영산강수계의 도시 하천 보 퇴적물 오염도 평가

조래현,조훈,박정훈,양현 한국폐기물자원순환학회 2014 한국폐기물자원순환학회 학술대회 Vol.2014 No.11

최근 들어 우리나라의 하천 및 호소 퇴적물로 인한 수질오염에 대한 심각성이 높아지면서 퇴적물 관련 연구가 진행되고 있다. 퇴적물의 오염물질 농도 측정은 환경오염 실태를 파악하는 방법의 하나로 이용되며 그 지역의 오염지표로 이용 될 수 있다. 현재 4대강 물 환경 연구소에서는 퇴적물 측정망 지점(117 개)에서 모니터링을 진행 하고 있으나 본류 위주의 지점 선정으로 영산강 수계내의 도시하천의 퇴적물은 모니터링은 진행 되지 않고 있다. 본 연구에서는 영산강 수계의 도시 하천 퇴적물의 적절한 관리에 필요한 퇴적물내 중금속 오염 거동과 오염정도를 파악하였으며, 국내・외 기준을 통하여 오염지수 및 오염 평가하여 영산강 수계의 적절한 관리와 하천 생태유지 관리에 기초자료를 제시하고자 하였다. 영산강수계의 4개 도시 하천(광주천, 풍영정천, 함평천, 나주천)에서 총 50개 지점의 퇴적물을 우기 전・후로 2회 채취하여 영양염류 및 중금속을 퇴적물 공정시험법으로 농도를 분석하고, 퇴적물의 오염물질 분포 특성을 확인 하였다. 그 결과 평균값은 23.9 ~ 68.8 mg/kg(T-P), 170 ~ 751 mg/kg(T-N), 0.11 ~ 1.13 %(TOC), N.D. ~ 6.5 mg/kg(As), 0.4 ~ 1.8 mg/kg(Cd), 13.8 ~ 40 mg/kg(Cr), 12.7 ~ 58.9 mg/kg(Cu), 4.9 ~ 29.2 mg/kg(Ni), 19.2 ~ 137.2 mg/kg(Pb), 40.1 ~ 162 mg/kg(Zn), N.D. ~ 0.22 mg/kg(Hg)이 나타났다. 국내 기준으로 평가한 4개 도하천은 오염지수가 1.0 이하 비오염으로 나타났지만, 국외 기준(캐나다 온타리오 환경기준, LEL)으로 평가한 결과는 약한 오염으로 타나났다.

Histone Deacetylase 701 (HDT701) Induces Flowering in Rice by Modulating Expression of OsIDS1

조래현,윤진미,Antt Htet Wai,안진흥 한국분자세포생물학회 2018 Molecules and cells Vol.41 No.7

Rice is a facultative short-day (SD) plant in which flowering is induced under SD conditions or by other environmental factors and internal genetic programs. Overexpression of Histone Deacetylase 701 (HDT701) accelerates flowering in hybrid rice. In this study, mutants defective in HDT701 flowered late under both SD and long-day conditions. Expression levels of florigens Heading date 3a (Hd3a) and Rice Flowering Locus T1 (RFT1), and their immediate upstream floral activator Early heading date 1 (Ehd1), were significantly decreased in the hdt701 mutants, indicating that HDT701 functions upstream of Ehd1 in controlling flowering time. Transcript levels of OsINDETERMINATE SPIKELET 1 (OsIDS1), an upstream repressor of Ehd1, were significantly increased in the mutants while those of OsGI and Hd1 were reduced. Chromatinimmunoprecipitation assays revealed that HDT701 directly binds to the promoter region of OsIDS1. These results suggest that HDT701 induces flowering by suppressing OsIDS1.

