한우의 올레인산과 근내지방도에 영향을 미치는 유전자 내 에스엔피 규명

오동엽,여정수,이제영,Oh, Dong-Yep,Yeo, Jung-Sou,Lee, Jea-Young 한국데이터정보과학회 2014 한국데이터정보과학회지 Vol.25 No.5

동물 유전학에 있어 한우의 우수한 품질개발과 통계학의 역할을 살펴본다. 본 연구는 한우에서 25 30개월에 특이적으로 유전자 발현이 일어나, 쇠고기 맛에 영향을 미치는 불포화지방산 및 육질등급에 직접적인 연관이 있는 것으로 알려진 6개의 유전자 (SCD, SREBPs, $PPAR{\gamma}$, FABP4, FASN, LPL)내의 30개 에스엔피와 가계 정보가 정확하고 도체 기록이 되어있으며, 포화지방산 및 불포화 지방산과 다가불포화 지방산을 분석한 한우 개체 513두에 대하여 연관 분석을 실시하였다. 그 중 FABP4; g.3977-325 T>C 에스엔피가 우수한 결과를 나타내고 있었다. 특히 선정된 에스엔피의 F-값은 91.36 및 30.00으로 다른 29개의 에스인피들 보다 우수한 효과를 보여주고 있었으며, 현장 농가에 직접적으로 재 검정한 결과 1+등급 이상이 나올 확률이 70.10%로 우수한 마커임을 입증할 수 있었다. This study is to identify the relationship between unsaturated fatty acids, which are indicators of beef flavor, and unsaturated fatty acid biosynthetic enzymes, which are associated with SNPs in the SCD, SREBPs, $PPAR{\gamma}$, FABP4, FASN and LPL in Hanwoo population. For analysis of fatty acid in Hanwoo, we used to Hanwoo steer(n=513). Also, following an analysis of the relationship raised from Gyeongbuk province region. FABP4; g.3977-325 T>C was selected and the distribution of beef grade of g.3977-325 T>C related in field trial was proved very excellent.

한우 사육실태 및 육종개량에 대한 농가인식도 조사 분석 - 경북지역 중심으로 -

김병기,오동엽,정대진,이제영,Kim, Byung-Ki,Oh, Dong-Yep,Jung, Dae-Jin,Lee, Jea-Young 한국데이터정보과학회 2014 한국데이터정보과학회지 Vol.25 No.3

Farmers' perception on actual raising conditions and breeding improvement for Hanwoo were surveyed and analyzed in order to utilize such data as basic resources for further development of courses of Hanwoo improvement and instructions on raising techniques. The survey was held based on Hanwoo farmers in Gyeongbuk region and the results for the analysis were as follow. Candidate cattle for breeding was selected in consideration of 'appearance, body shape, and pedigree-registration' (39.0%) and 'artificial insemination' (38.6%) was the most frequently used breeding method for the breeding cattle. 'Body length' was revealed to be the most considered factor while purchasing fattening calves and the castration for the fattening calves were mostly performed when '6~7 months after the birth'. The farmers also responded that they 'try to comply with over 80% of items specified in program for production of high quality beef' in order to produce high quality beef. However, the farmers believed that '12 months after the birth' was the most economic market month. Although the results differed by each items surveyed, majority of those results showed statistically significant differences with significance level of 0.05 upon the surveyees' general characteristics and demographic factors including level of education, age, occupation, and family man power. Most surveyees responded 'around 30% of shipping heads' (22.1%) for the prevalence of beef graded better than 1++ grade when shipping, however, no significant differences in between general characteristics of surveyees were observed. 경북지역의 한우농가를 대상으로 한우 사육실태와 육종개량에 대한 농가들의 인식도를 조사 분석하여, 앞으로 사육 기술지도와 한우개량 방향을 개선하는데 기초자료로 이용하고자 설문조사하여 분석한 결과는 다음과 같다. 후보번식우 선발은 '외모, 체형, 혈통등록우' (39.0%)를 고려하여 선발하였으며, 번식우의 종부방법은 '계획교배를 통한 인공수정' (38.6%)을 실시하고 있어 가장 높게 나타났다. 비육밑소 구입시 외관상 가장 관심을 두는 부분은 '체장' (40.7%)부분으로 나타났고, 비육 밑소의 거세는 '생후 6~7개월'이 가장 많이 실시하였고, 한우고급육 생산을 위하여 '고급육생산 프로그램에 준하여 80% 이상 맞춰준다' (51.7%)고 하였다. 그러나 농가들은 비육출하 월령은 '생후 28개월' (35.2%)이 가장 경제적일 것이라고 생각하고 있었다. 이러한 결과는 조사항목에 따라 다소 차이가 있긴 하지만 대체로 조사대상자의 일반적 특성에 따라 학력, 연령, 직업, 가족 노동력에 따라 유의수준 0.05에서 통계적으로 유의한 차이가 있었다. 그러나 비육 후 출하 시에 육질 1+등급 이상 출현율은 '출하두수의 30% 정도' (22.1%)라고 응답하여 가장 높았지만, 조사대상자의 알반적 특성 간에는 유의한 차이가 나타나지 않았다.

