메디컬패스웨이 병합을 통한 생물학적 모델 연구

전선희(Sun-hee Jeon),최윤수(Yunsoo Choi),서동민(Dongmin Seo),유석종(Seok Jong Yu),이민호(Min-ho Lee) 한국콘텐츠학회 2015 한국콘텐츠학회 종합학술대회 논문집 Vol.2015 No.5

Poly$[d(A-T)_2]$, Poly$[d(G-C)_2]$와 스퍼민의 결합 형태에 관한 연구

윤병화,전선희,송영대,조태섭,김석규,Yun, Byeong Hwa,Jeon, Sun Hee,Song, Young Dae,Cho, Tae Sub,Kim, Seog K. 대한화학회 1998 대한화학회지 Vol.42 No.5

When the spermine, which is one of the polyamines containing cation in vivo, binds to DNA, it can increase the stability of DNA. At the same time, it can cause B-form to Z-form transformations of DNA. However, because we cannot determine the binding geometry of the spermine to DNA by using spectroscopic methods, nobody can show the accurate binding mechanism of a DNA-spermine complex. Thus, we used DAPI as a spectroscopic probe of spermine, which binding geometry was well known. At the result of base selective binding geometry of spermine to synthetic DNA, the concentration of spermine gets higher, it grows the hydrophobic environment of DAPI which bound the minor groove of adenine-thymine base pair. Simultaneously, spermine seems to bridge the backbones around the minor groove of $poly[d(A-T)_2]$. So that, the intensity of fluorescence spectrum of that shows sudden increasement. In guanine-cytocine base pair, $poly[d(G-C)_2]$, we can suppose that spermine bind to the major groove of that, shoving out the DAPI which is partially intercalated between the base pocket across the major groove of it. In both cases, spermine doesn't show the base selectivity against to DNA. 생체 내에서 양이온을 가지는 폴리아민류인 스퍼민이 DNA에 결합할 경우 안정화도를 증가시킴과 동시에 구조적인 변환(B형태→Z형태 변환)을 유발하는 것으로 알려져 있다. 그러나, 스퍼민의 분광학적 비활성 때문에 DNA에 대한 정확한 결합 위치를 분광학적으로 결정하는 것은 불가능했으므로 그 결합메커니즘에 관한 구체적인 보고는 없다. 본 실험에서는 스퍼민에 대한 탐침 작용을 할 수 있는 물질로 분광 활성이 있으며 결합 자리를 잘 알고 있는 DAPI를 사용하였다. 합성 DNA에서 스퍼민의 결합 자리와 염기 선택성을 연구한 결과, 스퍼민의 농도가 커질수록 아데닌-티민 염기쌍이 교대로 나선을 이루는 $poly[d(A-T)_{2}]$ 에서는 스퍼민이 DNA의 작은 홈 주위의 인산기 뼈대에 걸쳐지면 DAPI의 소수성 환경을 증가시켜 형광스펙트럼의 세기를 급격히 증가시킨다. 구아닌-시토신 염기쌍이 교대로 반복되며 만들어진 $poly[d(G-C)_{2}]$에서는 스퍼민이 DNA의 큰 홈 속에 결합하면서 큰 홈에 걸쳐 있으면서 부분적으로 염기쌍사이에 삽입된 DAPI를 밀어내는 것으로 생각할 수 있다. 이 두 가지의 경우에 스퍼민이 염기쌍에 대해 특별한 선택성을 보이지 않았다.

생물학적 패스웨이 실시간 확장 시스템

최윤수(Yunsoo Choi),전선희(Sun-hee Jeon),서동민(Dongmin Seo),유석종(Seok Jong Yu) 한국콘텐츠학회 2015 한국콘텐츠학회 종합학술대회 논문집 Vol.2015 No.5

모체 혈액을 이용한 태아 유핵 적혈구 분리기법에 따른 산전 유전진단

전여진 ( Yeo Jin Jeon ),권경훈 ( Kyung Hun Kwon ),황효성 ( Hyo Sung Hwang ),이소현 ( So Hyun Lee ),방명걸 ( Myung Geol Pang ),안정자 ( Jung Ja Ann ),전선희 ( Sun Hee Chun ),김영주 ( Young Ju Kim ) 대한산부인과학회 2007 Obstetrics & Gynecology Science Vol.50 No.6

