차세대염기서열분석법을 이용한 Tiger Salamander의 유전체 및 전사체 연구

어수형,Jacqueline M. Doyle,J. Andrew DeWoody 한국산림휴양복지학회 2013 한국산림휴양학회 학술발표회 자료집 Vol.2013 No.4

학술연구논문 구두발표 1 : 차세대염기서열분석법을 이용한 Tiger Salamander의 유전체 및 전사체 연구

어수형,( Jacqueline M Doyle ),( J Andrew Dewoody ) 한국임학회 2013 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2013 No.-

Microsatellite markers for the Ussuri white-toothed shrew (Soricidae: Crocidura lasiura) developed by Ion Torrent sequencing and their application to the shrew populations in disturbed forests

어수형,이우신,이병주,고병준,Jong U. Kim,전종훈 한국유전학회 2016 Genes & Genomics Vol.38 No.4

Understanding the impacts of forest management practices on genetic diversity is essential for effective animal management and conservation. We characterized novel microsatellite loci in the Ussuri white-toothed shrew (Crocidura lasiura Dobson, 1890) to test the impacts of anthropogenic thinning of forest trees on the shrew populations and their genetic diversity. Using Ion Torrent sequencing technology, we characterized 611 potential microsatellite markers with complete di- to tetra-nucleotide motifs, identifying nine polymorphic loci. The observed and expected heterozygosities across the nine loci were 0.526 and 0.527, respectively. Mean allelic diversity was 5.2 alleles per locus, with the mean polymorphism information content at 0.498. In comparison among shrew populations, which inhabited in the forests thinned in 2004 (CLA; n = 10), 2008 (CLB; n = 9) and 2014 (CLC; n = 3), the observed heterozygosities are similar among the three populations (0.525 at CLA, 0.532 at CLB and 0.519 at CLC), whereas the expected heterozygosities were much lower in population of CLC (0.377) than that of CLA (0.509) and CLB (0.533). The small sample size at CLC limited effective comparison and evaluation of the impact of forest thinning on genetic diversity in this shrew population. Future application of the species-specific microsatellite markers described here to a larger sample size would be valuable in estimating the ecological parameters of shrew populations associated with existing forest management practices.

조선 후기 산림의 황폐화와 民衆의 생활

魚秀亨 숲과문화연구회 1996 숲과 문화 Vol.5 No.5

비상(非常)에서 비상(飛翔)을 꿈꾸며

어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회II 2020 한국조류학회지 Vol.27 No.1

조류 보호를 위한 한·일 조류학자 교류 및 공동연구의 중요성 - 한국과 일본 조류학회 공동 온라인 심포지엄 (21.03.11) 참석기

어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회 2021 한국조류학회지 Vol.28 No.1

우리나라 임목육종 연구동향 : 학술지 논문 키워드 분석을 중심으로

어수형(Soo Hyung Eo),이병주(Byeong-Ju Lee),강규석(Kyu-Suk Kang),강준원(Jun-Won Kang),정은주(Eun Ju Cheong),최명석(Myung Suk Choi) 한국육종학회 2020 한국육종학회지 Vol.52 No.S

Studies on forest tree breeding (FTB) in South Korea started in the 1950s and have achieved remarkable outcomes through various techniques and methods such as selective breeding, cross breeding, introduction breeding, and biotechnology. Despite these outstanding achievements, no attempt has been made to objectively and quantitatively evaluate the results of domestic FTB research. Here, we quantitatively analyzed past research trends using keywords of published journal papers and compared the current domestic research level of FTB with the international level. Using various keywords in this field, we searched for research articles published in the Journal of Korean Society of Forest Science, the Korean Journal of Breeding Science, and the journals listed on the Science Citation Index from 1962 to present. The analysis of these studies showed that the research on FTB has grown quantitatively in Korea, and has been conducted on various subjects. Research topics from Korea, in terms of purpose and species, are not significantly different from those of foreign countries. The genus Pinus has been the major subject of FTB studies both domestically and internationally. However, in foreign FTB research, the trees used for research have diversified each year, while they were not diverse in Korea. The FTB research capacity of Korean national institutions, such as the National Institute of Forest Science, continues to dramatically increase, while the research capacity of universities is relatively low. Based on the results of this analysis, it is necessary to establish a concrete and effective policy for future research and development of FTB.

