해양환경공학과 환경교육

심정은(Jung Eun Shim),이두곤(Du Gon Lee) 한국해양환경·에너지학회 2008 한국해양환경·에너지학회지 Vol.11 No.4

스마트폰의 가속도 센서를 이용한 사용자 행위 패턴 연구

심정은(Jung Eun Shim),임채현(Chae Hyeon Lim),한성우(Seong U Han),박지훈(Ji Hoon Park),신강식(Kangsik Shin),원유재(Yoojae Won) 한국정보과학회 2017 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.2017 No.12

초등 7차 교과서의 환경교육적 내용 분석 및 초등환경교육 체계화를 위한 학교 교육과정 개발 방안

심정은(Jung Eun Shim),이두곤(Du Gon Lee) 한국환경교육학회 2013 環境 敎育 Vol.26 No.2

The purpose of this study is to reorganize the dispersive contents of the elementary Environmental Education(EE) in subject matters from the perspective of the Environmental Studies for Environmental Education(ESEE) and to systematize the elementary EE through school-based curriculum by presenting how to develop the curriculum which is designed to practice elementary EE. In this research, we utilized the concept and the related theory of ESEE to analyze the contents of the elementary EE textbooks of all subjects of the 7th national curriculum of Korea, and presented a direction and model to implement in the school-based EE curriculums which can systemize and integrate the dispersive EE contents in elementary education. Using the five content areas of ESEE, this research evaluated the EE contents of elementary textbooks through the perspective of ESEE and presented a new organizing method of elementary EE curriculum to systemize and integrate the EE contents. This research showed that the ESEE has a potential to implement the systematic and integrative contents of EE in the school-based EE curriculum to solve the current problems of elementary EE under the national curriculum.

단백질 2-DE 젤 이미지에서 자동 기준점 추출을 통한 스팟 매칭 정확도 향상 기법

심정은 ( Jung Eun Shim ),김연화 ( Yan Hua Jin ),이원석 ( Won Suk Lee ) 한국정보처리학회 2008 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.15 No.1

단백질체학에서 2-DE 는 조직내의 단백질을 규명하는 단백질 분리 기술로서 2-DE 에 의하여 생성된 단백질 이미지에서 스팟 매칭을 진행하여 상이한 단백질 젤 내에 존재하는 동일한 단백질 클래스를 찾을 수 있다. 그러나 단백질 2-DE 이미지는 실험 환경의 변화에 민감하여 이미지의 위치적인 변형이나 먼지, 공기방울 등으로 인해 많은 에러 정보를 포함할 수 있다. 이러한 에러는 스팟 매칭에 치명적인 영향을 주어 낮은 정확도를 가지게 된다. 본 논문에서는 단백질 2-DE 이미지 분석을 위한 스팟 매칭에서의 정확도를 향상시키기 위하여 기준점 학습과 기준점 추출의 두 단계로 이루어진 자동화된 기준점 추출 방법을 사용하여 스팟 매칭의 정확도를 향상시킬 수 있는 최적의 기준점을 선정하는 방법을 제안하며 선정된 기준점을 기반으로 다수의 기준 이미지를 선택하여 스팟 매칭을 반복적으로 진행함으로써 확률 기반의 정확한 스팟 매칭 결과를 도출하고자 한다. 특히 데이터 마이닝 기법에서 사용되는 최소지지도 값을 적용함으로써 지지도가 높은 스팟 매칭 결과를 빈발한 스팟 매칭으로 판정한다. 제안한 스팟 매칭 정확도 향상 기법의 정확도를 평가하기 위하여 실제 단백질 2-DE 젤 이미지 데이터를 사용하여 입력 기준점의 개수와 최소 지지도의 증가에 따른 정확도의 변화를 분석하였다.

