단백질 3차원 구조 관련 발명의 특허성에 대한 연구 = (A) study for the patentability of inventions relating to a protein 3-dimensional structure

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

Patent applications relating to a protein 3-dimensional (3-D) structure will increase as the importance of the protein 3-D structure increases in the development of new drugs. It is an objective of this study to present an Examining Guideline to determine the patentability of the inventions relating to the protein 3-D structure and appropriate patent strategies thereof with reference to a report on protein 3-D structure-related inventions by Trilateral Patent Offices (European Patent Office, Japanese Patent Office, and United States Patent and Trademark Office). Among the inventions relating to the protein 3-D structure, inventions regarding (1) a computer model of a protein; (2) a data array containing atomic coordinates of a protein; (3) a computer-readable storage medium encoded by atomic coordinates of a protein; (4) a database encoded by data containing names and structures of compounds; and (5) a pharmacophore fall under non-statutory inventions under the Korean patent law, so that the above (1) to (5) inventions may not be patentable. On the other hand, since inventions relating to a crystalline form of a protein and an isolated and purified polypeptide consisting of a portion of a protein containing a protein binding pocket fall under statutory inventions under the Korean patent law, they are considered to be patentable as long as they meet the patentability requirements, such as an industrial applicability, written description, novelty and inventive step, etc. Further, even in silico screening methods can be also patentable if it satisfies the patentability requirements.Since some inventions belong to non-statutory inventions among the inventions relating to the protein 3-D structure and different patentability requirements apply even if inventions in question are eligible for a patent, it is recommended to establish a proper strategy for patent applications with reference to the Examining Guideline as mentioned above depending on the types of inventions.

국문 초록 (Abstract)

최근 신약개발에 있어서 단백질 3차원 구조의 중요성이 크게 부각되고 있는 가운데, 이와 관련된 발명의 특허출원도 지속적으로 증가할 것으로 예상된다. 본 연구는 구체적 사례를 통한 단백질 3차원 구조 관련 발명의 특허성 판단에 대한 3극 특허청(유럽, 일본 및 미국특허청)의 비교연구를 참조하여 우리나라에서의 심사가이드라인 및 바람직한 특허전략을 제시하는데 그 목적이 있다.단백질 3차원 구조 관련 발명 중, (1) 단백질의 컴퓨터 모델; (2) 단백질의 원자 좌표를 포함하는 데이터 배열; (3) 단백질의 원자 좌표에 의해 암호화되는 컴퓨터-판독 저장 매체; (4) 화합물의 이름 및 구조를 포함하는 데이터로 암호화된 데이터베이스; 및 (5) 약리작용단에 관한 발명 등은 우리나라에서 법정발명에 해당하지 않아 특허받기가 불가능할 것으로 판단된다. 반면, 단백질의 결정형 및 단백질의 결합 부위를 포함하는 단백질의 일부로 이루어진 분리되고 정제된 폴리펩타이드는 모두 법정발명에 해당하고, 산업상 이용가능성, 명세서 기재요건, 신규성 및 진보성 등의 특허요건을 만족하면 특허받을 수 있을 것으로 판단된다. 나아가, in silico 스크리닝 방법의 경우에도, 일반적인 스크리닝 방법에서와 같이 제반 특허요건을 충족하는 한 특허받을 수 있을 것이다. 단백질 3차원 구조 관련 발명이라고 하더라도 발명의 종류에 따라 불특허대상 발명에 해당하는 것도 있고, 적법한 특허대상발명이라 하더라도 특허를 받기 위해 요구되는 조건에 차이가 있을 수 있으므로, 발명의 종류에 따라 앞서 언급한 심사가이드라인을 참고하여 특허출원 전략을 수립하는 것이 바람직할 것으로 사료된다.