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아시아에서 분리된 viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV) isolates의 계통분석학적 비교
안상중 ( Sang Jung Ahn ),조미영 ( Mi Young Cho ),지보영 ( Bo Young Jee ),박명애 ( Myoung Ae Park ) 한국어병학회 2013 한국어병학회지 Vol.26 No.3
바이러스성 출혈성 패혈증을 일으키는 VHSV는 국내의 넙치양식에 심각한 피해를 주고 있다. 본 연구에서는 우리나라에서 분리한 8종의 VHSV 분리주들의 glycoprotein (G)의 염기서열을 분석하여 KoreanVHSV 분리주들과 기보고된 일본 및 중국의 분리주들을 계통발생학적으로 비교하여 G-protein의 8 부위(G34, C528, A755, T834, T951, T1147, T1221, T1336)에서 국내 VHSV 분리주들의 특이적인 서열을 확인하였고, 전 세계적으로 분리된 VHSV의 분리주들과의 비교결과 8 부위 중 3 부위 (A755, T834, T1221)의 국내VHSV 분리주 특이적 염기서열들을 확인하였다. 또한 중국 유래 VHSV 분리주의 특이적 염기서열11 부위 (C498, C545, C548, C642, G648, T678, A738, C804, C834, G851, C1139)와 일본 유래 VHSV 분리주의 특이적 염기서열 1부위 (C179)를 확인하였다. 이상의 연구결과는 국내 특이적인 염기서열을 확보하여, 구역화된 수산생물 질병의 예찰, 모니터링 및 질병 관리에 유용하게 사용될 것으로 사료된다. Viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV), the causative agent of viral haemorrhagic septicaemia (VHS), is an epidemic virus of cultured olive flounder Paralichthys olivaceus in Korea. In the present study, the entire glycoprotein (G) gene including several hypervariable regions from 36 isolates of diverse geographic and host origin and 8 Korean VHSV isolates from cultured olive flounder were analyzed. Phylogenetic analysis indicated that most of Asian VHSV belong to the genotype IVa group, suggesting that they originated from a common ancestral virus. Comparative sequence analysis of the complete G protein from Korean VHSV isolates revealed 3 Korean strain-specific nucleotide residues (nucleotide number of G-region: A755, T834 and T1221). These results suggest that Korean VHSV originated from a common ancestor, but these regional specific nucleotide sequences suggest that genetic differences of VHSV are more related to geographic areas than to host fish species.
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Na Young Kim(김나영),Moo-Sang Kim(김무상),Sung Hee Jung(정승희),Myoung Sug Kim(김명석),Mi Young Cho(조미영),Joon Ki Chung(정준기),Sang Jung Ahn(안상중) 한국생명과학회 2017 생명과학회지 Vol.27 No.11
본 연구의 목적은 넙치 인지질가수분해효소(PLC- δ1) 3가지 타입의 세포내 특성을 규명하고자 하였다. 일반적으로 인지질가수분해효소(PLC)의 신호전달경로는 핵, 세포막, 세포질에 분포한다고 알려져 있으나, 핵내 위치 메커니즘은 여전히 불분명하다. PoPLC-δ1A, PoPLC-δ1B (Sf)과 PoPLC-δ1B (Lf)의 3타입의 유전자들은 각각 핵위치 신호(NLS)와 핵방출서열(NES)을 포함하고 있다. 본 연구에서는, 넙치 3가지 타입 인지질가수분해효소(PLC-δ1)의 세포내 위치이동 메커니즘 분석을 위해 GFP 벡터에 유전자를 삽입하여 ionomycin과 thasogargin처리 후 세포위치와 이동양상을 공초점 레이저 주사현미경으로 관찰하였다. PoPLC-δ1A는 PoPLC-δ1B (Lf)와 PoPLC-δ1B (Sf)가 원형질막에 국한되어 분포할때 세포질과 세포막보다 세포 소기관에 분포되어 있었다. PoPLC-δ1B (Lf) 및 PoPLC-δ1 (Sf)이 핵 세포질내 이동양상을 보이지 않을 때, PoPLC-δ1A은 ionomycin과 thapsigargin 처리에 의해 핵 내에 축적되는 양상을 나타냈다. 이런 결과는 손상되지 않은 기능적 NES 서열을 포함하는 PoPLC-δ1A가 어류에서 핵 세포질 내 왕복 및 이동의 주된 역할을 한다는 것을 보여주고 있다. The purpose of this study was to investigate the cellular characterization of phospholipase C-δ1 in olive flounders (Paralichthys olivaceus). In general, phospholipase C signaling pathways are distributed in nuclei at plasma membranes and in cytoplasms, although the pathways" nuclear localization mechanisms are unclear. P. olivaceus duplicates type-A PoPLC-δ1 (PoPLC-δ1A), which has a high similarity to the human isoform PLC-δ; type-B PoPLC-δ1 (PoPLC-δ1B [Sf]), which has a low similarity to the human isoform PLC-δ and the alternative splice variant PoPLC-δ1B (Lf), which has a nuclear localization signal (NLS) and a nuclear export signal (NES) for nuclear imports and exports, respectively. This study confirmed the effects of the cellular localization and translocation of GFP-tagged PoPLC-δ1A, PoPLC-δ1B (Sf) and PoPLC-δ1B (Lf). It administered treatments of Ca<SUP>2+</SUP> ionophore ionomycin and endoplasmic reticulum (ER)–Ca2+ pump inhibitor thapsigargin to hirame natural-embryo (HINAE) cells. A laser-scanning confocal microscope was used. GFP-tagged PoPLC-δ1A was distributed to the cellular organelles, rather than to the cytoplasms and cytomembranes, when PoPLC-δ1B (Lf) and PoPLC-δ1B (Sf) were localized at the plasma membranes. The treatments of ionomycin and thapsigargin showed the accumulation of PoPLC-δ1A in the nuclei when PoPLC-δ1B (Lf) nucleocytoplasmic shuttling and PoPLC-δ1B (Sf) nucleocytoplasmic shuttling were not observed. The results were the first evidence that PoPLC-δ1A, which contains functional, intact NES sequences, has a main role in nucleocytoplasmic shuttling and translocation in fish.
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