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      mtDNA Diversity and Phylogenetic Analysis of Korean Native Goats

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      https://www.riss.kr/link?id=A82722977

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      국문 초록 (Abstract)

      한국재래염소는 흑모색의 특징을 나타내며, 유일한 염소 품종으로서 오랫동안 한반도에서 사육되어 왔다. 하지만 이들에 대한 유전적 다양성, 계통유전학적 분석 등을 통한 기원 추정 등에 대한 연구는 미비한 실정이다. 본 연구에서 한국재래염소 5개 집단, 60두를 대상으로 mtDNA D-loop 영역 중 HVI 영역의 서열을 이용하여 유전적 다양성 및 계통유전학적 분석을 실시하였다. 한국 재래염소는 다른 나라 염소들에 비해서 haplotype 다양성 지수가 낮게 나타났다. 또한 본 연구에서 분류된 한국재래염소 10개 haplotype 중 현재까지 보고되지 않은 6개의 새로운 haplotype이 확인되었다. 계통유전학적 분석 결과, 분석에 사용된 모든 한국재래염소는 mtDNA 모계혈통 A에 속하였다. 10개의 haplotype 중 8개는 베트남, 일부 중국 염소와 함께 subgroup을 형성하였다. 그러나 나머지 2개 haplotype은 각각 서로 독립적인 계통유전학적 위치를 보였다. 이런 결과들을 토대로 한국재래염소는 상대적으로 높은 근친상황으로 외부 유전자 유입이 적었을 것이라고 추정된다. 한국재래염소의 새로운 mtDNA haplotype의 발견 및 유전자원 보존 및 평가를 위해서 더 많은 분석집단 및 개체를 수집하고, MS 마커를 이용한 추가분석이 필요하다고 사료된다.
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      한국재래염소는 흑모색의 특징을 나타내며, 유일한 염소 품종으로서 오랫동안 한반도에서 사육되어 왔다. 하지만 이들에 대한 유전적 다양성, 계통유전학적 분석 등을 통한 기원 추정 등에 ...

      한국재래염소는 흑모색의 특징을 나타내며, 유일한 염소 품종으로서 오랫동안 한반도에서 사육되어 왔다. 하지만 이들에 대한 유전적 다양성, 계통유전학적 분석 등을 통한 기원 추정 등에 대한 연구는 미비한 실정이다. 본 연구에서 한국재래염소 5개 집단, 60두를 대상으로 mtDNA D-loop 영역 중 HVI 영역의 서열을 이용하여 유전적 다양성 및 계통유전학적 분석을 실시하였다. 한국 재래염소는 다른 나라 염소들에 비해서 haplotype 다양성 지수가 낮게 나타났다. 또한 본 연구에서 분류된 한국재래염소 10개 haplotype 중 현재까지 보고되지 않은 6개의 새로운 haplotype이 확인되었다. 계통유전학적 분석 결과, 분석에 사용된 모든 한국재래염소는 mtDNA 모계혈통 A에 속하였다. 10개의 haplotype 중 8개는 베트남, 일부 중국 염소와 함께 subgroup을 형성하였다. 그러나 나머지 2개 haplotype은 각각 서로 독립적인 계통유전학적 위치를 보였다. 이런 결과들을 토대로 한국재래염소는 상대적으로 높은 근친상황으로 외부 유전자 유입이 적었을 것이라고 추정된다. 한국재래염소의 새로운 mtDNA haplotype의 발견 및 유전자원 보존 및 평가를 위해서 더 많은 분석집단 및 개체를 수집하고, MS 마커를 이용한 추가분석이 필요하다고 사료된다.

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      Korean native goats, which are characterized by black coat color, have existed on the Korean peninsula for a long time. Until now, there has been no comprehensive investigation concerning their genetic diversity, phylogenetic analysis or origin. In this study, we investigated the genetic diversity and verified phylogenetic status of the Korean native goat using the 453-bp fragment of the hypervariable fragment I (HVI) of mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region from 60 individuals among 5 populations. The Korean native goat showed less haplotype diversity when compared with goats from other countries. In addition, 6 haplotypes that had not been previously reported were verified in this study. In phylogenetic analyses with other country"fs goats, 10 haplotypes from Korean native goats were classified into mtDNA lineage A. Moreover, in a phylogenetic tree for goats which contained mtDNA lineage A, 8 of 10 haplotypes could be included in a subgroup with goats from Vietnam and an area of China. However, none of the remaining haplotypes belonged to a major group of Korean native goats and were located on different independent positions. These results suggest that almost Korean native goats aligned more closely to China and Vietnam breeds in mtDNA lineage A and there was no gene flow from other mtDNA lineages. Our results will contribute to conservation strategies and genetic breeding of Korean native goats.
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      Korean native goats, which are characterized by black coat color, have existed on the Korean peninsula for a long time. Until now, there has been no comprehensive investigation concerning their genetic diversity, phylogenetic analysis or origin. In th...