목적: 태아 유핵 적혈구의 분리를 하여 FISH에 의해 산전 태아의 성과 염색체 이수성을 확인하기 위해 본 연구를 시행하였다. 연구방법: 말초혈액샘플은 임신 11주에서 24주 사이의 37명의 여성으로부터 수집되었다. 모체혈액으로부터 double density gradient와 magnetic activating cell sorting방법을 시행한 후 Kleihaur-Betke 염색을 통해 태아 유핵 적혈구를 형태학적으로 관찰하였다. K-B positive한 유핵 적혈구에 CEP X와 CEP Y probe를 이용한 FISH를 시행하여 유핵 적혈구의 성별 확인을 통해서 태아 기원 유무를 확인하였다. 결과: 10 ml의 혈액에서 분리한 K-B positive한 유핵 적혈구는 평균 17.3 (±17.2)개였으며, 최대 54개의 유핵 적혈구가 관찰되었다. 이 중 양수검사를 확인한 총 18명의 산모에서 분리한 유핵 적혈구의 67.3%에서 CEP Y probe의 signal을 확인하였다. 결론: 우리는 분리된 태아 유핵 적혈구를 이용해서 FISH 기법을 통해 태아 성별을 판정할 수 있을 뿐만 아니라 태아의 염색체의 이수성을 진단하는데 있어서의 활용 가능성을 확인할 수 있었다. 분리한 유핵 적혈구 중 모체 기원의 유핵적혈구가 포함되어 있어서 추후 이를 선별해 내는 방법에 대한 연구가 필요할 것으로 사료된다. Objective: To identify prenatal fetal sex and chromosomal aneuploidies by FISH using isolation of fetal nucleated RBCs. Methods: peripheral blood samples was collected from 37 women between 11 and 24 weeks of gestation. we tried to enrich nucleated RBCs morphologically by Kleihaur-Betke staining after double gradient centrifugation and magnetic activating cell sorting (MACS) from maternal blood. Fluorescence in situ hybridization (FISH) analyses with CEP X and CEP Y probes for K-B positive nucleated RBCs were performed to detect whether fetal cells were existed among nucleated RBCs by observation of sex chromosomes. Results: The average number of K-B positive nucleated RBCs separated from 10ml of maternal blood was 17.3 (±17.2) and the maximum number of nucleated RBCs was 54. We observed FISH signals in nucleated RBCs separated from 18 pregnant women, and Y probe signals were observed in 67.3% of nucleated RBCs separated from 10 pregnant women. Conclusion: We confirmed that separated nucleated fetal RBCs can be used to identify fetal sex and chromosomal aneuploidies by FISH. Since nucleated RBCs from maternal origin were not excluded, further studies are needed to overcome this limitation.

바이오 패스웨이 다차원 분석 시스템 개발

서동민(Dongmin Seo),최윤수(Yunsoo Choi),전선희(Sun-Hee Jeon),이민호(Min-Ho Lee) 한국콘텐츠학회 2014 한국콘텐츠학회논문지 Vol.14 No.11

최근 유전체학의 발전, 웨어러블 디바이스의 확산, IT/NT의 발전 등에 따라 방대한 양의 바이오-메디컬 데이터가 생산되고, 이에 따라 빅데이터를 활용한 헬스케어 산업이 급속히 발달하고 있으며, 이와 관련된 빅데이터 기술은 국민의 건강 증대와 건강한 고령 삶을 제공하는 핵심 기술로 급부상하고 있다. 패스웨이(Pathway)는 단백질, 유전자, 세포 등의 생체적 요소 간의 역학관계 혹은 상호작용 등을 네트워크 형식으로 표현한 생물학적 심층지식으로, 바이오-메디컬 빅데이터 분석에 있어서 널리 활용되고 있다. 하지만 패스웨이는 매우 다양한 형태를 갖고 용량이 매우 큰 빅데이터로 이를 분석하는데 많은 시간이 소요되며, 현재까지도 다양한 패스웨이를 통합 분석할 수 있는 시스템은 전무하다. 그래서 본 논문에서는 세계적으로 가장 우수하고 방대한 양의 패스웨이를 제공하는 KEGG 패스웨이 데이터베이스로부터 사용자가 관심 갖는 패스웨이만을 자동 수집하고 패스웨이 간 계층구조를 기반으로 네트워크를 구성 후, 해당 패스웨이 네트워크에 대한 클러스터링과 핵심 패스웨이 선정을 통해 패스웨이 간의 역학관계 또는 상호작용을 직관적으로 분석할 수 시스템을 제안했다. 마지막으로, 다양한 성능 평가 결과를 통해 개발한 분석 시스템의 우수성을 입증한다. With the development of genomics, wearable device and IT/NT, a vast amount of bio-medical data are generated recently. Also, healthcare industries based on big-data are booming and big-data technology based on bio-medical data is rising rapidly as a core technology for improving the national health and aged society. A pathway is the biological deep knowledge that represents the relations of dynamics and interaction among proteins, genes and cells by a network. A pathway is wildly being used as an important part of a bio-medical big-data analysis. However, a pathway analysis requires a lot of time and effort because a pathway is very diverse and high volume. Also, multidimensional analysis systems for various pathways are nonexistent even now. In this paper, we proposed a pathway analysis system that collects user interest pathways from KEGG pathway database that supports the most widely used pathways, constructs a network based on a hierarchy structure of pathways and analyzes the relations of dynamics and interaction among pathways by clustering and selecting core pathways from the network. Finally, to verify the superiority of our pathway analysis system, we evaluate the performance of our system in various experiments.

