Prediction of Response to Sorafenib in Hepatocellular Carcinoma: A Putative Marker Panel by Multiple Reaction Monitoring-Mass Spectrometry (MRM-MS)

Kim, Hyunsoo,Yu, Su Jong,Yeo, Injun,Cho, Young Youn,Lee, Dong Hyeon,Cho, Yuri,Cho, Eun Ju,Lee, Jeong-Hoon,Kim, Yoon Jun,Lee, Sungyoung,Jun, Jongsoo,Park, Taesung,Yoon, Jung-Hwan,Kim, Youngsoo American Society for Biochemistry and Molecular Bi 2017 Molecular and Cellular Proteomics Vol.16 No.7

<P>Sorafenib is the only standard treatment for unresectable hepatocellular carcinoma (HCC), but it provides modest survival benefits over placebo, necessitating predictive biomarkers of the response to sorafenib. Serum samples were obtained from 115 consecutive patients with HCC before sorafenib treatment and analyzed by multiple reaction monitoring-mass spectrometry (MRM-MS) and ELISA to quantify candidate biomarkers. We verified a triple-marker panel to be predictive of the response to sorafenib by MRM-MS, comprising CD5 antigen-like (CD5L), immunoglobulin J (IGJ), and galectin-3-binding protein (LGALS3BP), in HCC patients. This panel was a significant predictor (AUROC > 0.950) of the response to sorafenib treatment, having the best cut-off value (0.4) by multivariate analysis. In the training set, patients who exceeded this cut-off value had significantly better overall survival (median, 21.4 months) than those with lower values (median, 8.6 months; p = 0.001). Further, a value that was lower than this cutoff was an independent predictor of poor overall survival [hazard ratio (HR), 2.728; 95% confidence interval (CI), 1.312-5.672; p = 0.007] and remained an independent predictive factor of rapid progression (HR, 2.631; 95% CI, 1.448-4.780; p = 0.002). When applied to the independent validation set, levels of the cut-off value for triple-marker panel maintained their prognostic value for poor clinical outcomes. On the contrast, the triple-marker panel was not a prognostic factor for patients who were treated with transarterial chemoembolization (TACE). The discriminatory signature of a triple-marker panel provides new insights into targeted proteomic biomarkers for individualized sorafenib therapy.</P>

이동 통신 환경에서의 상호인증 및 세션키 공유 프로토콜의 성능향상

윤현수(Hyunsoo Yoon),조유근(Yookun Cho),이승원(Seungwon Lee),홍성민(Seong-Min Hong) 한국정보과학회 1999 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 Vol.26 No.11

이동 통신은 대기를 전달매체로 하고 이동단말기를 사용하기 때문에 가로채기나 불법사용과 같은 공격에 취약하다. 이를 극복하기 위해, 이동 통신 환경에서 이동단말기와 기지국 사이에 안전한 통신을 제공하기 위한 많은 프로토콜들이 제안되어왔다. 그러나 이동단말기의 부족한 계산능력과 전력량 때문에 공개키를 이용한 프로토콜들은 많은 장점에도 불구하고 충분히 활용되지 못했다. 본 논문에서는 이동 통신 환경에서 기지국과 이동단말기 사이의 상호인증 및 세션키 공유 프로토콜들의 성능을 향상시킬 수 있는 기법을 제안한다. 본 논문에서 제안하는 기법은 이동단말기의 비밀 정보를 기지국에게 드러나게 하지 않으면서 많은 계산을 기지국으로 하여금 대신 수행하도록 하는 것이다. 제안된 기법은 기존의 프로토콜들을 최대 5배까지 성능을 향상시키며 해당하는 만큼 이동단말기의 전력량 소모를 감소시킬 수 있다. Mobile communication is more vulnerable to security attacks such as interception and unauthorized access than fixed network communication. To overcome these problems, many protocols have been proposed to provide a secure channel between a mobile station and a base station. However, these public-key based protocols have not been fully utilized due to the poor computing power and small battery capacity of mobile stations. In this paper, we propose techniques for accelerating public-key based key establishment protocols between a mobile station and a base station. The proposed techniques enable a mobile station to borrow computing power from a base station without revealing its secret information. The proposed schemes accelerate the previous protocols up to five times and reduce the amount of power consumption of mobile stations.