엘피엘 유전자에 대한 한우의 우수 유전자 조합 선별

진미현,오동엽,이제영,Jin, Mi-Hyun,Oh, Dong-Yep,Lee, Jea-Young 한국데이터정보과학회 2013 한국데이터정보과학회지 Vol.24 No.6

지질 단백질 리파제 (lipoprotein lipase; LPL) 유전자는 지방산 합성을 조절하는 유전자로 알려져 있다. 특히, 한우의 LPL 유전자 내의 지방산 합성과 단일염기다형성 (SNP) 사이의 유전적 연관성이 밝혔진 바 있다. 최근에는 LPL 유전자 내의 3가지 SNP 즉, c.322G>A, c.329A>T 그리고 c.1591G>A는 한우의 불포화 지방산 조성과 도체형질과 관련된 새로운 유전자로 밝혀진 바 있다 (Oh 등; 2013). 본 논문은 최근 밝혀진 3개의 새로운 LPL 유전자를 활용 한우의 도체경제형질은 물론 맛과 향이 좋은 여러 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자 조합을 선별하려 하였다. 우수 유전자 선별 조합을 선별하기 위해 유전자 조합 방법으로 많이 활용되는 다중인자 차원 축소 방법을 이용하였다. 순수 유전자 효과만의 결과를 활용하기 위해 실험에서 얻어진 자료의 환경요인을 보정한 후 분석을 시도하였다 (Matsuhashi 등, 2011). The lipoprotein lipase (LPL) gene can be considered a functional candidate gene that regulates fatty acid composition. Oh etc (2013) investigated the relationship between unsaturated fatty acids and five novel SNPs, and had confirmed that three polymorphic SNPs (c.322G>A, c.329A>T and c.1591G>A) were associated with fatty acid composition. We have used generalized linear model for adjusted environmental effects and multifactor dimensionality reduction (MDR) method to identify gene-gene interaction effect of statistical model in general. We applied the MDR method on the identify major interaction effects of exonic single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the LPL gene for economic traits in Korean cattles population.

만성 폐쇄성 폐질환의 위험요인 선별을 통한 노모그램 구축

서주현,오동엽,박용수,이제영,Seo, Ju-Hyun,Oh, Dong-Yep,Park, Yong-Soo,Lee, Jea-Young 한국통계학회 2017 응용통계연구 Vol.30 No.4

