한소망교회 아동세례

서민구 장로회신학대학교 기독교교육연구원 2022 교육교회 Vol.514 No.-

Repeated Gene Transfection Impairs the Engraftment of Transplanted Porcine Neonatal Pancreatic Cells

서민구,손성림,김지원,윤건호,이숙경 대한당뇨병학회 2011 Diabetes and Metabolism Journal Vol.35 No.1

Background: Previously, we reported that neonatal porcine pancreatic cells transfected with hepatocyte growth factor (HGF)gene in an Epstein-Barr virus (EBV)-based plasmid (pEBVHGF) showed improved proliferation and differentiation compared to those of the control. In this study, we examined if pancreatic cells transfected repeatedly with pEBVHGF can be successfully grafted to control blood glucose in a diabetes mouse model. Methods: Neonatal porcine pancreatic cells were cultured as a monolayer and were transfected with pEBVHGF every other day for a total of three transfections. The transfected pancreatic cells were re-aggregated and transplanted into kidney capsules of diabetic nude mice or normal nude mice. Blood glucose level and body weight were measured every other day after transplantation. The engraftment of the transplanted cells and differentiation into beta cells were assessed using immunohistochemistry. Results: Re-aggregation of the pancreatic cells before transplantation improved engraftment of the cells and facilitated neovascularization of the graft. Right before transplantation, pancreatic cells that were transfected with pEBVHGF and then re-aggregated showed ductal cell marker expression. However, ductal cells disappeared and the cells underwent fibrosis in a diabetes mouse model two to five weeks after transplantation; these mice also did not show controlled blood glucose levels. Furthermore, pancreatic cells transplanted into nude mice with normal blood glucose showed poor graft survival regardless of the type of transfected plasmid (pCEP4, pHGF, or pEBVHGF). Conclusion: For clinical application of transfected neonatal porcine pancreatic cells, further studies are required to develop methods of overcoming the damage for the cells caused by repeated transfection and to re-aggregate them into islet-like structures.

공동주택 장기수선계획 시스템 개발을 위한 분석ㆍ설계단계에 관한 기초적 연구

서민구,정영한,박태근 대한건축학회 2004 대한건축학회 학술발표대회 논문집 - 계획계/구조계 Vol.24 No.1

Extension of building life cycle and reduction of maintenance and management relevant expenses are the top issues in the current construction market. The fields of maintenance and management are newly highlighted for the limited land and domestic economic crisis known as the 2nd IMF. We studied on the long-term maintenance plan of apartment buildings in order to analyze the defective management system of existing apartment building and secure the development-oriented management system in this study. Purposes of this study are to prevent the unwanted loss of manpower and capital resulted from the careless storage of repair and management records, extend the building life cycle and resolve the conflict caused by the uncomfortable relation with the occupants. This study is focused on presenting the potential to develop the process required for the basic analysis and development of system as the beginning stage in the process of developing the long-term maintenance plan.

