Error in Lowry Protein Determination by Canavanine

전방욱,권영명,Jun, Bang-Ook,Kwon, Young-Myung 생화학분자생물학회 1983 한국생화학회지 Vol.16 No.4

Canavanine은 arginine의 guanidinooxy structural analog로서 Lowry시약과 반응하여 Lowry 방법에 의한 단백질 정량시 심각한 오차를 일으킨다. Canavanine은 750 nm에서 reagent blank의 흡광도를 증가시키며 또한 단백질의 측정치를 증가시킨다. 280단위몰의 canavanine은 1단위몰의 소혈청단백질과 동일한 흡광도를 나타낸다. 단백질 정량에 미치는 canavanine의 이와 같은 간섭은 적절한 calibration curve를 사용하거나 trichloroacetic acid 첨전법에 의해 단백질로부터 canavanine을 분리하는 방법을 사용하여 제거할 수 있다. Canavanine, the guanidinooxy structural analog of arginine, significantly creats error in Lowry protein determination by being response to the Lowry reagents. It increases the absorbance of the reagent blank at 750nm and additively affects the apparent protein value. Two hundred and eighty unit mole of canavanine yields the colorimetric equivalent of 1.0 unit mole of bovine serum albumin. The interference of canavanine can be corrected by the use of appropriate calibration curves or by prior separation of protein from canavanine by trichloroacetic acid precipitation.

Canavanine 이 Lowry 방법에 의한 단백질 정량에 미치는 영향

전방욱,권영명 ( Bang Ook Jun,Young Myung Kwon ) 생화학분자생물학회 1983 BMB Reports Vol.16 No.4

Canavanine, the guanidinooxy structural analog of arginine, significantly treats error in Lowry protein determination by being response to the Lowry reagents. It increases the absorbance of the reagent blank at 750 ㎚ and additively affects the apparent protein value. Two hundred and eighty unit mole of canavanine yields the colorimetric equivalent of 1.0 unit mole of bovine serum albumin. The interference of canavanine can be corrected by the use of appropriate calibration curves or by prior separation of protein from canavanine by trichloroacetic acid precipitation.

Canavanine 존재시 합성된 보리 $\alpha$-Amylase의 정제와 그 생화학적 성질

전방욱,권영명,Jun, Bang-Ook,Kwon, Young-Myung 생화학분자생물학회 1986 한국생화학회지 Vol.19 No.2

$GA_3$에 의하여 유도된 $\alpha$-amylase (대조구의 $\alpha$-amylase)와 $GA_3$ 처리 12시간 경과 후 canavanine을 첨가하여 얻은 $\alpha$-amylase (canavanine 처리구의 $\alpha$-amylase)를 ammonium sulfate분획, CHA-affinity chromatography와 DEAE-cellulose chromatography를 사용하여 정제하였고 이들 두 효소의 성질을 비교 조사하였다. Canavanine 처리구의 $\alpha$-amylase를 아마노산 분석한 결과 $\alpha$-amylase 내에 1.5~1.7 mol의 canavanine이 투입되었음이 확인되었다. 대조구의 $\alpha$-amylase와 canavanine 처리구의 $\alpha$-amylase의 pI값은 각각 5.2와 4.9였다. 그러나 분자량은 50,000 dalton으로 동일하게 나타났으며, 최적온도, 최적 pH, 그리고 반응산물도 동일하였다. 그러나 amylose를 기질로 사용하였을 때의 최대반응속도는 대조구의 $\alpha$-amylase의 경우 canavamne 처리구의 $\alpha$-amylase의 경우보다 1.6배 빨랐다. 그러나 $K_m$값은 동일하였다. 또한 $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$ 및 $Mn^{2+}$과 같은 $\alpha$-amylase의 activator를 첨가하였을 예는 대조구의 $\alpha$-amylase의 경우 $10^{-3}M$보다 $10^{-2}\;M$처리시 그 활성이 높게 나타났으나 canavanine 처리구의 $\alpha$-amylase의 경우 $10^{-3}\;M$ 보다 오히려 그 활성이 감소하였다. 이상의 결과를 종합해 보면 보리종자에 canavanine을 처리하였을 때 canavanine이 $\alpha$-amylase내로 투입되어 효소구조를 변화시킴으로써 효소활성을 감소시키는 것으로 사료된다. The effect of canavanine on the $GA_3$-induced $\alpha$-amylase in barley halfseeds were investigated. $GA_3$-induced $\alpha$-amylase (control $\alpha$-amylase) and the $\alpha$-amylase to which canavanine was added 12 h after $GA_3$ treatment (canavanine treated $\alpha$-amylase) were purified through ammonium sulfate fractionation, CHA-affinity chromatography and DEAE-cellulose chromatography, and the properties of both kinds of enzyme were comparatively studied. The amino acid analysis of canavanine treated $\alpha$-amylase revealed that 1.5-1.7 mol of canavanine was incorporated into $\alpha$-amylase instead of arginine. The pI values of control $\alpha$-amylase and canavanine treated $\alpha$-amylase were 5.2 and 4.9 respectively. However, their molecular weights were determined as the same dalton of 50,000 and their optimum temperature and optimum pH as well as the reaction products were the same in both kinds. While $K_m$ values were the same in both kinds, the maximum enzyme reaction velocity using amylose as substrate were 1.6 times faster for control $\alpha$-amylase than for canavanine treated $\alpha$-amylase. When the enzyme activators such $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$, and $Mn^{2+}$ were treated upon the purified enzymes, the activator concentration of $10^{-3}\;M$ had less effect on the activation of control $\alpha$-amylase then the concentration of $10^{-2}\;M$. However, the situation was reversed in the case of canavanine treated $\alpha$-amylase. In summary, when canavanine was treated upon barley seeds, its incorporation into $\alpha$-amylase is considered to decrease the $\alpha$-amylase activity through. changing the structure of the enzyme.

