Global analysis on heat- or bile-responsive gene expression profile of clonorchis sinensis using cDNA microarray

김태임 중앙대학교 대학원 2009 국내박사

Human clonorchiasis is endemic in East Asian countries where about 35 million people were estimated infected. The clonorchiasis takes a chronic infection course causing jaundice, hepatomegaly, ascites, systemic weakness, and cholangiocarcinoma and threats inhabitants in endemic areas. Clonorchis sinensis develop through several larval stages, miracidium, sporocyst, redia, cercaria in freshwater snail and metacercaria in fish, and then grow to the egg-laying adult fluke in the mammalian hosts. When transmitted from freshwater fish to mammalian hosts by ingestion, C. sinensis metacercariae encounter a big heat shock in them. Newly excysted juveniles C. sinensis (CsNEJs) are exposed to bile in duodenum and then migrate up to bile duct where they grow into ovigerous adult fluke. The CsNEJs should overcome and adapt to these environmental changes for survival. Considering these biological challenging circumstances, this study was performed to analyze gene expression profiles of CsNEJs induced by heat-shock and bile using C. sinensis 12K cDNA microarrays. The microarray was fabricated loading 11,550 probes designed from the EST pool of C. sinensis adult and metacercaria. To figure out heat-induced genes, CsNEJs were heat-shocked at 37°C for 6 hours. To identify genes induced by bile, the CsNEJs were incubated in 0.005% bile for 2 or 6 hours, or in 0.01% bile for 6 hours at 37°C. Total RNA was extracted and genomic DNA was removed DNase I treatment. The RNA samples were labeled with Cy5 fluorescent and hybridized to the miocroarrays. Each group was biologically triplicated. Scanned signals were normalized by global normalization method. Signals of 8,653 probes were rescued and analyzed for heat-induced gene expression. Heat shock enhanced transcription of stress responsive proteins, such as heat shock protein, APEX nuclease, calreticulin, and thymidylate synthetase. Up-regulated genes were related to energy metabolism, such as NADH dehydrogenase subunit 3, cytochrome b-c1 complex subunit 7, glutamate dehydrogenase 1, N-acetylglucosamine kinase, glutamine:fructose-6-phosphate aminotransferase 1, acetyl-CoA, lactate dehydrogenase. Signal transduction related genes were also up-regulated, which were Rap1B, RAS-like GTP-binding protein RhoA, protein kinase, cGMP-dependent, cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit. Expression of genes associated with transcription and translation, or development and growth were up-regulated by 37°C heat shock. From bile-incubated groups, signals of 8,377 probes were rescued and analyzed for gene expression. Genes up-regulated were voltage-dependent calcium channels, calmodulin (CaM), calcium/CaM-dependent protein kinase, etc. These proteins were associated with locomotion of CsNEJs. Signal transduction related genes were up-regulated, which were Rho GTPase activating protein12, G protein, gamma 10. Transcription and translation, or protein transport related genes were also up-regulated by bile. Gene expression profiles of CsNEJ were dependent on incubation-time in bile. In the early infection stage, heat shock was a principal factor of gene expression associated with adaptation and maturation. Bile promote the juvenile to the bile ducts. 간흡충증은 우리나라를 포함한 동아시아 지역에서 유행하는 기생충성 질환이며 3,500만명이 간흡충에 감염되어 있을 것으로 추정된다. 간흡충증은 만성적 경과를 취하며 황달, 간종대, 복수, 전신쇄약, 담관암 등을 일으켜서 유행지 주민들의 건강을 위협한다. 간흡충은 담수산 패류와 담수어에서 유충기를 거치고 포유동물 숙주에서 성충으로 성장하는 복잡한 발육단계를 거친다. 포유동물에 섭취된 피낭유충은 숙주 체온에 의한 급격한 온도변화를 겪고, 소장 상부에서 탈낭하여 장내 담즙에 의해 자극을 받는다. 탈낭한 간흡충 유약충은 총수담관을 경유하여 간내 담도로 이동하여 성충으로 성숙한다. 본 논문에서는 간흡충의 종숙주 내 서식환경의 생태학적 특성에 착안하여 열충격 및 담즙에 의해 유도되는 유전자 발현상을 간흡충 12K cDNA microarray로 분석함으로써 환경에 의해 조절되는 간흡충의 숙주 적응 및 성장을 유전자 수준에서 규명하고자 하였다. 간흡충 성충과 피낭유충의 EST pool에서 probe 11,550개를 설계하여 en silico로 합성하였다. 열충격을 주기 위하여 간흡충 탈낭피낭유충을 37°C에서 6시간 동안 배양하였다. 답즙 자극에 의한 유전자 발현을 유도하기 위하여 0.005% 담즙에서 2시간 혹은 6시간, 0.01% 담즙에서 6시간 동안씩 각각 배양하였다. 각 실험군 및 대조군에서 total RNA를 추출하고 DNase I으로 처리하여 genomic DNA를 제거하였다. 각 RNA 샘플을 Cy5로 형광표지시켜서 microarray에 hybridization시켰다. 모든 실험을 생물학적으로 3회 반복하였다. Microarray의 형광을 스캐닝하고 global normalization 방법으로 보정하였다. 37°C 열충격을 받은 간흡충 유약충의 microarray 결과에서 8,653개 probe의 형광신호가 유효하여 유전자 발현 분석에 사용되었다. 발현이 증가한 유전자는 heat shock protein 및 APEX nuclease, calreticulin, thymidylate synthetase 등의 스트레스 반응 유전자와 해당작용 및 전자전달계와 관련되어 에너지 생산을 촉진하는 NADH dehydrogenase subunit 3, cytochrome b-c1 complex subunit 7, glutamate dehydrogenase 1, N-acetylglucosamine kinase, glutamine:fructose-6-phosphate aminotransferase 1, acetyl-CoA, lactate dehydrogenase 등이 있었다. 또 Rap1B, RAS-like GTP-binding protein RhoA, protein kinase, cGMP-dependent, cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit 등의 신호전달 관련 유전자의 발현이 증가하였고, transcription initiation factor IIE subunit beta, transcription factor RAP30, eukaryotic translation initiation factor 5, arginyl-tRNA synthetase 등의 전사 및 번역에 관련된 유전자의 발현이 증가하였다. 발육과 성장에 관련된 유전자의 발현 또한 증가하였다. 담즙 자극에 대한 microarray 결과에서는 8,377개 probe의 형광신호가 유효하여 유전자 발현 분석에 사용되었다. Voltage-dependent calcium channels, calmodulin (CaM), calcium/CaM-dependent protein kinase 등의 이동관련 유전자, Rho GTPase activating protein12, G protein, gamma 10의 신호전달 관련 유전자의 발현이 증가하였다. 또한 DNA-binding protein, transcription factor 25 등의 전사 및 번역에 관련된 유전자와 Vacuolar protein sorting 26, clathrin 등의 단백질 이동과 관련된 유전자의 발현 또한 증가하였으며, 유전자 발현은 배양시간 의존적으로 변화하였다. 이상의 결과를 종합하면, 포유동물 숙주의 체온은 간흡충의 숙주 적응 및 성장에 관련된 유전자 발현을 조절하는 중요한 요소로 작용하고, 담즙은 간흡충 유약충의 이동을 자극하여 간내 담도로 이동하는 것을 촉진할 것으로 예측된다.

