RAPD 표지자 분석에 의한 가시아메바속 한국분리주의 유전적 지위

홍용표,오승환,라미숙,임경일 INSTITUTE OF TROPICAL MEDICINE YONSEI UNIVERSITY 1995 YONSEI REPORTS ON TROPICAL MEDICINE Vol.26 No.1

가시아메바 속(Acanthamoeba spp.)의 DNA 염기 구성 정보와 관계없이 임의의 10개의 염기로 구성된 프라이머를 사용하여 random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction(RAPD-PCR)에 의해 게놈 상의 DNA를 무작위로 증폭하여 확인된 표지자로써 한국 분리주 및 외국 분리주와 기존의 알려진 4개 가시아메바 종간의 유전적 근연관계 분석을 통해서 4개 한국분리주의 분류상의 성상을 규명하였다. 본 연구에서 A. culbertsoni, A. hatchetti, A. triangularis, A. polyphaga와 한국 분리주인 YM-2, YM-3, YM-4, YM-5, 그리고 외국 분리주인 HOV의 게놈 DNA는 18종류의 프라이머에 의하여 다양한 양상의 증폭산물을 보였으며, 그 중 9개 프라이머는 한국 분리주간에도 특이성을 보이는 RAPD 표지자를 제공하였다. 총 18개의 프라이머에 대한 증폭산물을 대상으로 각 시료의 유사도를 조사한 결과, A. culbertsoni는 A. hatchetti, A. triangularis, A. polyphaga와 유사도가 각각 0.300, 0.308, 0.313이었고, A. hatchetti와 A. triangularis간의 유사도는 0.838이었다. 한국 분리주 YM-2, -3, -4간의 평균 유사도는 0.959이었고, YM-2, -3, -4와 A. hatchetti, A. triangularis간의 평균 유사도는 0.832이었다. 한국 분리주 YM-5는 YM-2, -3, -4 간의 비교에서 평균 0.237의 유사도를 보인 반면, A. culbertsoni와 유사도 0.857을 보여, 다른 한국 분리주보다 A. culbertsoni와 유전적으로 유사함을 알 수 있었다. UPGMA법에 의한 유전적 근연관계 분석 결과 phenogram 상에 두개의 분지군이 존재하는데, A. hatchetti, A. triangularis 및 3개 한국 분리주 (YM-2, -3, -4)가 하나의 분지군을, A. culbertsoni, A. polyphaga, HOV주, 및 YM-5가 다른 분지군을 형성하는 것으로 나타났다. 게놈 DNA 상의 변이에 근거하여 볼 때, YM-5 주는 유전적으로 A. culbertsoni와 거의 유사한 분리주이며 한국 분리주는 최소 2종 이상의 가시아메바로 분류할 수 있다고 사료된다. Genetic status of Acanthamoeba spp. were tested on the basis of random amplified polymorphic DNA(RAPD) marker analysis. Four previously established Acanthamoeba species. 4 Korean isolates of Acanthamoeba sp.. and one American isolate of Acanthamoeba sp. were analyzed by RAPD-PCR using an arbitrary decamer primers. Amplification products were fractionated by agarose gel electrophoresis and stained by ethidium bromide. Eighteen primers producted DNA amplification profiles revealing clear differences among 4 species. Nie of them also produced DNA amplification profiles which included some isolate-specific amplification products. On the basis of amplified fragments by 18 primers, the pairwise similarity indices between A. culbertsoni and other species (i.e., A. hatchetti, A. triangularis, A. polyphaga) were 0.300, 0.308, and 0.313, respectively. Similarity index between A. hatchetti and A. triangularis was 0.833. The mean similarity index among the 3 Korean isolates (YM-2,-3,-4) was 0.959 and 0.832 among them and 2 other species (A. hatchetti and A. triangularis). The mean similarity index among YM-5 and other Korean isolates (YM-2,-3,-4) was 0.237. However, the similarity index between YM-5 and A. culbertsoni was 0.857, which suggests that YM-5 is genetically more similar to A. culbertsoni than other Korean isolates. Phenogram reconstructed by UPGMA method revealed that there are two groups: one group consists of A. hatchetti, A. triangularis, and 3 Korean isolates (YM-2,-3,-4), and the other group consists of A. culbertsoni, A. polyphaga, HOV, and YM-5.

