2-모수 파레토분포의 객관적 베이지안 추정

손영숙,Son, Young Sook 한국통계학회 2013 응용통계연구 Vol.26 No.5

본 연구에서는 2-모수 파레토분포에 대해 무정보사전분포인 준거사전분포의 가정 하에서 객관적 베이지안 모수추정 절차를 제안하였다. 베이지안 추정은 깁스샘플링에 의해서 수행된다. 깁스샘플러에서 모수생성하는 방법은 형태모수는 감마분포로부터 생성하고 척도모수는 적응기각표집 알고리즘에 의해 생성한다. 제안된 베이지안 모수추정 절차는 모의실험과 자료분석에서 기존의 추정방법들인 L-적률추정법, 최우추정법, 공액사전분포 하의 주관적 베이지안 모수추정법과 비교된다. An objective Bayesian estimation procedure of the two-parameter Pareto distribution is presented under the reference prior and the noninformative prior. Bayesian estimators are obtained by Gibbs sampling. The steps to generate parameters in the Gibbs sampler are from the shape parameter of the gamma distribution and then the scale parameter by the adaptive rejection sampling algorism. A numerical study shows that the proposed objective Bayesian estimation outperforms other estimations in simulated bias and mean squared error.

Differential Responses to TGF Alpha in between Invasive Squamous Cell Carcinoma Cell Line and Noninvasive One

손영숙,최명재,정명희,박찬웅,Son, Young-Sook,Chey, Myoung-Jae,Fuchs, Elaine,Chung, Myung-Hee,Park, Chan-Woong The Korean Society of Pharmacology 1993 대한약리학잡지 Vol.29 No.1

SCC 12와 SCC 13 세포주는 피부의 상피암 조직에서 유래되었다. 본 연구에서는, 세포배양으로 in vivo 피부의 거의 모든 특징들을 재현할 수 있는 raft 배양법을 이용하여, 두 종류의 상피 암세포주의 진피 침투성 정도를 비교해 보았다. SCC 12 세포주의 raft 배양에서는, collagen matrix로 침투하는 많은 세포군들이 관찰되었고, 또한 기저세포와 유사한 세포들이 분화층 중간에 관찰되었다. 그러나 SCC 13 세포주의 raft 배양에서는 침투성 세포들이 전혀 관찰되지 않았다. 어떤 인자가 SCC 12 세포주의 침투성에 관여하였는지를 조사하기 위하여, 세포이동 또는 matrix 파괴에 관여하는 각종 단백질 즉, type 1 collagenase, Fn, Fn 수용체와 EGF 수용체 등의 기본 생합성속도를 침투성과 비침투성 세포주에서 측정하였다. 그 중 type 1 collagenase의 생합성만이 침투성 세포주에서 현저히 높게 나타났다. 침투성 SCC 12 세포주에서 관찰된 높은 type 1 collagenase 생합성과 이들 세포주의 침투성과의 연관관계 및 그 기작을 조사하기 위하여 두 세포주에서 TGF alpha에 대한 반응의 차이를 조사하였다. 비침투성 세포주에서는, TGF alpha에 의해 type 1 collagenase의 생합성이 처음 12시간 동안에 현저한 증가를 보였으나 24시간부터 그 유도가 down-regulation되는 현상을 보였다. 그러나 침투성 세포는 TGF alpha에 의해 계속적인 type 1 collagenase의 유도를 보였다. 이에 저자들은 EGF 수용체의 down-regulation으로 인해 type 1 collagenase의 down-regulation이 유도되고, 이와 같은 regulation의 결함으로 인해 SCC 12 세포주가 collagen matrix로 침투하는 현상을 나타낼 것으로 제시하였다. Both SCC 12 and SCC 13 cell lines were derived from squamous cell carcinoma (SCC) of the skin (Wu and Rheinwald, 1981). In the present study, we compared the inherent invasive activity in their raft cultures where most in vivo characteristics of epidermis can be reproduced by cell culture method. The raft culture of SCC 12 cell line produced many invading colonies within the collagen lattice and basal-like cells in the middle of differentiating cell layers, but no invasive activity was observed in the SCC 13 raft culture. We investigated which factors are implicated in inherent invasive activity of SCC 12 cell line by examining basal levels of type I collagenase, EGF receptor, fibronectin, and its receptor in two cell lines. Among them, only type I collagenase was significantly higher in invasive SCC 12 cells than in non-invasive SCC 13 cells. Furthermore, we tried to investigate mechanisms underlying between SCC 12 cell's inherent invasive activity and its high basal level of type I collagenase. As one of them, discrepancy in TGF alpha mediated responses between two cell lines was observed. In SCC 13 cells, TGF alpha initially stimulated type I collagenase at 12 h after TGF alpha treatment and then its down regulation was followed from 24 h even though TGF alpha was continuously present in the medium. However in SCC 12 cells, TGF alpha continuously stimulated type I collegenase up to 48 h. We propose that defect in EGF receptor's down-regulation may be involved in lack of type I collagenase's down-regulation and its possible connection to invasive activity of SCC 12 cell line.