크리스퍼 유전자가위에 의한 인간 배아 유전자 편집

전방욱(Jun, Bang-ook) 수원가톨릭대학교 이성과신앙연구소 2018 이성과 신앙 Vol.65 No.-

크리스퍼 유전자가위는 크리스퍼(규칙적인 간격을 갖는 짧은 회문구조 반복단위) 서열을 이용해서 DNA를 정확하게 절단하는 분해효소를 말한다. 이 크리스퍼 유전자가위는 이제까지 사용되어 온 유전자 변형 방법에 대해 비교적 사용하기 쉽고, 정밀 편집이 가능하기 때문에, 기존의 윤리적 물음들을 좀더 현실적으로 제기하고 있기 때문에 수십년부터 제기되어 온 인간 생식세포 유전자 변형에 대한 윤리적 물음들이 좀더 절박해졌다. 이 논문에서는 이제까지 이루어진 여덟 차례의 유전자 편집 사례들을 각각 비판적으로 분석하였다. 아울러 이러한 유전자 편집에 따르는 기술적인 문제점들을 살펴보고, 아직 기술적으로 완벽하지 않은 생식세포 편집을 섣불리 임상에 도입하려는 시도에 대해 경고한다. 또한, 유전질환 예방에 대한 반론, 맞춤형 보조생식기술에 대한 반론, 대리 동의의 문제, 논쟁적인 배아 사용의 문제를 통해 크리스퍼 유전자가위가 인간 생식세포 유전자 편집이 인류를 치료를 벗어난 증강의 미끄러운 비탈길에 올려 놓을 것이라는 점을 주장한다. 질병의 정의가 모호하다는 점을 부각하면서 다른 방향으로 오용될 가능성을 경고한다. 마지막으로 크리스퍼 유전자가위가 갖는 인류 진화 경로를 변경하는 잠재력을 지적하면서 우리가 우리 자신의 진화의 주인이 되어도 좋은가를 질문하고 있다. CRISPR/Cas9 refers to the endonuclese that precisely cuts DNA using a CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) sequence. Since this Crisperer genealogy is relatively easy to use and can make precise edits, ethical questions on the genetic modification of human germline cells that have been raised during decades become real. This paper critically analyze eight cases of gene editing so far. It also deals the technical limits associated with these gene editings and warns attempt of premature clinical application. Furthermore, It suggests that human germline gene editing put on the slippery slope to enhancement deviant from treatment through counter-arguments on preventing genetic diseases and tailor-made assisted reproductive technologies, problems of proxy consent, and controversial embryo use. Emphasizing the blurring demarcation of disease and health, it warns possible going astray for misuses. Finally, pointing to the potential of CRISPR/Cas9 to change the course of human evolution, it asks whether it is good we human to be a master of our own evolution.

