DNA marker와 수산양식에 활용(II)

한현섭,Han Hyeon-Seop 한국양식학회 2006 韓國養殖 Vol.18 No.1

DNA marker와 수산양식에 활용(Ⅰ)

한현섭 한국수산과학회 양식분과 2005 韓國養殖 Vol.17 No.2

갯벌어업 육성 정책의 필요성과 나아갈 방향

한현섭 한국해양수산개발원 2010 수산정책연구 Vol.8 No.-

Study on Optimal Condition for Oyster Rack Culture in terms of tidal exposure and rack height in Wando Coast, Korea.

한현섭,조상만 한국패류학회 2013 The Korean Journal of Malacology Vol.29 No.1

We investigated the growth performance of oysters (initial shell height 57.5 ± 8.5 mm) under differing conditions of tidal exposure time and culture rack height in an experiment that commenced in April, 2011. Significant differences were observed in shell height from June 2011, in total weight from August, and in meat weight from September. Fatness tended to decrease during the experimental period, but was not significantly different at the end of the experiment. Significant differences in survival rates were mainly observed from June to August. After September, further changes were not observed in any experimental treatment group. The greatest growth potential (L∞) and survival rate were observed at a sea level of approximately 116 cm. The results indicate that in the study area the use of oyster culture conditions involving 1 or 2 h of tidal exposure and 6070 cm rack height could result in oysters reaching the favored commercial half shell size within 14 months, with > 80% survival.

Utility of Isozyme as a Genetic Marker for Estimating the Effects of Release and Stock Enhancement of Fleshy Prawn Fenneropenaeus chinensis

한현섭,장인권,전제천,김종화,박영제 한국수산과학회 2006 Fisheries and Aquatic Sciences Vol.9 No.2

Genetic Variation in Wild and Cultured Populations of the Sea Squirt Halocynthia roretzi Inferred from Microsatellite DNA Analysis

한현섭,남보혜,강정하,김이경,지영주,허영백,윤문근 한국수산과학회 2012 Fisheries and Aquatic Sciences Vol.15 No.2

We used nine microsatellite DNA markers to estimate genetic variation among wild and cultured populations of the sea squirt Halocynthia roretzi. The loci were polymorphic, with 6-32 alleles, and allelic richness ranged from 6.0 to 26.1 in each population. The wild and the cultured populations had similar mean heterozygosities (HO and HE), allele numbers, and allelic richness. One cultured population with softness syndrome had a lower mean in the observed heterozygosity (HO = 0.57) and higher mean inbreeding coefficient (FIS = 0.261) than any other populations. This suggests that the loss of genetic variation in the diseased population might be due to increased inbreeding. A neighbor-joining tree and pairwise population estimates of FST showed moderate genetic differentiation between the wild and the cultured populations. Additionally, the softness syndrome population was genetically divergent from wild populations, but it was genetically close to the cultured populations.

Genetic Variation in Physiological Traits of Gynogenetic Diploid and Clonal Ayu, Plecoglosse altivelis : Tolerance to the Water Temperature and Salinity

한현섭 한국발생생물학회 2000 발생과 생식 Vol.4 No.2

생리적 형질인 수온과 염분에 대한 내성을 양적 형질로 개발하기 위하여 은어의 정상 발생 2배체 (2N-cont),극체형 2배체 (meiotic-G2N), 난할형 2배체 (mitotic-G2N) 및 2종류의 clone (clone-11, clone-15)의 부화 자어를 대상으로 유전적 변이성을 조사했다. 수온은 19. 22.5, 25. 그리고 30.로 설정하였고 각 수온구에 0, 15 및 30의 염분구를 조합하여 12개의 실험구를 만들어 조사했다. 평균 In this study, genetic variation in the 5 strains of 2N-cont, meiotic-G2N, mitotic-G2N and two types of clones with different genetic backgrounds was investigated by developing their tolerance to water temperature and salinity, which is a physiological trait, into a quantitative trait. The temperature was set at 19, 22.5, 25 and 30, each of which was combined with 0, 15 and 30 of salinity respectively, making 12 groups in all. In the mean survival time (MST), samples with 15 of salinity showed the longest survival time at all temperatures. The 2N-cont had the longest 126.16 h followed by clone-11 and clone-15 surviving for 113.22 h and 91.05 h respectively. Gynogenetic diploids showed the shortest 87,32 h and 36.56 h. At 22.5 and 25, MST of each strain was significantly short, showing similar results to those of the groups at 19. The 2N-cont had the longest MST while clones had a longer MST than gynogenetic diploids. This could be due to gynogenesis which causes homozygosis among malignant harmful genes, leading to its appearance in populations and resulting in early death in individuals with such genes. On the other hand, MST of clones was longer than that of gynogenetic fish. This could be because the 1st gynogenetic generation, which is a parental population, has already had its malignant genes removed, while the clones of the 2nd gynogenetic generation have had their superior genes fixed as well as their tolerance and survival improved. When temperature was raised to 22.5 and 25, increase in variation was observed in gynogenetic diploids and decrease in clones in 15 of salinity. This shows that such a trait is genetic to a certain extent. Consequently, if this character is developed into a quantitative trait and applied to selective breeding, it could be a useful character to secure superior strains and individuals, and also it would be possible to improve populations genetically through selection.