시간경로 유전자 발현자료의 군집분석에서 이질적인 시계열의 탐지를 위한 패턴일치지수

손영숙,백장선,Son, Young-Sook,Baek, Jang-Sun 한국통계학회 2005 응용통계연구 Vol.18 No.2

본 논문에서는 피어슨 상관계수를 이용한 시간경로 유전자 발현자료의 군집분석에서 군집의 대표적인 패턴에서 벗어나는 이질적인 패턴을 보이는 시계열을 탐지하기 위한 패턴일치지수를 제안하고, 이를 마이크로어레이 실험으로부터 얻어진 혈청 시간경로 유전자 발현자료에 적용하여 유용성을 검토해 본다. In this paper, we propose a pattern consistency index for detecting heterogeneous time series that deviate from the representative pattern of each cluster in clustering time course gene expression data using the Pearson correlation coefficient. We examine its usefulness by applying this index to serum time course gene expression data from microarrays.

시계열모형에 의한 전력판매량 예측

손영숙,Son, Young Sook 한국통계학회 2014 응용통계연구 Vol.27 No.3

전력수급의 정확한 예측은 국민들의 일상적 생활 유지, 산업활동, 그리고 국가경영을 위하여 매우 중요하다. 본 연구에서는 시계열모형화에 의해 전력판매량을 예측한다. 실제 자료분석을 통하여 입력시계열로서 냉난방도일과 개입변수로 펄스함수를 사용한 전이함수모형이 다른 시계열모형에 비해서 제곱근평균제곱오차 및 평균절대오차의 의미에서 더 우수하였다. An accurate prediction of electricity supply and demand is important for daily life, industrial activities, and national management. In this paper electricity sales is predicted by time series modelling. Real data analysis shows the transfer function model with cooling and heating days as an input time series and a pulse function as an intervention variable outperforms other time series models for the root mean square error and the mean absolute percentage error.

침투성 상피암세포주와 비침투성 상피암세포주의 TGF alpha에 대한 반응의 차이

손영숙(Young-Sook Son),최명재(Myoung-Jae Chey),Elaine Fuchs,정명희(Myung Hee Chung),박찬웅(Chan Woong Park) 대한약리학회 1993 대한약리학잡지 Vol.29 No.1

