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- 저자 : Ki Duk Song(송기덕) (검색결과 20 건)
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Current Progress in Generation of Genetically Modified Mice
송기덕,조병욱,Song, Ki-Duk,Cho, Byung-Wook Korean Society of Life Science 2007 생명과학회지 Vol.17 No.4
Manipulation of the mouse genome by activating or inactivating the gene has contributed to the understanding of the function of the gene in the subset of cells during embryonic development or postnatal period of life. Most of all, gene targeting, which largely depends on the availability of mouse embryonic stem (ES) cells, is the milestone of development of animal models for human disease. Recombinase-mediated genome modification (Cre-LoxP and Flp-Frt etc) and the ligand-dependent regulation system, more accurate and elaborate manipulation tools, have been successfully developed and applied to dissect the mechanisms governing complex biological processes and to understand the role of protein in temporal-and spatial aspects of development. As technologies concerning refined manipulation of mouse genome are developed, they are expected to open new opportunities to better understand the diverse in vivo functions of genes. 생쥐 유전자를 과발현 시키거나 제거하는 유전자 조작 기술의 발달은 배 발생 단계나 출생 후 특정한 세포에서의 특정 단계에서의 유전자 기능을 이해하는 많은 기여를 하고 있다. 특히, 높은 상동 재조합 활성을 가지는 생쥐 배 줄기세포를 이용한 유전자 적중 기법은 인간 질환을 이해하는데 필수적인 동물 모델 개발에 중요한 기여를 하였다. 최근에는 Cre과 Flp와 같은 염기서열 특이적 재조합 효소와 라이겐드에 의한 조절 시스템의 도입으로 좀 더 정확하고 정교한 유전자 발현 조절을 위해 개발되어 복잡한 생명현상을 지배하는 메카니즘과 시간과 공간에서 작동하는 유전자의 기능을 이해하는데 많은 기여를 하고 있다. 마우스 게놈을 세밀하게 조작할 수 있는 새로운 분자생물학적 도구의 적용으로 in vivo상에서 유전자의 다양한 기능을 좀 더 정확하게 이해할 수 있는 기회가 열릴 것으로 기대된다.
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Advances of Genome Research in Livestock Animals
Ki Duk Song(송기덕),Byung Wook Cho(조병욱) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.4
경제 동물의 유전체 연구는 최근에 급속하게 발전하여 초기의 유전체 지도로 부터 유전자의 발견에 필수적인 앙적/질적 형질 유전자를 확인 동정가능한 수준의 지도가 개발되었다. 이러한 발전은 경제동물의 전체 게놈 염기서열 결정과 대량 ESTs의 개발에 의해 가능해졌다. 특히 염시서열 결정은 경제형질과 연관된 대규모의 SNPs 개발에 의한 QTL 연구에 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다. 비교 유전체 연구를 통해 인간 및 설치류 모델동물에서 나온 유전체 정보를 이용하여 경제 동물의 유전체 연구에 있어 중요한 발견을 이루었다. 이러한 노력은 좀더 밀도 높은 QTL지도의 작성을 가능하게 하여 쉽게 측정하기 어려운 경제형질과 연관된 유전자의 확인 및 동정을 가능하게 하고 궁극적으로 산업체에서 이용 가능한 표지인자의 개발을 가능하게 할 것으로 사료된다. 이와 더불어, 경제동물 유전체 연구 성과는 인간의 생리현상의 유전체 측면의 이해를 더욱 증진시킬 것이다. Genome research in economic animals has progressed rapidly in recent years, transforming from primitive genome maps to quantitative/qualitative trait maps that are indispensable to gene discovery. These advances have been benefited from the result of animal genome sequencing projects and functional genomics that are being extensively applied in livestock animal research following the development of large expressed sequences tags (ESTs). Genome sequencing efforts will provide information to QTL study by larger scale single nucleotide polymorphisms (SNPs) association study. Comparative genomics which is applying the information from human genome research as well as rodents model has contributed to important discoveries in economic animal genome research. These efforts will speed up much denser QTL maps development for phenotypic traits which are not easy to measure and to be identified by quantitative genetics [20] and lead to development of convincing markers associated with economically important trait, which will be eventually applied to livestock industry. In addition to practical application, animal genome research will enrich the understanding of human physiology in terms of genome biology.