자원봉사동기의 잠재프로파일 유형 및 역할정체성, 사회적 신뢰의 차이

권현수(Hyunsoo Gweon) 사회복지정책실천회 2022 사회복지정책과 실천 Vol.8 No.3

본 연구는 국내 자원봉사센터 소속 자원봉사자의 자원봉사참여동기의 잠재프로파일을 분류하고 잠재프로파일 유형별 역할 정체성과 사회적 신뢰와의 차이를 검증하고자 하였다. 동시에 기존 선행연구에서 대부분 인용되고있는 기능주의적 자원봉사동기 개념을 극복하기 위해 자원봉사활동의 사회서비스 성격에 사회변화를 지향하는 성격을 결합한 변혁적 자원봉사(Transformative Volunteerism) 개념을 적용하여 자원봉사동기를 재구성하였다. 전국 245개 자원봉사센터 소속 자원봉사자를 대상으로 온라인 설문조사를 통해 자료를 수집하였으며, 최종 852부를 분석자료로 활용하였다. 분석결과, 자원봉사 동기 수준에 따라 잠재프로파일이 4개로 분류되었고, 이를각각‘저동기, 지식이해 유형’(6.5%), ‘고동기, 혼합형’(20.2%), ‘중간수준, 평균형’(39.5%), ‘고동기, 균형형’(33.8%)으로 명명하였다. 그리고, 자원봉사동기유형별 특성 및 자원봉사동기 프로파일과 역할 정체성, 사회적 신뢰와의 차이에 대해 검증한 결과, 자원봉사동기 프로파일별로 연령, 학력, 종교, 자원봉사 참여 기간에 대한 유의미한 차이가 있었고, 역할 정체성, 사회적 신뢰간에도 유의미한 차이가 있는 것으로 나타났다. 본 연구는 변혁적 자원봉사의 개념을 적용하여 자원봉사자의 사회 혁신적가치, 협력 지향, 조직헌신 의지와 같은 동기가 포함된 자원봉사동기를 더욱포괄적으로 확인하고자 하였고, 잠재프로파일분석을 적용하여 자원봉사동기를 사람 중심적 관점에서 분류하고 그 유형에 해당하는 자원봉사자들의 특성을 확인해봄으로써, 자원봉사자 개개인이 가지고 있는 자원봉사동기의 다양성을 인정하고 이해할 수 있었다는 부분에서 연구의 의의를 찾을 수 있을것이다. This study analyzed the latent profiles depending on the volunteer motivation and examined the characteristics of each profiles. In addition, this study is aimed at investigating the differences in the role identity of volunteer and social trust according to each latent class. At the same time, This study introduced the concept of transformative volunteerism that aims to change social change by overcoming the concept of functionalist volunteer motivation, which is mostly cited in existing previous studies, and combining social services and social change. The data were collected through online surveys for volunteers from 245 volunteer centers nationwide, and the final 852 copies were used as an analysis data. The results of this study revealed that there were four latent profiles amongst volunteers, distinguished by their volunteer motivation levels; a low motivation, knowledge understanding type group(6.5%), a high motivation, mixed type group(20.2%), an middle-level motivation level, average type group(39.5%) and a high motivation, balanced type group(33.8%). In addition, it was verified about the characteristics of volunteer motivation profiles and statistically significant difference in an volunteer’s role identity and social trust according to the pattern of volunteer’s motivations. Based on these findings, the study discusses practical implications that can promote the motivation of volunteers in Korea.

