Staphylococcus aureus KN556를 이용한 ERIC-과 REP-PCR 반응 구성성분 농도의 최적화

서현아,김영준,김근성 中央大學校 遺傳工學硏究所 2002 遺傳工學硏究論集 Vol.15 No.1

본 실험은 Staphylococcus aureus KN556의 ERIC과 REP-PCR 산물의 fingerprinting pattern의 파악과 PCR 구성성분의 농도의 최적화를 목적으로 실시하였다. 실험결과 ERIC-PCR은 증폭된 단편수가 4∼10개 정도로 나타냈고, REP-PCR은 전체 단편수가 5∼14개를 나타내었다. 이러한 현상은 ERIC sequence에 비해 REP sequence가 세균의 염색체 상에 빈도가 더 높게 분포한다는 이론과 일치하였다. ERIC-PCR의 경우, 0.8과 1.2kb를 중심으로 작은 분자량과 큰 분자량의 범위로 점차적으로 확대되어 각 변수들의 농도의 증가에 따라 전체단편의 수와 단편들의 강도가 증가하였다. REP-PCR은 최소분자량 0.25kb에서 최대분자량 3.5kb 정도 크기의 증폭된 단편들이 각 농도에 따라 강도의 차이를 나타내며 증가되는 것이 관찰되었다. 각 성분변수별로 MgCl_2는 2.0mM, primer는 2.0μM, dNTPs는 200μM, DNA는 1.0㎕에서 각각 최대 단편수를 나타냈고, 그 이상의 농도 적용 시에도 동일한 단편의 수를 유지하였으며 각 성분농도 변수 PVR 결과 나타나는 DNA fingerprinting pattern이 동일하게 나타나서 결과적으로 PCR 성분별 최적농도는 MgCl_2는 2.0mM, primer는 2.0μM, dNTPs는 200μM, DNA는 1.0㎕로 결론 지을 수 있었다. We attempted to optimize the concentrations of PCR components such as MgCl_2, primers, dNTPs and template DNA to produce fingerprinting patterns of the ERIC- and REP-PCR products for Staphylococcus aureus KN556. The ERIC-PCR reactions resulted in a total number of 4 to 10 DNA fragments and the REP-PCR reactions a total number of 5 to 14 DNA fragments. These phenomena can be explained by the hypothesis that more copies of REP sequences are present on bacterial chromosomes than those of ERIC sequences are. ERIC-PCR reactions generated two major bands of 0.8kb and 1.2kb DNA fragments. They also had the number of PCR products and their band intensity increased as the concentrations of the above four PCR components were increased. REP-PCR reactions generated multiple PCR products between 0.25kb and 3.5kb in size including three major bands of 0.7kb and 0.95kb DNA fragments. Their band intensity was also increased as the concentrations of the above four PCR components were increased. The PCR reaction cocktails containing 2.0mM MgCl_2, 2.0μM primers, 200μM dNTPs and 1.0㎕ template DNA, respectively, yielded the maximum number of PCR products. As the above four components were added more than the concentrations mentioned above in PCR reaction cocktails, the number of PCR products was not increased and the overall fingerprinting patterns remained unchanged. Therefore, a PCR reaction cocktail containing 2.0mM MgCl_2, 2.0μM primers, 200μM dNTPs and 1.0㎕ template DNA can be suggested to generate the most optimized PCR fingerprinting patterns.

Bioactivity and Chemical Composition of the Essential oil of Tea Tree (Melaleuca alternifolia)

Seun-Ah Yang(양선아),Sang-Kyung Jeon(전상경),Eun-Jung Lee(이은정),Nam-Kyung Im(임남경),Ji-Young Jung(정지영),In-Seon Lee(이인선) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.12