혈관내피세포 손상과 에스트로겐, 프로게스테론 관계에 대한 연구

김미경 ( Mi Kyoung Kim ),김지애 ( Ji Ae Kim ),전여진 ( Yeo Jin Jeon ),박종순 ( Jong Soon Park ),박미혜 ( Mi Hye Park ),서석효 ( Suk Hyo Suh ),전선희 ( Sun Hee Chun ),안정자 ( Jung Ja Ahn ),김영주 ( Young Ju Kim ) 대한산부인과학회 2007 Obstetrics & Gynecology Science Vol.50 No.3

목적: 자간전증 산모에서 에스트라디올, 에스트리올, 프로게스테론 농도 변화를 규명하고 LPC에 의한 세포 독성에 미치는 에스트로겐과 프로게스테론의 효과를 규명하고자 하였다. 연구방법: 자간전증 산모와 정상 산모를 대상으로 혈중 에스트라디올, 에스트리올, 프로게스테론, 산화성 저밀도지질단백 농도를 측정하였으며, LPC를 인간제대정맥 내피세포에 처리한 후 에스트로겐, 프로게스테론을 여러 용량으로 주었을 때 세포독성 억제 여부를 알아보았다. 결과: 에스트라디올, 에스트리올 혈중 농도는 자간전증 환자에서 정상 산모에 비해 감소하였고 산화성저밀도 지단백의 농도는 증가하였다 (P<0.05). 인간제대정맥 내피세포에 LPC를 첨가하였을 때 농도 의존적으로 세포 독성을 증가시켰으며 에스트로겐과 프로게스테론의 첨가는 각각 용량 의존적으로 세포 독성을 감소시켰다 (P<0.05). 결론: 자간전증에서의 에스트로겐, 프로게스테론 농도 감소는 자간전증의 내피세포 손상과 연관이 있으며 에스트로겐, 프로게스테론은 자간전증의 예방과 치료에 있어서 중요한 역할을 할 수 있을 것으로 생각되어 이에 대한 계속적인 연구가 필요하다 하겠다. Objective: The aim of this study were to examine the serum level of estradiol, estriol, progesterone, oxidized LDL in preeclamtic patients and to evaluate the protective effects of estrogen and progesterone against lysophosphatidylcholine (LPC) induced cell death in Human umbilical vein endothelial cells (HUVECs). Methods: We analysed the serum level of estradiol, estriol, progesterone, oxidized LDL in patients with preeclampsia and control. We used LPC to induce cell death in HUVECs. For cytotoxic assay, we did LDL assay for cell death and Resazurin assay for cell viability. HUVECs were exposed to various concentrations of LPC, LPC+estrogen, LPC+progesterone and we did cytotoxic assay. Results: The serum estradiol, estriol were lower in the preeclamptic patients (P<0.05). Oxidized LDL were higher in the preeclamptic patients(P<0.05). LPC induced cell death in a concentration-dependant manner. Estrogen or progesterone inhibited LPC-induced cell death in a concentration-dependant manner (P<0.05). Conclusion: Estrogen and progesterone attenuated LPC-induced cytotoxicity. The results suggest that Oxidized LDL induced endothelial damage in preeclampsia may be induced by low serum estradiol, estriol and progesterone levels and prevented by estrogen and progesterone addition.

제왕절개 자궁적출술의 임상적 고찰

김병수 ( Byung Soo Kim ),박덕련 ( Duk Rhun Park ),송희진 ( Hee Jin Song ),윤용복 ( Yong Bok Yoon ),이장현 ( Jang Huen Lee ),박상욱 ( Sang Wook Park ),임전주 ( Jeon Joo Lim ),전선희 ( Sun Hee Chun ),황익하 ( Ik Ha Hwang ),김두표 ( 대한주산의학회 1997 Perinatology Vol.8 No.2

자궁 천공이 동반된 만삭임신 후 전이성 융모상피암 1례

전선희,양훈진,김희옥,한지은 대한부인종양 콜포스코피학회 2000 Journal of Gynecologic Oncology Vol.11 No.3

Gestational trophoblastic tumor is one of the curable disease, but metastatic trophoblastic tumor still shows high mortality rate because of resistance to the chemotherapy. Choriocarcinoma may occur after an any type of human pregnancy. The incidence of choriocarcinoma following term pregnancy is very uncommon, and such tumor appears to follow a more aggressive course with more extensive metastatic spread and is less responsive to chemotherapy resulting in a poorer prognosis. Choriocarcinoma presenting as postpartum hemorrhage, and spontaneous tumor perforation with intra-abdominal hemorrhage is even rarer, requiring emergency laparotomy. We had experienced one case of metastatic choriocarcinoma following term pregnancy that required emergency total abdominal hysterectomy due to uterine perforation and hemorrhage. So, we report this case with brief review of literatures.