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      • KCI등재

        mtDNA cytochrome b에 기초한 한국흑우의 계통유전학적 분석

        Jae-Hwan Kim(김재환),Mi Jung Byun(변미정),Myung-Jick Kim(김명직),Sang Won Suh(서상원),Young-Sin Kim(김영신),Yeoung-Gyu Ko(고응규),Sung Woo Kim(김성우),Kyoung-Sub Jung(정경섭),Dong-Hun Kim(김동훈),Seong-Bok Choi(최성복) 한국생명과학회 2013 생명과학회지 Vol.23 No.1

        본 연구는 mtDNA cytochrome b(Cyt b) 유전자 서열을 토대로 한국흑우의 유전적 다양성 및 계통유전학적 위치를 파악하기 위하여 실시하였다. 한국흑우 38두로부터 결정된 mtDNA Cyt b유전자 전체서열 내에서 염기삽입 및 결실 없이 1개의 silent mutation이 동정되었다. 또한 2개의 haplotype으로 분류되었고, 염기변이율 및 haplotype 다양성지수에 기초한 한국흑우의 유전적 다양성은 기존에 보고된 중국 품종에 비해 낮게 나타났다. 한국, 일본, 중국에 분포하고 있는 12품종 101개 서열을 수집하여 한국흑우와의 유연관계를 확인하였다. 한국흑우에서 분류된 2개의 haplotype은 모두 B. taurus계열에 포함되었으며, 한우, 일본흑우, Yanbian, Zaosheng 등 4개 품종과 하나의 그룹을 형성하였다. 또한 품종별 D xy유전거리 산출 결과, 한국흑우는 한우 및 일본흑우에 비해서 중국의 Yanbian, Zaosheng 품종과 더 가까운 유연관계를 보였다. 본 연구의 결과는 가축유전자원으로서 한국흑우의 보존 및 유전적 특성 구명을 위한 중요한 자료로 활용이 가능할 것으로 사료된다. The purpose of this study was to identify genetic polymorphisms of the mitochondrial cytochrome b (mtDNA cyt b) gene in Korean black (KB) cattle breed and to analyze the genetic relationship between the KB and other breeds. We determined the complete sequence of the mtDNA cyt bgene in 38 KB cattle. We also analyzed their genetic diversity, and phylogenetic analysis was performed by comparison with Korean cattle (KC, called Hanwoo) and breeds from China and Japan. A nucleotide substitution was detected in the KB cattle, and two haplotypes were defined. In the neighbor-joining (NJ) tree, the haplotypes of KB were located in Bos taurus lineage with those of KC, Japanese black (JB), Yanbian and Zaosheng breeds. However, the haplotypes of Chinese breeds, excluding Yanbian and Zaosheng, were separated into B. taurusand B. indicus lineages. In the NJ tree of breeds based on D xygenetic distances, Chinese breeds mixed with B. taurus and B. indicus lineages were located between B. indicus and B. taurus lineages. KB was contained within B. taurus lineage and was determined to be genetically more closely related to two Chinese (Yanbian and Zaosheng) breeds than to KC and JB. The haplotype distribution and the results of the phylogenetic analysis suggest that KB and KC have genetic differences in their mtDNA cyt b gene sequences.

      • KCI등재

        유전 및 육종 : mtDNA Cytochrome b 유전자에 기초한 한국재래염소의 계통유전학적 분석

        김재환 ( Jae Hwan Kim ),변미정 ( Mi Jeong Byun ),고응규 ( Yeoung Gyu Ko ),김성우 ( Sung Woo Kim ),김상우 ( Sang Woo Kim ),도윤정 ( Yoon Jung Do ),김명직 ( Myung Jick Kim ),윤세형 ( Sei Hyung Yoon ),최성복 ( Seong Bok Choi ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2012 한국축산학회지 Vol.54 No.4

