차세대 염기서열분석법을 이용한 한국인 약물유전다형 연구 = Pharmacogenomic profiling of Korean population using next generation sequencing

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

○ NGS analysis of all exons and regulatory regions of 100 pharmacogenes of 200 Kore an subjects
- 100 genes encoding drug metabolizing exzymes, drug transporters, and drug targets
○ NGS analysis of 392 allelic loci of 141 genes in 200 Korean subjects
○ Development and optimization of capture probe sets for NGS analysis
- Captured over 95% variants within target regions of interest for NGS
○ Discovery of novel variants through NGS analysis
- Found total 127 novel variants that have been not reported in databases such as 1000 genome and dbSNP141 db
○ In vitro functional characterization of novel genetic variants
- Characterizaed 18 genetic variants found in OAT1, OAT4, NTCP, OATP2B1, PEPT 1, CYP2C19, BCRP, and MRP4 genes

국문 초록 (Abstract)

○ 한국인 200명 약물유전자 100종에 대한 NGS 전체 엑솜, 주요부위 NGS분석
- 약물대사효소, 약물수송단백, 약물표적단백 등 주요 약물반응성 관련 유전자군 100종 선정
○ 한국인 200명 약물유전자 141종, 392 loci 에 대한 NGS 분석
○ 차세대 염기서열 분석을 위한 프로브세트 개발 및 최적화
- 연구 대상 유전자의 95% 이상 변이 검출가능하고 기존의 전장염기서열 분석법에 의한 분석결과와의 비교를 통해 capture probe의 효율 최적화
○ 차세대 염기서열 분석을 통한 신규변이 발굴
- 1000 genome, dbSNP141 db에 보고되지 않은 127종 신규 변이유전자 최초 발굴
○ 신규 발굴된 변이유전자의 진위 검증 및 in vitro 기능성 연구
- OAT1, OAT4, NTCP, OATP2B1, PEPT1, CYP2C19, BCRP, MRP4 유전자에서 발굴된 18종 변이유전자의 기능성 연구○ 연구목표 : NGS 분석으로부터 발굴된 약물대사효소 및 SLC 약물수송단백의 신규 변이유전자에 대한 in vitro 기능성 검증을 통해 한국인에서 유용한 약물유전체 정보를 확보하고, 주요 기능성 변이 에 대한 인종간 비교 연구를 통해 한국인 약물유전체 특성의 인종 특이적 특성을 규명함. 한 국인 유전체 특성에 대한 자료 구축을 위해 한국인 표준 유전자 검체를 선정하고, 약물반응과 관련된 유전자 중 중요도 순에서 우선되는 100종의 유전자에 대해 신뢰성 있는 NGS 데이터 를 확보 및 분석하여 한국인의 맞춤치료기술 개발에 기반 자료로 활용하고자 함. 또한, 한국인 에서 고유하게 발견되는 신규 변이유전자의 기능성을 검사함으로써 변이기능성의 임상적 활용 도를 높이고 향후 한국인에 적합한 유전자 진단법 개발의 기반 자료 확보에 기여하고자 함.
...[중략] 원문 참조