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MOLECULAR CLONING OF CHICKEN INTERFERON - GAMMA
송기덕(Song Ki Duk),Hyun Lillehoj(Lillehoj Hyun),한재용(Han Jae Yong) 한국가금학회 1999 한국가금학회 정기총회 및 학술발표회 Vol.16 No.-
닭 T 임파구 하이브리도마 세포주인 P34로부터 RT-PCR 기법을 이용하여 닭 인터페론 감마 cDNA를 증폭하고 pUC18 벡터에 클로닝하여 염기서열을 결정하였다. 인터페론 감마 cDNA를 프로브로 이용하여 화이트 레그혼으로부터 작성된 박테리오페이지 라이브러리를 스크리닝하였다. 스크리닝 결과, 닭 인터페론 염기서열을 포함하고 있는 10개의 페이지를 분리하여 그중 하나를 이용하여 닭 인터페론 감마 유전자의 구조를 규명하였다. 인터페론 감마는 네 개의 엑손과 세개의 인트론으로 구성되며, 엑손과 인트론 경계는 정확한 스플라이싱에 필요한 GT/AG 규칙을 따르고 있다. 네 개의 엑손은 각각, 41, 26, 57 그리고 40개의 아미노산을 코딩한다. 이들 결과는 인터페론 감마의 유전자 구조가 포유류와 조류에 걸쳐서 진화적으로 보존적임을 암시한다. 5‘-UTR과 시그널 서열은 엑손 1번에 존재한다. 엑손 4번에 mRNA 대사에 중요한 역할을 하는 AT-rich 염기서열이 존재한다. 5‘-flanking 부위에는 사람 인터페론 감마 전사조절에 관여하는 AP-1, AP-2, CREB, ATF, GATA, USF와 같은 전사조절단백질이 결합할 수 있는 염기서열이 존재한다. 이는 닭과 포유류의 인터페론 감마의 전사조절 메커니즘이 유사함을 암시한다. A cDNA encoding chicken interferon-gamma (chIFN-γ) was amplified from P34, a CD4+ T-cell hybridoma by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and cloned into pUC18. The sequences of cloned PCR products were determined to confirm the correct cloning. Using this cDNA as probe, chicken genomic library from White Leghorn spleen was screened. Phage clones harboring chicken interferon-gamma (chIFN-γ) were isolated and their genomic structure elucidated. The chIFN-γ contains 4 exons and 3 introns spanning over 14 kb, and follows the GT/AG rule for correct splicing at the exon/intron boundaries. The four exons encode 41, 26, 57, and 40 amino acids, respectively, suggesting that the overall structure of IFN-γ is evolutionarily conserved in mammalian and avian species. The 5´- untranslated region and signal sequences are located in exon 1. Several AT-rich sequences located in the fourth exon may indicate a role in mRNA turnover. The 5´-flanking region contains sequences homologous to the potential binding sites for the mammalian transcription factors, activator protein-1(AP-1), activator protein-2(AP-2), cAMP-response element binding protein(CREB), activating transcription factor(ATF), GATA-binding factor(GATA), upstream stimulating factor(USF). This suggests that the mechanisms underlying transcriptional regulation of chicken and mammalian IFN-γ genes may be similar.
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Gene Targeted Mice to Study T Cell Development
Ki Duk Song(송기덕),Sang Wook Kim(김상욱),Mi Rang Lee(이미랑),Seon Ku Kim(김선구),Teak Soon Shin(신택순),Han Seok Kang(강한석),Hong Gu Lee(이홍구),Hae Yeal Jeon(전해열),Byung Wook Cho(조병욱) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.5
T 세포의 발생은 흉선에서 이루어지는데, 골수나 태아의 간으로부터 유래한 전구세포가 여러 단계의 복잡한 발달단계를 거쳐서 단일 CD4나 CD8 분자를 세포 표면에 발현하는 성숙한 T세포로 분화하여 2차 림프기관으로 이동한다. T세포 수용체로부터 유래하는 신호와 하위 신호전달 경로는 성숙한 T 세포 및 흉선 T 세포의 발생과 분화에 중요하다. 유전자 적중 마우스를 이용한 연구들을 통해서 복잡한 T 세포 발생을 조절하는 중요한 신호전달 경로를 파악하여 메카니즘에 대한 이해가 깊게 되었다. 유전자의 발현 시기와 조직이나 세포를 고려한 신호전달을 이해하기 위해 보다 정교한 유전자 조작로 기법의 개발이 중요하다고 사료된다. T cells develop in thymus, where immature progenitors undergo multi-stage developmental processes until mature CD4+ and CD8+ single positive T cells are generated and egress out to the periphery. Signals from T cell receptor are pivotal for T cell development in thymus as well as in periphery. Gene targeted mutant mice have contributed the understanding underlying mechanisms by dissecting the signaling pathways which governing these complex processes. Development of refined mutational system will be imperative to analyze the signaling pathways by taking consideration of context of ‘timing and/or space’ of gene function.