3차원 그래픽을 이용한 VRML 학습시스템 설계 및 구현

김태임 광운대학교 1997 국내석사

국문요약 본 논물은 3차원 그래픽을 학습매체로 하는 VRML(Virt질 Reality Modeling Language) 학습 시스템을 설계하여 구현하였다. 본 시스템의 특징은 3차원 그래픽을 통해 학습 내용을 현실감 있게 전달할 수 있도록 하였으며, 학습 자와의 상호작용을 통해 3차원 그래픽으로 나타난 학 습 결과를 VRML코드로 자동 변환하여 VRML 과일 편집기를 통하여 학습자가 VRML코드를 확인함으로써 VRML문법을 익힐 수 있도록 하였으며, CAI 저작 도구(동화상 녹음기, 오디오 편집기)를 제공하여 개개인의 독특한 학습 특성과 요구 수준에 기초한 학습 자료를 교사가 직접 제작하므로써 개별화 학습이 이 루어지도록 하였다. The main purpose of this thesis lies in designing and embadiment of VRML(Virtual Reality Modeling Language) that is the learning medium by third-dimension graphic. Using third-dimension graphic, thos system would make it possible to convey the learning text with reality, and automatically convert the learning results, which are presented in third-dimension graphic by the interaction between learner and system, into the code of VRML, and then for learners to learn the Grammar of VRML with translating the Code through VRML file-editor, and finally for the teacher himself to prepare the teaching materials based on the individually special learning styles and needs and realize the individualized learning with the CAI authoring tools, like animating recorder and audio editor.

