CRISPR/Cas를 이용한 유전체 편집과 유전자 발현 조절을 위한 기술에서 sgRNA는 표적서열을 인식하는 역할을 한다. gal 프로모터를 표적서열로 하여 유전체 편집에 필요한 sgRNA의 표적인식서열의 ...
http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
https://www.riss.kr/link?id=A107982997
2021
-
KCI등재,SCOPUS
학술저널
534-542(9쪽)
0
0
상세조회0
다운로드국문 초록 (Abstract)
CRISPR/Cas를 이용한 유전체 편집과 유전자 발현 조절을 위한 기술에서 sgRNA는 표적서열을 인식하는 역할을 한다. gal 프로모터를 표적서열로 하여 유전체 편집에 필요한 sgRNA의 표적인식서열의 ...
CRISPR/Cas를 이용한 유전체 편집과 유전자 발현 조절을 위한 기술에서 sgRNA는 표적서열을 인식하는 역할을 한다. gal 프로모터를 표적서열로 하여 유전체 편집에 필요한 sgRNA의 표적인식서열의 길이와 유전자 발현 조절에 필요한 sgRNA의 표적인식서열의 길이를 Cas9-NG에서 체계적으로 비교하였다. 유전체 편집의 경우, sgRNA의 표적인식 서열을 구성하는 20개의 뉴클레오티드에서 3개의 뉴클레오티드의 결손만을 허용하였다. 하지만, 유전자 발현 조절에는 표적인식서열에서 11개의 뉴클레오티드가 결손되어도 표적 서열을 인식하고 결합할 수 있다는 것을 밝혔다. 따라서, sgRNA의 표적인식서열에서 4개 이상의 뉴클레오티드의 결손이 있는 경우에 sgRNA/Cas9-NG는 표적 DNA 서열에 특이적으로 결합을 하지만, 엔도뉴클레아제의 활성을 갖지 못하기 때문에 유전체 편집을 할 수 없는 것으로 판단된다. 이 결과는 인공전사인자 개발과 합성생물학 분야의 다양한 CRISPR 기술 발전에 도움을 줄 것이다.
다국어 초록 (Multilingual Abstract)
Single-molecular guide RNA (sgRNA) plays a role in recognizing the DNA target sequence in CRISPR technology for genome editing and gene expression control. In this study, we systematically compared the length of the target recognition sequence in sgRN...
Single-molecular guide RNA (sgRNA) plays a role in recognizing the DNA target sequence in CRISPR technology for genome editing and gene expression control. In this study, we systematically compared the length of the target recognition sequence in sgRNAs required for genome editing using Cas9-NG (an engineered Cas9 recognizing 5’-NG as PAM sequence) and gene expression control using deactivated Cas9-NG (dCas9-NG) by targeting the gal promoter in E. coli. In the case of genome editing, the truncation of three nucleotides in the target recognition sequence (TRS) of sgRNA was allowed. In gene expression regulation, we observed that target recognition and binding were possible even if eleven nucleotides were deleted from twenty nucleotides of the TRS. When 4 or more nucleotides are truncated in the TRS of the sgRNA, it is thought that the sgRNA/Cas9-NG complex can specifically bind to the target DNA sequence, but lacks endonuclease activity to perform genome editing. Our study will be helpful in the development of artificial transcription factors and various CRISPR technologies in the field of synthetic biology.
참고문헌 (Reference)
1 Moghadam F, "Synthetic immunomodulation with a CRISPR superrepressor in vivo" 22 : 1143-1154, 2020
2 Jinek M, "Structures of Cas9 endonucleases reveal RNA-mediated conformational activation" 343 : 1247997-, 2014
3 Qi LS, "Repurposing CRISPR as an RNA-guided platform for sequence-specific control of gene expression" 152 : 1173-1183, 2013
4 Kim B, "Regulation of microbial metabolic rates using CRISPR interference with expanded PAM sequences" 11 : 282-, 2020
5 Jiang W, "RNAguided editing of bacterial genomes using CRISPR-Cas systems" 31 : 233-239, 2013
6 Bikard D, "Programmable repression and activation of bacterial gene expression using an engineered CRISPR-Cas system" 41 : 7429-7437, 2013
7 Cong L, "Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems" 339 : 819-823, 2013
8 Lee HJ, "Mismatch intolerance of 5'-truncated sgRNAs in CRISPR/Cas9 enables efficient microbial single-base genome editing" 22 : 6457-, 2021
9 Fu YF, "Improving CRISPR-Cas nuclease specificity using truncated guide RNAs" 32 : 279-284, 2014
10 Jansen R, "Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes" 43 : 1565-1575, 2002
1 Moghadam F, "Synthetic immunomodulation with a CRISPR superrepressor in vivo" 22 : 1143-1154, 2020
2 Jinek M, "Structures of Cas9 endonucleases reveal RNA-mediated conformational activation" 343 : 1247997-, 2014
3 Qi LS, "Repurposing CRISPR as an RNA-guided platform for sequence-specific control of gene expression" 152 : 1173-1183, 2013
4 Kim B, "Regulation of microbial metabolic rates using CRISPR interference with expanded PAM sequences" 11 : 282-, 2020
5 Jiang W, "RNAguided editing of bacterial genomes using CRISPR-Cas systems" 31 : 233-239, 2013
6 Bikard D, "Programmable repression and activation of bacterial gene expression using an engineered CRISPR-Cas system" 41 : 7429-7437, 2013
7 Cong L, "Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems" 339 : 819-823, 2013
8 Lee HJ, "Mismatch intolerance of 5'-truncated sgRNAs in CRISPR/Cas9 enables efficient microbial single-base genome editing" 22 : 6457-, 2021
9 Fu YF, "Improving CRISPR-Cas nuclease specificity using truncated guide RNAs" 32 : 279-284, 2014
10 Jansen R, "Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes" 43 : 1565-1575, 2002
11 Nishimasu H, "Engineered CRISPR-Cas9 nuclease with expanded targeting space" 361 : 1259-1262, 2018
12 김범준, "Effective Blocking of Microbial Transcriptional Initiation by dCas9-NGMediated CRISPR Interference" 한국미생물·생명공학회 30 (30): 1919-1926, 2020
13 Khakimzhan A, "Complex dependence of CRISPR-Cas9 binding strength on guide RNA spacer lengths" 18 : 056003-, 2021
14 Horvath P, "CRISPR/Cas, the immune system of bacteria and archaea" 327 : 167-170, 2010
15 Lee HJ, "CRISPR-Cas9-mediated pinpoint microbial genome editing aided by target-mismatched sgRNAs" 30 : 768-775, 2020
16 Larson MH, "CRISPR interference (CRISPRi) for sequence-specific control of gene expression" 8 : 2180-2196, 2013
17 이호중, "Advances in Accurate Microbial Genome- Editing CRISPR Technologies" 한국미생물·생명공학회 31 (31): 903-911, 2021
18 Jinek M, "A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity" 337 : 816-821, 2012
Exploring Staphylococcus aureus Virulence Factors; Special Emphasis on Staphyloxanthin
How Do Bacteria Maximize Their Cellular Assets?
B16F10 세포에서의 오크라 추출물의 미백 활성 검증
학술지 이력
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | |
2015-09-23 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Microbiology and Biotechnology -> Microbiology and Biotechnology Letters | |
2010-01-01 | 평가 | 등재 1차 FAIL (등재유지) | |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | |
2001-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | |
1998-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) |
학술지 인용정보
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.6 | 0.6 | 0.65 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.53 | 0.55 | 0.977 | 0.18 |