SCC 12와 SCC 13 세포주는 피부의 상피암 조직에서 유래되었다. 본 연구에서는, 세포배양으로 in vivo 피부의 거의 모든 특징들을 재현할 수 있는 raft 배양법을 이용하여, 두 종류의 상피 암세포주의 진피 침투성 정도를 비교해 보았다. SCC 12 세포주의 raft 배양에서는, collagen matrix로 침투하는 많은 세포군들이 관찰되었고, 또한 기저세포와 유사한 세포들이 분화층 중간에 관찰되었다. 그러나 SCC 13 세포주의 raft 배양에서는 침투성 세포들이 전혀 관찰되지 않았다. 어떤 인자가 SCC 12 세포주의 침투성에 관여하였는지를 조사하기 위하여, 세포이동 또는 matrix 파괴에 관여하는 각종 단백질 즉, type 1 collagenase, Fn, Fn 수용체와 EGF 수용체 등의 기본 생합성속도를 침투성과 비침투성 세포주에서 측정하였다. 그 중 type 1 collagenase의 생합성만이 침투성 세포주에서 현저히 높게 나타났다. 침투성 SCC 12 세포주에서 관찰된 높은 type 1 collagenase 생합성과 이들 세포주의 침투성과의 연관관계 및 그 기작을 조사하기 위하여 두 세포주에서 TGF alpha에 대한 반응의 차이를 조사하였다. 비침투성 세포주에서는, TGF alpha에 의해 type 1 collagenase의 생합성이 처음 12시간 동안에 현저한 증가를 보였으나 24시간부터 그 유도가 down-regulation되는 현상을 보였다. 그러나 침투성 세포는 TGF alpha에 의해 계속적인 type 1 collagenase의 유도를 보였다. 이에 저자들은 EGF 수용체의 down-regulation으로 인해 type 1 collagenase의 down-regulation이 유도되고, 이와 같은 regulation의 결함으로 인해 SCC 12 세포주가 collagen matrix로 침투하는 현상을 나타낼 것으로 제시하였다. Both SCC 12 and SCC 13 cell lines were derived from squamous cell carcinoma (SCC) of the skin (Wu and Rheinwald, 1981). In the present study, we compared the inherent invasive activity in their raft cultures where most in vivo characteristics of epidermis can be reproduced by cell culture method. The raft culture of SCC 12 cell line produced many invading colonies within the collagen lattice and basal-like cells in the middle of differentiating cell layers, but no invasive activity was observed in the SCC 13 raft culture. We investigated which factors are implicated in inherent invasive activity of SCC 12 cell line by examining basal levels of type I collagenase, EGF receptor, fibronectin, and its receptor in two cell lines. Among them, only type I collagenase was significantly higher in invasive SCC 12 cells than in non-invasive SCC 13 cells. Furthermore, we tried to investigate mechanisms underlying between SCC 12 cell s inherent invasive activity and its high basal level of type I collagenase. As one of them, discrepancy in TGF alpha mediated responses between two cell lines was observed. In SCC 13 cells, TGF alpha initially stimulated type I collagenase at 12 h after TGF alpha treatment and then its down regulation was followed from 24 h even though TGF alpha was continuously present in the medium. However in SCC 12 cells, TGF alpha continuously stimulated type I collegenase up to 48 h. We propose that defect in EGF receptor s down-regulation may be involved in lack of type I collagenase s down-regulation and its possible connection to invasive activity of SCC 12 cell line.

Symposia / S12-4 : Development of Ideal Bioartificial Skin

손영숙(Young Sook Son),(Yong Ha Yoon),(Seung Hoon Lee) 한국생화학분자생물학회 (구 한국생화학회) 1999 생화학분자생물학회 춘계학술발표논문집 Vol.- No.-

Bayesian Estimation via the Griddy Gibbs Sampling for the Laplacian Autoregressive Time Series Model

손영숙(Young Sook Son),조신섭(Sin Sup Cho) 한국통계학회 1995 Communications for statistical applications and me Vol.2 No.2

산소유리라디칼이 뇌조직 미크로좀분획의 Na⁺-K⁺-ATPase 활성도에 미치는 영향

오세문(Sae Moon Oh)손영숙(Young Sook Son),최길수(Kil Soo Choi),임정규(Jung Kyoo Lim),정명희(Myung Hee Chung) 대한약리학회 1982 대한약리학잡지 Vol.18 No.2