아이디 기반 대리 Signcryption 기법들에 대한 연구

윤여정(Yeojeong Yoon),박찬일(Chanil Park),윤현수(Hyunsoo Yoon) 한국정보과학회 2010 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.37 No.1D

아이디 기반 암호 체계는 공개키를 생성하기 위하여 별도의 정보 교환을 하지 않고, 사용자의 신원을 확인할 수 있는 고유 정보를 이용하여 공개키를 생성함으로써 효율적인 공개키 생성 및 관리가 가능하다. 또한 대리 서명 기법은 원 서명자가 부득이하게 서명을 할 수 없을 경우 자신이 선택한 대리 서명자 에게 서명 권한을 위임함으로써 대리 서명자가 원 서명자 대신 서명을 할 수 있는 기능을 제공하는 기법이다. Signcryption 기법은 하나의 기법으로 서명과 암호화 모두를 수행 할 수 있다. 위 기법들의 장점을 한번에 취할 수 있는 기법이 아이디 기반 대리 Signcryption 기법이다. 본 논문에서는 아이디 기반 대리 Signcryption 기법을 이해하기 위해 필요한 기반 지식과 아이디 기반 대리 Signcryption 기법에 대하여 기술하고자 한다.

Comparative Approach to Capture Bacterial Diversity of Coastal Waters

Hyunsoo Na,Seok-Hwan Yoon,Yunmin Kim,천종식,Jongsik Chun 한국미생물학회 2011 The journal of microbiology Vol.49 No.5

Despite the revolutionary advancements in DNA sequencing technology and cultivation techniques, few studies have been done to directly compare these methods. In this study, a 16S rRNA gene-based, integrative approach combining culture-independent techniques with culture-dependent methods was taken to investigate the bacterial community structure of coastal seawater collected from the Yellow Sea, Korea. For culture-independent studies, we used the latest model pyrosequencer, Roche/454 Genome Sequencer FLX Titanium. Pyrosequencing captured a total of 52 phyla including 27 candidate divisions from the water column, whereas the traditional cloning approach captured only 15 phyla including 2 candidate divisions. In addition, of 878 genera retrieved, 92.1% of the sequences were unique to pyrosequencing. For culture-dependent analysis, plate culturing, plate washing, enrichment, and high-throughput culturing (HTC) methods were applied. Phylogenetic analysis showed that the plate-washing clones formed a cluster devoid of any previously cultured representatives within the family Rhodobacteraceae. One HTC isolate (SF293) fell into the OM182 clade, which was not recovered by other culturing methods described here. By directly comparing the sequences obtained from cultures with those from culture-independent work, we found that only 33% of the culture sequences were identical to those from clone libraries and pyrosequences. This study presents a detailed comparison of common molecular and cultivation techniques available in microbial ecology. As different methods yielded different coverage, we suggest choosing the approach after carefully examining the scientific questions being asked.