우리나라 언론보도에 나타난 배아복제 연구자들의 수사 분석

전방욱(Jun Bang-Ook) 한국생명윤리학회 2005 생명윤리 Vol.6 No.1

The power of rhetorics is overwhelming in the science reporting practice in which the media depend heavily on scientists as their news source and draw the attention of readers by the incorporation of "soft" element in news stories, and scientists are keen to promote the benefits of the cloning research in order to ensure ongoing support for research and to alleviate public concerns about the outcome of research. Logos, ethos, and pathos, the Greek philosopher Aristotle's three basic types of rhetorics, are applied to analyze news reports. Results show that cloning researchers quoted in news articles try to avoid ethical challenge by adopting logos strategy such as "I never destroy any life during my process", "The embryos are never formed", "Therapeutic cloning is a far different technology from human reproductive cloning", or using inaccurate and obscure term "the cells" instead of "the embryos". It is also found that they are more dependent on ethos and pathos strategies than logos strategy especially regarding bioethics debate. The media reinforce embryo cloners' mythical status and lead readers to accept biased view as truth by overusing ethos rhetorics such as "the devoted scientist", "science hero", "Nobel Prize candidate", or "the magician of rhetorics". News reports present that embryo cloners use pathos rhetorics such as "patients mobilization", "treatment of incurable diseases", "patriotism", or "economic development" to defend their disputable research. Depending on the wide and biased use of rhetorics by both journalists and embryo cloners, the media contribute to enhancing embryo cloners' position and fail to provide sound battlefield for balanced cloning debates, which results in distorted decision making process.

일간신문에 나타난 배아복제 관련 보도 분석

전방욱(JUN Bang-Ook),김만재(KIM Manjae) 한국생명윤리학회 2003 생명윤리 Vol.4 No.1

This paper analyzes Korean newspaper articles of human embryo cloning between October 1997 and April 2003 to find out current conditions and problems of nine major newspapers in reporting the subject. For this purpose, the total of 674 articles are categorized into four reporting frames, such as science development, public responsibility, economic development and ethical orientation, and four scales of positivity regarding human embryo cloning, such as affirmation, conditional affirmation, negation, and no particular relation. The results of analysis show that scientific articles are rare to find and most newspapers heavily depend on university affiliated scientists except the Kukmin Daily which cites the religious most frequently. In terms of four news frames, public responsibility frame is the most popular, whereas economic development turns out to be the least. Scientists tends to stress science development along with public responsibility. By contrast, the religious and social movement groups hardly support science development frame. Regarding the positivity of human embryo cloning, government officials, businessmen, medical organizations, and university and research affiliated scientists stand for the positive extreme, and the religious, women's and environment movement groups, and university and research affiliated non-scientists represent the negative extreme, while parliament members are in between. Most newspapers similarly emphasize public responsibility the most, and then science development, ethical orientation, and economic development in order. However, there are some differences among newspapers according to their cited sources. For example, the Kukmin Daily's dependence on the religious is strongly related with its emphasis on ethical orientation as well as public responsibility, and the Hankyoreh's diverse sources also reflect its relative balance. Finally, this paper reveals that Korean newspapers depend heavily upon two major scientists of human embryo cloning, which can easily mislead the public by presenting their interests only. Therefore, it is crucial to include diverse opinions and avoid the interested parties in dealing with ethically debatable subject such as human embryo cloning.

[연구논단 2] 저자 자격 부여의 윤리

전방욱(Bang-Ook Jun) 한국생명윤리학회 2007 생명윤리 Vol.8 No.2

과학출판물은 과학자를 평가하는 기능을 가질 뿐만 아니라 과학계에서 전문적 정보를 교환할 수 있는 수단이기 때문에 진실성이 뒷받침되어야 한다. 최근 과학자의 능력을 평가하는 생의학 연구논문에서 논문 당 평균 저자수는 점차로 증가하고 있는데, 출판의 압력으로 인하여 저자 자격에 미치지 못하는 사람에게 부적절하게 저자 자격을 부여할 개연성이 있다. 가장 누가 원고의 공저자가 되어야 하는가, 누가 제1저자가 되어야 하는가, 누가 저자 순서에서 앞서야 하는가가 저자자격에서 가장 중요한 문제이다. 생의학 학술지에 투고되는 논문의 보편적 원칙과 같은 국제적인 지침들은 선사저자), 명예저자), 도용저자, 교환저자, 유령저자, 저자자격불인정 등 부적절한 저자자격 부여를 방지하기 위해 실질적인 기여를 한 사람을 저자로 등재하도록 권고하고 있다. 저자 자격에 대한 지침을 현실적으로 적용하기에는 무리가 있기 때문에 저자 자격 부여에 시비가 따를 경우 과학자들은 출판 전후 또는 도중이라도 편집인들을 포함하는 관련 전문가와의 원활한 커뮤니케이션을 통하여 저자자격 문제를 해결하도록 노력해야 할 것이다. Scientific publication which has a function to evaluate scientists and exchange professional information in scientific community requires to follow the law of integrity. Recently it is found that the numbers of authors per article have increased in the biomedical research articles, which indicates the possibility of improper authorship given to unqualified author(s). Critical issues in authorship address questions like "who should be the first author?", "who should be included in the byline?" and "how authors should be listed in order?". The international guidelines, namely the Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals, recommend to include substantial contributor(s) only as author(s) in order to prevent fraudulent authorship such as gift authorship, honorary authorship, disguised authorship, swapping authorship, ghost authorship, and denial of authorship. Because there is a discrepancy between ideal guidelines and reality, it is recommended for scientists to communicate with appropriate professionals including the editors whenever the authorship problem is concerned.

