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      KCI등재

      청청/낙동 배가반수체 집단에서 QTL을 통한 출수기와 수량관련 유전자좌 분석 = Characterization of Heading- and Yield-related Gene Loci in the Cheongcheong/ Nagdong Doubled Haploid Line using Rice QTLs

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      https://www.riss.kr/link?id=A106097180

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      A quantitative trait loci (QTL) analysis of traits related to heading and yield was performed develop rice cultivars that are both early maturing and panicle weight type varieties. Our analysis included 120 strains of the Cheongcheong Nagdong doubled ...

      A quantitative trait loci (QTL) analysis of traits related to heading and yield was performed develop rice cultivars that are both early maturing and panicle weight type varieties. Our analysis included 120 strains of the Cheongcheong Nagdong doubled haploid (CNDH) variety. An observational growth experiment was conducted to identify genetic agronomic traits of CNDH. Heading date, ten plant weight, moisture, thousand grain weight, and yield had a normal distribution based on the frequency distribution table of the observational growth data. The QTL analysis found one heading-related and nine yield-related QTLs. The LOD of 2.85 was the largest in QTLs for heading date (QHD), 5.39 in QTLs for ten plant weight (QTPW), 3.92 in QTLs for moisture (QM), 4.80 in QTLs for thousand grain weight (QTGW), and 3.7 in QTLs for yield (QY). Genomic analysis detected 58 candidate genes on chromosome 2, 3, 7, 8, and 10. Among those, we found Rcd1 protein and OsERF3 gene in QM, MtN3 and zinc finger protein genes in QTGW, and OsNAC3 protein gene in QY. If further analysis reveals the presence of genes related to water content, thousand grain weight or yield in the CNDH stains, we can develop a selection of varieties that will be capable of coping with climate change and will contribute to global food problems.

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      국문 초록 (Abstract)

      본 연구는 2017년 CNDH 계통을 이용하여 출수기와 수량을 QTL 조사하여 다음과 같은 결과를 가졌다. 1. 도수분포표에서 QHD, QTPW, QM, QTGW, QY는 정규분포를 이루고 있었다. 2. 출수기 관련 QTLs은 총 1...

      본 연구는 2017년 CNDH 계통을 이용하여 출수기와 수량을 QTL 조사하여 다음과 같은 결과를 가졌다.
      1. 도수분포표에서 QHD, QTPW, QM, QTGW, QY는 정규분포를 이루고 있었다.
      2. 출수기 관련 QTLs은 총 1개가 잡혔고, 수량관련 QTLs 은 총 9개가 잡혔다. QHD에서는 LOD 2.85가 가장 컸고, QTPW에서는 5.39, QM에서는 3.92, QTGW에서는4.80, QY에서는 3.7이 가장 컸다.
      3. 유전자 분석을 통해, 2, 3, 7, 8, 10번 염색체에서 총58개의 후보유전자를 찾았다. 이 중 수량요소인 QM에서 Rcd1 protein, OsERF3 유전자, QTGW에서 MtN3, Zinc finger protein 유전자, QY에서 OsNAC3 protein 유전자를 발견하였다.
      4. 본 연구를 통해 발견된 CNDH 계통 내의 수분함량, 천립중, 수량에 관련된 유전자의 존재여부를 찾아낸다면조생종, 수중형에 가까운 품종을 개발하는 데 기초자료로 이용될 수 있을 것이라 판단된다.

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      참고문헌 (Reference)

      1 정진일, "평야지재배 조생종 벼의 이화학적 및 식미특성 분석" 한국국제농업개발학회 16 (16): 345-349, 2004

      2 Jaspers, P., "Unequally redundant RCD1 and SRO1 mediate stress and developmental responses and interact with transcription factors" 60 (60): 268-279, 2009

      3 Wan, L., "Transcriptional activation of OsDERF1 in OsERF3 and OsAP2-39 negatively modulates ethylene syn-thesis and drought tolerance in rice" 6 (6): e25216-, 2011

      4 Yuan, M., "Rice MtN3/saliva/SWEET gene family: evolution, expression profiling, and sugar transport" 56 (56): 559-570, 2014

      5 Siddiqua, B. S., "RCD1 homologues and their constituent WWE domain in plants: analysis of conservation through phylogeny methods" 71 (71): 642-650, 2016

      6 Zhou, B., "Plant architecture and grain yield are regulated by the novel DHHC-type zinc fingerprotein genes in rice (Oryza sativa L.)" 254 : 12-21, 2017

      7 Tsutsumi, N., "Molecular cloning and nucleotide sequencing of nuclear genes coding for the chloroplast ribosomal proteins L13, L24, L28 of rice (Oryza sativa L.)" 121 (121): 167-174, 1996

      8 Gindullis, F., "Matrix attachment region binding protein MFP1 is localized in discrete domains at the nuclear envelope" 11 (11): 1117-1128, 1999

      9 Yano, M., "Identification of quantitative trait loci controlling heading date in rice using a high-density linkage map" 95 (95): 1025-1032, 1997

      10 Xiao, J., "Identification of QTLs affecting traits of agronomic importance in a recombinant inbred population derived from a subspecific rice cross" 92 (92): 230-244, 1996

      1 정진일, "평야지재배 조생종 벼의 이화학적 및 식미특성 분석" 한국국제농업개발학회 16 (16): 345-349, 2004

      2 Jaspers, P., "Unequally redundant RCD1 and SRO1 mediate stress and developmental responses and interact with transcription factors" 60 (60): 268-279, 2009

      3 Wan, L., "Transcriptional activation of OsDERF1 in OsERF3 and OsAP2-39 negatively modulates ethylene syn-thesis and drought tolerance in rice" 6 (6): e25216-, 2011

      4 Yuan, M., "Rice MtN3/saliva/SWEET gene family: evolution, expression profiling, and sugar transport" 56 (56): 559-570, 2014

      5 Siddiqua, B. S., "RCD1 homologues and their constituent WWE domain in plants: analysis of conservation through phylogeny methods" 71 (71): 642-650, 2016

      6 Zhou, B., "Plant architecture and grain yield are regulated by the novel DHHC-type zinc fingerprotein genes in rice (Oryza sativa L.)" 254 : 12-21, 2017

      7 Tsutsumi, N., "Molecular cloning and nucleotide sequencing of nuclear genes coding for the chloroplast ribosomal proteins L13, L24, L28 of rice (Oryza sativa L.)" 121 (121): 167-174, 1996

      8 Gindullis, F., "Matrix attachment region binding protein MFP1 is localized in discrete domains at the nuclear envelope" 11 (11): 1117-1128, 1999

      9 Yano, M., "Identification of quantitative trait loci controlling heading date in rice using a high-density linkage map" 95 (95): 1025-1032, 1997

      10 Xiao, J., "Identification of QTLs affecting traits of agronomic importance in a recombinant inbred population derived from a subspecific rice cross" 92 (92): 230-244, 1996

      11 Ooka, H., "Comprehensive analysis of NAC family genes in Oryza sativa and Arabidopsis thaliana" 10 (10): 239-247, 2003

      12 Lu, C. F., "Comparative mapping of QTLs for agronomic traits of rice across environments using a doubled haploid population" 93 (93): 1211-1217, 1996

      13 Cosgriff, A. J., "A topological model for the general aromatic amino acid permease, AroP, of Escherichia coli" 179 (179): 3317-3323, 1997

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      2009-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2007-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2005-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2002-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      1999-07-01 평가 등재후보학술지 선정 (신규평가) KCI등재후보
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      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.46 0.46 0.42
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.49 0.49 0.91 0.08
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