다차원 클러스터링 기반의 단백질 2DE 이미지에서의 자동화된 기준점 추출 방법

심정은,이원석,Shim, Jung-Eun,Lee, Won-Suk 한국정보처리학회 2005 정보처리학회논문지D Vol.12 No.5

2DE는 조직 내의 단백질을 규명하는 단백질 분리 기술이다. 그러나 2DE 이미지는 실험 조건, 스캐닝 상태와 같은 환경에 민감하게 영향을 받는다. 이러한 이미지간의 변화를 극복하기 위해서 사용자는 각각의 서로 다른 이미지에 수동으로 기준점을 입력해주어야 한다. 그러나 이 과정은 에러를 발생시키며 긴 시간을 요구하는 작업으로, 빠른 분석에 장애 요인이 된다. 따라서 본 논문에서는 기준점 프로파일에 기반 하여 기준점을 자동으로 추출하는 방법을 개발하였다. 기준점 프로파일은 이미 확인된 이미지들의 기준점들에 대한 클러스터링 방법을 통하여 생성하며, 각 클러스터의 다양한 속성을 정의한다. 새로운 이미지가 입력되면 기준점의 후보 스팟들을 대상으로 프로파일과 비교하석 기준점을 추출한다. 그리고 $A^*$알고리즘을 이용하여 기준점 선정 과정을 최적화한다. 본 논문에서는 실제 사람의 간 조직 이미지를 이용하여 기준점 추출 방법의 성능을 분석하였다 2-dimensional electrophoresis(2DE) is a separation technique to identify proteins contained in a sample. However, the image is very sensitive to its experimental conditions as well as the quality of scanning. In order to adjust the possible variation of spots in a particular image, a user should manually annotate landmark spots on each gel image to analyze the spots of different images together. However, this operation is an error-prone and tedious job. This thesis develops an automated method of extracting the landmark spots of an image based on landmark profile. The landmark profile is created by clustering the previously identified landmarks of sample images of the same type. The profile contains the various properties of clusters identified for each landmark. When the landmarks of a new image need to be fount all the candidate spots of each landmark are first identified by examining the properties of its clusters. Subsequently, all the landmark spots of the new image are collectively found by the well-known optimization algorithm $A^*$. The performance of this method is illustrated by various experiments on real 2DE images of mouse's brain-tissues.

나선형 분지 스텐트 내에서의 혈류 유동 수치모사

심정현(Jeong Hyun Shim),이경은(Kyung Eun Lee),유정열(Jung Yul Yoo) 대한기계학회 2008 대한기계학회 춘추학술대회 Vol.2008 No.5

It is broadly accepted that bifurcated stent-graft signifies an improvement in surgical technique for treatment of a lesion in the branched blood vessel. However, there still remains the high failure rate regarding bifurcated stent-graft due to the occurrence of thrombosis or re-stenosis. The objectives of this study are to understand the effect of torsion in helical bifurcated geometries, to explain how the mixing of flows in the geometries may be advantageous to the prevention of the occurrence of thrombosis, and to keep the patency of stent-graft in the aspect of hemodynamics. For clinical applications, flows in a helical bifurcated stent-graft with a small helix amplitude are simulated three-dimensionally using a Navier-Stokes solver. In this study, the hemodynamics is investigated in terms of mechanical factors, i.e., velocity profiles, vortex patterns and wall shear stress distributions. The result of this study can be utilized as design information for the developed devices.