영산강수계의 도시 하천 보 퇴적물 오염도 평가

조래현,조훈,양현,박정훈 한국폐기물자원순환학회(구 한국폐기물학회) 2014 한국폐기물자원순환학회 추계학술발표논문집 Vol.2014 No.-

최근 들어 우리나라의 하천 및 호소 퇴적물로 인한 수질오염에 대한 심각성이 높아지면서 퇴적물 관련 연구가 진행되고 있다. 퇴적물의 오염물질 농도 측정은 환경오염 실태를 파악하는 방법의 하나로 이용되며 그 지역의 오염지표로 이용 될 수 있다. 현재 4대강 물 환경 연구소에서는 퇴적물 측정망 지점(117 개)에서 모니터링을 진행 하고 있으나 본류 위주의 지점 선정으로 영산강 수계내의 도시하천의 퇴적물은 모니터링은 진행 되지 않고 있다. 본 연구에서는 영산강 수계의 도시 하천 퇴적물의 적절한 관리에 필요한 퇴적물내 중금속 오염 거동과 오염 정도를 파악하였으며, 국내ㆍ외 기준을 통하여 오염지수 및 오염 평가하여 영산강 수계의 적절한 관리와 하천 생태유지 관리에 기초자료를 제시하고자 하였다. 영산강수계의 4개 도시 하천(광주천, 풍영정천, 함평천, 나주천)에서 총 50개 지점의 퇴적물을 우기 전ㆍ후로 2회 채취하여 영양염류 및 중금속을 퇴적물 공정시험법으로 농도를 분석하고, 퇴적물의 오염물질 분포 특성을 확인 하였다. 그 결과 평균값은 23.9 ~ 68.8 mg/kg(T-P), 170 ~ 751 mg/kg(T-N), 0.11 ~ 1.13 %(TOC), N.D. ~6.5 mg/kg(As), 0.4 ~ 1.8 mg/kg(Cd), 13.8 ~ 40 mg/kg(Cr), 12.7 ~ 58.9 mg/kg(Cu), 4.9 ~ 29.2 mg/kg(Ni), 19.2 ~ 137.2 mg/kg(Pb), 40.1 ~ 162 mg/kg(Zn), N.D. ~ 0.22 mg/kg(Hg)이 나타났다. 국내 기준으로 평가한 4개 도하천은 오염지수가 1.0 이하 비오염으로 나타났지만, 국외 기준(캐나다 온타리오 환경기준, LEL)으로 평가한 결과는 약한 오염으로 타나났다. Acknowledgement: This study was financially supported by the GAIA project of Korea Environmental Industry & Technology Institute.

이삭 발달 유전자 분석에 의한 수량성 증대 벼 유용 유전자 기능 연구

박기경,최상철,조래현,윤진미,안진흥 한국육종학회 2012 한국육종학회 심포지엄 Vol.2012 No.07

벼 수량성 증진을 위해서는 생육초기부터 출수, 개화 및 등숙기 까지 광합성효율이 높게 유지하여야 하며 벼 생육기간 중 예상치 못한 기후변화로 발생한 생육불량환경 (저온, 고온, 빈번한 강우로 인한 일조량 부족, 가뭄에 인한 물 부족 등) 에서도 광합성 효율을 안정적으로 유지할 뿐만 아니라 벼 잎의 노화가 급속히 진행되는 벼 종자등숙 후기까지 광합성효율을 오래 지속시켜줄 수 있는 우량 유용유전자를 발굴하는 연구가 최대 목표이다. 발달초기 유수에 대한 microarray 수행을 위해, 동진 및 화영 품종을 재료로 하여 발달 단계에 따른 유수를 sampling 하였다. 3 cm 크기를 가지는 유수는 이미 유수 발달에 따른 identity가 모두 결정된 상태이므로, 4 cm 를 control로 사용하여 3 mm 이하, 4 - 10 mm, 1 - 2 cm, 크기의 유수를 각각 4단계로 sampling 하였다. 고 순도의 RNA는 Agilent 44K chip을 사용하여 분석하였으며, 그 결과를 바탕으로 유용 유전자를 선발 하였다. 특히 금년도에는 활성화변이체에서 이삭 유전자 활성빈도가 낮기 때문에 활성화변이체 숫자를 줄이고 삽입변이체를 500 line 으로 분석을 대폭 증가시켰다. T-DNA 삽입 변이체 집단에서 선발된 개체들은 이삭 모양, 이삭 가지 수, 가지 길이, 종자 숫자, 임실률 등의 수량성 형질을 분석하였다. 한편, 수량성 증대에 관련하는 것으로 추정되는 유망 유전자를 일본 National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS) 에서 KOME cDNA을 분양 받았다. 그리고 Ubiquitin promoter와 nos terminator 사이에 다양한 제한효소 자리가 있는 binary vector에 cloning 한 후 형질전환이 수월한 동진벼를 사용하였다. 그중 생산성 증가가 입증된 유전자는 일품벼 및 삼광벼 등 우수 벼품종에 형질전환 할 것이다.