      Korean native goats, which are characterized by black coat color, have existed on the Korean peninsula for a long time. Until now, there has been no comprehensive investigation concerning their genetic diversity, phylogenetic analysis or origin. In this study, we investigated the genetic diversity and verified phylogenetic status of the Korean native goat using the 453-bp fragment of the hypervariable fragment I (HVI) of mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region from 60 individuals among 5 populations. The Korean native goat showed less haplotype diversity when compared with goats from other countries. In addition, 6 haplotypes that had not been previously reported were verified in this study. In phylogenetic analyses with other country"fs goats, 10 haplotypes from Korean native goats were classified into mtDNA lineage A. Moreover, in a phylogenetic tree for goats which contained mtDNA lineage A, 8 of 10 haplotypes could be included in a subgroup with goats from Vietnam and an area of China. However, none of the remaining haplotypes belonged to a major group of Korean native goats and were located on different independent positions. These results suggest that almost Korean native goats aligned more closely to China and Vietnam breeds in mtDNA lineage A and there was no gene flow from other mtDNA lineages. Our results will contribute to conservation strategies and genetic breeding of Korean native goats.

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      목차 (Table of Contents)

      • 서론
      • 재료 및 방법
      • 결과 및 고찰
      • 감사의 글
      • References
      • 서론
      • 재료 및 방법
      • 결과 및 고찰
      • 감사의 글
      • References
      • 초록
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      참고문헌 (Reference)

      1 김영근, "한국재래산양의 발육형질에 대한 유전능력 평가" 한국동물자원과학회 44 (44): 171-180, 2002

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      3 Pereira, F., "The mtDNA catalogue of all Portuguese autochthonous goat (Capra hircus) breeds: high diversity of female lineages at the western fringe of European distribution" 14 : 2313-2318, 2005

      4 Zeder, M. A, "The initial domestication of goats (Capra hircus) in the Zagros Mountain 10,000 years ago" 287 : 2254-2257, 2000

      5 Amills, M., "Strong phylogeographic relationships among three goat breeds from the Canary Islands" 71 : 257-262, 2004

      6 Posada, D, "Selecting the best-fit model of nucleotide substitution" 50 : 580-601, 2001

      7 Joshi, M. B., "Phylogeography and origin of Indian domestic goats" 21 : 454-462, 2004

      8 Azor, P. J., "Phylogenetic relationships among spanish goats breeds" 35 : 423-425, 2005

      9 Sardina, M. T., "Phylogenetic analysis of Sicilian goats reveals a new mtDNA lineage" 34 : 376-378, 2006

      10 Swofford, D. L, "PAUP*. Phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods), Version 4"

      1 김영근, "한국재래산양의 발육형질에 대한 유전능력 평가" 한국동물자원과학회 44 (44): 171-180, 2002

      2 Vilà, C., "Widespread origins of domestic horse lineages" 291 : 474-477, 2001

      3 Pereira, F., "The mtDNA catalogue of all Portuguese autochthonous goat (Capra hircus) breeds: high diversity of female lineages at the western fringe of European distribution" 14 : 2313-2318, 2005

      4 Zeder, M. A, "The initial domestication of goats (Capra hircus) in the Zagros Mountain 10,000 years ago" 287 : 2254-2257, 2000

      5 Amills, M., "Strong phylogeographic relationships among three goat breeds from the Canary Islands" 71 : 257-262, 2004

      6 Posada, D, "Selecting the best-fit model of nucleotide substitution" 50 : 580-601, 2001

      7 Joshi, M. B., "Phylogeography and origin of Indian domestic goats" 21 : 454-462, 2004

      8 Azor, P. J., "Phylogenetic relationships among spanish goats breeds" 35 : 423-425, 2005

      9 Sardina, M. T., "Phylogenetic analysis of Sicilian goats reveals a new mtDNA lineage" 34 : 376-378, 2006

      10 Swofford, D. L, "PAUP*. Phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods), Version 4"

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      31 Thompson, J. D., "CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice" 22 : 4673-4680, 1994

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      33 Beja-Pereira, A., "African origins of the domestic donkey" 304 : 1781-, 2004

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      2027 평가예정 재인증평가 신청대상 (재인증)
      2021-01-01 평가 등재학술지 유지 (재인증) KCI등재
      2018-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2015-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2011-08-03 학술지명변경 외국어명 : Korean Journal of Life Science -> Journal of Life Science KCI등재
      2011-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2009-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2007-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2004-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      2003-01-01 평가 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) KCI등재후보
      2001-07-01 평가 등재후보학술지 선정 (신규평가) KCI등재후보
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      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.37 0.37 0.42
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.43 0.43 0.774 0.09
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