Classical Swine Fever (Hog cholera) Virus 약독순화주 (Suri 주)의 gp55 Gene 염기서열 분석

김귀현,장경수,강경임,이병형,박종현,안수환,전무형 충남대학교 생물공학연구소 1999 생물공학연구지 Vol.7 No.-

An attenuated classical swine fever virus (CSFV), Suri strain, is a variant derived from a vaccine virus, LOM strain. This study was performed to elucidate the molecular biologcal properties of CSFV Suri strain, and to obtain the basic data for molecular epidemiological approaches for the disease. The truncated form of gp55 gene without the C-terminal trasmembrane domain, in size of 1,023bp, was amplified by RT-PCR and sequenced by dye terminator cyclic sequencing method, and inserted into BamHI site of pAcGP67B baculovirus vector, establishing a cloned pAcHEG plasmid. By the nucleotide sequences determined, 341 amino acid sequences were predicted. As compard the nucleotide and amino acid sequences of gp55 of Suri with the various CSFV, Suri strain showed the high homology over 99.1% with ALD and LOM strains, but comparably the lower homology with Alfort and Brescia. In comparison of amino acid sequence in variable domain of gp55 protein, the similar tendency of homology was observed. In hydrophobicity analysis, all of four CSFV strains revealed the analogous patterns of hydrophobicity. The numbers and locations of N-glycosylation site and cysteine residuse in gp55 were analyzed, those of Suri strain being coincident with ALD and LOM strains. The results suggest that gp55 in Suri strain has the high similarity to those in ALD and LOM strains in terms of the nucleotide and amino acid sequences and the functional properties of gp55 protein.

타리비드 정(오플록사신 100㎎)에 대한 파비드 정의 생물학적동등성

박완수,조성희,이헌우,임호택,홍성제,서성훈,류재환,이경태 한국약제학회 2005 Journal of Pharmaceutical Investigation Vol.35 No.1

The purpose of the present study was designed to evaluate the bioequivalence of two ofloxacin tablets, Tarivid (Jell Pharm. Co., Ltd.) and Favid (ILHWA Co., Ltd.), according to the guidelines of Korea Food and Drug Administration (KFDA). Twenty-four normal male volunteers, 23.67±3.12 year in age and 68.50±7.23 kg in body weight, were divided into two groups and a randomized 2x2 cross-over study was employed. After four tablets containing 100 mg of ofloxacin were orally administered, blood was taken at predetermined time intervals and concentrations of ofloxacin in plasma were deter mined using HPLC. Pharmacokinetic parameters such as AUC_(t) and T_(max) were calculated and ANOVA test was utilized for the statistical analysis of the parameters using logarithmically transformed AUC_(t), and C_(max) and untransformed T_(max). There were no sequence effects between two formulations in these parameters. The 90% confidence intervals for the log transformed data were acceptance range of log 0.8 to log 1.25 (e.g., log 0.94-log 1.04 and log 0.90-log 1.07 for AUC_(t) and C_(max) respectively). The major parameters. AUC_(t) and C_(max) met the criteria of KDFA for bioequivalence indicating that Favid tablet is bioequivalent to Tarivid tablet.