워드클라우드를 이용한 국내·외 BIM 연구 동향 분석

서민구,이웅균 한국건축시공학회 2019 한국건축시공학회지 Vol.19 No.1

건설 프로젝트에서 BIM도입과 활용이 증가하고 있는 실정이다. 하지만 국내 BIM 활용 수준은 해외 BIM 활용 수준에 비해 아직 미약하다. 이를 위해 본 연구는 국내·외 연구문헌 분석을 통해 BIM연구의 방향성을 제시하는 것을 목적으로 한다. 연구 방법으로는 건축의 관련된 국내·외 BIM논문을 수집 후 연도별과 분야별로 나누어 비교·분석을 진행하였고, 빅데이터 기법 중 하나인 워드클라우드를 활용하여연구패턴을 분석하였다. 분석결과, 여전히 설계분야가 가장큰 비중을 차지하고 있지만 최근 들어와서는 시공분야에 대한 연구가 활발하게 진행되고 있었다. 또한 국내 BIM연구의흐름은 2012년을 시작으로 협업, 친환경에 대한 연구가 계속 진행되고 있으며, 국외 BIM연구의 흐름은 매 년마다 연구의 트렌드가 변화하는 것으로 파악되었고, 최근에는 IFC에 대한 연구가 활발하게 진행되고 있는 것으로 나타났다. 이에 본 연구는 향후 진행할 연구 방향으로 IFC 분야의 연구를 진행할 필요가 있음을 확인하였다. 본 연구의 결과물은향후 국내 BIM 연구를 진행하기 위한 효율적인 기초자료로활용될 수 있을 것이다. Introduction and use of Building Information Modeling(BIM) in construction projects have increased steadily over thepast few years. However, the level of domestic BIM utilization is still tenuous compared to the international scene. Therefore, this study aims to present the possible directions for BIM research through an analysis of researchliteratures in Korea as well as in foreign countries. Papers on BIM were collected for this study from Korea andforeign countries for the field of architecture, and analyses and comparisons were performed by year and field. Further,the research patterns were analyzed using WordCloud, which is one of the popular big data techniques. From theanalysis, it is found that the design field still constitutes the largest component of research, but the construction fieldis actively developing as well. In addition, it is realized that domestic BIM research continues to grow on collaborationand environment-friendly methodologies since 2012; it is also demonstrated that foreign BIM research has undergonechanges in research trends every year including recently, and is progressing actively. Therefore, this study concludesthat it is necessary to actively conduct research in the field of Industry Foundation Class(IFC) in the future. Theresults of this study can further be used as reference data for conducting BIM studies in Korea in the future.

단백질 이차 구조에 대한 패턴 검색을 위한 클러스터 세그먼트 인덱싱

서민구,박상현,원정임 한국정보과학회 2004 데이타베이스 연구 Vol.20 No.2

생물 데이터의 시퀀스 유사 검색은 유전자나 단백질의 기능과 진화 과정을 유추하기 위한 필수 연산이다.그러나 단백질의 유사 검색에서는 단백질 1차 구조(아미노산 배열)가 다르더라도, 단백질의 공간적 구조의 유사성을 통해 단백질의 기능 및 진화 단계를 유추할 수 있는 경우가 많다. 본 논문에서는 단백질 구조의 유사성 비교 중 단백질 2차 구조를 대상으로 하여, 직관적으로 기술 가능한 문자 단위의 질의 언어를 정의하고, 세그먼트를 조합한 클러스터 인덱스 구조 및 Look Ahead를 사용해 Exact Match, Range Match, Wildcard Match 질의를 효율적으로 처리할 수 있는 기법을 제시한다. 실험 결과 본 논문의 인덱스 구조가 좋은 정선도를 가지며, 또한 기존의 방식에 비해 검색 성능이 크게 향상됨을 확인하였다.

클러스터 세그먼트 인덱스를 이용한 단백질 이차 구조의 효율적인 유사 검색

서민구(Minkoo Seo),박상현(SangHyun Park),원정임(JungIm Won) 한국정보과학회 2006 정보과학회논문지 : 데이타베이스 Vol.33 No.3

단백질 일차 구조(아미노산 배열)에 대한 상동 검색은 유전자나 단백질의 기능과 진화 과정을 유추하기 위한 필수 연산이다. 그러나 진화 단계가 멀리 떨어진 경우 단백질 일차 구조는 보존되지 않기 때문에 단백질의 공간적 구조에 대한 유사 검색을 통해서만 진화 단계를 유추할 수 있다. 따라서 본 논문에서는 단백질의 공간적 구조를 표현하는 단백질 이차 구조를 대상으로 하여 RDBMS상에 쉽게 구현이 가능한 인덱싱 방안을 제안한다. 제안된 인덱싱 방안은 클러스터링 기법과 LookAhead 개념을 활용하여 Exact Match, Range Match, Wildcard Match 질의를 신속하게 처리한다. 제안된 방법의 우수성을 검증하기 위하여 실제의 단백질 데이타를 대상으로 성능 평가를 수행하였다. 실험 결과에 의하면, 제안된 방법은 기존의 방법과 비교하여 Exact Match의 경우 6.3배까지, Range Match의 경우 3.3배까지, Wildcard Match의 경우 1.5배까지의 개선된 검색 성능을 가지는 것으로 나타났다. Homology searching on the primary structure (i.e., amino acid arrangement) of protein sequences is an essential part in predicting the functions and evolutionary histories of proteins. However, proteins distant in an evolutionary history do not conserve amino acid residue arrangements, while preserving their structures. Therefore, homology searching on proteins' secondary structure is quite important in finding out distant homology. In this manuscript, we propose an indexing scheme for efficient approximate searching on the secondary structure of protein sequences which can be easily implemented in RDBMS. Exploiting the concept of clustering and lookahead, the proposed indexing scheme processes three types of secondary structure queries (i.e., exact match, range match, and wildcard match) very quickly. To evaluate the performance of the proposed method, we conducted extensive experiments using a set of actual protein sequences. CSI was proved to be faster than the existing indexing methods up to 6.3 times in exact match, 3.3 times in range match, and 1.5 times in wildcard match, respectively.

