belgium) where avoparcin have been used. A repetitive extragenic palindromic PCR (rep-PCR) method was also established to determine genetic relatedness between animal and human VRE isolates. The repPCR pattern of 31 human VREs isolates with 11 animal isolates was compared.
Human isolates generated five different types of group (Group Ⅱ to Ⅳ), whereas animal isolates generated only one group (Group Ⅰ). None of animal isolates had similar rep-PCR pattern of the human isolates. This result suggested that no genetic relatedness was in between animal and human VRE in Korea. In conclusion, the multiplex PCR and rep-PCR methods established in this study could be applied for detection of VRE and might be useful for the epidemiological investigations for their origins.