최근 미세먼지 농도가 올라감에 따라 사람들은 호흡기 질환에 큰 관심을 가지고 있다. 본 연구는 인구학적 및 임상적 특징을 통한 만성 폐쇄성 폐질환(chronic obstructive pulmonary disease)의 위험요인을 선별하고 이에 따른 노모그램을 구축하였다. 먼저 국민건강영양조사(KNHANES) 6기 (2013-2015)의 인구학적 및 임상적 특징, 폐기능 검사 결과를 사용하여 로지스틱 회귀분석을 실시 하였고 비전공자들도 분석 결과에 대한 해석을 쉽게 할 수 있도록 만성 폐쇄성폐질환의 위험 요 인을 시각화한 노모그램을 구축하였다. 또한 ROC curve와 Calibration plot을 이용하여 만성 폐쇄 성 폐질환의 노모그램을 검증하였다. The concentration of fine dust has increased in Korea and people have become more concerned with respiratory diseases. This study selected risk factors for chronic obstructive pulmonary disease (COPD) through demographic and clinical features and constructed a nomogram. First, logistic regression analysis was performed using demographic and clinical feature and the pulmonary function test results of the Korean National Health and Nutrition Examination Survey (KNHANES) $6^{th}$ (2013-2015) and the nomogram was constructed to visualize the risk factors of chronic obstructive pulmonary disease in order to facilitate the interpretation of the analysis results. The ROC curve and calibration plot were also used to verify the nomogram of chronic obstructive pulmonary disease.

사육방식의 차이가 거세한우의 등심내 콜티졸 수준 및 지방산조성에 미치는 영향

하재정,오동엽,이준구,이제영,이지홍,박영식,Ha, Jae Jung,Oh, Dong Yep,Yi, Jun Koo,Lee, Jae-Young,Lee, Ji Hong,Park, Young Sik 한국데이터정보과학회 2015 한국데이터정보과학회지 Vol.26 No.3

본 연구는 사육방식의 차이가 한우 등심내 콜티졸과 지방산함량에 미치는 영향을 구명하고자 실시하였다. 무항생제 및 관행축산으로 생산된 한우육 1등급 등심 부위를 3종류의 브랜드별로 각각 3회씩 총 18점을 구매하여 시료로 공시하였고, 분석한 결과는 다음과 같다. 한우육 등심내 콜티졸 함량은 무항생제 처리구에서 관행사육 처리구 대비 유의적 (p=0.0176)으로 낮게 나타났으며, 포화지방산 및 불포화지방산 함량에서는 유의적 (p >0.05)인 차이를 나타내지는 않았으나, 관행사육 처리구에서는 포화지방산이, 무항생제 처리구에서는 불포화지방산이 각각 높은 경향으로 분석되었다. 또한, 불포화지방산 중 n-3과 n-9 지방산을 제외한 n-6 지방산에서 유의적 (p <0.01)인 차이를 보였다. 또한, 한우 등심내 콜티졸 농도와 n-6 지방산 농도간의 상관관계를 분석한 결과 유의적 (p=0.0014)으로 부 (-)의 상관관계가 성립되었다. This study was carried out to elucidate the effect of different rearing system on cortisol level, stress hormone, and fatty acid composition in the edible muscle tissues. These steers were reared in two different systems including antibiotic-free (ARS) and conservative system (CRS). In the M-Longissimus tissue, cortisol level was significantly lower in ARS than CRS, (p=0.0176). But, the levels of total saturated and unsaturated-fatty acids does not differ in ARS as CRS (p >0.05). However, the total saturated fatty acid levels tended to be greater in CRS and the total unsaturated fatty acid levels tended to be greater in ARS. However, the level of n-6 unsaturated fatty acid was higher in ARS than CRS (p=0.004). Especially, levels of linoleic acid (LA) and ${\gamma}$-linolenic acid (GLA) were significantly higher in ARS (p <0.01). Cortisol level and the n-6 fatty acid content in muscle tissue were negatively correlated (at p=0.00140.) In conclusion, ARS may produce beef with higher quality which contains lower cortisol and greater n-6 fatty acids, such as ALA and GLA.

생강 및 인삼 분말 첨가가 돈육포의 휘발성 염기태 질소, 미생물 수 및 관능평가에 미치는 영향

황은경,오동엽,김병기,김수정,Hwang, Eun Gyeong,Oh, Dong Yep,Kim, Byung Ki,Kim, Soo Jung 한국식품영양학회 2014 韓國食品營養學會誌 Vol.27 No.2