사람-가축 간 전파 인수공통감염병 발생 동향: 큐열, 브루셀라, 결핵, 공수병

서민구 ( Min-goo Seo ) 대한인수공통감염병학회 2023 창립총회 및 학술대회 초록집 Vol.2023 No.2

선택적 Exclusive-OR 연산을 사용한 OFDM시스템의 PAPR감소를 위한 연구

서민구(Seo Min Gu),공형윤(Kong Hyung Yun) 한국통신학회 2004 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2004 No.11

단백질 이차구조의 검색을 위한 클러스터링된 세그먼트 인덱싱

서민구(Minkoo Seo),박상현(Sanghyun Park) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B

바이오 인포메틱스에서의 데이터 검색은 DNA와 단백질 시퀀스에 대해서 주로 이루어지며, 지금까지의 연구는 주로 DNA와 단백질 1차 구조의 검색에 대해 이루어졌다. 단백질 2차구조는 1차구조 내 인접한 아미노산들의 공간적인 배열을 나타내며, 단백질의 기능을 예측하는데 중요한 3차구조의 지역적 아미노산의 특성을 나타낸다. 따라서 2차구조에 대한 검색은 단백질의 기능을 이해하는데 매우 중요한 역할을 한다[1]. 이 논문에서는 단백질 2차구조 및 질의 문자열을 세그먼트 단위로 나누고 검색하는 [4]의 방법을 개선하여 세그먼트를 조합한 클러스터 구조 및 Look Ahead를 사용해 Exact Matching 및 Wildcard Matching 질의를 효율적으로 처리할 수 있는 기법을 제시한다.

중독 환자에서 고아밀라아제혈증의 발생률, 관련 요인 및 임상적 영향

서민구 ( Min Gu Seo ),오상훈 ( Sang Hoon Oh ),임지용 ( Jee Yong Lim ),김한준 ( Han Joon Kim ),최세민 ( Se Min Choi ) 대한임상독성학회 2016 대한임상독성학회지 Vol.14 No.2

Purpose: This study was conducted to investigate the incidence, associated factors and clinical impact of hyperamylasemia in self-poisoning patients. Methods: This study was based on a toxicology case registry of patients treated from 2009 to 2013 at a tertiary care university hospital. We retrospectively investigated the demographics, clinical variables, laboratory variables and intoxicants. Hyperamylasemia was defined as an elevation in serum amylase level to above the upper normal limit within 24 hours after admission. We analyzed the predisposing factors and clinical outcomes of patients in the hyperamylasemia group. Results: Hyperamylasemia was identified in 49 (13.3%) of the 369 patients. Using multivariate logistic regression, the odds ratios for HA were 3.384 (95% confidence interval, 1.142-8.013, p=0.014), 3.261 (95% confidence interval, 1.163-9.143, p=0.025) and 0.351 (95% confidence interval, 0.154-0.802, p=0.013) for pesticides, multi-drug use and sedatives, respectively. In the hyperamylasemia group, the peak amylase levels during 72 hours were correlated with the peak lipase levels (r=0.469, p=0.002) and peak aspartate aminotransferase levels (r=0.352, p=0.013). Finally, none of these patients had confirmed acute pancreatitis. Conclusion: Hyperamylasemia occurred rarely in these self-poisoning patients, and pesticide and multi-drug use were independent predictors of hyperamylasemia. Peak amylase levels were correlated with the peak lipase and aspartate aminotransferase levels.