티트리 에센셜 오일은 호주 원주민들의 전통적인 피부 소독제나 치료제로 널리 사용되어 왔으며, 항균효과와 주요성분 등 많은 보고가 있으나 추출 방법이나 사용 부위 등에 따라 효능의 차이를 보인다. 본 연구에서는 아로마테라피 등에 현재 많이 이용되고 있는 시판 티트리 오일의 성분과 효능을 평가하여, 다른 에센셜 오일과의 비교 이용을 용이하게 하고자 하였다. 티트리 오일의 주요성분은 GC-MS 분석에 의하여 β-terpinene (20.87%), α-pinene (17.60%), p-cymene (11.23%), 3-carene (10.40%), trans-anethole (8.47%), limonene (4.65%)으로 밝혀졌으며, 5% 이하의 농도에서 3시간 미만까지는 피부세포에 독성이 없었다. 오일의 라디컬 소거능을 알아본 결과, DPPH와 ABTS의 양라디컬에 대하여 강한 소거능을 나타내어 강한 항산화능을 시사했다. 또한, 오일의 direct contact와 vapor-phase의 항균활성을 disc diffusion법으로 스크리닝 한 결과, direct contact 활성의 경우 그람음성균에 대하여 높은 활성을 나타내었으며, vapor는 S. aureus에 대하여 강한 효과를 나타내었다. 본 연구에서 실제 많이 사용되는 티트리 오일의 성분과 생물활성을 측정함으로써 허브 오일들의 정확한 선택과 활용을 위한 기본적인 결과를 얻었다. The essential oil of tea tree (Melaleuca alternifolia) is widely used in traditional Australian medicine for skin lesions and infected injuries. In the present study, we investigated the chemical composition, cytotoxicity and its biological activities. The composition of the oil was analyzed by GC-MS. β-Terpinene (20.87%), α-pinene (17.60%), p-cymene (11.23%), 3-carene (10.40%), trans-anethole (8.47%) and limonene (4.65%) were the major components in the oil. The results tested by MTT assay indicated that the oil showed no cytotoxic effect, at concentrations up to 5%, for less than 3h. The antiradical capacity was evaluated by measuring the scavenging activity of the essential oil on the 2,20-diphenylpicrylhydrazyl (DPPH) and 2,2'-azino-bis 3-ethyl benzothiazoline-6-sulfonic acid (ABTS) radicals. The oil was able to reduce the both radicals dose-dependently, and the concentration required for 50% reduction (RC??) against ABTS radicals (1.6±0.02%) was slightly lower than DPPH radicals (2.6±0.29%). The direct contact and vapor-phase antibacterial activity of the oil were also evaluated using disc diffusion method against Staphylococcus aureus, Streptococcus mutans, Listeria monocytogenes, Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, and Vibrio parahaemolyticus. All the Gram-negative bacterial strains tested showed more sensibility to the oil than the Gram-positive strains when compare to the effect of gentamycin. On the other hand, the vapor phase of the essential oil against S. aureus exhibited strongest inhibitory effect.

Identification of the active components from wild dropwort extract fermented with oligosaccarides and their cytopro-tective effect against oxidative stress in HepG2 cells

Seun-Ah Yang,Min-Ju Kim,Kwang-Hwan Jhee,Hae-Jung Byun,Sam-Pin Lee,In-Seon Lee 한국식품영양과학회 2011 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2011 No.10

[P8-147] Isolation and identification of the anti-allergic inflammatory active compound from ethyl acetate fraction of Actinidia polygama extract

Seun-Ah Yang,Eun-Ju Lee,Myun-Ho Bang,In-Gyeong Chae,Mi-Hee Yu,Sam-Pin Lee,In-Seon Lee 한국식품영양과학회 2010 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2010 No.10

Hepatoprotective effect of fermented dropwort extract against carbon tetrachloride-induced toxicity in rats

Seun-Ah Yang,Eun-Ju Lee,Yeon-Seop Jeong,Seung-Jin Lee,Seung-Chun Park,Min-Ju Kim,In-Seon Lee 한국식품영양과학회 2011 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2011 No.10

Volatile Compounds and Antiproliferative Effects of Dendropanax morbifera on HepG2 Cells

Seun-Ah Yang(양선아),Coralia V. Garcia(코랄리아 가르시아),Ji-Won Lee(이지원) 한국생명과학회 2017 생명과학회지 Vol.27 No.5

