Hrq1은 곰팡이 유전체에서 생물정보분석에 의해 발견된 새로운 RecQ helicase이다. 이 단백질은 인간의 RECQL4와 가장 상동성이 높으며 최근의 유전학적 생화학적 연구를 통해서 유전체 안정성을 ...
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민문희 (인하대학교) ; 김민지 (인하대학교) ; 최유진 (학익여자고등학교) ; 유민주 (학익여자고등학교) ; 김유라 (학익여자고등학교) ; 안효빈 (학익여자고등학교) ; 김채현 (학익여자고등학교) ; 권채연 (학익여자고등학교) ; 배성호 (인하대학교) ; Min, Moon-Hee ; Kim, Min-Ji ; Choi, You-Jin ; You, Min-Ju ; Kim, Uy-Ra ; An, Hyo-Bin ; Kim, Chae-Hyun ; Kwon, Chae-Yeon ; Bae, Sung-Ho
2014
Korean
KCI등재,SCOPUS
학술저널
95-100(6쪽)
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Hrq1은 곰팡이 유전체에서 생물정보분석에 의해 발견된 새로운 RecQ helicase이다. 이 단백질은 인간의 RECQL4와 가장 상동성이 높으며 최근의 유전학적 생화학적 연구를 통해서 유전체 안정성을 ...
Hrq1은 곰팡이 유전체에서 생물정보분석에 의해 발견된 새로운 RecQ helicase이다. 이 단백질은 인간의 RECQL4와 가장 상동성이 높으며 최근의 유전학적 생화학적 연구를 통해서 유전체 안정성을 유지하는데 어떤 역할을 할 것으로 예상되었다. 본 연구에서는 RECQL4와 상호작용하는 것으로 알려진 인간 유전자들과 상동성이 있는 효모 유전자들이 Hrq1과 상호작용하는지를 yeast two-hybrid assay를 이용하여 조사하였다. 총 11개의 유전자를 조사한 결과, nucleotide excision repair (NER) 인자 중의 하나인 Rad14이 Hrq1과 상호작용하는 것을 발견하였다. 또한 정제한 단백질을 이용한 pull-down assay로 Hrq1과 Rad14 사이의 직접적인 상호작용을 확인하였다. Hrq1과 Rad14 사이의 yeast two-hybrid 상호작용은 4-nitroquinoline-1-oxide에 의한 DNA 손상으로 더욱 증가하였으며, 이러한 상호작용의 증가는 또 다른 NER 인자인 Rad4에 의존적이었다. 이러한 결과들은 Hrq1이 Rad14과의 상호작용을 통하여 NER 과정에 어떤 역할을 할 가능성을 제시하고 있다.
다국어 초록 (Multilingual Abstract)
Hrq1 is a novel member of RecQ helicase family, found in fungal genomes by bioinformatics analyses. It is most homologous to human RECQL4 and recent genetic and biochemical studies suggested that it may play roles in the maintenance of genome stabilit...
Hrq1 is a novel member of RecQ helicase family, found in fungal genomes by bioinformatics analyses. It is most homologous to human RECQL4 and recent genetic and biochemical studies suggested that it may play roles in the maintenance of genome stability. In this study, we investigated yeast two-hybrid interactions between Hrq1 and the yeast genes homologous to the human genes that are known to interact with RECQL4. Among the 11 genes tested, Rad14, a nucleotide excision repair (NER) factor, was found to interact with Hrq1. In addition, pull-down assay with the purified proteins revealed direct protein-protein interaction between Hrq1 and Rad14. The yeast two-hybrid interaction was enhanced by the DNA damage induced by 4-nitroquinoline-1-oxide, which was dependent on the presence of Rad4, a key NER factor. These results suggest that Hrq1 may function in NER through interaction with Rad14.