학제적 연구로서의 생명윤리학

전방욱(Bang-Ook Jun),김만재(Manjae Kim) 이화여자대학교 생명의료법연구소 2008 생명윤리정책연구 Vol.2 No.3

The study of bioethics is interdisciplinary in nature, requiring value judgments of humanities and information from the natural sciences. But this characteristic has been taken for granted without discussing openly within the filed. Therefore, this paper aims to analyze problems of studying bioethics as an interdisciplinary discipline. Preliminary survey results vividly reveal the gap between recognition and reality. Korean bioethicists fully recognize that the field is interdisciplinary. In reality, however, they hardly initiate interdisciplinary studies. They consider the difficulties of finding right co-researchers as a main reason of preventing them from trying interdisciplinary researches. Therefore, it is essential to provide bioethicists from diverse fields with an information and opportunities to contact.

HEAVEN 프로젝트의 윤리적 문제

전방욱(Bang-Ook Jun) 국가생명윤리정책원 2019 생명, 윤리와 정책 Vol.3 No.1

헤븐 프로젝트는 이탈리아 신경외과의 세르지오 카나베로(Sergio Canavero) 등이 시도하고 있는 머리 이식 수술이다. 헤븐 프로젝트가 현실화됨에 따라 대두되는 윤리적 문제를 다루기 위해 이 연구는 관련 논문의 키워드 분석 및 이슈별 분석을 통해 학술적 논의 현황을 종합 정리하였다. 키워드 분석 결과 어휘들이 transplantation을 중심으로 하는 군과 head transplantation을 중심으로 하는 군이라는 두 개의 군으로 분리된다. 이중 head transplantation 군은 기술과 관련된 어휘들과 주로 연결된다. 해악금지의 원칙에는 척수손상(Spinal Cord Injury, SCI), 대뇌허혈(Cerebral ischemia), 저체온증(Hypothermia)에 대한 임상시험의 안전성, 유효성 기준이 결여되어있고, 치료의 목표가 불명확하고 수술 가치가 비실재적이며, 성공의 합리적인 가능성이 없는 치료와 또한 자아 정체성과 성적 정체성 같은 이슈들이 포함되어 있다. 자율성 존중의 원칙에는 충분한 정보에 의한 동의가 사실상 어려운 이슈가 포함된다. 정의의 원칙에는 장기의 배분, 치료 비용이나 빈자 신체의 착취라는 사회적 격차 심화, 그리고 법적 주체의 문제 및 살인의 정의 등 법률적 문제 등의 이슈가 포함된다. 또한 연구 윤리에는 동물실험의 목적 왜곡, 동물자료 미공개, 장기적 생존통계 미비, 동료심사보다는 동영상이나 홍보자료 근거, 의도적인 인용 오류 등 이슈가 포함된다. 뇌중심주의의 문제도 지적된다. 문헌 분석에 바탕을 둔 이 연구결과는 향후 윤리문제에 대한 연구 및 정책 결정에 기초 자료로써 유용하게 사용할 수 있을 것 같다. The Heaven Project is a head/body transplant surgery that is attempted by Sergio Canavero, an Italian neurosurgeon. In order to address the ethical problems that emerged as the Heaven Project became a reality, this study summarizes current academic debates based on key word analysis and issue-specific analysis of related papers. Keyword analysis results show that words are divided into two groups, one centered on transformation and the other on head transformation. The head transformation group is mainly linked to technology related words. The principle of prohibition of harm includes issues such as the lack of safety and efficacy standards of clinical trials on SCI, Cerebral ischemia and Hypothermia, unclear objectives of treatment, illusive values of surgery, no reasonable possibility of success, self-identity and sexual identity. The principle of respect for autonomy addresses issues that consent by sufficient information is in reality difficult to obtain. The principle of justice includes issues such as the widening social gap related with the allocation of organs, treatment costs and exploitation of the poor, and legal problems including legal agents and definition of homicide. Research ethics also include issues such as the distortion of the purpose of animal testing, the disclosure of animal data, the lack of long-term survival statistics, the lack of peer reviews, and intentional errors of citation. The problem of cerebral centrism is also pointed out. These findings, based on literature analysis, are likely to be useful as basic data for future research and policy decisions on ethical issues.