중추신경계의 혈관폐쇄 또는 충격손상에 의한 허혈병소에서 진행되는 병리적 변화에 산소유리라디칼이 중요한 역할을 할 것으로 시사되고 있다. 저자는 산소유리라디칼이 뇌조직에 미치는 영향 중 특히 신경세포 정지막전위 유지에 중요한 Na⁺-K⁺-ATPase의 활성도에 미치는 영향을 관찰하기 위하여 산틴산화효소 반응계와 뇌조직미크로좀을 이용하여 본 연구를 시행하였다. 미크로좀분획(microsomal fraction)을 산틴과 산틴산화효소와 함께 반응시켰을 때, 분획의 Na⁺-K⁺-ATPase의 활성도는 현저한 불활성화를 보인 반면, Mg⁺⁺-ATPase의 활성도는 별로 영향을 받지 않았다. 이 불활성화는 산틴과 신틴산화효소 중 어느 한 물질이라도 반응계에 존재하지 않는 경우에는 나타나지 않았고, 두 물질이 같이 반응계에 존재할 때 나타났다. 산틴과 산틴산화효소의 반응에서 생성되는 산소유리라디칼들 중, 어떤 것이 Na⁺-K⁺-ATPase불활성화에 관계하고 있는가를 알아보기 위하여, 산수유리라디칼 각각에 대하여 제독작용을 가진 효소나 화학물질을 사용하여 불활성화의 저해유무를 관찰하였다. O^-₂⋅의 제독효소인 superoxide dismutase, H₂O₂의 제독효소인 catalase와 ¹O₂의 제독물질인 1,4-diazabixyclo(2,2,2)octane을 각각 사용하였을 때, 이들 물질들이 농도에 비례하여 Na⁺-K⁺-ATPase의 불활성화가 저해되었다. 그러나 OH⋅의 제독물질인 mannitol은 뚜렷한 효과를 보이지 못했다. 이상의 결과는 산소유리라디칼들 중 O^-₂⋅, H₂O₂ 및 ¹O₂가 Na⁺-K⁺-ATPase의 불활성화에 관계하고 있고, OH⋅는 거의 관계하지 않는다는 것을 시사하여 주었다. 이로 미루어, 산소유리라디칼에 의한 뇌조직 Na⁺-K⁺-ATPase의 불활성화는 뇌 허혈병소에서 관찰되는 신경세로의 기능적 장해를 유발시키는 한 요인으로 사료되었다. The effects of xanthine-xanthine oxidase reaction on brain microsomal Na⁺-K⁺-ATPase activity were studied to see possible involvement of oxygen free radicals in pathologic change occurring in ischemic state of CNS accompanied by cerebral vascular occlusion or impact injury. When microsomal fraction was incubated with xanthine ana xanthine oxidase, Na⁺-K⁺-ATPase activity of the fraction was markedly inactivated (80% inactivation) whereas btssl Mg⁺⁺-ATPase was much less sensitive (less than 10% inactivation) compared to that of Na⁺-K⁺-ATPase. The inactivation was observed only in the presence of both xanthine and xanthine oxidase, not either of them alone, and the extent of inactivation was dependent on the concentration of xanthine. In an attempt to determine which of the oxygen species was responsible for the inactivation, the ability of various scavengers to overcome the inactivation was tested. Superoxide dismutase, catalase and 1,4-diazabicyclo(2,2,2)octane were shown to reverse the inactivation of the ATPase in dose-dependent manner. In contrast, mannitol as well as other OH⋅quenchers were ineffective in limiting oxygen radical-induced inactivation. Thus OO^-₂⋅, H₂O₂ and ¹O₂ were implicated to be mediators involved in the inactivation. Since oxygen radicals are suspected as being a cause of the peroxidative damaging process in train ischemia, the ATPase inactivation by oxygen radicals may be a possible contributing factor which gives rise to functional derangement of nerve cells observed in the pathologic process.

Effects of Oxygen-Derived Free Radicals on Brain Microsomal $Na^+-K^+-ATPase$ Activity

오세문,손영숙,최길수,임정규,정명희,Oh, Sae-Moon,Son, Young-Sook,Choi, Kil-Soo,Lim, Jung-Kyoo,Chung, Myung-Hee The Korean Society of Pharmacology 1982 대한약리학잡지 Vol.18 No.2

