PCR-Based Typing 방법들의 원리 및 응용 = Principles and Applications of Methods for PCR-Based Typing

국문 초록 (Abstract)

식품기인 식중독은 식품을 매개체로 하여 질병을 야기하는 원인 미생물에 노출됨으로써 발생한다. 원인 미생물들은 동일한 미생물 종(種) 내에서도 서로 매우 다양하여 다른 지역에서 혹은 다른 시간에 발생한 식중독 건(件)들로부터 분리될 경우에 subtype들로 분리 동정될 수 있다. 그러므로 이때 식중독 발생 사건을 확인하고, 식중독 근원을 결정하고, 대상 미생물의 독특한 독성 strain들의 유무를 확인하는 등의 식중독관련 업무를 효율적으로 집행하기 위하여 subtyping 과정은 매우 중요하다. 이때 이용되는 subtyping 방법은 typeability, discrimination power, 그리고 reproducibility 등과 같은 기술적인 요구도가 충족되어야 한다. 이외에 이용의 편리성 또한 중요하다. 그리고 특히 어떤 특정한 typing 방법의 실용성을 평가할 때에 기술적 어려움, 소요경비, 그리고 결과를 얻는데 필요한 시간들이 고려되어야만 한다. 그러므로 본 논문에서는 유전형 typing과 관련하여 현재 널리 이용되고 있는 세가지 PCR-based typing 기술들의 원리, 재현성과 분리동정 능력, 그리고 이용의 편리성 및 비용 등을 서로 상호 비교하여 세가지 방법들 사이의 실용성에 대한 정보를 제공하고자 하였다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

An outbreak of food-borne diseases often results from exposure to a common source of the food poisoning microbial agents. For most outbreaks, the bacterial isolates from different sources at different times and in different geographical regions may be differentiated into subtypes because there is sufficient diversity at the species level. Therefore, the process of subtyping is necessary epidemiologically for recognizing outbreaks of food-borne diseases, determining the sources of the diseases, and recognizing particularly virulent strains of the isolates. For those purposes, any subtyping method must meet several criteria, such as high typeability, high discrimination power, and good reproducibility, in order to be broadly used. Along with the considerations above, its ease of use is also important. The technical difficulty, cost, and time to obtain a result must be evaluated in assessing the utility of a particular typing method as well. In this review, we compared the three current technologies for PCR-based typing with regard to the principles of the methods and their reproducibility and differentiation power, ease of use, and other aspects of the methods in order to provide readers with a glimpse of the PCR-based technologies available today.