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- 저자 : Wu, Peng (검색결과 1,762 건)
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Modification of tumor micro-environment to enhance anti-tumor immune response
Wu, Chao-Yi Joy The Johns Hopkins University 2013 해외박사(DDOD)
Increasing attention have been generated to minimized the adverse immune impact of tumor infiltrated myeloid cells to increase the anti-tumor immune response and potentially enhance tumor control. In present study, we've demonstrated that intratumorally administration of a peptide based vaccine in well defined solid tumor combining PADRE peptide and poly I:C leads to an enhanced antitumor effects in treated mice comparing with conventional vaccine route giving subcutaneous (Chapter 2). This challenges the prevailing notion of the tumor as an inherently immune-suppressive site and underscores the dynamic nature of interactions between the tumor and the immune system. Also, we evaluate the phenotype change of macrophages in the peritoneal cavity of disseminated ovarian cancer model after poly I:C treatment. With the help of PEI to increase the uptake of poly I:C by the peritoneal cells, significant improvement was observed in the antitumor effects against murine ovarian tumors. This anti-tumor effect was contributed by the alternative MI activation of peritoneal macrophages when treated and sequentially activate NK cells to clear tumor (Chapter 3). This suggests that the environment of ill-define disseminated tumors can also be changed to significantly benefit tumor control. Last, we focus on how conventional cancer treatments, tumor irradiation impact the tumor microenvironment. In chapter 4, we've show that by combining RT and targeted delivery of antigenic peptide to the tumor, the adjuvant effect generated by RT itself is sufficient to elicit the priming and expansion of antigen-specific CD8+ T cells through the type 1 interferon and toll like receptor 4 dependent pathways and leads to a potent therapeutic antitumor effect. In addition, we demonstrated that CTL-mediated killing of CD11b+ myeloid stromal cells, in the tumor by our approach is important for the control of tumor growth using two different transgenic mouse models. Altogether, we observed a greater tumor control achieved through the suppression of the immunomodulatory effects and the enhancement of favorable immune stimulation due to local RT. In summary, these results demonstrate that the immune-suppressive tumor micro-environment can be reversed by available, commonly practiced, interventions and provide impetus for the development and clinical translation of novel immune-based strategies for cancer therapy. iii.
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Anatomical and three-dimensional study of the lumen of the human seminal vesicle
이제성 Konkuk University 2020 국내석사