In this study, we analyzed 24 pieces ($4{\times}3{\times}2$) of pork jerky produced using raw meat and we then randomly assigned the hind leg meat to a treatment group. In addition, the effects of storage according to aerobic plate counts and sensory evaluation on pork jerky were examined. Form the results, We found that volatile basic nitrogen (VBN) content and aerobic plate counts of pork jerky gradually increased with increased storage time, ; moreover, there was a significant difference between the treatment groups and the control group (p<0.01). However, the counts did not increase as significantly in the ginseng powder group (B), as compared to the ginger powder group (A) (p<0.05). The sensory evaluation of pork jerky peaked during the second week of storage in all treatment groups, after which these characteristics gradually decreased (p<0.05). In addition, these characteristics were generally higher in the control group, compared to the treatment groups. When comparing the ginseng powder addition group (B) and ginger powder-addition group (A), only color was significantly higher in the ginger powder group. Based on this study as well as previous studies, storage of pork jerky significantly affects the sensory evaluation of raw pork. Ginger powder may have a more beneficial effect than other treatments on the sensory evaluation. Additionally, in all treatment groups, sensory characteristics were significantly higher in the ginger treated groups than in those of the ginseng-treated groups. 본 연구는 돈육 중의 후지육을 이용하여 천연 향신료인 생강 및 인삼 분말을 첨가비율별로 처리(무처리 대조구, T1구(A-생강 분말 0.1% 첨가, B-인삼 분말 0.1% 첨가), T2구(A-생강 분말 0.2% 첨가, B-인삼 분말 0.2% 첨가), T3구(A-생강 분말 0.3% 첨가, B-인삼 분말 0.3% 첨가)하여 돈육포를 제조한 후, 저장기간에 따른 VBN, 미생물 수 및 관능평가에 미치는 영향을 조사하였다. 돈육포의 VBN 함량은 대조구와 처리구간에서는 통계적인 유의차가 나타내었고(p<0.01), 저장기간이 길어짐에 따라 VBN 함량과 총 세균수 및 대장균 수도 점차 증가하는 경향을 나타내었다. 또한 처리구에 상관없이 생강 분말 첨가군(A)이 인삼 분말 첨가군(B)군보다 유의적으로 낮게 나타났다(p<0.01). 돈육포의 관능평가의 경우, 육색과 맛은 처리구에 상관없이 저장기간이 길어짐에 따라 저장 2주째에 가장 높아 통계적인 유의차가 나타났고(p<0.05), 그 이후는 서서히 낮아졌다. 특히 육색의 경우, T1구의 A군이 다른 처리구보다 크게 높게 나타났다(p<0.05). 이상의 결과로 볼 때 돈육포 제조 시 생강 분말 첨가는 미생물의 증식 억제에 다소 영향을 미치며, 육포 제조 후 2주째에 가장 맛이 좋은 것으로 판단된다.

한우 2번 염색체 양적형질좌위 영역에서 육질 연관 후보 DNA 마커 규명에 관한 연구

이윤석,오동엽,여정수,Lee, Yoon-Seok,Oh, Dong-Yep,Yeo, Jung-Sou 한국데이터정보과학회 2011 한국데이터정보과학회지 Vol.22 No.4

한우산업은 유전적으로 우수한 개체를 선발하기 위하여 전통적인 육종방법에 유전체정보를 활용하여 정확하게 예측하는 기술을 개발하고 있는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 이미 규명되어진 한우 2번 염색체 양적형질좌위을 바탕으로 발현염기서열표식 (EST) 단일염기 다형성 연관지도상에서 선발된 12개의 염기표식영역 표지인자내 단일염기다형성들과 한우집단의 육질과의 연관성을 평가하였다. 한우 2번 염색체 양적형질좌위영역에 있는 12개의 염기표식영역 표지인자를 이용하여 30차에서 33차 후대검정우 집단에서 가계정보가 서로 다른 20두에서 직접 염기서열분석을 한 결과 10개의 다형성이 있는 단일염기다형성를 확인할 수 있었다. 이 중에서 근내지방도 정규분포상 양쪽 집단과 단일염기다형성 유전자형간 빈도분석을 한 결과 HWSNP_1-1과 HWSNP_9-4 단일염기다형성에서 40%이상의 빈도차이를 나타내었다. 이 2개의 단일염기다형성들로 한우집단 (n=233)에서 근내 지방도와의 연관성을 살펴본 결과 HWSNP_1-1 단일염기다형성에서만 유의적인 차이를 나타내었다 (P<0.05). 따라서 본 연구에서는 HWSNP_1-1 단일염기다형성는 유전체정보를 활용한 한우 육질 개량에 있어 가장 효율적인 보조수단으로 활용가치가 높을 것이라 판단된다. By direct sequencing of 12 STS marker, we identified 10 polymorphic SNPs. As a result of genotype frequency analysis between 10 polymorphic SNPs and extreme population (n=20) for marbling score in Hanwoo (n=233), there was over 40 percent of frequency difference of HWSNP_1-1 and HWSNP_9-4 SNP. HWSNP_1-1 SNP was significantly associated with marbling score in large-scale population (n=233). Therefore we suggested that HWSNP_1-1 SNP can be useful as a positional candidate for beef quality for marker-assisted selection in Hanwoo.