이화령 및 육십령 백두대간 생태축 복원사업지 토양 박테리아 군집 분석

박영대,권태호,어수형 경상대학교 농업생명과학연구원 2016 농업생명과학연구 Vol.50 No.1

토양 미생물 군집은 외부 환경변화에 있어 식물 군집보다 더 빨리 반응할 수 있다는 점에서 복원 과 정의 초기 지표로 활용될 수 있다. 이런 측면에서 인위적인 교란에 대한 생태계 반응을 측정하고 생태 계 복원의 지표를 제공하는 토양 미생물 군집 연구가 증가하고 있는 추세이다. 본 연구는 2012년과 2013년 준공된 이화령과 육십령 백두대간 생태축 복원사업지와 주변 임분에서 각각 토양을 채취하여 16S rRNA 파이로시퀀싱 기법을 이용하여 토양 박테리아 군집을 분석하였다. 문(Phylum) 수준에서의 박테리아 다양성은 이화령이 평균 29.3, 육십령이 평균 32.3으로 나왔고 복원사업지와 주변 임분은 통 계적으로 유의한 차이를 보였으나(p<0.01), 지리적 위치(이화령과 육십령 비교)나 토심(0∼15cm, 16∼ 30cm 비교)에 따른 유의한 영향은 나타나지 않았다. 검색된 토양 박테리아 중에서 Acidobacteria (37.3%)와 Proteobacteria(31.1%)가 가장 우점적으로 분포하는 것으로 나타났으며, 복원한 토양과 주변 임분에서 이 두 문의 박테리아 다양성 양상은 서로 상반되었다. 즉, 인공적으로 복원된 토양에서는 Proteobacteria가 높은 비율로 나타났고(38.1%, 인근 산림토양에서는 24.2%), 주변 임분에서는 Acidobacteria가 다양한 것으로 나타났다(55.4%, 복원 사업지는 19.2%). 이러한 경향은 토양의 영양상 태에 따라 선호하는 박테리아 종류가 다르다는 기존의 연구 결과와 유사하였으며, 특히 Acidobacteria 는 산성토양을 선호하는 등 토양산도와 밀접한 연관이 있을 것으로 생각된다. 따라서, 토양 박테리아 군집 특성은 연구지 위치나 토심에 따른 영향보다는 토양복원에 따른 영향이 더 크게 나타났고 이는 향 후 토양복원의 성공여부를 정량적으로 모니터링하는데 활용될 수 있을 것으로 기대한다. Researches on soil microbial community are increasing to assess ecosystem responses to anthropogenic disturbances and to provide an indicator of ecosystem recovery. Microbial communities are able to respond more rapidly to environmental changes than plants and therefore they may provide an early indication of the ecosystem recovery trajectory. This study was conducted using 16S rRNA gene pyrosequencing of soil samples to compare soil bacterial community composition between artificially covered soils of the Baedudaegan ridgeline and their adjacent forest soils in two restoration project sites, Ihwaryeong and Yuksimnyeong, which were completed in 2012 and 2013, respectively. Richness of the Phylum level was 29.3 in Ihwaryeong and 32.3 in Yuksimnyeong. Significant difference in the richness between artificialrestored soils and adjacent forest soils(p<0.01) was observed, however no significant difference was observed for site location and soil depth. Acidobacteria(37.3%) and Proteobacteria(31.1%) were more abundant than any other phylum in collected soil samples. Also, we found the significant difference in the relative abundance of the two abundant phyla between artificially restored soils and their adjacent forest soils (Proteobacteria, 38.1% in restored soils vs 24.2% in adjacent forest soils, p<0.01; Acidobacteria, 55.4% in restored soils vs 19.2% in adjacent forest soils, p<0.001). The results support the previous researches indicating that soil bacterial community composition is affected by nutritional status of soils and that Acidobacteria is also strongly influenced by pH, thus favoring soils with lower pH. This study could be utilized to monitor and evaluate restoration success of forest soil environment quantitatively.