데이터 큐브를 이용한 폐암 2-DE 젤 이미지에서의 예외 탐사

심정은,이원석,Shim, Jung-Eun,Lee, Won-Suk 한국정보처리학회 2008 정보처리학회논문지D Vol.15 No.5

In proteomics research, the identification of differentially expressed proteins observed under specific conditions is one of key issues. There are several ways to detect the change of a specific protein's expression level such as statistical analysis and graphical visualization. However, it is quiet difficult to handle the spot information of an individual protein manually by these methods, because there are a considerable number of proteins in a tissue sample. In this paper, using database and data mining techniques, the application plan of OLAP data cube and Discovery-driven exploration is proposed. By using data cubes, it is possible to analyze the relationship between proteins and relevant clinical information as well as analyzing the differentially expressed proteins by disease. We propose the measure and exception indicators which are suitable to analyzing protein expression level changes are proposed. In addition, we proposed the reducing method of calculating InExp in Discovery-driven exploration. We also evaluate the utility and effectiveness of the data cube and Discovery-driven exploration in the lung cancer 2-DE gel image. 단백질체학에서 특정 조건 하에서 단백질의 기능 이상 및 구조 변형 유무를 규명하고 질병 과정을 추적하는 것은 중요한 연구이다. 일반적으로 단백질의 발현량 변화 분석에는 통계적 방법이 많이 사용되고 있으며 단백질 상용 이미지 분석 소프트웨어에서 제공하는 그래픽을 이용한 방법들도 있으나, 이 방법들은 많은 조직 내에 존재하는 수많은 단백질을 수동으로 비교해야 하는 어려움이 있다. 본 논문에서는 데이터베이스와 데이터마이닝 기법을 이용하여 OLAP 데이터 큐브와 Discovery-driven 탐색의 응용 방법을 제안한다. 데이터 큐브의 특성을 이용함에 의해서, 질병에 의해 발현량이 변하는 단백질 뿐 아니라 임상적 특성과 단백질의 영향 관계를 분석하는 것이 가능하다. 데이터 큐브에서 단백질의 발현량 변화 분석에 적합한 데이터 큐브의 척도와Discovery-driven 탐색을 위한 예외 지표를 제안하고, 특히 In-exception을 계산하는데 있어서의 계산량 감소 방안을 제시한다. 실험을 통해 폐암 2-DE 데이터에서 데이터 큐브와 Discovery-driven 방법이 유용함을 보인다.

정확도 향상을 위한 단백질 2-DE 이미지 정보 분석 프레임워크

김연화 ( Yanhua Jin ),심정은 ( Jung Eun Shim ),이원석 ( Won Suk Lee ) 한국정보처리학회 2009 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.16 No.2

단백질 2-DE 이미지 분석은 가장 널리, 가장 오랫동안 사용되고 있는 기술로서 샘플에 들어있는 수천 개에 달하는 단백질을 저한 비용으로 효과적으로 분리하는 장점을 가지고 있다. 하지만 단백질 자체가 가지고 있는 불안정성과 2-DE 실험이 가지고 있는 근본적인 문제점으로 인하여 2-DE 이미지 분석결과는 정확도가 낮아지게 된다. 따라서 이 논문에서는 데이터마이닝 기법을 사용한 “기준점 자동 추출 모듈”과 “확률기반 매칭 조정 모듈”로 구성된 이미지 정보 분석을 위한 프레임 워크를 제안하였으며 실제 데이터에 대한 실험을 통하여 제안한 방법의 타당성을 검증하였다.

단백질 2DE 이미지에서 참조 이미지에 의한 유사도 기반 에러 스팟 필터링 기법

김연화 ( Yan Hua Jin ),심정은 ( Jung Eun Shim ),이원석 ( Won Suk Lee ) 한국정보처리학회 2005 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.12 No.2

단백질 2DE 이미지 분석의 주요작업은 스팟 매칭에 의한 동일한 종류의 단백질 그룹인 패어링 클래스를 구성하는 것으로서 단백질간의 상호 작용, 질병에 관련한 단백질의 변화 등을 관찰할 수 있다. 하지만 2DE 실험의 여러 가지 문제점으로 인하여 패어링 클래스는 먼지, 공기방울 등 에러를 포함하게 되며 이런 에러들은 왜곡된 분석결과를 초래한다. 따라서 본 논문에서는 동일한 조직에서 같은 종류의 단백질은 발현량이 비슷하다는 특성을 이용하여 패어링 클래스의 개개의 스팟을 참조스팟 속성으로 나눈 값을 유사도로 정의하고, 스팟의 유사도가 사용자에 의하여 선택되는 필터링 배수에 의한 범위를 벗어날 때 에러 스팟으로 간주하여 제거되는 에러 필터링 기법을 제안한다. 실험에서는 정확도(Precision), 재현율(Recall) 및 조화평균(Harmonic-mean) 값을 사용하여 제안된 필터링 기법의 타당성을 보여준다.

사전환경해설이 공원이용객의 환경관심에 미치는 영향의 차이 -월드컵공원을 대상으로-

정관웅 ( Kwan Woong Jung ),심정선 ( Jung Sun Shim ),조중현 ( Joong Hyun Cho ),오형은 ( Hung Eun Oh ),김용근 ( Yong Geun Kim ) 한국환경생태학회 2007 한국환경생태학회지 Vol.21 No.3