        한국재래염소의 계통유전학적 위치를 확인하기 위해서 한국재래염소 4개 집단 48두를 공시한 후 mitochondrial DNA(mtDNA) 내부의 cytochrome b 유전자의 전체서열을 분석하였다. 또한 이 서열들을 이용하여 한국재래염소의 유전적 다양성을 확인하였고, 다른 나라의 여러 염소품종들과의 계통유전학적 분석을 수행하였다. 한국재래염소 cytochrome b 유전자 서열을 토대로 3개의 염기변이가 동정되었으며, 그 중 2개는 아미노산 치환을 일으키는 missense 변이로 확인되었다. 또한 4개의 haplotype으로 분류되었는데, 이 중 3개는 중국 재래염소 품종에서도 나타났으나 다른 나라의 품종에서는 확인되지 않았다. 계통유전학적 분석 결과 모든 재래흑염소는 4개의 clade를 형성하였으나, 5개의 야생염소와는 독립적인 그룹을 형성하였다. 한국재래염소는 mtDNA D-loop에 분류되는 여러 모계혈통 중 모계혈통-A로 추정되는 clade 1에 포함되었다. 한국재래염소에서 보여진 각각의 haplotype은 중국 재래염소품종들과 상대적으로 가까운 유전적 유연관계를 보였다. 기존 연구결과와 본 연구의 분석결과를 종합해보면 과거에 일부 중국 재래염소품종이 한반도로 유입되어 한국재래염소의 기원 및 가축화에 영향을 주었을 것으로 사료된다. The goal of this study was to verify the phylogenetic status of the Korean native goats(KNG). We determined the complete sequence of the mitochondrial cytochrome b gene in 48 goats among four populations. We also analyzed genetic variability within goats, and a phylogenetic analysis was performed by comparison with other country`s goats. Three nucleotide substitutions were detected, and two of these were missense mutations that occurred due to a substitution of amino acid. Four haplotypes were defined from KNG. Three of these haplotypes were only found in the Chinese goat. However, the other haplotype was KNG-specific. In the phylogenetic analysis, four clades(A~D) were classified among domestic goats, and the KNG was classified into clade 1 that estimated as lineage A based on the D-loop sequence. Each haplotype from the KNG was clustered closely with that of the Chinese goat. The results of haplotype distribution and phylogenetic location suggest that strong gene flow occurred from China to the Korean Peninsula.

      • KCI등재

        번식생리 및 내분비 : 한국재래닭(오계) 원시생식세포의 완만동결과 급속동결의 비교

        김성우 ( Sung Woo Kim ),고응규 ( Yeoung Gyu Ko ),변미정 ( Mi Jeong Byun ),도윤정 ( Yoon Jung Do ),한재용 ( Jae Yong Han ),김동훈 ( Dong Hun Kim ),성환후 ( Hwan Hoo Seong ),김현 ( Hyun Kim ) 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2013 한국축산학회지 Vol.55 No.5

        We sought to provide a method for freezing and preserving primordial germ cells, or an avian germ cell of a bird, as a material for developmental engineering or species preservation. The aim of this study was to compare the efficacy of slow freezing with a vitrification method for the cryopreservation of chicken primordial germ cells(PGCs). PGCs obtained from the germinal gonad of day 5.5-6 day(stage 28) cultured chick embryos, using the MACS method, were classified into two groups: slow freezing and vitrification. We examined the viability of PGCs after Cryopreservation. Four freezing methods were compared with each other, including the following: Method 1: The PGCs were frozen by a programmed freezer in a plastic straw, including 2.0M ethylene glycol(EG) as cryoprotective additive(slow freezing) Method 2: The PGCs were vitrified in a plastic straw, including 8.0 M EG, plus 7% polyvinylpyrrolidone(PVP)(rapid freezing). Method 3: The slow freezing was induced with a cryotube including 2.0 M EG Method 4: The PGCs were frozen in a cryotube including 10% dimethyl suloxide(DMSO)(rapid freezing). After freezing and thawing, survival rates of the frozen-thawed PGCs from Method 1 to 4were 76.4%, 70.6%, 80.5% and 78.1%(p<0.05), respectively. The slow freezing(-80℃ programmed freezer) method may provide better survival rates of frozen-thawed PGCs than the vitrification method for the cryopreservation of PGCs. Therefore, these systems may contribute to the cryopreservation of a rare avian species.

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