Genetic Variations of Natural and Hatchery Populations of Korean Ayu (Plecoglossus altivelis) by Isozyme Markers

한현섭(Hyon-Sob Han),진덕희(Deuk-Hee Jin),이종관(Jong-Kwan Lee) 한국수산과학회 양식분과 2003 韓國養殖學會誌 Vol.16 No.2

제주지역 넙치(Paralichthys olivaceus) 양식업의 경제성 분석: 배합사료 공급 양식어가를 중심으로

김남리,한현섭,이승한,김강웅,김도훈 한국수산과학회 2022 한국수산과학회지 Vol.55 No.5

The government has implemented a policy to promote the use of extruded pellets in sustainable aquaculture by protecting fishery resources and managing the ocean environment. A survey on the production status and the cost of targeting olive flounder Paralichthys olivaceus culture farms in Jeju Island using extruded pellets was conducted. The survey results were used to examine the profitability and economic feasibility of the test farms, as well as the degree of increase in profitability and economic feasibility of the fish farms receiving government subsidies for employing extruded pellets. The economic feasibility was predicted through a sensitivity analysis of prices and production, which are the variable factors when of using the extruded pellets. Using the economic feasibility analysis, the average NPV (Net Present Value) and IRR (Internal Rate of Return) of sample farms were found to be KRW 5.8 billion and 8.9%, respectively. The result of the economic feasibility analysis of the government subsidy showed a maximum average of about 2.3 times higher NPV and a 3.8% increase in IRR in cases where government subsidies were received.

서해안 유류 유출사고에 노출된 굴의 유전적 다양성

전제천,안혜숙,한현섭,강정하,김상규,김응오 한국발생생물학회 2010 한국발생생물학회 학술발표대회 Vol.29 No.-

2007년 12월 7일 충남 태안 해상에서 발생한 Hebei Spirit호 유류오염 사고로 원유 12,547 ㎘가 유출되어 서해안의 167 ㎞에 이르는 해안선이 오염됨으로서 이곳에 서식하고 있는 패류, 어류 등 양식생물들과 같은 유용 수산자원은 큰 영향을 받았을 것으로 판단된다. 유류에 노출된 굴, Crassostra gigas은 외부에서 정상적인 먹이 섭취활동이나 에너지 대사 작용을 하지 못하여 생체량의 감소가 나타나 산란량에 크게 영향을 미칠 것으로 예상된다. 본 연구는 유류유출사고 피해지역인 태안군 원북면 신두리 및 소원면 의항리와 유류오염에 노출되지 않은 경기도 안산시 종현동의 참굴 집단을 대상으로 11개의 microsatellite DNA marker를 이용하여 계절적인 차이를 두고 유전적 특성을 비교하고, 유류오염에 대한 참굴 집단의 유전적 다양성 변화에 대해서 조사하고자 msDNA 마커의 유전자형을 분석하였다. 유류 오염지역과 비오염지역 굴에 대하여 11개의 microsatellite DNA marker로 유전자형을 분석한 결과, marker에 따라 대립유전자 수가 19개에서 42개로 매우 다양하였으며, 평균 대립유전자 수는 약 33개, 대립유전자 수 보정치 (Allelic richness)는 약 32개로 모든 집단에서 비슷하게 나타났다. 이형접합체율 관찰값 (Ho)은 경기 9월 집단의 ucdCg-161에서 0.602로 가장 낮았고, 태안 3월 집단의 ucdCg-109에서 0.979로 가장 높게 나타났다. 이형접합체율 기댓값 (He)은 경기 3월과 태안 9월 집단의 ucdCg-130에서 0.886으로 가장 낮았고, 경기 9월의 유전자좌 ucdCg-133에서 0.972로 가장 높았다. 평균 이형접합체율 관찰값 (Ho)과 기댓값 (He)은 각각 0.762~0.798과 0.948~0.952로 계절적, 지리적으로 비슷한 수준을 보였다. 다형성정보지수 (PIC)에서도 경기 3월 집단의 ucdCg-130에서 0.871로 가장 낮았고, 경기 9월 집단의 ucdCg-133에서 0.966으로 가장 높았으며, 각 집단의 평균은 0.940~0.944로 계절적, 지리적인 차이는 없었다. Hardy-Weinberg equilibrium (HWE)에서는 태안 9월 집단의 ucdCg-130에서 유의한 이탈이 나타나 유전적 불균형의 징후가 보였다. 대립유전자 빈도를 바탕으로 계산되는 Linkage disequilibrium (LD)을 기초로 한 유효집단크기 (Ne)에서는 경기 9월 집단이 76,395마리로 가장 높았는데, 이것은 genetic linkage, 재조합률, 돌연변이율, random drift, non-random mating 등을 포함하는 여러 원인과 집단구조에 의해 영향을 받기 때문에 과대평가되는 경향이 있다. 각 집단의 유효집단의 크기는 비오염 지역의 경우 3, 5월 집단이 각각 753마리, 1,494마리로 나타났으나, 오염지역의 경우, 3, 5, 9월 집단이 현재의 다양성을 유지하기 위해서는 각각 450마리, 660마리, 546마리로 매우 낮게 나타나 비오염 지역에 비해 다양성이 현저하게 낮아진 것으로 사료된다. 각 집단에 대한 유전적분화에 의해 야기되는 아집단내의 이형접합체율의 감소정도를 나타내는 FST를 유의차 검정 (P<0.05)에 의한 P값을 반영하여 각 집단 간을 비교한 FST 값에서는 태안 5월 집단이 경기 3월, 5월, 9월 집단 그리고 태안 3월 집단 사이에 유의한 차이가 보였다. 대립유전자 빈도를 근거로 하여 Nei's genetic distance에서는 0.1035~0.1497로 나타났으며, 태안 5월 집단에 비교적 높은 수치가 보였다. UPGMA와 Neighborjoining 방법으로 계통수를 만들어 참굴 집단 간 유연관계를 확인한 결과, 계절적, 지리적인 집단 간의 특별한 차이는 찾을 수 없었다. 계절적, 지리적인 집단 사이의 차이는 크게 나타나지 않았으나, 유류오염이 산란에 미친 영향 파악을 위해 유전적 특성의 변화를 지속적으로 관찰하는 연구가 요구된다.