복합유기용제 장기 노출자들의 골수충실도 평가를 위한 자기공명영상의 계량적 활용

정해관,최대섭,박건욱,윤환중,김정란,하경임,양승오,김양호 大韓産業醫學會 2002 대한직업환경의학회지 Vol.14 No.2

목 적 : 자기공명영상은 골수의 지방세포와 조혈세포간의 분퐁 차이를 신호강도 차이로 구분할 수 있어 골수 충성도에 대한 평가가 가능하다. 저자들은 유기용제에 장기간 노출된 조선업체 도장공 및 대조군을 대상으로 비참습적인 방법으로 골수 충실도를 평가하는 도구를 개발하기위하여 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 1998녀 8월부터 2000년 1월까지 조선소 도장공 중 1개 대학병원에서 유기용제 장기간 사용으로 인한 골수검사 결과 저세포성 골수로 진단 받은 환자 6명(남자 5명, 여자 1명; 평균연령 환자군 46.5세)을 대상으로 말초혈액이 혈액학적 검사, 골수검사 및 요추부 자기공명영상을 실시하였다. 대조군으로는 동일 병원에서 요추부 자기공명영상을 촬영한 환자 132명(남 67명, 여자 65명, 연령 평균 42.5세, 범위 30-59세)을 선정하였다. 요추부 자기공명영상은 T1 및 T2 강조영상의 시상 단면에서 제 12 흉추부터 제 1 천추사이의 추체에서 각반드시 신호강도를 기록하였다. 기준 부위로는 동일 단면의 척추주위근 및 지방조직의 산호강도를 이용하여 각 부위에서 측정한 신호강도를 나누어 골수 신호강도지표를 구하였다. 결 과 : 환자군의 골수 충실도는 20.33-33.6 %이었고 혈액검사상 백혈구수는 2,100-7,600/㎣이었다. 환자군과 대조군 모두에서 각 지표는 제 12흉추에서 아래로 내려갈수록 점차 감소하였다가 제 4 요추 이후 다시 증가하는 양상을 보였다. 환자군과 대조군간의 골수 신호강도지표를 비교하였을 때 T1 강조영상에서 척추주위근을 기준으로 한 골수 신호강도지표가 환자군과 대조군간의 차이를 가장 잘 반영하였으며 환자군이 모든 추체에서 유의하게 높았다. (p<0.05, p<0.01). 대조군의 골수 신호강도지표는 T1 강조영상이 척추주위근을 기준으로 측정하였을 때 여성에서 연령 증가에 따라 모든 측정점에서 골수 신호강도지표는 증가하는 양상을 보였으며 30대와 50대간의 차이는 유의하였다. (p<0.05, p<0.01). 성별에 따른 골수 신호강도지표는 근육을 기준으로 한 골수 신호강도지표에서는 보이지 않았으나 비장을 기준으로 한 골수 신호강도지표는 남녀간에 유의한 차이를 보였다. (p<0.05). 다변량 선형회귀분석에서 연령 및 성별을 보정하였을 때 T1 강조영상의 근육을 기준으로 한 골수 신호강도지표는 환자군에서 대조군에 비하여 제 1 천추에서 0.364 더 높았다. 제 1 천추의 T1 근육을 기준으로 한 골수 신호강도지표의 연령 성별 평균+1 표준편차를 기준으로 하였을 때 6명 중 5명이 그 이상이 분포를 보여 두 군간의 차이가 가장 뚜렷하였다. 결 론 : 저자들은 자기공명영상을 이용하여 골수 충실도를 평가하기 위한 지표를 개발하였고 정상 참고치를 제시하였다. 골수 신호강도지표는 지방조직 함량, 골밀도함께 칼슘 등의 영향을 동시에 반영하지만 이러한 영향을 적절히 보정할 경우 고위험집단에서 골수 충실도를 평가하는데 활용할 수 있음을 확인하였다. 보다 좋은 지표의 개발을 위하여 충분한 표본수를 가진 저세포성 골수 환자집단을 대상으로 후속연구를 수행할 필요가 있다. Objectives : To develop a quantitative and noninvasive method of bone marrow cellularity evaluation in solvent exposed painters. Methods : Six painters (mean 46.5 years, 5 males and one female with hypocellular marrow, and 132 controls were examined using magnetic resonance imaging (MRI). A full examination of the peripheral blood and a bone marrow biopsy was done on each patient. Signal intensities were measured at the vertebral bodies from T12 to S1 on both the T1 and the T2-weighted image (T1WI and T2WI). Signal indices were calculated by dividing the signal indeces of the vertebral bodies by that of the paraspinal muscle and the subcutaneous fat in the same view. Results : The Bone marrow cellularities of the cases painters were between 20.3 % and 33.6 %. Signal indices based on the muscle at T1WI were greater in the cases of the painters compared to those of the controls (p<0.05, p<0.01). Signal indices based on the muscle at T1WI were significantly higher in older women compared with men (p<0.05). After adjusting for age and gender, the signal index of cases at S1 based on muscle of T1WI was higher than that of the controls by 0.364. Five of the six cases had a muscle signal index at S1 of T1WI higher than the mean + 1 standard deviation for the same age group and gender. Conclusions : MR signal indices are influenced by constitutional factors such as fat content. bone density, and the presence of other pathology. However, after adequate adjustment, it can be used as a useful indicator of bone marrow cellularity in a high-risk population.