Hierarchical Structures and Dissected Functions of MADS-Box Transcription Factors in Rice Development

윤진미,조래현,정기홍 한국식물학회 2022 Journal of Plant Biology Vol.65 No.2

Floral organ development and regulation of flowering time in rice is closely associated with MADS-box transcriptional factors (TFs). MADS-box proteins contain a conserved 60 amino acid MADS-box motif for a sequence-specific DNA-binding activity that also functions in dimerization and accessory factor binding. A systematic understanding of this MADS-box TF subfamily is needed to explain the functional complexity among the gene family members. In total, the function of 33 out of 75 MADS-box TFs in rice has been characterized. Meta-anatomical expression data based on a large collection of spatiotemporal microarray data integrated to the phylogenetic tree context was very effective at explaining the functional complexity or specificity among a large gene family. Subsequently, a cluster of MADS-box TFs consisting of 15 gene members showed preferred expression in floral organs, and their expression patterns are well correlated with previously identified functions in floral organ identity. In addition, the hierarchical structure of a group of MADS-box TFs, based on the expression patterns, was well supported by the genetic studies. OsMADS1 functions in the earliest step of floral organ development and affects the overall floral organ development by identifying downregulation of nine members in the same clade in osmads1 mutant and observed phenotypic changes. The combination of hierarchical structure and possible hetero-dimerization among MADS-box TFs allows for understanding the molecular and genetic regulatory model for floral organ development in rice. This work provides a comprehensive understanding of the functions of MADS-box TFs and will be a useful guide for further studies.

벼 QTL 분석을 통한 줄기 발달 연구

김송림,조래현,최상철,강주원,안상락,안진홍 한국육종학회 2010 한국육종학회 학술발표회 발표요지 Vol.42 No.1

Identification of the Regulatory Region Responsible for Vascular Tissue–Specific Expression in the Rice Hd3a Promoter

Richa Pasriga,조래현,윤진미,안진흥 한국분자세포생물학회 2018 Molecules and cells Vol.41 No.4

Flowering time is determined by florigens. These genes include, Heading date 3a (Hd3a) and Rice FT 1 (RFT1) in rice, which are specifically expressed in the vascular tissues of leaves at the floral transition stage. To study the cis-regulatory elements present in the promoter region of Hd3a, we generated transgenic plants carrying the 1.75-kb promoter fragment of Hd3a that was fused to the β-glucuronidase (GUS) reporter gene. Plants expressing this construct conferred a vascular cell-specific expression pat-tern for the reporter gene. However, GUS was expressed in leaves at all developmental stages, including the early seedling stage when Hd3a was not detected. Furthermore, the reporter was expressed in roots at all stages. This suggests that the 1.75-kb region lackings cis-elements that regulate leaf-specific expression at the appropriate developmental stages. Deletion analyses of the promoter region indicated that regulatory elements determining vascular cell-specific expression are present in the 200-bp region between -245 bp and -45 bp from the transcription initiation site. By transforming the Hd3a-GUS construct to rice cultivar ‘Taichung 65’ which is defective in Ehd1, we observed that Ehd1 is the major regulatory element that controls Hd3a promoter activity.

이삭 발달 유전자 분석에 의한 수량성 증대 벼 유용 유전자 기능 연구

박기경,최상철,조래현,윤진미,안진홍 한국육종학회 2011 한국육종학회 학술발표회 발표요지 Vol.43 No.-

폐광산지역 토양에서 중금속과 PAHs 농도 분포 상관관계

기성간,박하승,조래현,최경균,양현,박정훈 한국환경농학회 2014 한국환경농학회지 Vol.33 No.4

BACKGROUND: Heavy metals contamination of soils inthe vicinity of abandoned mines in South Korea has beeninvestigated. However, PAHs contamination rarely hasbeen studied. Both heavy metals and PAHs concentrationshave been measured in this study. METHODS AND RESULTS: The samples of soil andsediment were collected from the vicinities of threeabandoned coal mines and two abandoned metal mines foranalysis of heavy metals contaminants and PAHsconcentration from April to September 2012. Afterpreparation of these samples following the Korean standardtest method for soils, the concentrations of heavy metalscontaminants and PAHs were measured using ICP-OESand GC-MS, respectively. It was observed that theconcentration of Arsenic was above the concern level basedon ‘area 1’ suggested by Korean soil conservation law,resulting that Arsenic is the main contaminant in theseareas. Also Cd, Cu, Pb and Zn were observed as a partialcontaminants. The concentrations of other investigatedcomponents including benzo(a)pyrene were less than theconcern level. CONCLUSION: The correlation observed betweenArsenic (as main contaminant) and PAHs concentrationssuggested that the contaminant source and pathway aredifferent for each other. The effect of mine activity on PAHsconcentration was rarely observed.

하천 퇴적물 중 입도에 따른 유기물질 분포 특성

양원준,정효진,한종학,조래현,양해종,김상돈,강태우,송상환,강태구 한국분석과학회 2016 학술대회논문집 Vol.2016 No.11