The seminal vesicle is the gland of male reproductive organs that produces the fluid and nutrient constituents of semen. It has been believed for a long time that the lumen of the seminal vesicle was a single coiled tubular structure with irregular diverticula. There are several previous reports of the symmetry, differences in morphological sizes, and classification of the seminal vesicles. However, a three-dimensional (3D) coiled tubular structure is difficult to understand using a classical anatomical methodology, and hence 3D reconstruction is needed to understand the structure of the lumen of the seminal vesicle. Thirty-one seminal vesicles harvested from 21 formalin-embalmed cadavers were investigated. The seminal vesicle along with the ampulla of the ductus deferens was separated, and the length and width of each seminal vesicle were measured. The vesicles were then embedded in colored paraffin, and the resulting paraffin block was sectioned transversely and photographed at an interval of 500 µm, with the sectioned surfaces of the seminal vesicles then utilized in 3D reconstruction performed by ‘Reconstruct’ computer software. The mean length and width of the seminal vesicles were 39.4 mm and 13.4 mm, respectively, and the right seminal vesicle was a little larger than the left one. The size of the seminal vesicles differed from previous reports, while the lumen structure was similar to the classification of Aboul-azm but differed from that of Pereira. The width of the seminal vesicle was closely related to the number of curves and diverticula. These findings suggest that the lumen structure of the seminal vesicles differs from previous reports. 정낭은 정액의 액체성분과 영양성분을 생성하는 남성생식 기관의 하나이다. 정낭의 내강은 불규칙한 곁주머니를 가지는 꼬여있는 단순 관 구조라고 오랫동안 믿어 왔다. 이전에 몇몇 연구에서 정낭 양쪽의 대칭성과 형태학적 크기에 대해 다룬 적이 있었다. 그러나 3차원 (3D) 으로 꼬여 있는 관 구조를 고전적인 해부학적 방법을 사용하여서는 이해하기 어렵기 때문에, 정낭의 내강 구조를 이해하기 위해서 3차원 재구성이 필요하다. 21 구의 포르말린에 보정된 시신에서 31 쪽의 정낭을 해부하여 조사하였다. 정낭은 정관팽대와 함께 분리하고 각 정낭의 길이와 폭을 계측하였다. 이후 정낭을 유색 파라핀에 매립하고, 제작된 파라핀 블록을 가로 방향으로 연속절단 하였으며, 500 μm 간격으로 사진을 촬영하였다. 촬영된 블록의 단면 표면을 ‘Reconstruct’ 컴퓨터 소프트웨어를 사용하여 3차원 재구성 하였다. 정낭의 평균 길이와 폭은 각각 39.4 mm와 13.4 mm였다. 오른쪽 정낭은 왼쪽보다 약간 컸다. 정낭의 크기는 이전 보고와 달랐으며, 내강 구조는 Aboul-azm의 분류와 유사하지만 Pereira의 구조와는 차이를 보였다. 정낭의 폭은 꼬인 정도와 곁주머니의 수와 밀접한 관련이 있었다. 이러한 결과는 실제 정낭의 내강 구조가 이전 보고와 다를 수 있다는 것을 시사한다.
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Prediction of transmembrane helical topology using neural network
최수진 Pukyong National University 2019 국내석사
화학적 메신저와 상호 작용하여 세포의 중요한 생리학적 역할을 담당하는 transmembrane protein (TM 단백질)은 세포막 사이에 위치하기 때문에 그 구조와 동역학을 관측하는 것이 생물학적으로 매우 중요한 의미를 가지고 있다. TM 단백질의 구조와 동역학을 보다 정확히 기술하기 위하여 joint-based descriptor라는 방법이 제안되었다. 이 방법은 TM 나선 양단의 Cα를 하나의 점으로 생각하고 TM 단백질의 구조를 macroscopic level에서 예측할 수 있는 장점이 있다. 하지만 TM 나선 내부의 굽은 구조 (kink)는 기술하지 못한다는 단점을 가지고 있다. 본 논문에서는 TM 나선 양단이 아닌 내부를 분절하는 다중 연결점을 제안한다. 이 연구에서 우리는 3 ~ 14개의 TM나선으로 구성된 101 개의 비 상동 TM 단백질의 PDB구조와 시퀀스 기반의 정보를 이용하여 인공신경망을 학습하였다. 신경망으로부터 얻어진 Cα 원자 기반의 각도 (θ)와 이면각 (τ)을 통해 TM 단백질의 구조를 예측하고 이를 joint-based descriptor와 결합하여 보강된 macroscopic level에서의 최적의 모델을 제안한다.
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Movement of potassium ions in channel KcsA using a molecular dynamics simulation
김묘정 Pukyong National University 2019 국내석사
전압에 의존하는 이온 채널은 이온 전도를 통해, 세포막 전압의 변화에 반응한다. 이러한 이온에는 나트륨, 칼륨 및 칼슘 이온 등이 포함된다. 또한 이온 채널은 신경과 근육의 활동에 기초가 되기 때문에 그 구조와 동역학을 관측하는 것이 생물학적으로 의미가 크다. 그 중 칼륨 채널의 단백질의 구조 및 이온이 주어진 환경에서 어떤 변화를 보이는지 확인하기 위하여 분자 동역학을 실시하였다. 이 방법은 칼륨 이온 채널에 대해 진행되었다. 본 논문에서는 특히 KcsA 채널의 움직임 및 내부 이온을 관측하였다. 이 연구에서 주어진 환경은 첫 째, 일반적인 체내 칼륨 농도 보다 2배로 높고 둘 째, 세포막에 전압을 인가하지 않았다. 이렇게 분자 동역학으로부터 얻어진 결과를 통해 실제 칼륨 이온 채널의 움직임을 예측하고 그 원동력을 자세히 알아볼 수 있다.
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