중추신경계의 혈관폐쇄 또는 충격손상에 의한 허혈병소에서 진행되는 병리적 변화에 산소유리라디칼이 중요한 역할을 할 것으로 시사되고 있다. 저자는 산소유리라디칼이 뇌조직에 미치는 영향 중 특히 신경세포 정지막전위 유지에 중요한 $Na^+-K^+-ATPase$의 활성도에 미치는 영향을 관찰하기 위하여 산틴산화효소 반응계와 뇌조직미크로좀을 이용하여 본 연구를 시행하였다. 미크로좀분획(microsomal fraction)을 산틴과 산틴산화효소와 함께 반응시켰을 때, 분획의 $Na^+-K^+-ATPase$의 활성도는 현저한 불활성화를 보인 반면, $Mg^{++}-ATPase$의 활성도는 별로 영향을 받지 않았다. 이 불활성화는 산틴과 신틴산화효소 중 어느 한 물질이라도 반응계에 존재하지 않는 경우에는 나타나지 않았고, 두 물질이 같이 반응계에 존재할 때 나타났다. 산틴과 산틴산화효소의 반응에서 생성되는 산소유리라디칼들 중, 어떤 것이 $Na^+-K^+-ATPase$불활성화에 관계하고 있는가를 알아보기 위하여, 산수유리라디칼 각각에 대하여 제독작용을 가진 효소나 화학물질을 사용하여 불활성화의 저해유무를 관찰하였다. $O_{\bar{2}}{\cdot}$의 제독효소인 superoxide dismutase, $H_2O_2$의 제독효소인 catalase와 $^1O_2$의 제독물질인 1,4-diazabixyclo(2,2,2)octane을 각각 사용하였을 때, 이들 물질들이 농도에 비례하여 $Na^+-K^+-ATPase$의 불활성화가 저해되었다. 그러나 $OH{\cdot}$의 제독물질인 mannitol은 뚜렷한 효과를 보이지 못했다. 이상의 결과는 산소유리라디칼들 중 $O_{\bar{2}}{\cdot},\;H_2O_2$ 및 $^1O_2$가 $Na^+-K^+-ATPase$의 불활성화에 관계하고 있고, $OH{\cdot}$는 거의 관계하지 않는다는 것을 시사하여 주었다. 이로 미루어, 산소유리라디칼에 의한 뇌조직 $Na^+-K^+-ATPase$의 불활성화는 뇌 허혈병소에서 관찰되는 신경세로의 기능적 장해를 유발시키는 한 요인으로 사료되었다. The effects of xanthine-xanthine oxidase reaction on brain microsomal $Na^+-K^+-ATPase$ activity were studied to see possible involvement of oxygen free radicals in pathologic change occurring in ischemic state of CNS accompanied by cerebral vascular occlusion or impact injury. When microsomal fraction was incubated with xanthine ana xanthine oxidase, $Na^+-K^+-ATPase$ activity of the fraction was markedly inactivated (80% inactivation) whereas btssl $Mg^{++}-ATPase$ was much less sensitive (less than 10% inactivation) compared to that of $Na^+-K^+-ATPase$. The inactivation was observed only in the presence of both xanthine and xanthine oxidase, not either of them alone, and the extent of inactivation was dependent on the concentration of xanthine. In an attempt to determine which of the oxygen species was responsible for the inactivation, the ability of various scavengers to overcome the inactivation was tested. Superoxide dismutase, catalase and 1,4-diazabicyclo(2,2,2)octane were shown to reverse the inactivation of the ATPase in dose-dependent manner. In contrast, mannitol as well as other $OH{\cdot}$quenchers were ineffective in limiting oxygen radical-induced inactivation. Thus $O_{\bar{2}}{\cdot},\;H_2O_2$ and $^1O_2$ were implicated to be mediators involved in the inactivation. Since oxygen radicals are suspected as being a cause of the peroxidative damaging process in train ischemia, the ATPase inactivation by oxygen radicals may be a possible contributing factor which gives rise to functional derangement of nerve cells observed in the pathologic process.

생인공치주인대 제조를 위한 차폐막이 부착된 복합 나노섬유 스캐폴드의 제조

서영권 ( Young Kwon Seo ),안재일 ( Jae Il Ahn ),최경민 ( Kyung Min Choi ),윤희훈 ( Hee Hoon Yoon ),송계용 ( Kye Yong Song ),김영진 ( Young Jin Kim ),최정원 ( Jeong Won Choi ),손영숙 ( Young Sook Son ),박정극 ( Jung Keug Park ) 한국조직공학과 재생의학회 2006 조직공학과 재생의학 Vol.3 No.4

Various biodegradable scaffolds have been used for the development of bioartificial periodontal ligament( Bio-PDL), but those scaffolds were focused on cell growth and differentiation only, and could not function as a guided tissue regeneration(GTR) membrane which can inhibit gingival cells migration. So, in this study, we tried to make a composite scaffold composed of collagen nanofiber on amniotic membrane(AM) using electrospinning for dental tissue engineering. As results, we could make a composite scaffold whose breaking load was 1±0.3 N superior to nanofiber scaffold without AM(0.1±0.05 N). After seeding of PDL cell on each scaffold, they attached and proliferated well on both scaffolds. However nanofiber only scaffold was contracted after 5 days of culture, but composite nanofiber scaffold was not contracted for all culture days. In conclusion, the composite nanofiber scaffold made by electrospun collagen fiber on AM will be a suitable substrate for PDL cell culture finally resulting in a good Bio-PDL.