귀제비(Cecropis daurica) 둥지에서 번식하는 박새(Parus major)와 참새(Passer montanus) 사례 보고

김봉균,어수형 한국조류학회II 2023 한국조류학회지 Vol.30 No.1

It was observed that a Great tit (Parus major) and Eurasian tree sparrow (Passer montanus) attempted to breed in the nests of Red-rumped swallows (Ceropis daurica) located on the outer wall of a building in Gongju-si, Chungcheongnam-do. The overall process and success of the reproduction during incubation and brooding could not be confirmed because the nests were removed via human activities; however, it was found that Great tits and Eurasian tree sparrows attempted to reproduce using the nests of Red-rumped swallows. In the future, it will be necessary to accumulate data and investigate the role that Red-rumped swallow nests play in the breeding process of other birds, Great tits and Eurasian tree sparrows, and to evaluate the reproductive success of Red-rumped swallows and other birds when they try to breed and brood simultaneously at a close distance. 충청남도 공주시 소재 건물 외벽에 자리한 귀제비(Cecropis daurica)의 둥지에서 박새(Parus major)와 참새(Passer montanus)가 번식을 시도한 것이 확인되었다. 포란 및 육추가 진행되던 중 사람의 활동에 따라 둥지가 제거되었기에 번식에 대한 전반적인 과정과 성공 여부를 확인할 수 없었으나 박새와 참새가 귀제비의 둥지를 이용해 번식을 시도했음을 알 수 있었다. 향후 귀제비 둥지가 박새와 참새를 비롯한 다른 조류의 번식 과정에서 은신처 혹은 둥지로써 어떤 역할을 하고, 가까운 거리에서 동시간에 귀제비와 다른 조류가 같이 번식 및 육추를 시도할 때 서로의 번식 성공 여부에 어떠한 영향을 끼치는지 등 다양한 자료 축적이 필요할 것으로 판단된다.

국내 포유류 연구의 주제와 동향

고병준,어수형 한국환경생태학회 2017 한국환경생태학회지 Vol.31 No.1

국내에서 포유류는 축산학, 수의학, 실험동물학, 생태학, 유전학 등 다양한 분야에서 활발하게 연구되고 있으며, 최근 생물다양성의 중요성이 강조되면서 이들의 보전 및 관리는 국민적으로도 많은 관심을 받고 있다. 하지만 전문 연구와 국민 관심의 증가에도 불구하고 국내 포유류 연구동향을 파악한 사례는 아직까지 찾아보기 힘들다. 이 연구는 국내 포유류의 연구동향을 파악하여 향후 세부연구영역의 계획과 관련 정책 제시를 위한 기초자료 제공을 목표로 하였다. 2015년까지 국내에서 발행된 포유류 학술논문 392편을 분석 대상으로 하였으며, 최근 각광받는 연구영역을 파악하기 위해 텍스트마이닝과 동시출현단어 분석을 이용하였다. 그 결과, 국내 포유류 연구논문 발행 수는 점차 증가하 였으며, 연구대상 종 역시 점차 다양해진 것으로 나타났다. 텍스트마이닝과 동시출현단어 분석을 통해 파악된 주된 포유류 연구영역은 (1)진화/계통/유전학, (2)환경/생태학, (3)발생/생식/세포생물학, (4)기생충/수의학, (5)설치류/기생충 학, (6)세균/바이러스학, (7)해부/세포생물/실험동물학, (8)형태/해부수의학, (9)축산학, (10)해양포유류학, (11)익수목 연구 등 11개로 구분되었다. 환경/생태학 연구는 11개 연구영역 중에서 최근 가장 활발하였으며, 과거에 비해 연구 비율이 급격히 증가한 분야로 나타났다. 환경/생태학 연구분야는 생물다양성 보전의 핵심으로, 최근 생물다양성의 중요성이 강조됨에 따라 국내 서식 포유류의 생태연구에 대한 연구자들의 관심 역시 더욱 증가한 것으로 보인다. 이 연구결과가 미래 국내 포유류 연구의 계획과 관련 정책 수립을 위한 기초자료로 유용하게 활용되기를 희망한다 Mammals in Korea have been studied in various fields such as animal science, veterinary medicine, laboratory animal science, ecology, and genetics. As the importance of biodiversity has been emphasized recently, conservation and management of mammals have attracted much public attention. However, in spite of such an increase in scientific research and public interest, it is still difficult to find a report or summary to grasp the trend of mammalian research in Korea. The purpose of this study is to provide the basic data for future plans of the detailed research area and the related policies by grasping the research trends of mammals in Korea. Using text-ming and co-word analysis, we analyzed 392 mammalian research papers published in Korean national journals as of 2015. Our results showed that the number of mammalian research papers published in Korea has gradually increased and that the research target species have also become increasingly diverse. The major research areas identified through text-mining and co-word analysis are (1) evolution/phylogenetics/genetics, (2) environmental science/ecology, (3) embryology/reproductive biology/cell biology, (4) veterinary medicine related to parasites, (5) parasitology related to rodents, (6) bacteriology/virology, (7) anatomy/cell biology/laboratory animal science, (8) veterinary science related to morphology and anatomy, (9) animal science, (10) marine mammalogy, and (11) Chiroptera (bat) research. Environmental science/ecology has been the most active field among the 11 research areas in recent times, and the proportion of research has increased sharply compared to the past. Environmental science/ecology is the core of biodiversity conservation, and as the importance of biodiversity has been emphasized in recent years, researchers' interest in mammal ecology appears to have increased. We expect that the results of this study will be useful for future research plan and related policies on mammals in Korea