고품질 한우 생산 유전자 연구에서 환경 요인을 보정한 통계적 모형 제안

장지은,이제영,오동엽,Jang, Ji-Eun,Lee, Jae-Young,Oh, Dong-Yep 한국데이터정보과학회 2015 한국데이터정보과학회지 Vol.26 No.6

Individual phenotype is mostly influenced by genetic factors as well as the effects of environmental factors. Therefore, adjustment of environmental factors are needed in order to see more clearly the effects of genetic factors that we are interested in gene screening study related to Hanwoo's economic trait. The purpose of this study is to propose new statistical model that was adjusted environmental factor and identify adjustment effect in a superior gene marker screening study for producing high quality Hanwoo. First, statistical model including both genetic factor and environmental factor establishes and adjusted value of economic trait find by removing effect of environmental factor such as age, breeding farm. Finally, we identify superior gene marker combination and compare accuracy by applying MDR to data of before and after adjustment. Economic trait is used C18:1, SFA, MUFA, MS, CWT, BFT and SNP marker is used 6 markers of LPL that were identified as more excellent SNP marker than the others among 49 markers through fatty acid composition and economic trait performance test. 개체의 표현형은 대부분 유전적인 요인의 영향과 환경적인 요인의 영향을 모두 받는다. 따라서 한우의 경제적인 특성과 연관이 있는 유전자 마커 선별 연구에서도 관심이 있는 유전적인 요인의 효과를 좀 더 정확히 보기 위해서는 환경적인 요인의 보정이 필요하다. 본 연구의 목적은 고품질 한우 생산을 위한 우수 유전자 마커 선별 연구에서 환경적인 요인이 보정된 새로운 통계 모형을 제안하고 그 효과를 규명하는 데 있다. 먼저 환경적인 요인과 유전적인 요인을 모두 포함한 통계모형을 구축한 뒤, 환경적인 요인인 도축일령과 사육농가의 효과를 제거하여 보정된 경제형질의 값을 구한다. 그리고 다중인자차원축소 방법을 보정 전 후 데이터에 각각 적용하여 우수 유전자 마커 조합을 선별하고 정확도를 비교한다. 사용된 경제형질은 C18:1, SFA, MUFA, MS, CWT, BFT이며 사용된 유전자 마커는 49개 LPL 유전자 마커 중 지방산 조성 및 경제 형질 능력 검정을 통해 나머지에 비해 더 뛰어난 유전자 마커로 선별된 6개 (g.6960 A>T, g.6974 G>A, g.21604 G>A, g.22488 G>T, g.22649 G>A, g.25670 C>T)이다.