체육교사학습공동체 참여 양상 탐색

윤기준,전세명,정현수 이화여자대학교 교과교육연구소 2017 교과교육학연구 Vol.21 No.5

본 연구의 목적은 체육교사의 교사학습공동체 참여 동기 및 양상을 탐색하는 데 있다. 이를 위해 중등학교 체육교사 2명과 초등학교 교사 2명을 연구 참여자로 선정하였으며 심층면담으로 자료를 수집하였다. Corbin & Strauss(2008)가 제시한 개방-축-선택 코딩 기법을 활용하여 분석한 결과 세 가지의 범주가 생성되었다. 첫째, 교사들은 수업 개선을 위한 실질적 지식의 습득을 위해서 교사학습공동체에 참여하는 것으로 나타났으며, 물리적 거리 및 기존 구성원과의 유대 관계 형성이 가입 과정에서 겪는 어려움으로 나타났다. 둘째, 수업 개선 체험, 구성원과의 긍정적 유대 관계 형성, 공동체 내 중요 역할 수행은 교사들의 지속적인 공동체 참여에 긍정적인 영향을 미쳤다. 셋째, 탄력적 운영, 수용적 분위기, 수업 개선 활동 유지가 효과적인 체육교사 전문성 개발을 위한 교사학습공동체의 특성으로 도출되었다. 이를 바탕으로 단위학교 기반 교사학습공동체의 형성 및 구성원의 참여 양상과 교사학습공동체를 통한 교사 전문성 개발 원리를 구체적으로 탐색하는 연구 수행을 제안한다. The purpose of this study was to explore motivational aspects that comprise of physical education (PE) teachers’ participation in communities of practice (CoP). Two PE teachers and two elementary school teachers participated in this project. Semi-structured interviews were conducted in order to collect data. The data were analyzed with an inductive category analysis suggested by Corbin and Strauss (2008). A total of three themes were constructed. Firstly, the research participants participated in CoPs in order to obtain practical knowledge leading the enhancement of PE lessons. Long distances to CoP meetings and difficulties of forming rapport were barriers toward participation in CoPs. Secondly, experiencing the improvement of PE lessons, positive interaction with members, and taking important roles in CoPs led to the teachers’ continuous participation. Thirdly, flexible management of CoP, supportive environment, and retaining focus of developing pedagogies were characteristics of CoP that contributed to the teachers’ effective professional development. Based on these findings, implications for conducting future PE-CoP research are suggested.

Enhanced electrocatalytic activity of the Au-electrodeposited Pt nanoparticles-coated conducting oxide for the quantum dot-sensitized solar cells (5 pages)

Yoon, Yeung-Pil,Kim, Jae-Hong,Kang, Soon-Hyung,Kim, Hyunsoo,Choi, Chel-Jong,Kim, Kyong-Kook,Ahn, Kwang-Soon AMERICAN INSTITUTE OF PHYSICS 2014 APPLIED PHYSICS LETTERS Vol.105 No.8

Prediction of Response to Sorafenib in Hepatocellular Carcinoma: A Marker Panel by Multiple Reaction Monitoring- mass Spectrometry

( Hyunsoo Kim ),( Su Jong Yu ),( Injun Yeo ),( Jeong-ju Yoo ),( Dong Hyeon Lee ),( Yuri Cho ),( Eun Ju Cho ),( Jeong-hoon Lee ),( Yoon Jun Kim ),( Sungyoung Lee ),( Jongsoo Jun ),( Taesung Park ),( Ju 대한간학회 2016 춘·추계 학술대회 (KASL) Vol.2016 No.1

Aims: Sorafenib is the only standard treatment for advanced hepatocellular carcinoma (HCC), but it provides modest survival benefits over placebo, necessitating predictive biomarkers of the response to sorafenib. Methods: Serum samples were obtained before and after sorafenib treatment from 115 consecutive patients [training set (n = 65) and validation set (n = 50)] with HCC and analyzed by multiple reaction monitoring-mass spectrometry (MRM-MS) to quantify candidate biomarkers. Results: We verified a triple-marker panel to be predictive of the response to sorafenib by MRM-MS in HCC patients. This panel was a significant predictor (AUROC > 0.950) of the response to sorafenib treatment, having the best cutoff value by multivariate analysis. In the training set, patients who exceeded this threshold (0.4) had significantly better overall survival (median, 21.4 months) than those with lower values (median, 8.6 months; P = 0.001). Further, a value that was lower than this cutoff was an independent predictor of poor overall survival [hazard ratio (HR), 2.728; 95% confidence interval (CI), 1.312-5.672; P = 0.007] and remained an independent predictive factor of rapid progression (HR, 2.631; 95% CI, 1.448-4.780; P = 0.002). Consequently, when applied to the independent validation set, levels of the cut-off value for triple-marker panel maintained their prognostic value for poor clinical outcomes. Conclusions: A discriminatory signature that comprises a triple-marker panel independently correlates with poorer survival and more rapid progression in HCC patients who are treated with sorafenib. These findings provide new insights into targeted proteomics-based biomarkers, which might engender individualized sorafenib therapy.