황칠나무(Dendropanax morbifera Lev.)는 황금빛의 수액과 약리효과로 한국에서 알려져 있으며, 잎 및 줄기 추출물의 다양한 효능은 피부질환, 편두통, 월경통, 근육통 및 전염성 질환 등의 질병을 개선하는 약리 성분을 공급하는 우수한 공급원이 될 수 있는 것을 시사한다. 그러나, 황칠나무 추출물의 효능에 관해서는 다양한 연구가 보고되어 있으나, 부위별 휘발성 성분의 조성에 대한 보고는 전무한 상황이다. 따라서, 본 연구는 황칠나무의 잎, 줄기 및 수액의 주요 휘발성 성분을 규명하기 위하여, 유기용매 및 초임계유체추출법을 이용한 추출물을 가스크로마토그래피-질량분석법으로 분석하였다. 잎 추출물에서는 15가지 화합물이 검출되었으며, 줄기 및 수액에는 각각 29가지 및 3가지 성분이 확인되었다. 또한 용매와 초임계유체추출법을 사용하여 얻은 휘발성 성분의 프로파일은 다르게 나타났다. 잎의 용매 추출물과 줄기의 초임계유체 추출물에서는 에스테르와 방향족 탄화수소가, 잎의 초임계유체 추출물 및 줄기의 초임계유체 추출물에는 테르페노이드가 주요 성분으로 나타났다. 한편, limonene (96.3%), α-pinene, 그리고 β-myrcene은 수액 용매 추출물의 휘발성 성분으로 확인되었다. 잎 및 줄기의 용매 추출물의 암세포 증식 억제 효과를 평가한 결과, 잎의 용매 추출물이 HepG2 세포의 증식을 유의적으로 감소시키는 것으로 나타났다. Dendropanax morbifera Lev. is known in Korea for its golden sap and medicinal properties. The many biological activities of the leaf and stem extracts suggest that this tree could be a valuable source of medicinal compounds for the treatment of various ailments such as dermatitis, migraines, dysmenorrhea, muscle pain, and infectious diseases. However, there is little information on the composition and biological activity of the volatile fraction of D. morbifera. Therefore, in this study, the volatile compounds in leaves, stems, and sap of D. morbifera were isolated using solvent and supercritical fluid extraction (SFE), and analyzed by gas chromatography/mass spectrometry to reveal their chemical composition and identify potential compounds of interest. Fifteen compounds were identified in the leaf extracts, whereas 29 and 3 compounds were identified in the stem and sap extracts, respectively. The volatile profiles obtained using solvent and SFE differed. Esters and aromatic hydrocarbons predominated in the solvent extract of leaves and SFE extract of stems, whereas the solvent extract of stems and SFE extract of leaves contained terpenoids. Limonene, α-pinene, and β-myrcene were identified in the volatile extract of sap, with limonene representing 96.30% of the total peak area. In addition, the antiproliferative effects of the solvent extracts of leaves and stems were evaluated, revealing that these solvent extracts were particularly effective in decreasing the proliferation of HepG2 cells.

Tricin derivatives as anti-inflammatory and anti-allergic constituents from the aerial part of Zizania latifolia

Seun-Ah Yang,Cheong-Su Eun,Min-Ju Kim 한국식품영양과학회 2015 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2015 No.8

Involvement of Intracellular Ca(2+)-and PI3K-Dependent ERK Activation in TCDD-Induced Inhibition of Cell Proliferation in SK-N-SH Human Neuronal Cells

( Seun Ah Yang ),( Yong Soo Lee ),( Da Qing Jin ),( Jae Wook Jung ),( Byung Chul Park ),( Yoon Seok Lee ),( Seung Hwan Paek ),( Tae Cheon Jeong ),( Han Gon Choi ),( Chul Soon Yong ),( Bong Kyu Yoo ),( 한국응용약물학회 2005 Biomolecules & Therapeutics(구 응용약물학회지) Vol.13 No.2

단삼 메탄올 추출물의 항혈전 및 항산화 효과

양선아(Seun-Ah Yang),임남경(Nam-Kyung Im),이인선(In-Seon Lee) 한국식품과학회 2007 한국식품과학회지 Vol.39 No.1