한우의 지방산 조성에 영향을 미치는 SREBPs와 FABP4의 유전자 조합 규명

이제영,장지은,오동엽,Lee, Jae-Young,Jang, Ji-Eun,Oh, Dong-Yep 한국데이터정보과학회 2015 한국데이터정보과학회지 Vol.26 No.3

Disease of human and economic traits of livestocks are affected a lot by gene combination effect rather than a single gene effect. In this study, we used SNPHarvester method that supplement existing method in order to investigate the interaction of these genes. The used genes are SREBPs (g.3270+10274 C>T, g.13544 T>C) and FABP4 (g.2634+1018 A>T, g.2988 A>G, g.3690 G>A, g.3710 G>C, g.3977-325 T>C, g.4221 A>G) that are closely related to the fatty acid composition affecting the meatiness of Korean cattle. The economic traits which are used are oleic acid (C18:1), monounsaturated fatty acid (MUFA), marbling score (MS). First, we have utilized the SNPHarvester method in order to find excellent gene combination, and then used the multifactor dimensionality reduction method in order to identify excellent genotype in gene combination. 인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성은 단일 유전자보다는 여러 유전자들의 상호작용에 의한 영향을 많이 받는다. 본 연구에서는 이러한 유전자들의 상호작용을 규명하기 위해 기존에 사용되었던 방법들의 단점을 보완한 에스엔피 하비스트 방법을 이용하였다. 사용된 유전자는 최근 한우의 육질에 영향을 미치는 지방산 조성과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 단일염기다형성 중 SREBPs (g.3270+10274 C>T, g.13544 T>C)와 FABP4 (g.2634+1018 A>T, g.2988 A>G, g.3690 G>A, g.3710 G>C, g.3977-325 T>C, g.4221 A>G)이며, 경제형질은 한우의 맛과 향에 영향을 주는 올레인산, 불포화지방산, 근내지방도를 이용하였다. 먼저 에스엔피 하비스트 방법을 이용하여 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자 조합을 찾은 뒤 다중인자차원축소방법을 이용하여 단일염기다형성 조합 내의 우수 유전자형도 함께 규명하였다.

고급육생산을 위한 한방생균제 첨가급여 효과

김병기,하재정,이준구,오동엽,정대진,황은경,이제영,Kim, Byung Ki,Ha, Jae Jung,Yi, Jun Koo,Oh, Dong Yep,Jung, Dae Jin,Hwang, Eun Gyeoung,Lee, Jea Young 한국데이터정보과학회 2016 한국데이터정보과학회지 Vol.27 No.4

본 연구는 한방생균제 첨가급여가 거세한우육의 이화학적 특성 및 지방산, 아미노산 조성에 미치는 영향을 알아보기 위하여 거세한우 50두 (5처리${\times}$10두)를 공시하여 육질을 분석하였다. 육의 조지방 함량은 T2그룹과 T3그룹이 유의적 높았으나, 가열감량은 Con 2그룹이 가장 높았다 (p<0.05). 보수력은 56.73~60.16% 범위로, 전반적으로 처리그룹이 대조그룹보다 더 높았으며, 그 중에서 T3그룹이 유의적으로 높았다 (p<0.05). 콜레스테롤 함량은 41.64~47.33 mg/100g 범위로, 그 중에서 Con 1그룹이 유의적으로 높았다 (p<0.05). 또한 관능평가인 다즙성, 연도, 향미는 T3그룹이 매우 높게 나타났다 (p<0.05). 그리고 지방산 조성에서 올레인산과 무파 T2그룹과 T3그룹이 유의적으로 높았으나 (p<0.05), 아미노산 함량은 처리그룹 간에 거의 차이가 없었다. 이 결과에서 한방생균제 첨가급여는 한우육의 육질개선 및 불포화 지방산에 영향을 미치며 고급육 생산에 도움이 될 것으로 판단된다. This study was carried out to investigate the effect of dietary addition of herbal probiotics on the Hanwoo steers' physiochemical property. A total of 50 Hanwoo steers (5 treatment groups${\times}$10 heads) were used. The crude fat content of beef has been found significant high in T2 and T3 group, and the Con 2 group had the highest heating loss (p<0.05). The water-holding capacity ranged from 56.73% through 60.16%, and the treatment group was generally higher than the control group. In particular, the T3 group showed significantly high water-holding capacity (p<0.05). The cholesterol content ranged from 41.64mg/100g through 47.33mg/100g. In the overall and the Con 2 group had significantly high cholesterol content (p<0.05). Furthermore, the oleic acid and MUFA had significant high T2 and T3 group in the fatty acid composition (p<0.05), but the amino acid content made no difference between the treatment groups.