Pseudomonas sp. Strain DJ77에서 Rieske-Type의 Ferredoxin을 암호화하는 phnR 유전자의 구조 = Nucleotide Sequence of the phnR Gene Encoding Rieske-Type Ferredoxin from Pseudomonas sp. Strain DJ77

국문 초록 (Abstract)

phenanthrene을 cis-phenanthrene dihydrodiol 형태로 바꾸는데 관여하는 효소는 방향족고리에 두 개의 수산기를 붙이는 dioxygenase이다. phenanthrene과 biphenyl을 분해하는 능력이 있는 Pseudomonas sp. strain DJ77에서 클로닝한 재조합 플라즈미드 pUPX5로부터 전보의 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase을 암호화하는 phnQ의 하류방향으로 327개의 open reading frame을 발견하였다. 이 ORF, PhnR을 분석한 결과 dioxygenase의 Rieske-type ferredoxin 성분을 암호화하고 있는 것으로 밝혀졌다. PhnR은 108개의 아미노산으로 구성되어 분자량 11355의 단백질을 만들어내며, Sphingomonas BN6의 naphthalenesulfonic acid dioxygenase ferredoxin 단위체와 79.2%의 상동성을 나타내었고, Pseudomonas sp. strain C18의 DoxA, Pseudomonas sp. strain NCIB9816의 NdoA와 NahAb 등과는 46.7%의 상동성을 보였다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

One of the three components of the phenanthrene dioxygenase which is required for conversion of phenanthrene to cis-phenanthrene dihydrodiol, Rieske-type ferredoxin encoded by phnR has been cloned and sequenced from Pseudomonas sp. strain DJ77. The gene phnR is positioned at the downstream of phnQ encoding 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase. The PhnR ferredoxin contains 108 amino acids with a Mr of 11,355. The deduced amino acid sequence of the PhnR ferredoxin is 35-79% identical to those of homologous ferredoxins encoded by various genes.