항생제 다제내성균 Staphylococcus aureus SA2로부터 분리한 테트라사이클린 내성 플라스미드 pKH6의 염기서열

이대운,윤성준,김우구,신철교,임성환,이백락,문경호 한국미생물생명공학회 ( 구 한국산업미생물학회 ) 1996 한국미생물·생명공학회지 Vol.24 No.4

한국에서 임산균주로부터 분리한 테트라사이클린(Tc) 내성 플라스미드 pKH6의 전체 염기서열을 결정하여 가장 대표적인 Tc 내성 플라스미드인 pT181과 비교하였다. pKH6의 전체 길이는 4439bp로 pT181과 동일하게 나타났으며 염기서열은 7개의 염기에서 차이를 보였다. 전부 다 염기쌍이 치환된 형태로 나타났으며 그 중 3개는 coding 부위에서 일어났다. coding 부위에서 일어난 경우에도 1개는 동일한 아미노산을 coding 하였기 때문에 pT181과 차이가 없었으며 RepC와 Pre 단백질에 있어 각각 1개의 아미노산에서 차이를 나타내었다. The complete nucleotide sequence of pKH6, a tetracycline-resistance (Tc^r) plasmid isolated from multi-drug resistant Staphlococcus aureus SA2, has been determined and compared with that of the staphylococcal Tc^r plasmid pT181. The nucleotide sequences of the two plasmids are in agreement except for 7 nucleotides. All differences are caused by base pair substitutions. Among 6 substitutions, 3 occurred in coding regions. However, only tow base substitutions in coding regions resulted in changes of amino acid sequences in two different ORFs of repC and Pre proteins.

서울의 Penicillinase Producing Neisseria Gonorrhoeae 발생빈도(1996)

김재홍,황동규,전재홍,김윤석,김중환,김용준,이창균,임동진,김현수,조창근,김경문,박상훈,전우형,김희성,이호정,차명수,김갑형,김형석,김석우,황지환,박병순,권오상,이민수,송기훈,성소영,이인섭,부태성 대한화학요법학회 1999 대한화학요법학회지 Vol.17 No.2

Background : In recent years, gonorrhea has been panedemic and remains one of the most commom STDs in the world, especially in developing countries. Objective & Methods: For the detection of a more effective therapeutic regimen and assessing the prevalence of PPNG, we have been trying to study the patients who have visited the VD Clinic of Choong-Ku Public Health Center in Seoul since 1980 by means of the chromogenic cephalosporin method. Results: In 1996, 139 strains of N. gonorrhoeae were isolated, among which 53(39.0%) were PPNG. Conclusion: Our results suggests that after a peak of 74.3% in 1993, the prevalence of PPNG in Seoul is gradually declining.

표고버섯 물 추출물을 첨가한 쿠키의 품질 특성

정경임(Kyung Im Jung),최영주(Young Ju Choi),오정환(Jung Hwan Oh),이정임(Jung Im Lee),박소영(So Young Park),김혜란(Hye Ran Kim),전병진(Byung-Jin Jeon),김동민(Dongmin Kim),공창숙(Chang-Suk Kong) 한국생명과학회 2019 생명과학회지 Vol.29 No.9

