신변종 바이러스 조기탐지 유전자 DB 유지보수 = Virus Sequence Database Maintenance

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

In this project, we have maintained the current system named as 'Virus Sequence Database', improved user interface and utility functions, and provided on-line user manual and help media so that usability and convenience of the system was elevated. The detail improvements and additions are the followings :
∎ Simplified web interface.
∎ Functions of curation program were added by following curator's demands.
∎ Papillomavirus, was newly added and the curation program corresponding to the virus was adopted.
∎ New complex function named as "My VSD" was developed to provide user's storage area for keeping interest of sequences, analysis, results, new project, management of research note, etc. And some of web board functions were also adopted to the My VSD.
∎ GenoTyping Tool at which Soongsil University had installed on the server, was ported to new Java version and moved to same server for the current system.
∎ Webalizer setting was adopted for every 3 hours watching.
∎ Updates of DBMS and index was applied.
∎ Boolean seraching was improved to provide intuitive usage.
∎ Help media were authored including texts and movies.

국문 초록 (Abstract)

기 구축된 “신․변종 병원체 조기탐지 DB 시스템”의 개선을 위해, 보기에 편한 인터페이스를 제공하고, 실 사용자가 이용하기 편리하도록 기능을 추가, 보완하고, 시스템의 활용도를 높이기 위해 매뉴얼을 제공하는 등 유지보수를 수행하였다. 이를 통해서 시스템 활용을 높이기 위한 기반을 마련하였다.
∎ 웹 사이트 개선의 일환으로 심플하게 웹 인터페이스를 개선하였음
∎ 기 구축된 바이러스 6종에 대한 큐레이터들의 요구사항을 분석하여 큐레이팅 프로그램에 반영하였음
∎ 기 구축 바이러스 6종외에 Papillomavirus를 추가로 구축하고, 이에 연관된 큐레이팅 프로그램을개발하였음
∎ 사용자별 맞춤형 연구지원을 위해, 프로젝트 생성 기능 추가, 실험일지 등록을 위한 게시판 기능추가, 서열 등록, 서열 분석, 분석 결과 저장 및 확인을 위한 MyVSD를 개발하였음
∎ 기존 숭실대에서 운영 중인 GenoTyping Tool을 버전 수정하여 이전, 적용하였음
∎ 기존 Webalizer를 3시간 마다 실시간 분석할 수 있게 개선하였음
∎ 데이터베이스 성능 개선을 위해, MySQL DB를 업데이트하고, Indexing을 적용하였음
∎ 멀티검색기능 개선을 위해, 직관적 검색이 가능하도록 and, or 연산을 별도로 수행하도록 개선하였음
∎ 시스템 활용도를 높이기 위해, 동영상 매뉴얼을 제작하였음