A 0.5-V, 1.47- <inline-formula> <tex-math notation='TeX'> <tex> $\mu\hbox{W}$ </tex> </tex-math></inline-formula> 40-kS/s 13-bit SAR ADC With Capacitor Error Compensation

Hyunsoo Ha,Seon-Kyoo Lee,Byungsub Kim,Hong-June Park,Jae-Yoon Sim IEEE 2014 IEEE transactions on circuits and systems. a publi Vol.61 No.11

<P>A 13-bit successive approximation analog-to-digital converter (ADC) is presented for an ultralow-power sensor interface. Capacitor error compensation is achieved by swapping the roles of two identical capacitor banks in a digital-to-analog converter. The ADC is implemented in a standard 0.13-μm CMOS. With a single supply voltage of 0.5 V and a rail-to-rail conversion range, the ADC dissipates 1.47 μW at a sampling rate of 40 kS/s. It shows a figure of merit of 17.9 fJ/conversion-step with an effective number of 11.0 bits.</P>

동적 윈도우를 갖는 조건부확률 모델을 이용한 한국어 문맥의존 철자오류 교정 규칙의 재현율 향상

최현수(Hyunsoo Choi),권혁철(Hyukchul Kwon),윤애선(Aesun Yoon) 한국정보과학회 2015 정보과학회논문지 Vol.42 No.5

한국어 맞춤법 검사기가 교정하는 오류어의 유형은 크게 단순 철자오류와 문맥의존 철자오류로 구분할 수 있다. 이 중 문맥의존 철자오류는 어절(word)단위로 봤을 때는 올바르지만, 문맥을 고려하였을 때 오류가 되는 유형으로, 교정 난도가 매우 높다. 문맥의존 철자오류는 글을 쓰는 사람들도 자주 저지르는 오류이므로, 이를 잘 검색하여 정확하게 교정하는 것이 맞춤법 검사기의 사용자가 갖는 신뢰도에 큰 영향을 미친다. 높은 정확도가 매우 중요하므로, 문맥의존 철자오류의 교정 방법은 대부분 규칙에 기반한다. 반대 급부로 재현율이 매우 낮다는 단점을 갖는다. 문맥의존 철자오류의 교정에서 재현율을 높이기 위한 방법은 크게 언어지식을 이용하여 규칙을 일반화하는 방법과 통계 정보에 기반을 하여 공기 어휘의 제약 조건을 확장하는 방법으로 나뉠 수 있다. 기존 연구는 언어지식을 이용하여 규칙을 일반화하는 다양한 방식을 연구했으나, 최고 성능이 평균 정확도 95.19%, 평균 재현율 37.56%을 보였다. 본 논문에서는 통계정보에 기반한 규칙의 확장 방식을 제안한다. 동적 윈도우를 갖는 조건부확률 모델을 이용한 방법이며, 최고 성능은 평균 정확도 97.23%, 평균 재현율 50.50%을 보여주었다. The types of errors corrected by a Korean spelling and grammar checker can be classified into isolated-term spelling errors and context-sensitive spelling errors (CSSE). CSSEs are difficult to detect and to correct, since they are correct words when examined alone. Thus, they can be corrected only by considering the semantic and syntactic relations to their context. CSSEs, which are frequently made even by expert wiriters, significantly affect the reliability of spelling and grammar checkers. An existing Korean spelling and grammar checker developed by P University (KSGC 4.5) adopts hand-made correction rules for correcting CSSEs. The KSGC 4.5 is designed to obtain very high precision, which results in an extremely low recall. Our overall goal of previous works was to improve the recall without considerably lowering the precision, by generalizing CSSE correction rules that mainly depend on linguistic knowledge. A variety of rule-based methods has been proposed in previous works, and the best performance showed 95.19% of average precision and 37.56% of recall. This study thus proposes a statistics based method using a conditional probability model with dynamic window sizes. in order to further improve the recall. The proposed method obtained 97.23% of average precision and 50.50% of recall.