우리나라 주요 신문에 나타난 유전자 관련 메타포 분석

전방욱(Jun Bang-Ook),서은주(Seo Eun-Joo) 한국생명윤리학회 2006 생명윤리 Vol.7 No.2

메타포는 유전자를 둘러싼 논의에서 전문적인 내용을 쉽게 전달하는 도구이자 대중을 감성적으로 동화시킬 수 있는 수단으로서 과학 분야에서도 널리 사용되고 있다. 실제로 유전자와 관련하여 우리나라 신문에서는 메타포가 다양하게 사용되고 있지만 이에 관한 이해는 아직 부족한 실정이다. 저자는 한국언론재단의 데이터베이스로부터 1990년부터 2005년까지 매 5년마다 우리나라 주요 신문 기사 449건에 나타난 1,121건의 메타포를 연도별, 신문사별, 장르별, 저자별, 관심분야별로 분석하고 각 메타포를 긍정적 메타포, 대중화 메타포, 그리고 부정적 메타포로 클러스터링하고자 시도하였다. 1990년부터 2005년까지 메타포 관련 기사는 각각 1990년에 10건, 1995년에 44건, 2000년에 271건으로 증가하다가 2005년에는 124건으로 감소하였으며, 메타포는 각각 1990년에 13건, 1995년에 58건, 2000년에 803건으로 증가하다가 2005년에는 247건으로 감소하였다. 2000년도 초의 인간게 놈 발표가 2000년도 신문의 기사와 메타포 건수의 증가를 가져왔다. 긍정적 메타포의 비율은 전반적으로 증가하였으며 부정적 메타포의 비율은 감소하였다. 다른 신문에 비하여 경제지의 긍정적 메타포 비율은 높았으며 부정적 메타포 비율은 낮았고 인용?기고자 중 기업가와 분야 중 바이오산업 부문에서도 이와 유사한 결과를 나타내어 경제와 관련된 측면들은 긍정적으로 프레이밍됨을 알 수 있었다. 과학자와 의사들은 대중에게 전문적인 어휘와 내용을 교육시키기 위한 대중화 메타포를 주로 사용하였다. 배아연구 분야와 유전자 조작 분야에서 긍정적인 메타포와 부정적인 메타포가 동시에 비교적 높은 비율로 나타나는 것은 이 분야들을 둘러싸고 찬반양론이 첨예하게 대립하고 있다는 결과를 뒷받침해 주었다. 배아연구와 복제의 메타포 속성은 2000년도에는 부정적인 것에서 2005년도에는 긍정적인 것으로 바뀌어 이 기간동안 발표된 인간배아줄기세포의 수립에 영향을 받은 것으로 나타났다. 특히 유전자 관련 메타포의 긍정적, 대중화 및 부정적 속성은 문화적인 고유성을 나타내었으며 엄격하게 클러스터링되지 않았고 문맥에 의해 많이 좌우되는 경향을 나타내었다. Metaphor is a powerful tool to transform technical contents into public terms and influence the public emotionally, which explains its wide use in scientific fields. Although Korean newspapers are not exceptional in applying metaphors to their articles, it is hard to find previous researches dealing with Korean cases. Therefore, this paper analyzes 1,121 metaphors of 445 articles related to "gene" in every five years between 1990 and 2005 screened on the Korean Integrated News Database System to find out historical changes and significant differences in newspapers, categories, writers and interested areas. For this purpose, metaphors too are clustered into positive, popularization and negative ones. First of all, the numbers of gene articles containing metaphors increased from 10 in 1990 to 271 in 2000 and then declined into 124 in 2005. The numbers of metaphors also followed the similar pattern. The sharp rise in 2000 was largely indebted to human genome reports of the year. The results of analysis also show that the percentage of positive metaphors increased whereas that of negative ones decreased. Among others, economic newspapers, entrepreneurs, and biotech industry particularly favored positive metaphors over negative ones. And scientists and medical doctors dominantly use popularization metaphors in order to explain technical contents. Embryo research and genetic manipulation presented even divides between positive and negative metaphors, which reflected heated arguments for and against the subject. Metaphors of embryo research and cloning changed from negative cluster in 2000 to positive one in 2005, reflecting breakthrough achievement during these period. Clustering result of metaphors in Korean newspapers shows cultural uniqueness and much more depends on the other relevant association in the text.