情報시스템 部署의 成果 測定 基準에 관한 硏究 : 평가자 관점과 조직적 요소의 상황요인을 고려하여

김태임 韓國外國語大學校 1996 국내석사

초산모의 영아에 대한 지각 및 양육태도와 초기수유 상황에서의 모아 상호작용 양상과의 관계

김태임 梨花女子大學校 1991 국내박사

Francis Poulenc의 Sonata for flute and piano의 연구 분석

김태임 祥明女子大學校 大學院 1995 국내석사

Francis Poulenc은 20세기 초 프랑스 예술가곡의 대표적인 작곡가이다. 그는 당시의 시대적 상황을 대변하는 초현실주의 시와 피아노 반주의 효 과적인 결합으로 다수의 성공작을 낳았다. Poulenc은 이국적 정취와 함께 리듬과 화성이 가볍고 화려한 작품뿐만 아니라 종교적 재인식에 따른 심오하고 극적인 작품까지 다양하게 표현 했다. 그의 작품은 당시 20세기 음악과는 달리 분명한 조성과 박자를 지니며 선율선이 단순하고 리듬형의 반복 동형진행으로 음악적 통일성을 이룬 다. 그 밖에 자주 등장하는 피아노의 pedal사용과 staccato음형의 효과 적인 처리는 곡의 다양한 분위기를 조성한다. 본 논문은 석사과정 이수를 위한 졸업연주회에서 연주하였던 작품들 중 에서 Francis Poulenc의 Sonata for flute and piano를 분석 고찰한 것이 다. 분석을 통하여 살펴본 결과는 다음과 같다. F. Poulenc의 Sonata for flute and piano는 3악장의 구성으로 강렬한 조성, Pedal point의 사용 순환형식, 대위법적인 모방기법에 의한 주제의 변형, 잦은 전조, 급격한 화성진행, 이명동음, 9화음 선율의 대칭관계 등이 자주 사용되고 있다. French composer, also known as a pianist, Francis Poulenc, tried to recapture the wit and esprit that are part of his national heritage which made him considered not a sincere composer at the beginning. But eventually he has been believed that he is one of the most remarkable composers together with Messiaen in Me>lodie and sacred music after Faure> by reacting against the excessive complexity of Western art. The analyses of "Sonata for flute and piano" by F.Poulenc in this paper are as follows : 1. It was composed of three movements which had a intense tonal and a lot of using pedal points though it did not have a key signature. 2. In first and third movement it was written in ternary form, and in second movement it was written in binary form, And the theme was developed by the style of cycle theme and imitative counterpoint throughout whole movement. 3. The distinguishing features of this work are frequent modulation, abrupt harmonic motion, using pedal point, gradual part progress, imitate counterpoint, using chord of 9th, and symmetric relation of melody. In the viewpoint of musical history, his musical sense toward chromatic tonal and magnificent sense of rhythm enabled him to be one of Les six.

새로 합성된 항염증펩타이드의 효과 : 알레르기 결막염 기니픽모델의 in vivo 실험

김태임 울산대학교 대학원 2001 국내석사

Identification of morphogenetic transition regulator FIG1-interacting proteins in Candida albicans by two-hybrid analysis