단삼 메탄올 추출물의 항혈전 및 항산화 효과를 확인하기 위하여 혈소판의 응고 억제효과, 혈장응고시간의 연장, 혈전용해 활성으로 항혈전 효과를 고찰하였으며 DPPH radical 소거능을 측정하여 항산화 효과를 검토하였다. 그 결과, 단삼의 메탄올 추출물은 항혈전과 항산화에 효과가 있는 것으로 나타났다. 이 추출물은 혈소판응고 억제, 혈액응고시간 연장 및 혈전용해 활성에 모두 효과가 좋은 것으로 나타났으며, 폴리페놀 함량이 높고 DPPH radical 소거능도 매우 좋았다. 이로서 단삼의 높은 DPPH radical 소거능이 항혈전 효과에 영향을 미치는 것으로 사료되며, 정확한 효과 및 혈소판의 기능을 조절하는 기전에 대한 연구는 이 결과들을 바탕으로 현재 진행 중에 있다. Salvia miltiorrhiza Bunge is known to potentially prevent arteriosclerosis and hypertension, but its effects on platelet function are not clear. In this study, we evaluated the in vitro antithrombotic activities of the edible plant extract. Methanol extract of S. miltiorrhiza Bunge exhibited about 70% fibrinolytic activity compared to the plasmin control, and inhibited ADP- and collagen-induced platelet aggregation in a concentration-dependent manner with IC?? values of 0.42 and 0.07 ㎎/㎖, respectively. S. miltiorrhiza Bunge extract significantly prolonged the activated partial thromboplastin time (APTT) and prothrombin time (PT) compared with control. Moreover, 0.05 ㎎/㎖, S. miltiorrhiza Bunge extract contained 87.3% 1, 1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) radical-scavenging activity. In conclusion, S. miltiorrhiza Bunge seemed to enhance antithrombotic activity due to its radical scavenging activity. Based on these data, further examination is required to determine the mechanism of platelet-dependent antithrombosis and the effect of polyphenols on platelet function.

독활의 항혈소판 및 항산화 효과

양선아(Seun-Ah Yang),임남경(Nam-Kyung Im),지광환(Kwang-Hwan Jhee),이인선(In-Seon Lee) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.3

독활 메탄올 추출물과 그 분획의 항혈전 및 항산화 효과를 확인하기 위하여 ADP를 이용하여 혈소판 응집억제효과를 탐색하고 DPPH 및 ABTS-radical 소거능을 측정하여 항산화능을 측정하였다. 그 결과 독활, 특히 EtOAc 분획은 ADP에 의해 유도된 혈소판응집과 트롬빈에 의한 혈소판 부착에 대하여 농도 의존적으로 저해효과를 나타내었으며, 높은 폴리페놀 함량과 가장 높은 라디칼 소거능을 통하여 독활의 항산화 효과를 확인하였다. 이상의 결과로 독활 EtOAc 분획의 높은 DPPH 및 ABTS radical 소거능이 항혈소판 효과에 영향을 미치는 것으로 사료된다. The dried roots of Aralia continentalis Kitagawa is known to have the potential for anti-inflammation and anti-rheumatic, but their effects on thrombosis are not clear. In this study, we evaluated the anti-platelet and antioxidative activities of A. continentalis Kitagawa. Methanol extract and its various fractions of A. continentalis Kitagawa inhibited ADP-induced platelet aggregation, and EtOAc fraction showed strongest inhibition in a concentration-dependent manner with a IC?? value of 217.7 ㎍/ml. Moreover, the EtOAc fraction contained 77.7% of 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) and 43.1% of 2,2’-azinobis (3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS) radical-scavenging activity at 0.1 ㎎/ml. In addition, the methanol and EtOAc fraction dose-dependently inhibited thrombin-stimulated platelet adhesion to collagen or fibrinogen. Collectively, these results suggest that the polyphenol-rich EtOAc fraction from A. continentalis Kitagawa can reduce platelet hyperactivation by scavenging free radicals. Thus, the EtOAc fraction of A. continentalis Kitagawa is a potential source for inhibition of platelet-dependent thrombosis.