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이성진,송기덕,고영두,김창현,Lee, Sung-Jin,Song, Ki-Duk,Ko, Yung-Du,Kim, Chang-Hyun Korean Association of Organic Agriculture 2010 韓國有機農業學會誌 Vol.18 No.3
This study was carried out to investigate the effects of wormwood (Artemisia sp.) addition on the growth performance, nutrients utilization and abdominal fat deposition of broiler chickens. Two hundred twenty five and two-day old Arboracre strain male commercial broiler chicks were distributed to 5 treatments with wormwood supplementation levels; C(O%), $T_1$ (1%), $T_2$ (3%), $T_3$ (5%), and $T_4$ (10%) and with 3 replications each with 5 birds for five weeks. Body weight gain during the experiment was improved in $T_1$ (1723.0g) compared with that of $T_3$ (1557.7g) and $T_4$ (1450.7g) (P<0.05). Feed intake was significantly (P<0.05) increased as the levels of wormwood addition increased (C: 2653.8g, T1: 2852.0, $T_2$: 2900.3, $T_3$: 2900.7g, T4: 2954.7g). Feed conversion rate (feed/gain) was significantly (P<0.05) increased as the levels of wormwood addition increased (C: 1.55, $T_1$: 1.66, $T_2$: 1.70, $T_3$: 1.86, $T_4$: 2.04). The days reaching to 2.0kg of body weight were expected to be 43.2 days in control, whereas those of group T1 were reduced to 42.6 days by 0.6 day from control. Nutrient utilization and abdominal fat deposition in the experiment were significantly decreased (P<0.05) and small intestine contents in the broilers was significantly increased (P<0.05) as the levels of wormwood addition increased. Therefore, although there was no significant improvement for the performance of broiler chickens with the dietary supplementation of wormwood meal, less than 1% addition of wormwood to broiler diets might have beneficial for human health by reducing the abdominal fat deposition of the broiler chicknens. 본 연구는 국내에서 약용으로 많이 사용되고 있는 쑥을 건조시켜 사료에 첨가할 경우 육계의 성장률, 영양소 이용률, 복강내 지방함량에 미치는 영향을 구명하기 위하여 2일령의 Arbroracre 계통의 육계 숫병아리 225 수를 공시하여 쑥 분말의 첨가를 00/0(대조군, C), 1% ($T_l$), 3%($T_2$), 5%($T_3$), 10%($T_4$) 둥 모두 5개 군으로 나누어 5 주간 3 반복 사양실험하였다. 육계의 최종체중 1% 처리군($T_l$ : 1723.0g)이 대조군(1715.3g), $T_2$(1708.3g), $T_3$(1557.7g, P<0.05), 그리고 $T_4$(l450.7g) 보다 효과가 좋았다. 그러나 사료 섭취량은 쑥 분말 첨가량이 많아질수록 증가하였다(C: 2653.8g, $T_l$: 2852.0, $T_2$: 2900.3, $T_3$: 2900.7g, $T_4$: 2954.7g). 또한 쑥 분말 1% 첨가군($T_l$)에서 2kg 도달일령이 가장 우수하여 대조군 보다 0.6일 빠른 42.6일이었으나 쑥 분말을 3% 이상 처리시에는 오히려 늦어지는 것으로 나타났다. 사료요구량은 쑥분말 첨가가 증가함에 따라 유의적으로 증가하졌지만, 복강내 지방함량은 유의적으로 감소하였다. 비록 체중, 사료요구량, 사료 섭취량 등은 대조구와 비교하여 효과가 없었지만, 복강내 지방함량을 고려할 때, 쑥 분말 첨가 1% 이하로 급여할 경우 인간의 건강에는 효과적일 것으로 판단되었다.
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