김태임 서울대학교 대학원 2010 국내석사

(The)effect of mitomycin C, ceramide, and 5-FU in rabbit cornea after PRK

김태임 울산대학교 2004 국내박사

경제민주주의에 관한 일연구 : 협동조합 기업제도를 중심으로

김태임 이화여자대학교 1992 국내석사

대지미술 연구 : 자연 친화적 작가 와 이중적인 작가를 중심으로

김태임 강릉대학교 교육대학원 2007 국내석사

미술은 본래 삶의 일부분으로서 사회적 활동과 결합되어 있었고 미술과 삶을 융합하려는 이런 시도들은 20세기 초 러시아 구성주의(Constructivism)와 바우하우스(Bauhaus), 다다이즘(Dadaism) 그리고 네오다다이즘(Neo-Dadaism)에 이르기 까지 계속되어왔다. 이들은 미술을 자신들의 주변세계와 연관시키고 미술을 통해 사회를 변화시키고자 시도하였으며, 작품을 미술과 생활의 매개체로 삼고자 하는 노력의 일환으로써 좀 더 대중적이며 일상적인 것들을 미술세계에 포함시키고자 하였다. 사회적 불안과 문화영역의 동요가 심했던 서양의1960년대 말, 많은 미술가들은 기존 미술의 형식주의적 한계를 벗어나기 위한 다양한 방도를 모색한다. 미술이 시각적이 테두리에서만 행해지지 않고 종합 예술적인 성격을 가지고 다양한 변화과정을 가질 수 있다는 점에서 주목하여 새로이 자연환경의 중요성에 관심을 갖게 되면서 대지미술이 생성되었다. 그들은 도시와 실내의 제한된 전시 공간에 대한 한계를 극복하고 화랑이나 박물관 등 실내에서 이루어지는 예술 활동을 자연으로 끌어내려고 노력하였으며, 자연을 직접적인 미술적 오브제로 채택하여 미술에 적용함으로써 재료와 작품의 규모를 확대 시켰다. 이러한 대지미술가들은 자연환경을 파악하는데 큰 관심을 기울였으며, 작품이 놓일 장소의 선택에 신중을 기했다. 또한 대지에 나아가 자연의 요소를 덧붙이거나 제거하고, 혹은 변경시키거나 재조정함으로써, 작품 속에 시간과 공간의 요소를 통합시키고자 노력을 기울였다. 대지미술 작가들 중에는 자연자체를 작품의 소재로 이용하여 자연에 맞먹는 거대한 규모의 인위적 작업을 수행하는가 하면, 자연에 몰입하여 자연과 일체가 되려는 태도를 보이는 작가도 있다. 전자는 그들의 기념비적 규모의 작품을 풍경에 통합시킴으로써 예술과 자연의 조화, 동의를 추구 하였다. 반면에 후자의 경우는 그들의 창작행위가 현대인의 삶의 많은 부분에 효과적으로 작용할 수 있으며, 미술이 사회에 보다 큰 역할을 할 수 있음을 나타내었다. 따라서 대중과의 밀접한 교류, 참여 유도는 그들에게 시각적으로 아름다움을 공유하게 하는 공공미술일 뿐만 아니라 이념이나 메시지를 전달하는 정보적 미술로까지 발전시킬 수 있다고 생각하였던 것이다. 그러한 대지미술의 예술적 특징을 살펴보면 조각적 행위를 바깥으로 옮겨 이른바 ‘확장된 영역’ 으로 관심을 넓힌 것과 미니멀리즘 (Minimalism)에서 강조 되었던 미술작품으로서의 오브제 (Objecct) 에 대한 식상함에 따라 광활한 대지에서 거대한 작품을 만들게 된 것이라 할 수 있다. 또한 미술시장과 미술제도에 대한 염증으로 화랑이나 미술관 혹은 개인의 소유하거나 매매할 수 없는 장소에 고정된 미술 작품을 만드는 작업방식과 함께 개념미술의 일환으로 프로젝트(Project)를 만들어 작품을 제시하고자 하는 것도 대지미술의 특징이라고 할 수 있다. 그러나 대지미술은 장소의 특수성으로 인해 사진, 지도, 작품계획서 혹은 드로잉 등의 2차적 기록물로 제시되기도 하는데, 이는 문화적 사회적으로 고립되는 약점을 나타내기도 하였다. 따라서 본고에서는 그 의의와 대지미술이 생성되기 까지 시대적 배경과, 미니멀리즘에 대한 반동으로 발생한 대지미술의 표현적 배경을 살펴보고 대지미술을 대표하는 작가에 대하여 논하고자 한다. Art is basically coupled with social activities as part of life. There had been sustained efforts by Bauhaus of Russian constructivism in the early 20th century, dadaism and neo-dadaism to fuse art and life. They attempted to make art way of life for and around themselves and to change their societies through it. And they channeled their energy into injecting more popular and routine things into the world of art in an effort to have their works serve as a medium between art and everyday life. In the end of the 1960s, the West was rocked by social and cultural turmoil, and many contemporary artists made various attempts to go beyond formalistic art. They noted that art could make a diverse change as a sort of a composite art without sticking to its existing sphere that just depended on the sight of viewers, and then they newly woke up to the importance of natural surroundings, which paved the way for the creation of land art. Land artists tried to overstep the limit of restricted urban and indoor exhibition spaces and to extend the realm of existing art activities to nature, as it was still confined to indoor spaces like gallery or museum. They selected nature as object in a move to enlarge the domain of materials and the world of their works. They directed their attention into grasping natural environments around themselves, and used discretion in selecting displaying places for their works. And they tried to input the components of time and space into their works by adding, removing, transforming or readjusting the elements of nature. Some land artists adopted nature as the subject matter of their works and produced works that were as huge in size as nature. On the other hand, others focused on nature itself to unite themselves with it. The former land artists wanted to integrate their monumental works into landscape in pursuit of harmony between art and nature. In contrast, the latter made it clear that their creative behaviors could affect the lives of modern people in large part, and that art could play a more superb role in society. According to them, close exchange with people in general and an encouragement of their participation in art could convert art into public one by helping them share the beauty of it, and could turn it into informative art as well by conveying particular ideals or messages When it comes to the artistic characteristics of land art, it contributed to having sculptors pay attention to 'an extended sphere' by urging them to work in outdoor spaces. That encouraged artists to produce massive works on the vast ground, since they were surfeited with object that was highlighted by minimalism as art works. Their disgust against existing art market and system led themselves to make immovable works that couldn't be sold or owned by any specific gallery, museum or individual, and they presented their works in the form of a project as a sort of conceptual art. All these things could be called the unique features of land art. Yet land art is sometimes viewed as a secondary documentary like photograph, map, work proposal or drawing due to the specificity of place where it's displayed. This phenomenon partially results in making land art isolated. The purpose of this study was to delve into the situations of the era when land art was created, the artistic and philosophical background of it as what's generated as a backlash against minimalism, and the historical significance of it. In addition, it's also meant to discuss how land art was closely tied into human life through the works of leading artists and what impact it had on natural environments.