생물정보 데이터베이스 구축을 위한 XML 적용 기법

국문 초록 (Abstract)

최근 셍물정보 분야에서 웹상에서 단백질과 유전자의 서열정보 및 이와 관련된 실험과 참조정보를 다른 유전체 데이터베이스 시스템과 상호교환을 위한 표준 형식으로 XML을 이용하기 시작하였다. 더불어 웹에서 데이터전송을 위한 표준 형식인 XML을 생물정보응용 분야에서 이용하기 위한 BioML을 정의하였다. 그러나 BioML에서는 서열의 소스 및 참조정보, 갱신정보와 XML문서사이의 참조정보를 포함하지 않고 있다. 따라서 이 논문에서는 BioML에서 포함하지 않는 이러한 정보를 XLink와 XPointer를 이용하여 나타낼 수 있도록 BioML을 확장하고 BioML에 포함된 서열 정보에 대한 메타정보를 RDF를 적용하여 제시하였다. 이렇게 함으로써 이질적인 생명정보데이터베이스 시스템에서 서열에 대한 복잡한 링크 정보와 서열의 변경정보를 효율적으로 교환이 가능하다.

목차 (Table of Contents)

• 요약
• 1. 서론
• 2. Xpath를 이용한 이질적인 소스 데이터 링크
• 2.1 생물정보 데이터 특징과 XML.
• 2.2. BioML
• 3. BioML 메타데이터를 위한 RDF
• 4. 결론 및 향후 연구방향