본 연구에서는 표고버섯 물 추출물 0%, 1%, 3%, 5% 및 7%를 첨가한 쿠키의 항산화활성과 품질 특성을 알아보았다. 손실률은 표고버섯 물 추출물의 함량이 증가함에 따라 증가하였고(p<0.05), pH는 추출물의 함량이 증가함에 따라 감소하였으며(p<0.05), 퍼짐성과 팽창률 및 수분 함량은 모든 군에서 유의적인 차이가 없었다. 쿠키의 L값과 b값은 농도의존적으로 감소하였고(p<0.05), a값은 농도의존적으로 증가하였다(p<0.05). 쿠키의 기계적 특성 평가에서 경도는 7% 첨가군에서 가장 높게 나타났고, 씹힘성과 파쇄성은 농도의존적으로 증가하였으나 응집성과 탄력성은 모든 군에서 유의적인 차이가 없었다. 표고버섯 물 추출물을 첨가한 쿠키의 총 폴리페놀 함량과 DPPH radical 소거능은 농도의존적으로 증가하였다(p<0.05). 쿠키의 관능적 특성 평가에서 외관과 색 및 맛은 무첨가군, 향과 조직감 및 전반적인 기호도는 1% 첨가군에서 가장 높게 나타났다. 이상의 결과에서 표고버섯 물 추출물 1~3%를 첨가하여 제조한 쿠키는 관능적인 기호도와 항산화활성을 높일 수 있는 바람직한 방법이라 판단된다. This study evaluated the characteristics and antioxidant properties of cookies prepared with different amounts (0%, 1%, 3%, 5%, and 7%) of Lentinus edodes water extract (LEWE). The baking loss rate of cookies increased as the amount of LEWE increased (p<0.05). The pH of cookies significantly decreased when amounts of LEWE increased (p<0.05), but spread factor, leavening rate, and moisture content showed no significant difference among the samples. L value and b value of cookies significantly decreased when amounts of LEWE increased (p<0.05), but a value of cookies significantly increased when amounts of LEWE increased (p<0.05). Hardness was higher in the 7% LEWE cookies. Chewiness and brittleness increased with increasing LEWE concentration, but cohesiveness and springiness showed no significant differences among the samples. Total polyphenol content and DPPH (1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl) radical scavenging activity significantly increased upon the addition of LEWE (p<0.05). In a sensory evaluation, the appearance, color, and taste of the cookies were rated higher in groups containing 0% LEWE, but the flavor, texture, and overall acceptability scores were highest for cookies with 1% LEWE added. These results suggest that cookies prepared by adding 1-3% LEWE achieve the best sensory evaluation and antioxidant activity.

하향 경사급기 지하주차장의 환기설비성능에 관한 제트팬 공기혼합의 효과

김경환(Kyung-Hwan Kim),문정환(Jung-Hwan Moon),유준(Yoo Joon),이재헌(Jae-Heon Lee),오명도(Myung-Do Oh),김종필(Jong-Pil Kim),임윤철(Yoon-Chul Im) 대한설비공학회 2001 대한설비공학회 학술발표대회논문집 Vol.2001 No.-

도시 생활쓰레기의 배출 특성에 따른 효율적 관리방안 연구

임재명,강성환,김병욱,심무경 한국환경정책학회 1997 環境政策 Vol.5 No.2

Decoding intravesical pressure from local field potentials in rat lumbosacral spinal cord

Im, Changkyun,Park, Hae Yong,Koh, Chin Su,Ryu, Sang Baek,Seo, In Seok,Kim, Yong Jung,Kim, Kyung Hwan,Shin, Hyung-Cheul IOP 2016 Journal of neural engineering Vol.13 No.5

<P>Chronic monitoring of intravesical pressure is required to detect the onset of intravesical hypertension and the progression of a more severe condition. Recent reports demonstrate the bladder state can be monitored from the spiking activity of the dorsal root ganglia or lumbosacral spinal cord. However, one of the most serious challenges for these methods is the difficulty of sustained spike signal acquisition due to the high-electrode-location-sensitivity of spikes or neuro-degeneration. Alternatively, it has been demonstrated that local field potential recordings are less affected by encapsulation reactions or electrode location changes. Here, we hypothesized that local field potential (LFP) from the lumbosacral dorsal horn may provide information concerning the intravesical pressure. LFP and spike activities were simultaneously recorded from the lumbosacral spinal cord of anesthetized rats during bladder filling. The results show that the LFP activities carry significant information about intravesical pressure along with spiking activities. Importantly, the intravesical pressure is decoded from the power in high-frequency bands (83.9–256 Hz) with a substantial performance similar to that of the spike train decoding. These findings demonstrate that high-frequency LFP activity can be an alternative intravesical pressure monitoring signal, which could lead to a proper closed loop system for urinary control.</P>