참고문헌 (Reference)
1 Ashton, T.M., "Yeast as a model system to study RecQ helicase function" 9 : 303-314, 2010
2 Riedl, T., "The comings and goings of nucleotide excision repair factors on damaged DNA" 22 : 5293-5303, 2003
3 Groocock, L.M., "The RecQ4 orthologue Hrq1 is critical for DNA interstrand cross-link repair and genome stability in fission yeast" 32 : 276-287, 2012
4 Bernstein, K.A., "The RecQ DNA helicases in DNA repair" 44 : 393-417, 2010
5 Compe, E., "TFIIH: when transcription met DNA repair" 13 : 343-354, 2012
6 Tsodikov, O.V., "Structural basis for the recruitment of ERCC1-XPF to nucleotide excision repair complexes by XPA" 26 : 4768-4776, 2007
7 Lafrance-Vanasse, J., "Structural and functional evidence that Rad4competes with Rad2 for binding to the Tfb1 subunit of TFIIH in NER" 41 : 2736-2745, 2013
8 Kwon, S.H., "Saccharomyces cerevisiae Hrq1 requires a long 3'-tailed DNA substrate for helicase activity" 427 : 623-628, 2012
9 Wang P. J., "Rnr4p, a novel ribonucleotide reductase small-subunit protein" 17 : 6114-6121, 1997
10 Bohr, V.A., "Rising from the RecQ-age: the role of human RecQ helicases in genome maintenance" 33 : 609-620, 2008
1 Ashton, T.M., "Yeast as a model system to study RecQ helicase function" 9 : 303-314, 2010
2 Riedl, T., "The comings and goings of nucleotide excision repair factors on damaged DNA" 22 : 5293-5303, 2003
3 Groocock, L.M., "The RecQ4 orthologue Hrq1 is critical for DNA interstrand cross-link repair and genome stability in fission yeast" 32 : 276-287, 2012
4 Bernstein, K.A., "The RecQ DNA helicases in DNA repair" 44 : 393-417, 2010
5 Compe, E., "TFIIH: when transcription met DNA repair" 13 : 343-354, 2012
6 Tsodikov, O.V., "Structural basis for the recruitment of ERCC1-XPF to nucleotide excision repair complexes by XPA" 26 : 4768-4776, 2007
7 Lafrance-Vanasse, J., "Structural and functional evidence that Rad4competes with Rad2 for binding to the Tfb1 subunit of TFIIH in NER" 41 : 2736-2745, 2013
8 Kwon, S.H., "Saccharomyces cerevisiae Hrq1 requires a long 3'-tailed DNA substrate for helicase activity" 427 : 623-628, 2012
9 Wang P. J., "Rnr4p, a novel ribonucleotide reductase small-subunit protein" 17 : 6114-6121, 1997
10 Bohr, V.A., "Rising from the RecQ-age: the role of human RecQ helicases in genome maintenance" 33 : 609-620, 2008
11 Fan, W., "RecQ4 facilitates UV light-induced DNA damage repair through interaction with nucleotide excision repair factor xeroderma pigmentosum group A (XPA)" 283 : 29037-29044, 2008
12 Chu, W.K., "RecQ helicases: multifunctional genome caretakers" 9 : 644-654, 2009
13 Mardiros, A., "Rad10-YFP focus induction in response to UV depends on RAD14 in yeast" 113 : 409-415, 2011
14 Croteau, D.L., "RECQL4 in genomic instability and aging" 28 : 624-631, 2012
15 Prakash, S., "Nucleotide excision repair in yeast" 451 : 13-24, 2000
16 Chris, K., "Methods in yeast genetics" Cold Spring Harbor Laboratory Press 207-217, 1994
17 Barea, F., "In silico analyses of a new group of fungal and plant RecQ4-homologous proteins" 32 : 349-358, 2008
18 Huang, M., "Identification of RNR4, encoding a second essential small subunit of ribonucleotide reductase in Saccharomyces cerevisiae" 17 : 6105-6113, 1997
19 최도희, "Hrq1 Functions Independently of Sgs1 to Preserve Genome Integrity in Saccharomyces cerevisiae" 한국미생물학회 51 (51): 105-112, 2013
20 최도희, "Hrq1 Facilitates Nucleotide Excision Repair of DNA Damage Induced by 4-Nitroquinoline-1-Oxide and Cisplatin in Saccharomyces cerevisiae" 한국미생물학회 52 (52): 292-298, 2014
21 James, P., "Genomic libraries and a host strain designed for highly efficient two-hybrid selection in yeast" 144 : 1425-1436, 1996
22 Guzder, S.N., "Complex formation with damage recognition protein Rad14 is essential for Saccharomyces cerevisiae Rad1-Rad10 nuclease to perform its function in nucleotide excision repair in vivo" 26 : 1135-1141, 2006
23 Rodriguez, K., "Affinity purification and partial characterization of a yeast multiprotein complex for nucleotide excision repair using histidine-tagged Rad14 protein" 273 : 34180-34189, 1998
24 Baudin, A., "A simple and efficient method for direct gene deletion in Saccharomyces cerevisiae" 21 : 3329-3330, 1993
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